MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori F30

Total Repeats: 699

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017365	CCGCAG	2	12	1043	1054	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384898370
2	NC_017365	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	384898371
3	NC_017365	GCTTGC	2	12	6104	6115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384898374
4	NC_017365	CGTGGT	2	12	6502	6513	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384898374
5	NC_017365	ATTACC	2	12	6520	6531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384898374
6	NC_017365	GAAACC	2	12	7636	7647	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384898375
7	NC_017365	AGAAAA	2	12	18571	18582	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384898384
8	NC_017365	AGTTTT	2	12	20272	20283	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384898385
9	NC_017365	GATAAA	2	12	22133	22144	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384898387
10	NC_017365	ATGCAA	2	12	27179	27190	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384898391
11	NC_017365	CCAAAA	2	12	31301	31312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384898395
12	NC_017365	GCTGAA	2	12	31459	31470	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384898395
13	NC_017365	CATGGA	2	12	41554	41565	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384898403
14	NC_017365	TTTTAT	2	12	45165	45176	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384898405
15	NC_017365	TTCTTT	2	12	45828	45839	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384898406
16	NC_017365	TTGGTG	2	12	48243	48254	0 %	50 %	50 %	0 %	384898409
17	NC_017365	ACAAAA	2	12	49167	49178	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384898410
18	NC_017365	ATTGAA	2	12	51050	51061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384898412
19	NC_017365	TGAGCA	2	12	55523	55534	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384898416
20	NC_017365	GAAAAT	2	12	56191	56202	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384898416
21	NC_017365	GTGCCT	2	12	58666	58677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384898419
22	NC_017365	GATTTT	2	12	59002	59013	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384898419
23	NC_017365	GTTTTT	2	12	62920	62931	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384898423
24	NC_017365	GGGTTT	2	12	64336	64347	0 %	50 %	50 %	0 %	384898425
25	NC_017365	AGGCTT	3	18	64354	64371	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384898425
26	NC_017365	TGGAGA	2	12	64663	64674	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384898425
27	NC_017365	TTTGGC	2	12	71170	71181	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384898434
28	NC_017365	AGCGTC	2	12	76158	76169	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384898438
29	NC_017365	GATTTG	2	12	83925	83936	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384898447
30	NC_017365	GTAAAG	2	12	87702	87713	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384898454
31	NC_017365	CACGAT	2	12	90482	90493	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384898462
32	NC_017365	TAAGGG	2	12	90566	90577	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384898462
33	NC_017365	ATCACT	2	12	94838	94849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384898471
34	NC_017365	ACACCA	2	12	97746	97757	50 %	0 %	0 %	50 %	384898475
35	NC_017365	TTGCAA	2	12	101161	101172	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384898479
36	NC_017365	CGAATA	2	12	102265	102276	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384898480
37	NC_017365	TGCATA	2	12	102429	102440	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384898480
38	NC_017365	TTAAAG	2	12	107299	107310	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384898484
39	NC_017365	AGAAAA	2	12	108207	108218	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384898485
40	NC_017365	CGTGAG	2	12	113949	113960	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384898489
41	NC_017365	CAAAAA	2	12	114324	114335	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384898490
42	NC_017365	CCAAAA	2	12	115326	115337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384898490
43	NC_017365	TAAAAT	2	12	115619	115630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384898491
44	NC_017365	CAACAC	2	12	118463	118474	50 %	0 %	0 %	50 %	384898492
45	NC_017365	GCTTTA	2	12	118773	118784	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384898492
46	NC_017365	AGCCCT	2	12	120248	120259	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384898495
47	NC_017365	CAAAGC	2	12	121869	121880	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384898497
48	NC_017365	TTCATT	2	12	124674	124685	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384898498
49	NC_017365	GCGTAA	2	12	126053	126064	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384898500
50	NC_017365	AAAACA	2	12	131260	131271	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384898509
51	NC_017365	AAGAAA	2	12	136059	136070	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384898513
52	NC_017365	CGCTAA	2	12	143040	143051	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384898520
53	NC_017365	TTTTAA	2	12	144990	145001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384898521
54	NC_017365	AGCGTT	2	12	147169	147180	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384898522
55	NC_017365	GTTTGT	2	12	151226	151237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384898526
56	NC_017365	TGATAT	2	12	157234	157245	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384898533
57	NC_017365	GCCCAC	2	12	157301	157312	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384898533
58	NC_017365	TTTTGC	2	12	159125	159136	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384898535
59	NC_017365	GGGGCT	2	12	160106	160117	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384898536
60	NC_017365	AAAGCG	2	12	162976	162987	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384898540
61	NC_017365	GATTAT	2	12	169923	169934	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384898545
62	NC_017365	GGGGCT	2	12	174892	174903	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384898549
63	NC_017365	GCTAAA	2	12	175000	175011	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384898549
64	NC_017365	AGTAAA	2	12	175081	175092	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384898550
65	NC_017365	TGATTT	2	12	176315	176326	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384898551
66	NC_017365	CAAGCT	2	12	182298	182309	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384898557
67	NC_017365	GATTTG	2	12	183896	183907	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384898560
68	NC_017365	ATATTT	2	12	187054	187065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384898562
69	NC_017365	TATATG	2	12	188601	188612	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384898562
70	NC_017365	GAAAAA	2	12	189623	189634	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384898562
71	NC_017365	AAAACA	2	12	193993	194004	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384898564
72	NC_017365	AAGAAA	2	12	194646	194657	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384898565
73	NC_017365	GATCAC	2	12	194662	194673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384898565
74	NC_017365	AGTGGA	2	12	196300	196311	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384898565
75	NC_017365	GTTTTG	2	12	199368	199379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384898568
76	NC_017365	GATTTT	2	12	199640	199651	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384898568
77	NC_017365	AGAACA	2	12	202638	202649	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384898570
78	NC_017365	AGAACA	2	12	202659	202670	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384898570
79	NC_017365	AGAAGC	2	12	202815	202826	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384898570
80	NC_017365	GGTTAT	2	12	203251	203262	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384898570
81	NC_017365	CTAACA	2	12	203825	203836	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384898571
82	NC_017365	TTTTGG	2	12	206073	206084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384898573
83	NC_017365	TTTTTA	2	12	207446	207457	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384898574
84	NC_017365	GCTTAC	2	12	212392	212403	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384898578
85	NC_017365	TAAGGG	2	12	213527	213538	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384898579
86	NC_017365	TATGCT	2	12	213961	213972	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384898579
87	NC_017365	GGCTCA	2	12	214748	214759	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384898580
88	NC_017365	TAGCAG	2	12	215347	215358	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384898580
89	NC_017365	TTCTGT	2	12	218197	218208	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384898581
90	NC_017365	GCAAAT	2	12	225397	225408	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384898588
91	NC_017365	CAAGCT	2	12	229142	229153	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384898590
92	NC_017365	AAAGAA	2	12	229884	229895	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384898591
93	NC_017365	CTTTTT	2	12	230465	230476	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384898591
94	NC_017365	CTTTGA	2	12	236911	236922	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384898599
95	NC_017365	ACCCCT	2	12	238021	238032	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384898599
96	NC_017365	GCTTTA	2	12	241621	241632	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384898601
97	NC_017365	GAAAAA	2	12	245062	245073	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384898603
98	NC_017365	CAAAAA	2	12	245588	245599	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384898604
99	NC_017365	CAGACA	2	12	255583	255594	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384898613
100	NC_017365	TTCTCA	2	12	256690	256701	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384898613
101	NC_017365	AGCGTG	2	12	263341	263352	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384898621
102	NC_017365	GATTGA	2	12	266017	266028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384898624
103	NC_017365	AATTTG	2	12	269121	269132	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384898628
104	NC_017365	CTCAAG	2	12	270118	270129	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384898630
105	NC_017365	GCAATC	2	12	271618	271629	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384898632
106	NC_017365	ACAACC	2	12	272760	272771	50 %	0 %	0 %	50 %	384898634
107	NC_017365	GAAAAA	2	12	273373	273384	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384898635
108	NC_017365	ATGCGA	2	12	276997	277008	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384898637
109	NC_017365	TGTTAT	2	12	286294	286305	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384898645
110	NC_017365	GCTTTT	2	12	289557	289568	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384898649
111	NC_017365	GCTTTT	2	12	290896	290907	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384898650
112	NC_017365	GCCCAC	2	12	292794	292805	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384898651
113	NC_017365	CCGCTC	2	12	293635	293646	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384898652
114	NC_017365	TTTTCT	2	12	294446	294457	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384898653
115	NC_017365	TTCAAA	2	12	294883	294894	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384898653
116	NC_017365	TTCCAA	2	12	295040	295051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384898654
117	NC_017365	GCACTT	2	12	296920	296931	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384898655
118	NC_017365	ATCGCT	2	12	297171	297182	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384898655
119	NC_017365	CAAGGG	2	12	299022	299033	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384898657
120	NC_017365	CGATGG	2	12	299306	299317	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384898657
121	NC_017365	ATGGCG	2	12	299455	299466	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384898657
122	NC_017365	ATTGGT	2	12	307910	307921	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384898665
123	NC_017365	GCATGC	2	12	311388	311399	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384898669
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125	NC_017365	AACGCT	2	12	322419	322430	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384898678
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130	NC_017365	GCATGG	2	12	331071	331082	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384898687
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132	NC_017365	CAAATC	2	12	335831	335842	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384898691
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228	NC_017365	TTGTAG	2	12	578990	579001	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384898909
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343	NC_017365	CTAGCC	2	12	811470	811481	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384899121
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