MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori F30

Total Repeats: 485

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017365	ATGC	2	8	4274	4281	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017365	ATAA	2	8	9561	9568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017365	ATTC	2	8	9764	9771	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017365	TTAA	2	8	13577	13584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017365	AGTT	2	8	16524	16531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017365	ATCA	2	8	22636	22643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017365	GATT	2	8	25096	25103	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017365	ATTA	2	8	25192	25199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017365	AGCG	2	8	30921	30928	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017365	TGAA	2	8	54966	54973	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017365	TAGA	2	8	54994	55001	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017365	TTCT	2	8	55038	55045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017365	TTTA	2	8	59059	59066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017365	TAAA	2	8	59095	59102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017365	AAAG	2	8	60112	60119	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017365	AGCA	2	8	63185	63192	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017365	TTCA	2	8	63305	63312	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017365	AAAG	2	8	63812	63819	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017365	TTCG	2	8	65561	65568	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017365	ACCA	2	8	65683	65690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017365	AATT	2	8	65726	65733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017365	GTCC	2	8	69447	69454	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017365	TCCT	2	8	69564	69571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017365	GCAT	2	8	70806	70813	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017365	TTAA	2	8	78782	78789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017365	ATGA	2	8	78815	78822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017365	CTTT	2	8	78826	78833	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017365	TTGG	2	8	97202	97209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017365	GTTA	2	8	97335	97342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017365	TAGG	2	8	101017	101024	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017365	TGCA	2	8	109572	109579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017365	GTTG	2	8	109644	109651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017365	GTGA	2	8	110090	110097	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017365	TTAA	2	8	110147	110154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017365	TTTA	2	8	141544	141551	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017365	TTTA	2	8	141554	141561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017365	TTTA	2	8	141624	141631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017365	CTTT	2	8	144313	144320	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017365	CTTT	2	8	144328	144335	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017365	CTTT	2	8	144343	144350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017365	CTTT	2	8	144380	144387	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017365	CTTT	2	8	144411	144418	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017365	CTTT	2	8	144451	144458	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017365	CTTT	2	8	144511	144518	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017365	TCTT	2	8	144526	144533	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017365	TAGT	2	8	144610	144617	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017365	ACAA	2	8	148453	148460	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017365	ATTG	2	8	148769	148776	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017365	TTGG	2	8	154016	154023	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017365	CAGT	2	8	166234	166241	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017365	TTAA	2	8	166360	166367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017365	TTGT	2	8	167846	167853	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017365	AAAT	2	8	174199	174206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017365	TTAG	2	8	174408	174415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017365	TAAA	2	8	175036	175043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017365	CTTT	2	8	181388	181395	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017365	GAAA	2	8	182841	182848	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017365	TTAA	2	8	184190	184197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017365	TTTG	2	8	184665	184672	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017365	TTTA	2	8	196801	196808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017365	TTGA	2	8	201763	201770	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017365	TAGC	2	8	201838	201845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017365	TTAT	2	8	203310	203317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017365	TCAA	2	8	204313	204320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017365	TCTT	2	8	205807	205814	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017365	AATA	2	8	207246	207253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017365	TTGA	2	8	214420	214427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017365	TAAA	2	8	214494	214501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017365	CGTT	2	8	216645	216652	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017365	TCTT	2	8	219603	219610	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017365	CAAA	2	8	220301	220308	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017365	TTTG	2	8	225674	225681	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017365	TTAG	2	8	225820	225827	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017365	CTTT	2	8	225835	225842	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017365	CAAA	2	8	227632	227639	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017365	TTAA	2	8	232605	232612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017365	TTAT	2	8	240920	240927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017365	TGGT	2	8	240941	240948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017365	CTTT	2	8	248900	248907	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017365	CTTT	2	8	248952	248959	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017365	GTTG	2	8	249067	249074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017365	ACTT	2	8	250182	250189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017365	ATTG	2	8	250460	250467	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017365	TATG	2	8	250476	250483	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017365	TTTC	2	8	250546	250553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017365	AGTC	2	8	251246	251253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017365	AGGT	2	8	251319	251326	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017365	GATG	2	8	251473	251480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017365	TCTT	2	8	252293	252300	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017365	TGAT	2	8	252360	252367	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017365	TGTT	2	8	252642	252649	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017365	CTTG	2	8	252703	252710	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017365	TTTC	2	8	252841	252848	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017365	AATA	2	8	252987	252994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017365	TGAT	2	8	253120	253127	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017365	GAAA	2	8	260467	260474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017365	GAAT	2	8	271758	271765	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017365	TTGA	2	8	275663	275670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017365	ATAA	2	8	277639	277646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017365	TTGC	2	8	278564	278571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017365	TTGT	2	8	278585	278592	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017365	AACA	2	8	278618	278625	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017365	AGCG	2	8	278645	278652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017365	ACAA	2	8	279449	279456	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017365	TATT	2	8	287192	287199	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017365	ATTT	2	8	287236	287243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017365	AATT	2	8	289396	289403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017365	CTTT	2	8	290719	290726	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017365	AATT	2	8	290727	290734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017365	TTAA	2	8	296247	296254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017365	CTTT	2	8	299810	299817	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017365	CTTG	2	8	300078	300085	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017365	ATTT	2	8	300114	300121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017365	TGAT	2	8	302653	302660	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017365	TGCG	2	8	307609	307616	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017365	TGCG	2	8	307619	307626	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017365	TCTA	2	8	309555	309562	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017365	ACAA	2	8	313755	313762	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017365	TTGA	2	8	313811	313818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017365	TAAA	2	8	326678	326685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017365	TCAA	2	8	332930	332937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017365	AAAT	2	8	344051	344058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017365	TAAA	2	8	358381	358388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017365	ATAA	2	8	358497	358504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017365	AGAA	2	8	358592	358599	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017365	TTGA	2	8	372714	372721	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017365	TTTA	2	8	372924	372931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017365	TTTC	2	8	372989	372996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017365	GCGA	2	8	373684	373691	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017365	CAAA	2	8	374261	374268	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017365	GGTG	2	8	374422	374429	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017365	AATC	2	8	374434	374441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017365	AAAG	2	8	374558	374565	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017365	AGCT	2	8	374915	374922	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017365	TCCC	2	8	375213	375220	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_017365	CAGG	2	8	375668	375675	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017365	AGCC	2	8	375787	375794	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017365	GTTT	2	8	376770	376777	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017365	AATC	2	8	376920	376927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017365	ATTT	2	8	377048	377055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017365	CAAT	2	8	377976	377983	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017365	TCAA	2	8	378246	378253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017365	TCCC	2	8	378392	378399	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_017365	TATT	2	8	379818	379825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017365	TATT	2	8	379981	379988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017365	CTGT	2	8	384437	384444	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017365	GCAT	2	8	395271	395278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017365	CAAT	2	8	401602	401609	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017365	GTTT	2	8	412766	412773	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017365	TCAA	2	8	412922	412929	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_017365	TTTC	2	8	413616	413623	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.