MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Lithuania75 plasmid unnamed

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017363	CAAAT	2	10	1993	2002	60 %	20 %	0 %	20 %	384896667
2	NC_017363	AAGCG	2	10	2762	2771	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017363	AAAAG	2	10	3604	3613	80 %	0 %	20 %	0 %	384896669
4	NC_017363	AGTTT	2	10	5439	5448	20 %	60 %	20 %	0 %	384896672
5	NC_017363	GCTAT	2	10	6486	6495	20 %	40 %	20 %	20 %	384896673
6	NC_017363	GCCAA	2	10	6524	6533	40 %	0 %	20 %	40 %	384896673
7	NC_017363	TTGTG	2	10	7290	7299	0 %	60 %	40 %	0 %	384896675
8	NC_017363	CTTTT	2	10	7873	7882	0 %	80 %	0 %	20 %	384896675
9	NC_017363	TTCCT	2	10	8167	8176	0 %	60 %	0 %	40 %	384896675
10	NC_017363	CCATA	2	10	8237	8246	40 %	20 %	0 %	40 %	384896675
11	NC_017363	TTTCT	2	10	9209	9218	0 %	80 %	0 %	20 %	384896676
12	NC_017363	CATTG	2	10	10449	10458	20 %	40 %	20 %	20 %	384896678
13	NC_017363	AATAC	2	10	12235	12244	60 %	20 %	0 %	20 %	384896678
14	NC_017363	CCTTG	2	10	13585	13594	0 %	40 %	20 %	40 %	384896680
15	NC_017363	ATCAA	2	10	13875	13884	60 %	20 %	0 %	20 %	384896680
16	NC_017363	TTTTA	2	10	14647	14656	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017363	AAAGT	2	10	14796	14805	60 %	20 %	20 %	0 %	384896682
18	NC_017363	TCTAA	2	10	15320	15329	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017363	AAGCG	2	10	15606	15615	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.