MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Lithuania75 plasmid unnamed

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017363	CTTG	2	8	771	778	0 %	50 %	25 %	25 %	384896666
2	NC_017363	ATGC	2	8	1914	1921	25 %	25 %	25 %	25 %	384896667
3	NC_017363	GAAA	2	8	1951	1958	75 %	0 %	25 %	0 %	384896667
4	NC_017363	GAAG	2	8	2026	2033	50 %	0 %	50 %	0 %	384896667
5	NC_017363	ATGC	2	8	3640	3647	25 %	25 %	25 %	25 %	384896669
6	NC_017363	CTTT	2	8	3767	3774	0 %	75 %	0 %	25 %	384896669
7	NC_017363	CTAT	2	8	4333	4340	25 %	50 %	0 %	25 %	384896669
8	NC_017363	ACAA	2	8	4454	4461	75 %	0 %	0 %	25 %	384896670
9	NC_017363	ATCT	2	8	4488	4495	25 %	50 %	0 %	25 %	384896670
10	NC_017363	CTAC	2	8	4886	4893	25 %	25 %	0 %	50 %	384896671
11	NC_017363	GGGT	2	8	5049	5056	0 %	25 %	75 %	0 %	384896671
12	NC_017363	GCAA	2	8	5336	5343	50 %	0 %	25 %	25 %	384896672
13	NC_017363	GAAA	2	8	5626	5633	75 %	0 %	25 %	0 %	384896672
14	NC_017363	AAGA	2	8	6285	6292	75 %	0 %	25 %	0 %	384896673
15	NC_017363	AAAG	2	8	6471	6478	75 %	0 %	25 %	0 %	384896673
16	NC_017363	TGAA	2	8	6589	6596	50 %	25 %	25 %	0 %	384896673
17	NC_017363	AGTG	2	8	6752	6759	25 %	25 %	50 %	0 %	384896673
18	NC_017363	AAAC	2	8	7012	7019	75 %	0 %	0 %	25 %	384896674
19	NC_017363	TGAA	2	8	7099	7106	50 %	25 %	25 %	0 %	384896674
20	NC_017363	TTTC	2	8	7512	7519	0 %	75 %	0 %	25 %	384896675
21	NC_017363	CAAT	2	8	7648	7655	50 %	25 %	0 %	25 %	384896675
22	NC_017363	GAAT	2	8	7694	7701	50 %	25 %	25 %	0 %	384896675
23	NC_017363	TTTG	2	8	7829	7836	0 %	75 %	25 %	0 %	384896675
24	NC_017363	ATTT	2	8	7967	7974	25 %	75 %	0 %	0 %	384896675
25	NC_017363	CTAG	2	8	8352	8359	25 %	25 %	25 %	25 %	384896675
26	NC_017363	GTTT	2	8	8665	8672	0 %	75 %	25 %	0 %	384896675
27	NC_017363	TCAA	2	8	8721	8728	50 %	25 %	0 %	25 %	384896675
28	NC_017363	AATC	2	8	8884	8891	50 %	25 %	0 %	25 %	384896675
29	NC_017363	GATT	2	8	9270	9277	25 %	50 %	25 %	0 %	384896676
30	NC_017363	AAAG	2	8	9607	9614	75 %	0 %	25 %	0 %	384896677
31	NC_017363	TCCC	2	8	10271	10278	0 %	25 %	0 %	75 %	384896678
32	NC_017363	AAAT	2	8	10561	10568	75 %	25 %	0 %	0 %	384896678
33	NC_017363	CTTT	2	8	10588	10595	0 %	75 %	0 %	25 %	384896678
34	NC_017363	AAGT	2	8	10599	10606	50 %	25 %	25 %	0 %	384896678
35	NC_017363	ATAG	2	8	12060	12067	50 %	25 %	25 %	0 %	384896678
36	NC_017363	TAAA	2	8	12253	12260	75 %	25 %	0 %	0 %	384896678
37	NC_017363	ATGC	2	8	12273	12280	25 %	25 %	25 %	25 %	384896678
38	NC_017363	GTTT	2	8	12852	12859	0 %	75 %	25 %	0 %	384896679
39	NC_017363	GTAA	2	8	13971	13978	50 %	25 %	25 %	0 %	384896680
40	NC_017363	TGAG	2	8	14073	14080	25 %	25 %	50 %	0 %	384896680
41	NC_017363	TTAG	2	8	14097	14104	25 %	50 %	25 %	0 %	384896680
42	NC_017363	AAGA	2	8	14858	14865	75 %	0 %	25 %	0 %	384896682
43	NC_017363	AGCG	2	8	15542	15549	25 %	0 %	50 %	25 %	384896684

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.