MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Lithuania75 plasmid unnamed

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017363	ATC	2	6	448	453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896666
2	NC_017363	ATT	2	6	459	464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896666
3	NC_017363	CAA	2	6	500	505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896666
4	NC_017363	ACC	2	6	517	522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384896666
5	NC_017363	ACC	2	6	574	579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384896666
6	NC_017363	CAA	2	6	585	590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896666
7	NC_017363	ATT	2	6	750	755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896666
8	NC_017363	ACA	2	6	779	784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896666
9	NC_017363	GGC	2	6	787	792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384896666
10	NC_017363	CAA	2	6	954	959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896666
11	NC_017363	CAA	2	6	1300	1305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896666
12	NC_017363	AAC	2	6	1480	1485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896666
13	NC_017363	CAA	2	6	1566	1571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896666
14	NC_017363	ACT	2	6	1587	1592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896666
15	NC_017363	CAA	2	6	1749	1754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896666
16	NC_017363	GAA	2	6	1875	1880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896666
17	NC_017363	ACC	2	6	1982	1987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384896667
18	NC_017363	ATG	2	6	2060	2065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896667
19	NC_017363	TGG	2	6	2073	2078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896667
20	NC_017363	CAA	2	6	2117	2122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896667
21	NC_017363	CAT	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896667
22	NC_017363	TCA	2	6	2312	2317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896667
23	NC_017363	TAC	2	6	2341	2346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896667
24	NC_017363	ACA	2	6	2366	2371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896667
25	NC_017363	CAT	2	6	2917	2922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896668
26	NC_017363	ATT	2	6	3091	3096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896668
27	NC_017363	CTA	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896668
28	NC_017363	CTT	2	6	4050	4055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896669
29	NC_017363	TTG	2	6	4250	4255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896669
30	NC_017363	CAA	2	6	4288	4293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896669
31	NC_017363	AGA	2	6	4304	4309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896669
32	NC_017363	CAT	2	6	4358	4363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896669
33	NC_017363	ATT	3	9	4531	4539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896670
34	NC_017363	TAT	2	6	4707	4712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896671
35	NC_017363	GAT	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896671
36	NC_017363	AAG	2	6	4841	4846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896671
37	NC_017363	AGT	2	6	4860	4865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896671
38	NC_017363	AGA	2	6	4983	4988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896671
39	NC_017363	CTA	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896671
40	NC_017363	TAT	2	6	5253	5258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896671
41	NC_017363	CTT	2	6	5670	5675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896672
42	NC_017363	GAT	2	6	5729	5734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896672
43	NC_017363	AAG	2	6	5790	5795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896672
44	NC_017363	AGA	2	6	5851	5856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896672
45	NC_017363	ATG	2	6	5910	5915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896672
46	NC_017363	GAT	2	6	6200	6205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896673
47	NC_017363	ATT	2	6	6272	6277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896673
48	NC_017363	CAC	2	6	6518	6523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384896673
49	NC_017363	TGA	2	6	6616	6621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896673
50	NC_017363	CTA	2	6	6631	6636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896673
51	NC_017363	ATA	2	6	6715	6720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896673
52	NC_017363	ATG	2	6	6820	6825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896673
53	NC_017363	CAA	2	6	7001	7006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896674
54	NC_017363	AGA	2	6	7031	7036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896674
55	NC_017363	TGA	2	6	7075	7080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896674
56	NC_017363	AGA	2	6	7088	7093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896674
57	NC_017363	TCA	2	6	7263	7268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896675
58	NC_017363	CTT	2	6	7318	7323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896675
59	NC_017363	TCA	2	6	7614	7619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896675
60	NC_017363	CAA	2	6	7802	7807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896675
61	NC_017363	TAA	2	6	7859	7864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896675
62	NC_017363	TTA	2	6	7923	7928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896675
63	NC_017363	TAT	2	6	8005	8010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896675
64	NC_017363	GTT	2	6	8077	8082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896675
65	NC_017363	TTG	2	6	8127	8132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896675
66	NC_017363	ATT	2	6	8141	8146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896675
67	NC_017363	TCA	2	6	8250	8255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896675
68	NC_017363	TCT	2	6	8271	8276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896675
69	NC_017363	TGA	2	6	8299	8304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896675
70	NC_017363	TGA	2	6	8314	8319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896675
71	NC_017363	AAT	2	6	8512	8517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896675
72	NC_017363	TTA	2	6	8598	8603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896675
73	NC_017363	TGA	2	6	8644	8649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896675
74	NC_017363	TCA	2	6	8781	8786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896675
75	NC_017363	CAA	2	6	8872	8877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896675
76	NC_017363	TGT	2	6	9083	9088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896675
77	NC_017363	TCA	2	6	9096	9101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896675
78	NC_017363	TGT	2	6	9262	9267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896676
79	NC_017363	GTG	3	9	9423	9431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896676
80	NC_017363	TGA	2	6	9571	9576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896677
81	NC_017363	AAG	2	6	9832	9837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896677
82	NC_017363	TGA	2	6	10174	10179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896678
83	NC_017363	CTA	2	6	10184	10189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896678
84	NC_017363	TGT	2	6	10351	10356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896678
85	NC_017363	TCT	2	6	10423	10428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896678
86	NC_017363	TCA	2	6	10573	10578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896678
87	NC_017363	AAT	2	6	10647	10652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896678
88	NC_017363	CTT	2	6	10868	10873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896678
89	NC_017363	CAT	2	6	10928	10933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896678
90	NC_017363	TTG	2	6	10977	10982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896678
91	NC_017363	CAT	2	6	11060	11065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896678
92	NC_017363	ACC	3	9	11079	11087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384896678
93	NC_017363	GGT	2	6	11196	11201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896678
94	NC_017363	TAT	2	6	11387	11392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896678
95	NC_017363	AGG	2	6	11553	11558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384896678
96	NC_017363	CAA	2	6	11561	11566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896678
97	NC_017363	ACT	2	6	11596	11601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896678
98	NC_017363	TAA	2	6	11685	11690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896678
99	NC_017363	TAA	2	6	11725	11730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896678
100	NC_017363	TTA	2	6	11792	11797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896678
101	NC_017363	TAG	2	6	11815	11820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896678
102	NC_017363	ATT	2	6	11881	11886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896678
103	NC_017363	ATA	2	6	12353	12358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896679
104	NC_017363	ATC	2	6	12395	12400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896679
105	NC_017363	ACC	2	6	12430	12435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384896679
106	NC_017363	TTA	2	6	12674	12679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896679
107	NC_017363	TAG	2	6	13350	13355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896680
108	NC_017363	GTT	2	6	13357	13362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896680
109	NC_017363	GTT	3	9	13418	13426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896680
110	NC_017363	GTA	2	6	13523	13528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896680
111	NC_017363	TGA	2	6	13630	13635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896680
112	NC_017363	TGT	2	6	13735	13740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896680
113	NC_017363	TGT	2	6	13750	13755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896680
114	NC_017363	GTT	2	6	13756	13761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896680
115	NC_017363	TCA	2	6	14019	14024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896680
116	NC_017363	CCT	2	6	14190	14195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384896680
117	NC_017363	TGA	2	6	14248	14253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896681
118	NC_017363	GTT	2	6	14267	14272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896681
119	NC_017363	TTA	2	6	14371	14376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896681
120	NC_017363	TAA	2	6	14878	14883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896682
121	NC_017363	TAA	2	6	14893	14898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896682
122	NC_017363	TTA	2	6	14915	14920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896682
123	NC_017363	GTT	2	6	15270	15275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896683
124	NC_017363	ATT	2	6	15381	15386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896684

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.