MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Lithuania75 chromosome

Total Repeats: 804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017362	AAAGCG	2	12	288	299	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384896753
2	NC_017362	TTGCAA	2	12	867	878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384896754
3	NC_017362	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	384896756
4	NC_017362	GCTTGC	2	12	6086	6097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384896759
5	NC_017362	CCATTC	2	12	6824	6835	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384896759
6	NC_017362	GTTTTT	2	12	7489	7500	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017362	GAAACC	2	12	7860	7871	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384896761
8	NC_017362	ACTATA	2	12	9879	9890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017362	GCCACG	2	12	10854	10865	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384896763
10	NC_017362	AAACAC	2	12	18439	18450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017362	AGAAAA	2	12	18789	18800	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384896770
12	NC_017362	AGCTTT	2	12	20490	20501	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384896771
13	NC_017362	TTTCTT	2	12	23083	23094	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384896774
14	NC_017362	TATCAA	2	12	30281	30292	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384896780
15	NC_017362	AAGACC	2	12	30822	30833	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384896780
16	NC_017362	TCTTAT	2	12	30989	31000	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384896780
17	NC_017362	GCGTGG	2	12	33039	33050	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384896783
18	NC_017362	TTGGAT	2	12	33149	33160	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384896783
19	NC_017362	TAATGA	2	12	33184	33195	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384896783
20	NC_017362	TAAGGA	2	12	34534	34545	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384896783
21	NC_017362	TAGGGG	2	12	36050	36061	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384896786
22	NC_017362	TTCTAC	2	12	37535	37546	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017362	AAAGAA	2	12	37563	37574	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017362	AAAGAA	2	12	39133	39144	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384896789
25	NC_017362	CAAAAT	2	12	41479	41490	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384896791
26	NC_017362	TAAACT	2	12	43047	43058	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384896792
27	NC_017362	CGCAAA	2	12	45315	45326	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384896795
28	NC_017362	ATTTGC	2	12	50397	50408	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384896798
29	NC_017362	TAAAAA	2	12	52001	52012	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384896799
30	NC_017362	ATTTTT	2	12	55739	55750	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017362	AGAAAA	2	12	56735	56746	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017362	AGAAAA	2	12	56798	56809	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017362	AAAAGA	2	12	56921	56932	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017362	AAGAAA	2	12	57049	57060	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017362	GATGTG	2	12	58478	58489	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017362	AGCCAA	2	12	58556	58567	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017362	TTTTGT	2	12	60770	60781	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017362	AAAGAG	2	12	61049	61060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017362	AGAAAA	2	12	62438	62449	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017362	AGTAAT	2	12	72189	72200	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017362	ACGCCC	2	12	72354	72365	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384896813
42	NC_017362	AAGGGC	2	12	75081	75092	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384896816
43	NC_017362	GGCATG	2	12	77659	77670	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384896819
44	NC_017362	GCAACG	2	12	78707	78718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384896819
45	NC_017362	GATATT	2	12	79488	79499	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384896822
46	NC_017362	TACAAA	2	12	89720	89731	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017362	GATTTT	2	12	93356	93367	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384896835
48	NC_017362	AAACTC	2	12	93473	93484	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384896835
49	NC_017362	TCAAAA	2	12	94986	94997	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384896837
50	NC_017362	GCGGTG	2	12	95680	95691	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384896838
51	NC_017362	TTAAGG	2	12	97226	97237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896839
52	NC_017362	AAATCA	2	12	97316	97327	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384896839
53	NC_017362	CAATAT	2	12	98886	98897	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384896839
54	NC_017362	CATATT	2	12	104643	104654	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384896844
55	NC_017362	AGCGTT	2	12	105506	105517	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384896844
56	NC_017362	AAGCAA	2	12	107108	107119	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384896846
57	NC_017362	GGAGCG	2	12	109696	109707	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384896849
58	NC_017362	TTTTCT	2	12	111196	111207	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384896850
59	NC_017362	TGCAAG	2	12	111602	111613	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384896850
60	NC_017362	CGCTCG	2	12	116199	116210	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384896855
61	NC_017362	TAGGCA	2	12	118736	118747	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384896856
62	NC_017362	CTTCTA	2	12	121043	121054	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384896858
63	NC_017362	GTTCTA	2	12	121175	121186	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384896858
64	NC_017362	GTTCTA	2	12	122831	122842	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384896859
65	NC_017362	TGAATT	2	12	124686	124697	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384896860
66	NC_017362	TTTCAA	2	12	124845	124856	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384896860
67	NC_017362	AGCAAA	2	12	128217	128228	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384896863
68	NC_017362	GTTTTA	2	12	129229	129240	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017362	TAGCGA	2	12	139936	139947	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384896877
70	NC_017362	TTAGCG	2	12	142826	142837	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384896879
71	NC_017362	ATCGCT	2	12	143039	143050	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384896879
72	NC_017362	ATCGCT	2	12	144754	144765	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384896880
73	NC_017362	CCTAAA	2	12	146977	146988	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384896882
74	NC_017362	TTCTAT	2	12	148137	148148	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384896883
75	NC_017362	TTGTTT	2	12	151125	151136	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384896888
76	NC_017362	CTTGGG	2	12	151786	151797	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384896890
77	NC_017362	TTGGGT	2	12	156560	156571	0 %	50 %	50 %	0 %	384896895
78	NC_017362	GATTTT	2	12	157074	157085	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384896896
79	NC_017362	AATTGA	2	12	157333	157344	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384896896
80	NC_017362	GATGGC	2	12	160299	160310	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384896900
81	NC_017362	GATGGC	2	12	160407	160418	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384896900
82	NC_017362	CTTTCT	2	12	160551	160562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896900
83	NC_017362	CCGCTC	2	12	162319	162330	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384896904
84	NC_017362	AACCCA	2	12	163472	163483	50 %	0 %	0 %	50 %	384896905
85	NC_017362	GCTCTC	2	12	164747	164758	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384896906
86	NC_017362	TAAAAA	2	12	165405	165416	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017362	TTCTAA	2	12	167081	167092	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384896909
88	NC_017362	ATCGTT	2	12	169192	169203	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384896911
89	NC_017362	AATTTC	2	12	169543	169554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384896912
90	NC_017362	TAAAAT	2	12	171067	171078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896913
91	NC_017362	TTCTTT	2	12	171477	171488	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384896913
92	NC_017362	TTCTTT	2	12	172457	172468	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384896915
93	NC_017362	ATTTTG	2	12	172879	172890	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384896916
94	NC_017362	CGCTTT	2	12	173357	173368	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384896916
95	NC_017362	ACTTAT	2	12	173454	173465	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384896916
96	NC_017362	GTTTAA	2	12	174142	174153	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384896917
97	NC_017362	CCGCTC	2	12	177189	177200	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384896920
98	NC_017362	GAGATA	2	12	178773	178784	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017362	GAAAAA	2	12	180818	180829	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384896923
100	NC_017362	AGGCAT	2	12	180907	180918	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384896923
101	NC_017362	AGAAAT	2	12	182455	182466	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384896925
102	NC_017362	CATTTG	2	12	182621	182632	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384896925
103	NC_017362	GGGCGA	2	12	182659	182670	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384896925
104	NC_017362	TCAAAC	2	12	183187	183198	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384896926
105	NC_017362	TAAAGA	2	12	183331	183342	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384896926
106	NC_017362	GGTATT	2	12	187105	187116	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384896928
107	NC_017362	TCTAAA	2	12	187335	187346	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384896928
108	NC_017362	TGGGCA	2	12	188404	188415	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384896929
109	NC_017362	ATTTTC	2	12	190828	190839	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384896930
110	NC_017362	TGGGGC	2	12	198237	198248	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384896940
111	NC_017362	CTATGG	2	12	198626	198637	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384896940
112	NC_017362	AAATCC	2	12	200004	200015	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384896942
113	NC_017362	AATTTT	2	12	202766	202777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896943
114	NC_017362	CAAAAA	2	12	210397	210408	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384896950
115	NC_017362	CATAGC	2	12	212624	212635	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384896952
116	NC_017362	GTTTTG	2	12	213129	213140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896952
117	NC_017362	TAATTA	2	12	217631	217642	50 %	50 %	0 %	0 %	384896956
118	NC_017362	ACTTTA	2	12	217681	217692	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384896957
119	NC_017362	ATTAAA	2	12	223956	223967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017362	TGTTTT	2	12	225220	225231	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017362	AATGCC	2	12	225529	225540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384896965
122	NC_017362	AGGGCC	2	12	228164	228175	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384896966
123	NC_017362	GGTGAT	2	12	229759	229770	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384896967
124	NC_017362	CACGCC	2	12	230667	230678	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384896968
125	NC_017362	GCTTTG	2	12	231922	231933	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384896969
126	NC_017362	GCTAGG	2	12	233303	233314	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384896970
127	NC_017362	TCTTTA	2	12	239980	239991	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384896977
128	NC_017362	GTTTTT	2	12	245618	245629	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384896984
129	NC_017362	ATTTTA	2	12	247078	247089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017362	TCCCGC	2	12	250977	250988	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384896989
131	NC_017362	TCCCGC	2	12	251790	251801	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384896989
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181	NC_017362	TTTTCT	2	12	359957	359968	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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237	NC_017362	ACTTTA	2	12	463938	463949	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384897193
238	NC_017362	AGCGCT	2	12	466103	466114	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384897195
239	NC_017362	TATTTT	2	12	470047	470058	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_017362	CTACAA	2	12	470524	470535	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384897198
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341	NC_017362	TATTGA	2	12	669739	669750	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
342	NC_017362	ACGCAA	2	12	669809	669820	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
343	NC_017362	CTAAAG	2	12	670464	670475	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
344	NC_017362	AAAAAT	2	12	673229	673240	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
345	NC_017362	ACCATT	2	12	675855	675866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384897381
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348	NC_017362	AAGAAA	2	12	683634	683645	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
349	NC_017362	TCAAAA	2	12	685845	685856	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384897389
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352	NC_017362	ATAAAC	2	12	690795	690806	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384897393
353	NC_017362	GTGAAT	2	12	696375	696386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384897398
354	NC_017362	TTGCGC	2	12	702127	702138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384897403
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356	NC_017362	AGGCTA	2	12	708472	708483	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384897409
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459	NC_017362	TTAAAA	2	12	924113	924124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_017362	TTTGGG	2	12	925524	925535	0 %	50 %	50 %	0 %	384897621
461	NC_017362	CCTCAC	2	12	926836	926847	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384897622
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464	NC_017362	ATTGAA	2	12	931424	931435	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
465	NC_017362	TTAATT	2	12	933053	933064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384897626
466	NC_017362	TAAGAT	2	12	936318	936329	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384897626
467	NC_017362	AATATC	2	12	937618	937629	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384897626
468	NC_017362	CTCAAT	2	12	937882	937893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384897626
469	NC_017362	ATATTA	2	12	939677	939688	50 %	50 %	0 %	0 %	384897626
470	NC_017362	CTTTAT	2	12	939791	939802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384897627
471	NC_017362	TTGATA	2	12	941116	941127	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384897628
472	NC_017362	TTAGAA	2	12	942666	942677	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384897630
473	NC_017362	TATAGA	2	12	943794	943805	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384897631
474	NC_017362	GCAAAA	2	12	944355	944366	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384897632
475	NC_017362	ATCACT	2	12	945513	945524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384897634
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478	NC_017362	CCAAGC	2	12	954863	954874	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384897645
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480	NC_017362	GCAGGG	2	12	960961	960972	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384897651
481	NC_017362	TTCTAA	2	12	962330	962341	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384897653
482	NC_017362	AAATTT	2	12	965274	965285	50 %	50 %	0 %	0 %	384897657
483	NC_017362	TTTAAA	2	12	965498	965509	50 %	50 %	0 %	0 %	384897657
484	NC_017362	TTCCAA	2	12	970332	970343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384897663
485	NC_017362	CCCCAG	2	12	972664	972675	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384897666
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487	NC_017362	CAAACC	2	12	977296	977307	50 %	0 %	0 %	50 %	384897672
488	NC_017362	TAAAAA	2	12	979147	979158	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384897672
489	NC_017362	CTGAAA	2	12	986819	986830	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384897677
490	NC_017362	CGCATG	2	12	988109	988120	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384897679
491	NC_017362	TCCAAA	2	12	989035	989046	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384897679
492	NC_017362	GATAGC	2	12	989316	989327	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384897680
493	NC_017362	GGGACT	2	12	992665	992676	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384897682
494	NC_017362	GATGTT	2	12	993211	993222	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384897682
495	NC_017362	ATCAAA	2	12	996511	996522	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384897686
496	NC_017362	CTAGCC	2	12	997592	997603	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
497	NC_017362	TTTCTT	2	12	1002894	1002905	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
498	NC_017362	CTTAAA	2	12	1004004	1004015	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384897689
499	NC_017362	TATTTT	2	12	1005319	1005330	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384897691
500	NC_017362	ACTTAG	2	12	1006296	1006307	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

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