MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Lithuania75 chromosome

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017362	GTTTTT	2	12	7489	7500	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017362	ACTATA	2	12	9879	9890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017362	AAACAC	2	12	18439	18450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017362	TTCTAC	2	12	37535	37546	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017362	AAAGAA	2	12	37563	37574	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017362	ATTTTT	2	12	55739	55750	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017362	AGAAAA	2	12	56735	56746	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017362	AGAAAA	2	12	56798	56809	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017362	AAAAGA	2	12	56921	56932	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017362	AAGAAA	2	12	57049	57060	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017362	GATGTG	2	12	58478	58489	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017362	AGCCAA	2	12	58556	58567	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017362	TTTTGT	2	12	60770	60781	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017362	AAAGAG	2	12	61049	61060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017362	AGAAAA	2	12	62438	62449	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017362	AGTAAT	2	12	72189	72200	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017362	TACAAA	2	12	89720	89731	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017362	GTTTTA	2	12	129229	129240	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017362	TAAAAA	2	12	165405	165416	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017362	GAGATA	2	12	178773	178784	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017362	ATTAAA	2	12	223956	223967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017362	TGTTTT	2	12	225220	225231	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017362	ATTTTA	2	12	247078	247089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017362	TTTGGC	2	12	359028	359039	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017362	TTTCTT	2	12	359481	359492	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017362	TTTTCT	2	12	359957	359968	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017362	CTTGCA	2	12	376608	376619	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017362	AATTTA	2	12	405650	405661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017362	AAAATA	2	12	431163	431174	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017362	TATTTT	2	12	470047	470058	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017362	TTTAAT	2	12	481826	481837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017362	TTGTAA	2	12	520638	520649	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017362	GAATAA	2	12	527130	527141	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017362	TCTTGT	2	12	538656	538667	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017362	TTTAAA	2	12	545320	545331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017362	CATTAC	2	12	556413	556424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017362	ATTTTA	2	12	578460	578471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017362	TAAAAT	2	12	583716	583727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017362	CTCAAT	2	12	631462	631473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017362	TATTGA	2	12	669739	669750	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017362	ACGCAA	2	12	669809	669820	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017362	CTAAAG	2	12	670464	670475	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017362	AAAAAT	2	12	673229	673240	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017362	AAGAAA	2	12	683634	683645	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017362	CTTTTT	2	12	705739	705750	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017362	AATTAA	2	12	712442	712453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017362	AAAATG	2	12	720607	720618	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017362	TTTCAT	2	12	744891	744902	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017362	CAAAAA	2	12	826871	826882	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017362	ATTTTG	2	12	827355	827366	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017362	CGTGGG	2	12	846338	846349	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017362	GCTCCC	2	12	857908	857919	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_017362	ATTTTT	2	12	880611	880622	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017362	AAAATA	2	12	896972	896983	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017362	AAAAAT	2	12	900999	901010	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017362	TGCATT	2	12	903511	903522	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017362	ATTATA	2	12	924012	924023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017362	TTAAAA	2	12	924113	924124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017362	ATTGAA	2	12	931424	931435	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017362	CTAGCC	2	12	997592	997603	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017362	TTTCTT	2	12	1002894	1002905	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017362	ACTTAG	2	12	1006296	1006307	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017362	CAAAAA	2	12	1006554	1006565	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017362	CTTTAA	2	12	1007427	1007438	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017362	TTTTAA	2	12	1054580	1054591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017362	ACAAAA	2	12	1103097	1103108	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017362	AAAAGA	2	12	1139821	1139832	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017362	GCATTT	2	12	1162308	1162319	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017362	ATCCTT	2	12	1188036	1188047	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017362	GCGCAT	2	12	1188055	1188066	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017362	TTGTAT	2	12	1190457	1190468	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017362	ACTTAA	2	12	1207489	1207500	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017362	AAACTT	2	12	1231122	1231133	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017362	TGTTAT	2	12	1240553	1240564	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017362	TTTGAT	2	12	1246200	1246211	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017362	ATTTTT	2	12	1263018	1263029	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017362	AGTTTT	2	12	1377087	1377098	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017362	CTTTAA	2	12	1379816	1379827	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017362	AGCGGG	2	12	1388210	1388221	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017362	TTTTCT	2	12	1390319	1390330	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017362	TGTTTA	2	12	1390473	1390484	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017362	TTTGAT	2	12	1390588	1390599	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017362	GTTTTA	2	12	1398321	1398332	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017362	TTTTTC	2	12	1399083	1399094	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017362	TAAAAA	2	12	1399278	1399289	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017362	CTAAGT	2	12	1410562	1410573	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017362	TGTTTA	2	12	1419403	1419414	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017362	AGAAAC	2	12	1422261	1422272	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017362	GATAAA	2	12	1466832	1466843	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017362	TAGCGA	2	12	1516153	1516164	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017362	AAAAAC	2	12	1519675	1519686	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017362	ATTTTG	2	12	1520001	1520012	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017362	AGATTT	2	12	1520510	1520521	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017362	TTGGTT	2	12	1523112	1523123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017362	TAAAGA	2	12	1523575	1523586	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017362	CTCTTT	2	12	1524357	1524368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017362	GGTTTG	2	12	1525051	1525062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017362	CTTGAG	2	12	1525359	1525370	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017362	AGGCTT	2	12	1527215	1527226	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017362	ACATTG	2	12	1534612	1534623	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017362	TCAAAC	2	12	1593818	1593829	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017362	TTCTTT	2	12	1594213	1594224	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017362	AAAGAT	2	12	1619305	1619316	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.