MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Lithuania75 chromosome

Total Repeats: 1324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017362	GAAAC	2	10	4646	4655	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017362	GTTTT	2	10	4860	4869	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017362	TTTTA	2	10	4923	4932	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017362	TTTGA	2	10	6055	6064	20 %	60 %	20 %	0 %	384896759
5	NC_017362	TTTCT	2	10	8524	8533	0 %	80 %	0 %	20 %	384896761
6	NC_017362	AATTT	2	10	9363	9372	40 %	60 %	0 %	0 %	384896761
7	NC_017362	TTGAA	2	10	12039	12048	40 %	40 %	20 %	0 %	384896764
8	NC_017362	TTTTG	2	10	12055	12064	0 %	80 %	20 %	0 %	384896764
9	NC_017362	TGGTG	2	10	12890	12899	0 %	40 %	60 %	0 %	384896765
10	NC_017362	GCTTT	2	10	13718	13727	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017362	CAAAA	2	10	18754	18763	80 %	0 %	0 %	20 %	384896770
12	NC_017362	CCATG	2	10	23599	23608	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017362	CTCTT	2	10	23629	23638	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017362	CAAGC	2	10	28304	28313	40 %	0 %	20 %	40 %	384896777
15	NC_017362	GCTGG	2	10	28677	28686	0 %	20 %	60 %	20 %	384896777
16	NC_017362	TTTTA	2	10	29229	29238	20 %	80 %	0 %	0 %	384896778
17	NC_017362	TCAAA	2	10	31073	31082	60 %	20 %	0 %	20 %	384896780
18	NC_017362	TTTTC	2	10	31243	31252	0 %	80 %	0 %	20 %	384896780
19	NC_017362	TGATT	2	10	32295	32304	20 %	60 %	20 %	0 %	384896781
20	NC_017362	ATCAA	2	10	36329	36338	60 %	20 %	0 %	20 %	384896786
21	NC_017362	AGCCT	2	10	39621	39630	20 %	20 %	20 %	40 %	384896790
22	NC_017362	TTACT	2	10	43372	43381	20 %	60 %	0 %	20 %	384896793
23	NC_017362	TTTAG	2	10	44467	44476	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017362	TAAAA	2	10	45250	45259	80 %	20 %	0 %	0 %	384896795
25	NC_017362	TCCCA	2	10	46262	46271	20 %	20 %	0 %	60 %	384896796
26	NC_017362	AAAAT	2	10	46762	46771	80 %	20 %	0 %	0 %	384896796
27	NC_017362	TAGGG	2	10	47362	47371	20 %	20 %	60 %	0 %	384896796
28	NC_017362	TAAAA	2	10	50152	50161	80 %	20 %	0 %	0 %	384896798
29	NC_017362	ATCAA	2	10	50183	50192	60 %	20 %	0 %	20 %	384896798
30	NC_017362	TGAAA	2	10	50920	50929	60 %	20 %	20 %	0 %	384896799
31	NC_017362	TCGCC	2	10	53917	53926	0 %	20 %	20 %	60 %	384896800
32	NC_017362	TAAAA	2	10	54213	54222	80 %	20 %	0 %	0 %	384896800
33	NC_017362	CAACA	2	10	54582	54591	60 %	0 %	0 %	40 %	384896800
34	NC_017362	TCAAA	2	10	54929	54938	60 %	20 %	0 %	20 %	384896800
35	NC_017362	TGATA	2	10	56374	56383	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017362	AAGAG	2	10	57528	57537	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017362	ATGCG	2	10	58509	58518	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017362	TATCC	2	10	59178	59187	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017362	AAAAG	2	10	59881	59890	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017362	GGTGG	2	10	64518	64527	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017362	TCAAT	2	10	67691	67700	40 %	40 %	0 %	20 %	384896808
42	NC_017362	CTTGG	2	10	68480	68489	0 %	40 %	40 %	20 %	384896809
43	NC_017362	CTTCT	2	10	68534	68543	0 %	60 %	0 %	40 %	384896809
44	NC_017362	TGCCT	2	10	68611	68620	0 %	40 %	20 %	40 %	384896809
45	NC_017362	TCCAA	2	10	69023	69032	40 %	20 %	0 %	40 %	384896810
46	NC_017362	CAATG	2	10	69858	69867	40 %	20 %	20 %	20 %	384896811
47	NC_017362	TTTTA	2	10	72279	72288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017362	TTTTG	2	10	72310	72319	0 %	80 %	20 %	0 %	384896813
49	NC_017362	ACGCC	2	10	72616	72625	20 %	0 %	20 %	60 %	384896813
50	NC_017362	AAAGC	2	10	73382	73391	60 %	0 %	20 %	20 %	384896814
51	NC_017362	ATCTT	2	10	80644	80653	20 %	60 %	0 %	20 %	384896822
52	NC_017362	TGGCT	2	10	81185	81194	0 %	40 %	40 %	20 %	384896822
53	NC_017362	ATGCC	2	10	81594	81603	20 %	20 %	20 %	40 %	384896823
54	NC_017362	TTGAT	2	10	82634	82643	20 %	60 %	20 %	0 %	384896825
55	NC_017362	GGCGT	2	10	84448	84457	0 %	20 %	60 %	20 %	384896827
56	NC_017362	TAAGA	2	10	87656	87665	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017362	TAAAA	2	10	87727	87736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017362	CTTTC	2	10	87980	87989	0 %	60 %	0 %	40 %	384896829
59	NC_017362	CGCTC	2	10	89092	89101	0 %	20 %	20 %	60 %	384896830
60	NC_017362	TTTGA	2	10	90936	90945	20 %	60 %	20 %	0 %	384896832
61	NC_017362	TGGCT	2	10	92264	92273	0 %	40 %	40 %	20 %	384896833
62	NC_017362	ACGAT	2	10	97427	97436	40 %	20 %	20 %	20 %	384896839
63	NC_017362	GAATT	2	10	99268	99277	40 %	40 %	20 %	0 %	384896840
64	NC_017362	TCGTT	2	10	101087	101096	0 %	60 %	20 %	20 %	384896841
65	NC_017362	TCTTT	2	10	104396	104405	0 %	80 %	0 %	20 %	384896844
66	NC_017362	TGAAA	2	10	106170	106179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017362	AAAGC	2	10	107161	107170	60 %	0 %	20 %	20 %	384896846
68	NC_017362	AATGG	2	10	108187	108196	40 %	20 %	40 %	0 %	384896847
69	NC_017362	GAATG	2	10	108394	108403	40 %	20 %	40 %	0 %	384896848
70	NC_017362	CAAAT	2	10	109716	109725	60 %	20 %	0 %	20 %	384896849
71	NC_017362	CGTTT	2	10	110349	110358	0 %	60 %	20 %	20 %	384896849
72	NC_017362	ACCCT	2	10	111145	111154	20 %	20 %	0 %	60 %	384896850
73	NC_017362	ATGCC	2	10	111277	111286	20 %	20 %	20 %	40 %	384896850
74	NC_017362	TGATT	2	10	113272	113281	20 %	60 %	20 %	0 %	384896852
75	NC_017362	CTAAA	2	10	113742	113751	60 %	20 %	0 %	20 %	384896854
76	NC_017362	GATCG	2	10	117766	117775	20 %	20 %	40 %	20 %	384896856
77	NC_017362	AGCTC	2	10	117785	117794	20 %	20 %	20 %	40 %	384896856
78	NC_017362	TTATT	2	10	118044	118053	20 %	80 %	0 %	0 %	384896856
79	NC_017362	AAGCC	2	10	119673	119682	40 %	0 %	20 %	40 %	384896857
80	NC_017362	CCAAT	2	10	121794	121803	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_017362	GTTTG	2	10	122395	122404	0 %	60 %	40 %	0 %	384896859
82	NC_017362	TTGAT	2	10	122923	122932	20 %	60 %	20 %	0 %	384896859
83	NC_017362	TTTGA	2	10	124171	124180	20 %	60 %	20 %	0 %	384896860
84	NC_017362	ATCTC	2	10	125456	125465	20 %	40 %	0 %	40 %	384896860
85	NC_017362	CGCTT	2	10	125614	125623	0 %	40 %	20 %	40 %	384896860
86	NC_017362	TTTGT	2	10	125968	125977	0 %	80 %	20 %	0 %	384896861
87	NC_017362	AGTGA	2	10	127254	127263	40 %	20 %	40 %	0 %	384896862
88	NC_017362	TGCGT	2	10	128028	128037	0 %	40 %	40 %	20 %	384896863
89	NC_017362	GAAAA	2	10	128189	128198	80 %	0 %	20 %	0 %	384896863
90	NC_017362	CGTTT	2	10	128456	128465	0 %	60 %	20 %	20 %	384896863
91	NC_017362	GAAAA	2	10	128507	128516	80 %	0 %	20 %	0 %	384896863
92	NC_017362	ATTTT	2	10	131471	131480	20 %	80 %	0 %	0 %	384896869
93	NC_017362	ATGTT	2	10	131553	131562	20 %	60 %	20 %	0 %	384896869
94	NC_017362	AAAAG	2	10	131965	131974	80 %	0 %	20 %	0 %	384896869
95	NC_017362	GATGT	2	10	132708	132717	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017362	AAATC	2	10	134248	134257	60 %	20 %	0 %	20 %	384896871
97	NC_017362	AAAAT	2	10	135720	135729	80 %	20 %	0 %	0 %	384896872
98	NC_017362	TTTTC	2	10	138300	138309	0 %	80 %	0 %	20 %	384896875
99	NC_017362	GTAAA	2	10	138852	138861	60 %	20 %	20 %	0 %	384896876
100	NC_017362	TTCTT	2	10	140256	140265	0 %	80 %	0 %	20 %	384896877
101	NC_017362	TCTTT	2	10	140749	140758	0 %	80 %	0 %	20 %	384896878
102	NC_017362	ACTTG	2	10	140962	140971	20 %	40 %	20 %	20 %	384896878
103	NC_017362	TTTTG	2	10	141911	141920	0 %	80 %	20 %	0 %	384896879
104	NC_017362	GCGAT	2	10	142704	142713	20 %	20 %	40 %	20 %	384896879
105	NC_017362	GCTTG	2	10	142960	142969	0 %	40 %	40 %	20 %	384896879
106	NC_017362	TTTTG	2	10	143620	143629	0 %	80 %	20 %	0 %	384896880
107	NC_017362	CCAAA	2	10	145460	145469	60 %	0 %	0 %	40 %	384896881
108	NC_017362	ATTTA	2	10	148346	148355	40 %	60 %	0 %	0 %	384896883
109	NC_017362	ACGCC	2	10	148982	148991	20 %	0 %	20 %	60 %	384896883
110	NC_017362	TTATT	2	10	150878	150887	20 %	80 %	0 %	0 %	384896887
111	NC_017362	GATTT	2	10	152210	152219	20 %	60 %	20 %	0 %	384896890
112	NC_017362	CAAAT	2	10	154107	154116	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017362	GGGGA	2	10	154930	154939	20 %	0 %	80 %	0 %	384896893
114	NC_017362	AGATT	2	10	156729	156738	40 %	40 %	20 %	0 %	384896895
115	NC_017362	AAGCC	2	10	158067	158076	40 %	0 %	20 %	40 %	384896898
116	NC_017362	TAAAA	2	10	159070	159079	80 %	20 %	0 %	0 %	384896899
117	NC_017362	GGGTG	2	10	160475	160484	0 %	20 %	80 %	0 %	384896900
118	NC_017362	AACAA	2	10	161395	161404	80 %	0 %	0 %	20 %	384896902
119	NC_017362	AATAA	2	10	161417	161426	80 %	20 %	0 %	0 %	384896902
120	NC_017362	ATTCA	2	10	161627	161636	40 %	40 %	0 %	20 %	384896903
121	NC_017362	TGGGG	2	10	173647	173656	0 %	20 %	80 %	0 %	384896917
122	NC_017362	ATTTG	2	10	174424	174433	20 %	60 %	20 %	0 %	384896917
123	NC_017362	AATTG	2	10	174580	174589	40 %	40 %	20 %	0 %	384896918
124	NC_017362	AGGTG	2	10	175048	175057	20 %	20 %	60 %	0 %	384896918
125	NC_017362	AAATC	2	10	175574	175583	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017362	AAATG	2	10	175975	175984	60 %	20 %	20 %	0 %	384896919
127	NC_017362	TGTAA	2	10	176765	176774	40 %	40 %	20 %	0 %	384896920
128	NC_017362	ATAAA	2	10	178261	178270	80 %	20 %	0 %	0 %	384896921
129	NC_017362	TTTAA	2	10	178624	178633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017362	AAAAG	2	10	179416	179425	80 %	0 %	20 %	0 %	384896922
131	NC_017362	ACCCC	2	10	179481	179490	20 %	0 %	0 %	80 %	384896922
132	NC_017362	GGTTG	2	10	184734	184743	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017362	AGAGG	2	10	185123	185132	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017362	ATTCA	2	10	186902	186911	40 %	40 %	0 %	20 %	384896928
135	NC_017362	AATCC	2	10	187579	187588	40 %	20 %	0 %	40 %	384896928
136	NC_017362	TTCAA	2	10	191730	191739	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017362	TATTG	2	10	192181	192190	20 %	60 %	20 %	0 %	384896932
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