MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Lithuania75 chromosome

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017362	GAAAC	2	10	4646	4655	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017362	GTTTT	2	10	4860	4869	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017362	TTTTA	2	10	4923	4932	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017362	GCTTT	2	10	13718	13727	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017362	CCATG	2	10	23599	23608	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017362	CTCTT	2	10	23629	23638	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017362	TTTAG	2	10	44467	44476	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017362	TGATA	2	10	56374	56383	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017362	AAGAG	2	10	57528	57537	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017362	ATGCG	2	10	58509	58518	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017362	TATCC	2	10	59178	59187	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017362	AAAAG	2	10	59881	59890	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017362	GGTGG	2	10	64518	64527	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017362	TTTTA	2	10	72279	72288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017362	TAAGA	2	10	87656	87665	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017362	TAAAA	2	10	87727	87736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017362	TGAAA	2	10	106170	106179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017362	CCAAT	2	10	121794	121803	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017362	GATGT	2	10	132708	132717	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017362	CAAAT	2	10	154107	154116	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017362	AAATC	2	10	175574	175583	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017362	TTTAA	2	10	178624	178633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017362	GGTTG	2	10	184734	184743	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017362	AGAGG	2	10	185123	185132	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017362	TTCAA	2	10	191730	191739	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017362	TTAAG	2	10	196101	196110	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017362	TTTAT	2	10	199482	199491	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017362	ATTTA	2	10	203336	203345	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017362	AAACA	2	10	203358	203367	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017362	TAAAA	2	10	225093	225102	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017362	ATTTT	2	10	225284	225293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017362	CTAAC	2	10	236431	236440	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017362	CAAAA	2	10	237767	237776	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017362	AAATT	2	10	247118	247127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017362	CAATC	2	10	256207	256216	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017362	CTCTT	2	10	261058	261067	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017362	AAATA	2	10	273187	273196	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017362	GTTTT	2	10	278803	278812	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017362	CTATC	2	10	298494	298503	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_017362	ATTCC	2	10	298560	298569	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017362	TTATT	2	10	327437	327446	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017362	AAGTT	2	10	328870	328879	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017362	ATTAA	2	10	334699	334708	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017362	TGTGT	2	10	337059	337068	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017362	AATCC	2	10	359376	359385	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017362	TAAAA	2	10	366925	366934	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017362	TTTTA	2	10	371388	371397	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017362	AAATC	2	10	376568	376577	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017362	GATGC	2	10	376654	376663	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017362	TAAAG	2	10	419348	419357	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017362	ATAAA	2	10	431193	431202	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017362	AAAAT	2	10	431227	431236	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017362	TTTTG	2	10	438893	438902	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017362	TAACA	2	10	451839	451848	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017362	AATAA	2	10	453228	453237	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017362	TAAAA	2	10	453323	453332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017362	TTTGA	2	10	453423	453432	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017362	AAAAT	2	10	460230	460239	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017362	TATCC	2	10	468250	468259	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017362	AAAAC	2	10	471600	471609	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017362	TAAGC	2	10	471634	471643	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017362	AGTTT	2	10	477360	477369	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017362	TCCTA	2	10	478559	478568	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017362	ATTTT	2	10	478610	478619	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017362	TAAAA	2	10	496903	496912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017362	TATAG	2	10	523136	523145	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017362	TTATT	2	10	526184	526193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017362	GTTTT	2	10	527286	527295	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017362	GCATT	2	10	538616	538625	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017362	GCTAT	2	10	545229	545238	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017362	ATTTT	2	10	545262	545271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017362	TTGTA	2	10	549495	549504	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017362	ACTCT	2	10	573595	573604	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_017362	TAAGG	2	10	583424	583433	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017362	ATTTT	2	10	583651	583660	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017362	CAACA	2	10	590513	590522	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017362	TTTAA	2	10	615603	615612	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017362	TTTAA	2	10	638254	638263	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017362	CACAA	2	10	643118	643127	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017362	TGCAA	2	10	669564	669573	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017362	AGGTT	2	10	669645	669654	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017362	GCTTT	2	10	670022	670031	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017362	TCTAT	2	10	670497	670506	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017362	GAAAA	2	10	670611	670620	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017362	TTAAA	2	10	689421	689430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017362	CAAAA	2	10	695278	695287	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017362	GGGTT	2	10	712098	712107	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017362	GCGAT	2	10	720197	720206	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017362	ATTTA	2	10	729400	729409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017362	ACCAC	2	10	729891	729900	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
91	NC_017362	ATTCT	2	10	729990	729999	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017362	TACTA	2	10	733607	733616	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017362	AAAAG	2	10	753454	753463	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017362	TCTTT	2	10	768443	768452	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017362	TTTTA	2	10	795913	795922	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017362	CCATC	2	10	826409	826418	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_017362	TGGGG	2	10	826452	826461	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017362	TCAAA	2	10	827527	827536	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017362	AAGAA	2	10	827605	827614	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017362	TATTT	2	10	843947	843956	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017362	TTAAA	2	10	844266	844275	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017362	AGCCT	2	10	846869	846878	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_017362	TTTTA	2	10	852684	852693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017362	CTCTT	2	10	853029	853038	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017362	GAATT	2	10	854131	854140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017362	GGTTA	2	10	855423	855432	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017362	AATTG	2	10	856188	856197	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017362	TCTTT	2	10	857261	857270	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017362	TTTAA	2	10	875821	875830	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017362	ATTTT	2	10	880529	880538	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017362	TATAA	2	10	888621	888630	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017362	TCGTA	2	10	906742	906751	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017362	TAAAA	2	10	909664	909673	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017362	TTTGT	2	10	921970	921979	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017362	AATAT	2	10	949066	949075	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017362	TAGGG	2	10	950939	950948	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017362	TAACT	2	10	951785	951794	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017362	CTTAT	2	10	952548	952557	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017362	TATCA	2	10	952571	952580	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017362	TGAAG	2	10	961170	961179	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017362	TTACT	2	10	973493	973502	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017362	TTAGT	2	10	984745	984754	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017362	TATTT	2	10	987740	987749	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017362	TATAA	2	10	995761	995770	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017362	TTTCC	2	10	995811	995820	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017362	TTTGC	2	10	996913	996922	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017362	GCAAA	2	10	998633	998642	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017362	AGCTT	2	10	1000632	1000641	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017362	TTCAT	2	10	1000965	1000974	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017362	TTATG	2	10	1007008	1007017	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017362	TTTTA	2	10	1007026	1007035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017362	TTTTA	2	10	1007046	1007055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017362	AAACC	2	10	1007140	1007149	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_017362	TTATC	2	10	1007554	1007563	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017362	TTCAA	2	10	1008569	1008578	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017362	CTCAT	2	10	1008799	1008808	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017362	TCACT	2	10	1010277	1010286	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017362	TACTT	2	10	1010573	1010582	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017362	TCTTT	2	10	1017522	1017531	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017362	AAAAT	2	10	1037132	1037141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017362	TAAAA	2	10	1069588	1069597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017362	AAAAT	2	10	1070767	1070776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017362	TTATT	2	10	1086931	1086940	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017362	AAATC	2	10	1098253	1098262	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017362	AAAAC	2	10	1116678	1116687	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017362	CACGA	2	10	1136909	1136918	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_017362	TTACC	2	10	1137707	1137716	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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184	NC_017362	TCACT	2	10	1382666	1382675	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
185	NC_017362	TACTT	2	10	1382962	1382971	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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193	NC_017362	GAAAT	2	10	1415558	1415567	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_017362	CTTTT	2	10	1459655	1459664	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.