MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Lithuania75 chromosome

Total Repeats: 4601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017362	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	384896753
2	NC_017362	TTCT	2	8	259	266	0 %	75 %	0 %	25 %	384896753
3	NC_017362	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	384896754
4	NC_017362	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	384896755
5	NC_017362	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	384896755
6	NC_017362	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	384896756
7	NC_017362	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	384896756
8	NC_017362	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	384896756
9	NC_017362	GTTT	2	8	2179	2186	0 %	75 %	25 %	0 %	384896756
10	NC_017362	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	384896756
11	NC_017362	GAAA	2	8	3322	3329	75 %	0 %	25 %	0 %	384896758
12	NC_017362	AGAA	2	8	3778	3785	75 %	0 %	25 %	0 %	384896758
13	NC_017362	ATAG	2	8	3833	3840	50 %	25 %	25 %	0 %	384896758
14	NC_017362	ATGC	2	8	4280	4287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017362	TAAA	2	8	4685	4692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017362	TCGC	2	8	5189	5196	0 %	25 %	25 %	50 %	384896759
17	NC_017362	CATT	2	8	5262	5269	25 %	50 %	0 %	25 %	384896759
18	NC_017362	GCTA	2	8	6514	6521	25 %	25 %	25 %	25 %	384896759
19	NC_017362	TTTG	2	8	6582	6589	0 %	75 %	25 %	0 %	384896759
20	NC_017362	TGGT	2	8	6781	6788	0 %	50 %	50 %	0 %	384896759
21	NC_017362	ATCG	2	8	6964	6971	25 %	25 %	25 %	25 %	384896759
22	NC_017362	CGTT	2	8	6999	7006	0 %	50 %	25 %	25 %	384896759
23	NC_017362	TAAG	2	8	7255	7262	50 %	25 %	25 %	0 %	384896759
24	NC_017362	TAAG	2	8	7451	7458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017362	TTTG	2	8	7546	7553	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017362	TTCA	2	8	7988	7995	25 %	50 %	0 %	25 %	384896761
27	NC_017362	TCTT	2	8	8282	8289	0 %	75 %	0 %	25 %	384896761
28	NC_017362	ATAA	2	8	9785	9792	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017362	TATT	2	8	9985	9992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017362	GATA	2	8	10091	10098	50 %	25 %	25 %	0 %	384896763
31	NC_017362	TCAA	2	8	10198	10205	50 %	25 %	0 %	25 %	384896763
32	NC_017362	TTTG	2	8	11018	11025	0 %	75 %	25 %	0 %	384896763
33	NC_017362	GTTT	2	8	11114	11121	0 %	75 %	25 %	0 %	384896763
34	NC_017362	ATTG	2	8	11993	12000	25 %	50 %	25 %	0 %	384896764
35	NC_017362	GCAA	2	8	12184	12191	50 %	0 %	25 %	25 %	384896764
36	NC_017362	GGCC	2	8	12652	12659	0 %	0 %	50 %	50 %	384896764
37	NC_017362	TATT	2	8	12767	12774	25 %	75 %	0 %	0 %	384896764
38	NC_017362	TGCA	2	8	12867	12874	25 %	25 %	25 %	25 %	384896765
39	NC_017362	AGCA	2	8	12922	12929	50 %	0 %	25 %	25 %	384896765
40	NC_017362	GTTT	2	8	13280	13287	0 %	75 %	25 %	0 %	384896765
41	NC_017362	TCTT	2	8	13667	13674	0 %	75 %	0 %	25 %	384896765
42	NC_017362	TTAA	2	8	13816	13823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017362	AGCG	2	8	14139	14146	25 %	0 %	50 %	25 %	384896767
44	NC_017362	GATT	2	8	14247	14254	25 %	50 %	25 %	0 %	384896767
45	NC_017362	CAAA	2	8	14416	14423	75 %	0 %	0 %	25 %	384896768
46	NC_017362	ATGC	2	8	14831	14838	25 %	25 %	25 %	25 %	384896768
47	NC_017362	TTTA	2	8	15418	15425	25 %	75 %	0 %	0 %	384896768
48	NC_017362	CAGG	2	8	16576	16583	25 %	0 %	50 %	25 %	384896768
49	NC_017362	TGAT	2	8	16620	16627	25 %	50 %	25 %	0 %	384896768
50	NC_017362	ATCT	2	8	18153	18160	25 %	50 %	0 %	25 %	384896769
51	NC_017362	TTGA	2	8	18718	18725	25 %	50 %	25 %	0 %	384896770
52	NC_017362	TGCT	2	8	19094	19101	0 %	50 %	25 %	25 %	384896770
53	NC_017362	AGCG	2	8	19266	19273	25 %	0 %	50 %	25 %	384896770
54	NC_017362	TAAA	2	8	20784	20791	75 %	25 %	0 %	0 %	384896772
55	NC_017362	GCGA	2	8	20793	20800	25 %	0 %	50 %	25 %	384896772
56	NC_017362	AGGC	2	8	21225	21232	25 %	0 %	50 %	25 %	384896772
57	NC_017362	CTTT	2	8	21650	21657	0 %	75 %	0 %	25 %	384896773
58	NC_017362	AAGT	2	8	21962	21969	50 %	25 %	25 %	0 %	384896773
59	NC_017362	GCTT	2	8	22089	22096	0 %	50 %	25 %	25 %	384896773
60	NC_017362	AACT	2	8	22707	22714	50 %	25 %	0 %	25 %	384896773
61	NC_017362	CTTT	2	8	22721	22728	0 %	75 %	0 %	25 %	384896773
62	NC_017362	ATCA	2	8	22860	22867	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017362	CTTG	2	8	23250	23257	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017362	TTTA	2	8	23293	23300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017362	TTTG	2	8	23357	23364	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017362	TCCC	2	8	25095	25102	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_017362	GATT	2	8	25597	25604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017362	TAAG	2	8	25635	25642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017362	ATTA	2	8	25693	25700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017362	TCGC	2	8	26036	26043	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017362	ATAA	2	8	26856	26863	75 %	25 %	0 %	0 %	384896776
72	NC_017362	AAGG	2	8	28248	28255	50 %	0 %	50 %	0 %	384896777
73	NC_017362	GCTC	2	8	28382	28389	0 %	25 %	25 %	50 %	384896777
74	NC_017362	CCAC	2	8	28651	28658	25 %	0 %	0 %	75 %	384896777
75	NC_017362	TCGC	2	8	28819	28826	0 %	25 %	25 %	50 %	384896777
76	NC_017362	GATG	2	8	28829	28836	25 %	25 %	50 %	0 %	384896777
77	NC_017362	GAAT	2	8	29086	29093	50 %	25 %	25 %	0 %	384896778
78	NC_017362	TTTA	2	8	29462	29469	25 %	75 %	0 %	0 %	384896778
79	NC_017362	TCAA	2	8	30337	30344	50 %	25 %	0 %	25 %	384896780
80	NC_017362	AGTC	2	8	30351	30358	25 %	25 %	25 %	25 %	384896780
81	NC_017362	TGCT	2	8	30369	30376	0 %	50 %	25 %	25 %	384896780
82	NC_017362	AGCA	2	8	30480	30487	50 %	0 %	25 %	25 %	384896780
83	NC_017362	CAAT	2	8	30494	30501	50 %	25 %	0 %	25 %	384896780
84	NC_017362	CAAT	2	8	31004	31011	50 %	25 %	0 %	25 %	384896780
85	NC_017362	GAAA	2	8	31439	31446	75 %	0 %	25 %	0 %	384896780
86	NC_017362	GGTT	2	8	32021	32028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017362	TTTA	2	8	32155	32162	25 %	75 %	0 %	0 %	384896781
88	NC_017362	ATTG	2	8	32343	32350	25 %	50 %	25 %	0 %	384896781
89	NC_017362	GCGA	2	8	32353	32360	25 %	0 %	50 %	25 %	384896781
90	NC_017362	ACCC	2	8	32486	32493	25 %	0 %	0 %	75 %	384896782
91	NC_017362	CATC	2	8	32612	32619	25 %	25 %	0 %	50 %	384896782
92	NC_017362	TCAA	2	8	32754	32761	50 %	25 %	0 %	25 %	384896783
93	NC_017362	CATG	2	8	33877	33884	25 %	25 %	25 %	25 %	384896783
94	NC_017362	GAAA	2	8	33985	33992	75 %	0 %	25 %	0 %	384896783
95	NC_017362	CGCT	2	8	33993	34000	0 %	25 %	25 %	50 %	384896783
96	NC_017362	GCTT	2	8	34892	34899	0 %	50 %	25 %	25 %	384896783
97	NC_017362	GAAA	2	8	34951	34958	75 %	0 %	25 %	0 %	384896783
98	NC_017362	ATGA	2	8	35232	35239	50 %	25 %	25 %	0 %	384896784
99	NC_017362	GGGC	2	8	35332	35339	0 %	0 %	75 %	25 %	384896785
100	NC_017362	TTCT	2	8	36654	36661	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017362	CTTT	2	8	36983	36990	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017362	TTTG	2	8	37106	37113	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017362	AATA	2	8	37661	37668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017362	TAAA	2	8	37683	37690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017362	GAAA	2	8	37813	37820	75 %	0 %	25 %	0 %	384896787
106	NC_017362	ATTT	2	8	37844	37851	25 %	75 %	0 %	0 %	384896788
107	NC_017362	TGAA	2	8	38391	38398	50 %	25 %	25 %	0 %	384896788
108	NC_017362	TTTG	2	8	38443	38450	0 %	75 %	25 %	0 %	384896788
109	NC_017362	CGAA	2	8	38633	38640	50 %	0 %	25 %	25 %	384896789
110	NC_017362	TGAT	2	8	38933	38940	25 %	50 %	25 %	0 %	384896789
111	NC_017362	CCAA	2	8	39692	39699	50 %	0 %	0 %	50 %	384896790
112	NC_017362	AAAC	2	8	39831	39838	75 %	0 %	0 %	25 %	384896790
113	NC_017362	CAAA	2	8	39907	39914	75 %	0 %	0 %	25 %	384896790
114	NC_017362	ATTG	2	8	40321	40328	25 %	50 %	25 %	0 %	384896790
115	NC_017362	ATCA	2	8	40496	40503	50 %	25 %	0 %	25 %	384896790
116	NC_017362	TCAA	2	8	40509	40516	50 %	25 %	0 %	25 %	384896790
117	NC_017362	GAGG	2	8	41020	41027	25 %	0 %	75 %	0 %	384896791
118	NC_017362	TGTT	2	8	41283	41290	0 %	75 %	25 %	0 %	384896791
119	NC_017362	CTTT	2	8	41876	41883	0 %	75 %	0 %	25 %	384896791
120	NC_017362	GAGC	2	8	41902	41909	25 %	0 %	50 %	25 %	384896791
121	NC_017362	GAAA	2	8	42151	42158	75 %	0 %	25 %	0 %	384896792
122	NC_017362	GATC	2	8	42280	42287	25 %	25 %	25 %	25 %	384896792
123	NC_017362	TTTG	2	8	42682	42689	0 %	75 %	25 %	0 %	384896792
124	NC_017362	ATGA	2	8	43287	43294	50 %	25 %	25 %	0 %	384896792
125	NC_017362	AAAG	2	8	43644	43651	75 %	0 %	25 %	0 %	384896793
126	NC_017362	CAAA	2	8	44126	44133	75 %	0 %	0 %	25 %	384896793
127	NC_017362	CAAA	2	8	44313	44320	75 %	0 %	0 %	25 %	384896794
128	NC_017362	TTGA	2	8	44707	44714	25 %	50 %	25 %	0 %	384896795
129	NC_017362	AAAC	2	8	44721	44728	75 %	0 %	0 %	25 %	384896795
130	NC_017362	TAGC	2	8	44739	44746	25 %	25 %	25 %	25 %	384896795
131	NC_017362	CATT	2	8	44849	44856	25 %	50 %	0 %	25 %	384896795
132	NC_017362	CGCT	2	8	44862	44869	0 %	25 %	25 %	50 %	384896795
133	NC_017362	GTTT	2	8	45484	45491	0 %	75 %	25 %	0 %	384896795
134	NC_017362	CAAA	2	8	45980	45987	75 %	0 %	0 %	25 %	384896796
135	NC_017362	CGCT	2	8	46328	46335	0 %	25 %	25 %	50 %	384896796
136	NC_017362	AGGG	2	8	46806	46813	25 %	0 %	75 %	0 %	384896796
137	NC_017362	TTCC	2	8	47116	47123	0 %	50 %	0 %	50 %	384896796
138	NC_017362	GCAA	2	8	47459	47466	50 %	0 %	25 %	25 %	384896796
139	NC_017362	TAAA	2	8	47728	47735	75 %	25 %	0 %	0 %	384896796
140	NC_017362	AGCG	3	12	48151	48162	25 %	0 %	50 %	25 %	384896797
141	NC_017362	TAAA	2	8	49060	49067	75 %	25 %	0 %	0 %	384896798
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