MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica7 chromosome

Total Repeats: 4737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017361	CAAT	2	8	787	794	50 %	25 %	0 %	25 %	385221506
2	NC_017361	CTGT	2	8	811	818	0 %	50 %	25 %	25 %	385221506
3	NC_017361	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	385221507
4	NC_017361	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	385221508
5	NC_017361	CATG	2	8	2127	2134	25 %	25 %	25 %	25 %	385221508
6	NC_017361	CTTT	2	8	2557	2564	0 %	75 %	0 %	25 %	385221509
7	NC_017361	CAAA	2	8	3099	3106	75 %	0 %	0 %	25 %	385221509
8	NC_017361	GAAA	2	8	3245	3252	75 %	0 %	25 %	0 %	385221510
9	NC_017361	GAAA	2	8	3320	3327	75 %	0 %	25 %	0 %	385221510
10	NC_017361	AAAC	2	8	4743	4750	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017361	AAAG	2	8	5238	5245	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017361	TCGC	2	8	5424	5431	0 %	25 %	25 %	50 %	385221511
13	NC_017361	ATTC	2	8	5453	5460	25 %	50 %	0 %	25 %	385221511
14	NC_017361	CATT	2	8	5497	5504	25 %	50 %	0 %	25 %	385221511
15	NC_017361	GAAA	2	8	5597	5604	75 %	0 %	25 %	0 %	385221511
16	NC_017361	TTTG	2	8	6763	6770	0 %	75 %	25 %	0 %	385221511
17	NC_017361	ATCG	2	8	7145	7152	25 %	25 %	25 %	25 %	385221511
18	NC_017361	CGTT	2	8	7180	7187	0 %	50 %	25 %	25 %	385221511
19	NC_017361	TTTG	2	8	7527	7534	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017361	AGCG	2	8	7630	7637	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017361	AGCG	2	8	7672	7679	25 %	0 %	50 %	25 %	385221512
22	NC_017361	TTCA	2	8	8006	8013	25 %	50 %	0 %	25 %	385221513
23	NC_017361	ATAA	2	8	9802	9809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017361	TATT	2	8	10004	10011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017361	AAAG	2	8	10056	10063	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017361	TCAA	2	8	10217	10224	50 %	25 %	0 %	25 %	385221515
27	NC_017361	ATTG	2	8	10572	10579	25 %	50 %	25 %	0 %	385221515
28	NC_017361	AAAG	2	8	10786	10793	75 %	0 %	25 %	0 %	385221515
29	NC_017361	ACAA	2	8	10799	10806	75 %	0 %	0 %	25 %	385221515
30	NC_017361	CTTT	2	8	11665	11672	0 %	75 %	0 %	25 %	385221515
31	NC_017361	GCAA	2	8	12203	12210	50 %	0 %	25 %	25 %	385221516
32	NC_017361	TGCT	2	8	12408	12415	0 %	50 %	25 %	25 %	385221516
33	NC_017361	CGCT	2	8	12527	12534	0 %	25 %	25 %	50 %	385221516
34	NC_017361	GCCG	2	8	12672	12679	0 %	0 %	50 %	50 %	385221516
35	NC_017361	AGCA	2	8	12944	12951	50 %	0 %	25 %	25 %	385221517
36	NC_017361	GTTT	2	8	13302	13309	0 %	75 %	25 %	0 %	385221517
37	NC_017361	TCTT	2	8	13689	13696	0 %	75 %	0 %	25 %	385221517
38	NC_017361	TTAA	2	8	13837	13844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017361	AGCG	2	8	14160	14167	25 %	0 %	50 %	25 %	385221519
40	NC_017361	GATT	2	8	14268	14275	25 %	50 %	25 %	0 %	385221519
41	NC_017361	CACT	2	8	14806	14813	25 %	25 %	0 %	50 %	385221520
42	NC_017361	TTCA	2	8	15095	15102	25 %	50 %	0 %	25 %	385221520
43	NC_017361	TTTA	2	8	15439	15446	25 %	75 %	0 %	0 %	385221520
44	NC_017361	CAGG	2	8	16597	16604	25 %	0 %	50 %	25 %	385221520
45	NC_017361	TGAT	2	8	16641	16648	25 %	50 %	25 %	0 %	385221520
46	NC_017361	AGTT	2	8	16769	16776	25 %	50 %	25 %	0 %	385221520
47	NC_017361	GTTT	2	8	16784	16791	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017361	TTCT	2	8	17015	17022	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017361	TTAA	2	8	17618	17625	50 %	50 %	0 %	0 %	385221521
50	NC_017361	GCGA	2	8	17987	17994	25 %	0 %	50 %	25 %	385221521
51	NC_017361	GTTT	2	8	18391	18398	0 %	75 %	25 %	0 %	385221521
52	NC_017361	TGAT	2	8	18733	18740	25 %	50 %	25 %	0 %	385221522
53	NC_017361	TGCT	2	8	19108	19115	0 %	50 %	25 %	25 %	385221522
54	NC_017361	AGCG	2	8	19280	19287	25 %	0 %	50 %	25 %	385221522
55	NC_017361	AGAA	2	8	19713	19720	75 %	0 %	25 %	0 %	385221523
56	NC_017361	TTAA	2	8	20694	20701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017361	TAAA	2	8	20818	20825	75 %	25 %	0 %	0 %	385221524
58	NC_017361	GCGA	2	8	20827	20834	25 %	0 %	50 %	25 %	385221524
59	NC_017361	AGGC	2	8	21259	21266	25 %	0 %	50 %	25 %	385221524
60	NC_017361	TTTG	2	8	21279	21286	0 %	75 %	25 %	0 %	385221524
61	NC_017361	AAAT	2	8	21579	21586	75 %	25 %	0 %	0 %	385221525
62	NC_017361	CTTT	2	8	21684	21691	0 %	75 %	0 %	25 %	385221525
63	NC_017361	AAGT	2	8	21996	22003	50 %	25 %	25 %	0 %	385221525
64	NC_017361	CTTT	2	8	22761	22768	0 %	75 %	0 %	25 %	385221525
65	NC_017361	ATCA	2	8	22900	22907	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017361	TAAC	2	8	23678	23685	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017361	TTGA	2	8	25468	25475	25 %	50 %	25 %	0 %	385221527
68	NC_017361	GCTC	2	8	28878	28885	0 %	25 %	25 %	50 %	385221529
69	NC_017361	GATG	2	8	29325	29332	25 %	25 %	50 %	0 %	385221529
70	NC_017361	GAAT	2	8	29583	29590	50 %	25 %	25 %	0 %	385221530
71	NC_017361	CAAC	2	8	29776	29783	50 %	0 %	0 %	50 %	385221530
72	NC_017361	TGGC	2	8	29803	29810	0 %	25 %	50 %	25 %	385221530
73	NC_017361	TGAT	2	8	30474	30481	25 %	50 %	25 %	0 %	385221531
74	NC_017361	TCAA	2	8	30831	30838	50 %	25 %	0 %	25 %	385221532
75	NC_017361	TTGA	2	8	31514	31521	25 %	50 %	25 %	0 %	385221532
76	NC_017361	TTTA	2	8	32591	32598	25 %	75 %	0 %	0 %	385221533
77	NC_017361	GCGA	2	8	32789	32796	25 %	0 %	50 %	25 %	385221533
78	NC_017361	ACCC	2	8	32900	32907	25 %	0 %	0 %	75 %	385221534
79	NC_017361	GAAG	2	8	32999	33006	50 %	0 %	50 %	0 %	385221534
80	NC_017361	TCGT	2	8	33538	33545	0 %	50 %	25 %	25 %	385221535
81	NC_017361	GGGA	2	8	33692	33699	25 %	0 %	75 %	0 %	385221535
82	NC_017361	CATG	2	8	34288	34295	25 %	25 %	25 %	25 %	385221535
83	NC_017361	GCTT	2	8	35303	35310	0 %	50 %	25 %	25 %	385221535
84	NC_017361	GAAA	2	8	35335	35342	75 %	0 %	25 %	0 %	385221535
85	NC_017361	GAAA	2	8	35362	35369	75 %	0 %	25 %	0 %	385221535
86	NC_017361	GATC	2	8	35440	35447	25 %	25 %	25 %	25 %	385221536
87	NC_017361	ATGA	2	8	35643	35650	50 %	25 %	25 %	0 %	385221536
88	NC_017361	AGCC	2	8	36113	36120	25 %	0 %	25 %	50 %	385221538
89	NC_017361	TTCT	2	8	37050	37057	0 %	75 %	0 %	25 %	385221539
90	NC_017361	AATA	2	8	38065	38072	75 %	25 %	0 %	0 %	385221539
91	NC_017361	TAAA	2	8	38087	38094	75 %	25 %	0 %	0 %	385221539
92	NC_017361	GAAA	2	8	38217	38224	75 %	0 %	25 %	0 %	385221540
93	NC_017361	TGAA	2	8	38795	38802	50 %	25 %	25 %	0 %	385221541
94	NC_017361	TGAT	2	8	38952	38959	25 %	50 %	25 %	0 %	385221541
95	NC_017361	TGAT	2	8	39328	39335	25 %	50 %	25 %	0 %	385221542
96	NC_017361	TTGT	2	8	39665	39672	0 %	75 %	25 %	0 %	385221542
97	NC_017361	ACAA	2	8	39727	39734	75 %	0 %	0 %	25 %	385221542
98	NC_017361	CAAC	2	8	40105	40112	50 %	0 %	0 %	50 %	385221543
99	NC_017361	CAAA	2	8	40329	40336	75 %	0 %	0 %	25 %	385221543
100	NC_017361	ATTG	2	8	40743	40750	25 %	50 %	25 %	0 %	385221543
101	NC_017361	ATTG	2	8	40809	40816	25 %	50 %	25 %	0 %	385221543
102	NC_017361	ATCA	2	8	40918	40925	50 %	25 %	0 %	25 %	385221543
103	NC_017361	TCAA	2	8	40931	40938	50 %	25 %	0 %	25 %	385221543
104	NC_017361	GATT	2	8	41518	41525	25 %	50 %	25 %	0 %	385221544
105	NC_017361	TGTT	2	8	41700	41707	0 %	75 %	25 %	0 %	385221544
106	NC_017361	AAAG	2	8	42020	42027	75 %	0 %	25 %	0 %	385221544
107	NC_017361	CTTT	2	8	42293	42300	0 %	75 %	0 %	25 %	385221544
108	NC_017361	GAAA	2	8	42572	42579	75 %	0 %	25 %	0 %	385221545
109	NC_017361	GATC	2	8	42701	42708	25 %	25 %	25 %	25 %	385221545
110	NC_017361	TTGA	2	8	43431	43438	25 %	50 %	25 %	0 %	385221545
111	NC_017361	GAGC	2	8	43456	43463	25 %	0 %	50 %	25 %	385221545
112	NC_017361	ATGA	2	8	43708	43715	50 %	25 %	25 %	0 %	385221545
113	NC_017361	TATT	2	8	43825	43832	25 %	75 %	0 %	0 %	385221546
114	NC_017361	CCAA	2	8	44098	44105	50 %	0 %	0 %	50 %	385221546
115	NC_017361	CAAA	2	8	44547	44554	75 %	0 %	0 %	25 %	385221546
116	NC_017361	GATT	2	8	45158	45165	25 %	50 %	25 %	0 %	385221548
117	NC_017361	CAAA	2	8	45402	45409	75 %	0 %	0 %	25 %	385221548
118	NC_017361	GCTC	2	8	45445	45452	0 %	25 %	25 %	50 %	385221549
119	NC_017361	AGTG	2	8	45503	45510	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017361	TTGA	2	8	45762	45769	25 %	50 %	25 %	0 %	385221550
121	NC_017361	AAAC	2	8	45776	45783	75 %	0 %	0 %	25 %	385221550
122	NC_017361	CGCT	2	8	45917	45924	0 %	25 %	25 %	50 %	385221550
123	NC_017361	TCAA	2	8	46528	46535	50 %	25 %	0 %	25 %	385221550
124	NC_017361	GTTT	2	8	46539	46546	0 %	75 %	25 %	0 %	385221550
125	NC_017361	TCGC	2	8	47859	47866	0 %	25 %	25 %	50 %	385221551
126	NC_017361	TTCA	2	8	48071	48078	25 %	50 %	0 %	25 %	385221551
127	NC_017361	GCAA	2	8	48523	48530	50 %	0 %	25 %	25 %	385221551
128	NC_017361	CAAC	2	8	48655	48662	50 %	0 %	0 %	50 %	385221551
129	NC_017361	CAAT	2	8	48905	48912	50 %	25 %	0 %	25 %	385221552
130	NC_017361	AGCG	3	12	49215	49226	25 %	0 %	50 %	25 %	385221552
131	NC_017361	AACA	2	8	49361	49368	75 %	0 %	0 %	25 %	385221552
132	NC_017361	GCAA	2	8	49864	49871	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017361	CTTT	2	8	50192	50199	0 %	75 %	0 %	25 %	385221553
134	NC_017361	TGGT	2	8	50951	50958	0 %	50 %	50 %	0 %	385221554
135	NC_017361	CTTT	2	8	51245	51252	0 %	75 %	0 %	25 %	385221554
136	NC_017361	CAAT	2	8	51762	51769	50 %	25 %	0 %	25 %	385221555
137	NC_017361	AAAC	2	8	52270	52277	75 %	0 %	0 %	25 %	385221555
138	NC_017361	AAAT	2	8	52301	52308	75 %	25 %	0 %	0 %	385221555
139	NC_017361	AAAC	2	8	53162	53169	75 %	0 %	0 %	25 %	385221556
140	NC_017361	AGCC	2	8	53362	53369	25 %	0 %	25 %	50 %	385221556
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142	NC_017361	GATG	2	8	53947	53954	25 %	25 %	50 %	0 %	385221556
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