MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica7 chromosome

Total Repeats: 614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017361	AAAC	2	8	4743	4750	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017361	AAAG	2	8	5238	5245	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017361	TTTG	2	8	7527	7534	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017361	AGCG	2	8	7630	7637	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017361	ATAA	2	8	9802	9809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017361	TATT	2	8	10004	10011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017361	AAAG	2	8	10056	10063	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017361	TTAA	2	8	13837	13844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017361	GTTT	2	8	16784	16791	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017361	TTCT	2	8	17015	17022	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017361	TTAA	2	8	20694	20701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017361	ATCA	2	8	22900	22907	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017361	TAAC	2	8	23678	23685	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017361	AGTG	2	8	45503	45510	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017361	GCAA	2	8	49864	49871	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017361	AGCG	2	8	58208	58215	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017361	TAAT	2	8	58271	58278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017361	AAAT	2	8	58437	58444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017361	CTAA	2	8	59364	59371	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017361	ATGC	2	8	61662	61669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017361	GGCA	2	8	61859	61866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017361	AAAG	2	8	61941	61948	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017361	GGGC	2	8	62081	62088	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017361	GCTT	2	8	62095	62102	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017361	GCGA	2	8	62631	62638	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017361	GAAA	2	8	62844	62851	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017361	ATTC	2	8	63345	63352	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017361	CAAA	2	8	73241	73248	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017361	AAAT	2	8	75972	75979	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017361	ATTT	2	8	78451	78458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017361	TGGT	2	8	79682	79689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017361	ACCA	3	12	79749	79760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017361	ATAA	2	8	79820	79827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017361	TAAA	2	8	79866	79873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017361	CTTT	3	12	82157	82168	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017361	AAAT	2	8	84407	84414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017361	GCTT	2	8	87741	87748	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017361	ATTT	2	8	87768	87775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017361	GGTG	2	8	95054	95061	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017361	TCCC	2	8	95124	95131	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_017361	GAAT	2	8	102132	102139	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017361	GTTA	2	8	105622	105629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017361	AAAC	2	8	109154	109161	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017361	TTTG	2	8	109274	109281	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017361	GATC	2	8	112284	112291	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017361	ATTT	2	8	112913	112920	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017361	CGCT	2	8	113038	113045	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017361	CTTT	2	8	114938	114945	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017361	AAAT	2	8	114949	114956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017361	ATTT	2	8	116454	116461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017361	AGTT	2	8	116490	116497	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017361	TCAT	2	8	121130	121137	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017361	ATTA	2	8	121151	121158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017361	AATG	2	8	128243	128250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017361	TTAG	2	8	128346	128353	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017361	AAAG	2	8	128523	128530	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017361	AAAG	2	8	131250	131257	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017361	AAAG	2	8	131747	131754	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017361	GAAG	2	8	131804	131811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017361	GCAA	2	8	132809	132816	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017361	TATT	2	8	133664	133671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017361	GAAT	2	8	134849	134856	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017361	TGAA	2	8	135454	135461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017361	ATCT	2	8	139993	140000	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017361	TAAG	2	8	143890	143897	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017361	ATTT	2	8	162636	162643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017361	TTTA	2	8	163742	163749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017361	TTAG	2	8	163923	163930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017361	GAAA	2	8	164692	164699	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017361	AACT	2	8	168605	168612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017361	ATTT	2	8	168791	168798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017361	TTCT	2	8	168799	168806	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017361	GCTA	2	8	168914	168921	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017361	ATCA	2	8	168991	168998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017361	AATG	2	8	169011	169018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017361	AGCG	2	8	178857	178864	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017361	TAAA	2	8	179091	179098	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017361	AAAC	2	8	179168	179175	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017361	AAAG	2	8	182312	182319	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017361	AACG	2	8	187341	187348	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017361	ATCA	2	8	188480	188487	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017361	ACGA	2	8	197137	197144	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017361	ATTA	2	8	201870	201877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017361	CTTT	2	8	202123	202130	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017361	ATAA	2	8	202142	202149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017361	TCAA	2	8	202271	202278	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017361	AAAC	2	8	202360	202367	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017361	GTTT	2	8	213142	213149	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017361	TTTG	2	8	220107	220114	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017361	ATCC	2	8	220466	220473	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017361	TTAA	2	8	221328	221335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017361	ATGC	2	8	221963	221970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017361	ATTT	2	8	222020	222027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017361	GAGC	2	8	224878	224885	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017361	TTAT	2	8	226890	226897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017361	CTGT	2	8	228155	228162	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017361	CTAA	2	8	228207	228214	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017361	GCTT	2	8	228668	228675	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017361	AAAG	2	8	232028	232035	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017361	GAAA	2	8	232098	232105	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017361	TTTA	2	8	235008	235015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017361	GTTG	2	8	239185	239192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017361	TTGG	2	8	239326	239333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017361	ATTA	2	8	250246	250253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017361	ATTT	2	8	253453	253460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017361	TAAT	2	8	256305	256312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017361	TTAA	2	8	256426	256433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017361	GCCA	2	8	266240	266247	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017361	ATCA	2	8	273768	273775	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017361	ATTG	2	8	284343	284350	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017361	TGAA	2	8	304570	304577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017361	TCTT	2	8	307644	307651	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017361	CAAA	2	8	310225	310232	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017361	GTTG	2	8	317503	317510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017361	AAAT	2	8	317595	317602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017361	AACT	2	8	318619	318626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017361	TTGA	2	8	323327	323334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017361	ATTG	2	8	326111	326118	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017361	CTAG	2	8	326225	326232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017361	AAAT	2	8	329145	329152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017361	TTGG	2	8	332514	332521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017361	TTGG	2	8	334711	334718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017361	AAAT	2	8	340913	340920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017361	CCAA	2	8	346139	346146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017361	AATC	2	8	346189	346196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017361	AAAT	2	8	374412	374419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017361	TTAT	2	8	374626	374633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017361	TTAA	2	8	374767	374774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017361	TAAA	2	8	374778	374785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017361	CCAA	2	8	379883	379890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017361	CTAT	2	8	380119	380126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017361	AGAA	2	8	380394	380401	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017361	ATCT	2	8	380441	380448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017361	AAAG	2	8	380485	380492	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017361	ATTT	2	8	385226	385233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017361	CAAA	2	8	388566	388573	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017361	TGAC	2	8	392037	392044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017361	GTTT	2	8	392103	392110	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017361	AAAG	2	8	392175	392182	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017361	TTTC	2	8	396431	396438	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017361	GGGT	2	8	398379	398386	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017361	GAAA	2	8	398437	398444	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017361	CCAA	2	8	410478	410485	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017361	AAGC	2	8	410612	410619	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017361	AAGC	2	8	411681	411688	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017361	ATTG	2	8	415671	415678	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017361	TGCT	2	8	415902	415909	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017361	GCTT	2	8	415987	415994	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017361	TCAA	2	8	428458	428465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017361	CAAT	2	8	430872	430879	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_017361	TAAA	2	8	436331	436338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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