MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica7 chromosome

Total Repeats: 1941

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017361	TTC	2	6	2458	2463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017361	GGT	2	6	4083	4088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017361	TAT	2	6	4131	4136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017361	TGG	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017361	TGG	2	6	4301	4306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017361	GTG	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017361	ACC	2	6	4450	4455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017361	GGT	2	6	4463	4468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017361	TAG	2	6	4689	4694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017361	CAT	2	6	4732	4737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017361	TTG	2	6	4758	4763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017361	TTG	2	6	4768	4773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017361	TTA	2	6	4813	4818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017361	TTG	2	6	5054	5059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017361	AGT	2	6	7377	7382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017361	GGT	2	6	7535	7540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017361	TAA	3	9	9411	9419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017361	TTA	2	6	9832	9837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017361	ATT	2	6	9911	9916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017361	CAA	2	6	9982	9987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017361	AGG	2	6	12881	12886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017361	ACC	2	6	13770	13775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017361	CTG	2	6	16846	16851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017361	TTG	2	6	22987	22992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017361	TCA	2	6	23000	23005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017361	TTA	2	6	23049	23054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017361	TAT	2	6	23088	23093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017361	ATT	2	6	23096	23101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017361	AGG	2	6	23277	23282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017361	CAT	2	6	23285	23290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017361	CAG	2	6	23298	23303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017361	TGT	2	6	23533	23538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017361	AAG	2	6	23650	23655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017361	TTG	2	6	23699	23704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017361	AGA	3	9	23842	23850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017361	TCA	2	6	23903	23908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017361	TGT	2	6	26339	26344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017361	AAG	2	6	26526	26531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017361	TTA	2	6	26577	26582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017361	TTA	2	6	27948	27953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017361	TAT	2	6	32392	32397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017361	TGC	2	6	41078	41083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017361	TAA	2	6	41097	41102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017361	TTG	2	6	45482	45487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017361	TAG	2	6	45511	45516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017361	TAA	2	6	49849	49854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017361	TAA	2	6	51686	51691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017361	TCA	2	6	52968	52973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017361	TAT	2	6	58339	58344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017361	TAT	2	6	58366	58371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017361	TAT	2	6	58405	58410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017361	TGT	2	6	58856	58861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017361	ATA	2	6	58901	58906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017361	CTT	2	6	59129	59134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017361	AAC	2	6	59200	59205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017361	AAG	2	6	59209	59214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017361	AGA	2	6	59240	59245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017361	GAT	2	6	59316	59321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017361	TAG	2	6	61522	61527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017361	TGT	2	6	61534	61539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017361	AGC	2	6	61581	61586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017361	AGA	2	6	61625	61630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017361	CTT	2	6	61687	61692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017361	TGA	2	6	61706	61711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017361	AAC	2	6	61794	61799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017361	GAT	2	6	61832	61837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017361	TAG	2	6	62167	62172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017361	GAT	2	6	62241	62246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017361	AGG	2	6	62371	62376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017361	CAA	2	6	62456	62461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017361	TTA	2	6	62711	62716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017361	GAC	2	6	62741	62746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017361	ATG	2	6	62879	62884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017361	GAC	2	6	62989	62994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017361	AGA	2	6	63012	63017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017361	GCT	2	6	63066	63071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017361	CTT	2	6	63168	63173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017361	AGG	2	6	63240	63245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017361	GTT	2	6	63460	63465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017361	ATT	2	6	63724	63729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017361	AGA	2	6	63741	63746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017361	GGT	2	6	64700	64705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017361	GAA	3	9	66874	66882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017361	GAT	2	6	66892	66897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017361	AGA	2	6	66927	66932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017361	GAA	2	6	67010	67015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017361	ATG	2	6	67122	67127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017361	ATA	2	6	67949	67954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017361	TAG	2	6	69692	69697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017361	TAG	2	6	69705	69710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017361	CAT	2	6	69752	69757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017361	CTT	2	6	69782	69787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017361	AGC	2	6	69814	69819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017361	ACA	2	6	73256	73261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017361	TTG	2	6	73283	73288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017361	TTA	2	6	75951	75956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017361	ATT	3	9	75961	75969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017361	TTA	2	6	76012	76017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017361	TAA	2	6	76091	76096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017361	TGG	2	6	76097	76102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017361	TTA	2	6	76174	76179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017361	CTT	2	6	78371	78376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017361	TAT	2	6	78394	78399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017361	CTT	2	6	78404	78409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017361	TTG	2	6	78433	78438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017361	AAT	2	6	79549	79554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017361	TTG	2	6	79779	79784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017361	ACC	2	6	79807	79812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017361	CCT	2	6	79837	79842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017361	TGA	2	6	80037	80042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017361	GGA	2	6	80375	80380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017361	AAT	2	6	84253	84258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017361	GAG	2	6	84322	84327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017361	AAT	2	6	84468	84473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017361	ATT	2	6	86576	86581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017361	ATT	2	6	86586	86591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017361	AAG	2	6	87712	87717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017361	TAT	2	6	87762	87767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017361	TAA	2	6	89403	89408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017361	TAA	2	6	92913	92918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017361	TCA	2	6	93008	93013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017361	ACC	2	6	93269	93274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017361	TGA	2	6	95179	95184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017361	TTA	2	6	99606	99611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017361	TTA	2	6	100573	100578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017361	TTC	2	6	102057	102062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017361	TAT	3	9	102172	102180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017361	TCA	2	6	102235	102240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017361	ATA	2	6	105453	105458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017361	GTT	2	6	105602	105607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017361	ATC	2	6	105669	105674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017361	AGT	2	6	105729	105734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017361	TAA	2	6	107306	107311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017361	TAT	2	6	109222	109227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017361	ACA	2	6	109560	109565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017361	TGA	2	6	110097	110102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017361	TCC	2	6	112192	112197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017361	ATA	2	6	112201	112206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017361	AAT	2	6	112216	112221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017361	TAG	2	6	112265	112270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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