MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica7 chromosome

Total Repeats: 14852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017361	TGA	3	9	121	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221505
2	NC_017361	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221505
3	NC_017361	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221505
4	NC_017361	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221505
5	NC_017361	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221506
6	NC_017361	TGT	2	6	536	541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221506
7	NC_017361	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221506
8	NC_017361	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221507
9	NC_017361	TCA	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221507
10	NC_017361	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385221507
11	NC_017361	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385221507
12	NC_017361	TAA	2	6	1358	1363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221507
13	NC_017361	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221508
14	NC_017361	TAT	2	6	1822	1827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221508
15	NC_017361	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221508
16	NC_017361	GCT	2	6	1957	1962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385221508
17	NC_017361	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221508
18	NC_017361	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221508
19	NC_017361	TCA	3	9	2051	2059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221508
20	NC_017361	ATA	2	6	2105	2110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221508
21	NC_017361	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385221508
22	NC_017361	GGA	2	6	2538	2543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385221509
23	NC_017361	TGC	2	6	2724	2729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385221509
24	NC_017361	AGC	2	6	2776	2781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385221509
25	NC_017361	GTG	2	6	2965	2970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221509
26	NC_017361	AGA	2	6	3063	3068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221509
27	NC_017361	GTG	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221509
28	NC_017361	GCC	2	6	3131	3136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385221509
29	NC_017361	TGC	2	6	3215	3220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385221510
30	NC_017361	GTT	2	6	3596	3601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221510
31	NC_017361	ATC	2	6	3660	3665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221510
32	NC_017361	ATT	2	6	3904	3909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221510
33	NC_017361	TGT	2	6	3915	3920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221510
34	NC_017361	GGC	2	6	3977	3982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385221510
35	NC_017361	TGG	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221511
36	NC_017361	TGA	2	6	5632	5637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221511
37	NC_017361	CTT	2	6	5757	5762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221511
38	NC_017361	GTT	2	6	5819	5824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221511
39	NC_017361	TAA	2	6	5888	5893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221511
40	NC_017361	TTA	2	6	5946	5951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221511
41	NC_017361	GTG	2	6	6015	6020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221511
42	NC_017361	TGT	2	6	6136	6141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221511
43	NC_017361	CAG	2	6	6367	6372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385221511
44	NC_017361	GCG	2	6	6394	6399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385221511
45	NC_017361	CGA	2	6	6445	6450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385221511
46	NC_017361	TGT	2	6	6679	6684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221511
47	NC_017361	CTA	2	6	6687	6692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221511
48	NC_017361	CCG	2	6	6744	6749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385221511
49	NC_017361	CAG	2	6	6757	6762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385221511
50	NC_017361	CCG	2	6	7057	7062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385221511
51	NC_017361	GTT	2	6	7202	7207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221511
52	NC_017361	GAT	2	6	7737	7742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221512
53	NC_017361	CAT	2	6	7763	7768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221513
54	NC_017361	GCC	2	6	7769	7774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385221513
55	NC_017361	TCT	2	6	7830	7835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221513
56	NC_017361	AAT	2	6	7928	7933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221513
57	NC_017361	CTT	2	6	7936	7941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221513
58	NC_017361	CAT	2	6	8026	8031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221513
59	NC_017361	ATG	2	6	8079	8084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221513
60	NC_017361	TCA	2	6	8103	8108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221513
61	NC_017361	CCG	2	6	8157	8162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385221513
62	NC_017361	CTT	2	6	8176	8181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221513
63	NC_017361	CCG	2	6	8185	8190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385221513
64	NC_017361	CAT	2	6	8380	8385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221513
65	NC_017361	GTG	2	6	8412	8417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221513
66	NC_017361	TTC	2	6	8492	8497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221513
67	NC_017361	TGA	2	6	8500	8505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221513
68	NC_017361	CCG	2	6	8511	8516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385221513
69	NC_017361	CAC	2	6	8612	8617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385221513
70	NC_017361	GAT	2	6	8654	8659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221513
71	NC_017361	ACA	2	6	8835	8840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221513
72	NC_017361	CTT	2	6	8866	8871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221513
73	NC_017361	TCT	2	6	8976	8981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221513
74	NC_017361	CTT	2	6	9097	9102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221513
75	NC_017361	GGT	2	6	9131	9136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221513
76	NC_017361	GCA	2	6	9150	9155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385221513
77	NC_017361	CTT	2	6	9175	9180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221513
78	NC_017361	TCT	2	6	9531	9536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221514
79	NC_017361	GAT	3	9	9701	9709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221514
80	NC_017361	TCT	2	6	9729	9734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221514
81	NC_017361	CTA	2	6	9745	9750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221514
82	NC_017361	TTG	2	6	10176	10181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221515
83	NC_017361	GAA	2	6	10192	10197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221515
84	NC_017361	TTA	2	6	10371	10376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221515
85	NC_017361	AGA	2	6	10386	10391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221515
86	NC_017361	ACC	2	6	10394	10399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385221515
87	NC_017361	AAG	2	6	10427	10432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221515
88	NC_017361	ATT	2	6	10460	10465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221515
89	NC_017361	CAT	2	6	10641	10646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221515
90	NC_017361	GTG	2	6	10675	10680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221515
91	NC_017361	AGC	2	6	10710	10715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385221515
92	NC_017361	ATG	2	6	10955	10960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221515
93	NC_017361	GCG	2	6	10981	10986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385221515
94	NC_017361	AAC	2	6	11047	11052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221515
95	NC_017361	TAA	2	6	11076	11081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221515
96	NC_017361	TTG	2	6	11446	11451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221515
97	NC_017361	GAC	2	6	11533	11538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385221515
98	NC_017361	TTA	3	9	11554	11562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221515
99	NC_017361	TTG	2	6	11611	11616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221515
100	NC_017361	CAT	2	6	11712	11717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221515
101	NC_017361	TGT	2	6	11965	11970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221516
102	NC_017361	TTG	2	6	12240	12245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221516
103	NC_017361	TTG	2	6	12301	12306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221516
104	NC_017361	TAT	2	6	12384	12389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221516
105	NC_017361	TAA	2	6	12434	12439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221516
106	NC_017361	TGG	3	9	12535	12543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221516
107	NC_017361	GAA	3	9	12552	12560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221516
108	NC_017361	TGG	2	6	12634	12639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221516
109	NC_017361	AAG	2	6	12655	12660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221516
110	NC_017361	TTA	2	6	12968	12973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221517
111	NC_017361	GAA	2	6	12985	12990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221517
112	NC_017361	GTT	2	6	13052	13057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221517
113	NC_017361	TAA	2	6	13062	13067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221517
114	NC_017361	ATT	2	6	13075	13080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221517
115	NC_017361	TAA	2	6	13323	13328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221517
116	NC_017361	AAT	2	6	13357	13362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221517
117	NC_017361	ACC	2	6	13451	13456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385221517
118	NC_017361	GGT	2	6	13593	13598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221517
119	NC_017361	TTG	2	6	13601	13606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221517
120	NC_017361	AGA	2	6	13653	13658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221517
121	NC_017361	AGT	2	6	13715	13720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221517
122	NC_017361	GTG	2	6	14078	14083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221518
123	NC_017361	GAA	2	6	14169	14174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221519
124	NC_017361	ATT	2	6	14356	14361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221519
125	NC_017361	ATT	2	6	14454	14459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221520
126	NC_017361	GAA	2	6	14495	14500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221520
127	NC_017361	ATG	2	6	14520	14525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221520
128	NC_017361	TCC	2	6	14565	14570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385221520
129	NC_017361	TGG	2	6	14676	14681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221520
130	NC_017361	AAG	2	6	14766	14771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221520
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255	NC_017361	ATG	2	6	30299	30304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221531
256	NC_017361	TCT	2	6	30351	30356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221531
257	NC_017361	CAT	2	6	30484	30489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221531
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259	NC_017361	TGT	2	6	31104	31109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221532
260	NC_017361	TTG	2	6	31127	31132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221532
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