MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori 35A chromosome

Total Repeats: 769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017360	AGCGGG	2	12	2202	2213	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384895184
2	NC_017360	TGAAGC	2	12	3990	4001	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384895185
3	NC_017360	AAATAG	2	12	5288	5299	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384895187
4	NC_017360	AAATGC	2	12	11864	11875	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384895192
5	NC_017360	GTTTTA	2	12	12399	12410	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017360	TAAAAA	2	12	13225	13236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017360	TGATGG	2	12	13512	13523	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384895195
8	NC_017360	GTGCAA	2	12	14906	14917	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384895197
9	NC_017360	CATCGC	2	12	15097	15108	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384895197
10	NC_017360	CATGGG	2	12	17294	17305	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384895198
11	NC_017360	GCATTA	2	12	20059	20070	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384895203
12	NC_017360	AGACCC	2	12	20970	20981	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384895203
13	NC_017360	TCGCAT	2	12	24896	24907	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384895208
14	NC_017360	TTTTAA	2	12	25574	25585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895209
15	NC_017360	TTTGAG	2	12	26673	26684	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017360	GGCACA	2	12	30318	30329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384895213
17	NC_017360	AGCGGG	2	12	31579	31590	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384895215
18	NC_017360	AATTAG	2	12	32223	32234	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384895217
19	NC_017360	AAAGAA	2	12	33279	33290	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384895219
20	NC_017360	AATTGA	2	12	34193	34204	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384895221
21	NC_017360	CAAAAA	2	12	36999	37010	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384895223
22	NC_017360	ACCCAA	3	18	38112	38129	50 %	0 %	0 %	50 %	384895224
23	NC_017360	CTATAG	2	12	38967	38978	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384895224
24	NC_017360	TAGGGT	2	12	39029	39040	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384895224
25	NC_017360	ATTCTT	2	12	40933	40944	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384895227
26	NC_017360	CGCAAC	2	12	42986	42997	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384895230
27	NC_017360	CTTATC	2	12	44882	44893	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384895233
28	NC_017360	GCCTAT	2	12	48683	48694	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384895234
29	NC_017360	TTTTCT	2	12	50681	50692	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384895236
30	NC_017360	ATCGCA	2	12	52832	52843	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384895239
31	NC_017360	TTGTAA	2	12	53236	53247	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384895239
32	NC_017360	AATCCC	2	12	53739	53750	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384895239
33	NC_017360	GTCTTT	2	12	57413	57424	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384895243
34	NC_017360	TTTTAG	2	12	59044	59055	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384895243
35	NC_017360	CAATTT	2	12	59646	59657	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017360	TGAAAT	2	12	60085	60096	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017360	TAAAAA	2	12	63574	63585	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384895245
38	NC_017360	AGTCTT	2	12	67386	67397	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384895249
39	NC_017360	CCCGCT	2	12	67405	67416	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384895249
40	NC_017360	TCAAAA	2	12	67566	67577	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384895250
41	NC_017360	GATAAT	2	12	69343	69354	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384895250
42	NC_017360	ATTTTC	2	12	70625	70636	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384895251
43	NC_017360	AATAAG	2	12	72514	72525	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384895254
44	NC_017360	CAAAAA	2	12	72971	72982	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384895254
45	NC_017360	CATCAA	2	12	80239	80250	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384895261
46	NC_017360	AGAGCG	2	12	81918	81929	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384895262
47	NC_017360	TTGGAT	2	12	86194	86205	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384895268
48	NC_017360	AGCGTC	2	12	89267	89278	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384895271
49	NC_017360	TCTAAT	2	12	91123	91134	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384895273
50	NC_017360	TTCTAA	2	12	92811	92822	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384895273
51	NC_017360	CTAGGG	2	12	94712	94723	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384895275
52	NC_017360	CGCTCA	2	12	96542	96553	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384895277
53	NC_017360	TCGCTA	2	12	99079	99090	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384895279
54	NC_017360	TTATTT	2	12	99364	99375	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384895279
55	NC_017360	GAAGTG	2	12	100632	100643	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384895282
56	NC_017360	AAGCGG	2	12	100756	100767	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384895282
57	NC_017360	GCGAGC	2	12	103158	103169	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384895283
58	NC_017360	AAGAAA	2	12	103411	103422	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384895283
59	NC_017360	ATTGAG	2	12	104802	104813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895284
60	NC_017360	TAAAGA	2	12	104996	105007	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384895284
61	NC_017360	TCTTTT	2	12	105954	105965	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384895285
62	NC_017360	GTCTTT	2	12	108488	108499	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384895285
63	NC_017360	TTTTGG	2	12	109138	109149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384895285
64	NC_017360	TTGATT	2	12	110688	110699	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384895286
65	NC_017360	AAACCC	2	12	110889	110900	50 %	0 %	0 %	50 %	384895286
66	NC_017360	CAAAAT	2	12	111070	111081	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384895286
67	NC_017360	TTTTTC	2	12	111278	111289	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384895286
68	NC_017360	ATTAAA	2	12	113429	113440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895288
69	NC_017360	ATTCAA	2	12	118741	118752	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384895293
70	NC_017360	TGAAAT	2	12	122317	122328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384895296
71	NC_017360	GCATGG	2	12	123868	123879	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384895297
72	NC_017360	TTTTGT	2	12	127860	127871	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384895301
73	NC_017360	ATCAGC	2	12	128995	129006	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384895301
74	NC_017360	TCTTTA	2	12	136006	136017	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017360	TCGCTC	2	12	137089	137100	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384895305
76	NC_017360	ACTGAT	2	12	137820	137831	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384895306
77	NC_017360	TGACAA	2	12	138074	138085	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384895306
78	NC_017360	CAATGC	2	12	138476	138487	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384895306
79	NC_017360	AATAAA	2	12	138580	138591	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384895306
80	NC_017360	CCACGG	2	12	138674	138685	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384895306
81	NC_017360	CCTAAA	2	12	141836	141847	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017360	CCAAAA	2	12	144439	144450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895311
83	NC_017360	GAAATT	2	12	146323	146334	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384895312
84	NC_017360	TTTAAA	2	12	154050	154061	50 %	50 %	0 %	0 %	384895324
85	NC_017360	CAGCGA	2	12	156017	156028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384895326
86	NC_017360	TGTCTT	2	12	156643	156654	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017360	GAAAAA	3	18	156994	157011	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384895327
88	NC_017360	AAAGAC	2	12	158980	158991	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384895327
89	NC_017360	AAAGCA	2	12	159011	159022	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384895327
90	NC_017360	GTTTGC	2	12	160598	160609	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384895328
91	NC_017360	AGATGA	2	12	161591	161602	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384895330
92	NC_017360	TTTTCT	2	12	164565	164576	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384895333
93	NC_017360	AAAGAG	2	12	165112	165123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384895333
94	NC_017360	GCTCAT	2	12	168712	168723	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384895336
95	NC_017360	GCGAGC	2	12	169798	169809	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384895337
96	NC_017360	AGTGGA	2	12	170919	170930	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384895339
97	NC_017360	TGAGCG	2	12	173162	173173	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384895339
98	NC_017360	CATCAC	2	12	173397	173408	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384895339
99	NC_017360	ACGATA	2	12	173453	173464	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384895339
100	NC_017360	TCTTTT	2	12	174957	174968	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384895341
101	NC_017360	ATGGAG	2	12	177153	177164	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384895345
102	NC_017360	GTTAGC	2	12	181279	181290	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384895349
103	NC_017360	AAATCC	2	12	181679	181690	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384895350
104	NC_017360	GGGCTT	2	12	182814	182825	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384895351
105	NC_017360	TTGACT	2	12	184095	184106	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384895352
106	NC_017360	GGTTAT	2	12	187492	187503	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384895355
107	NC_017360	TAAAAA	2	12	188203	188214	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384895356
108	NC_017360	TAAAAA	2	12	192288	192299	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384895362
109	NC_017360	TGACGC	2	12	194102	194113	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384895364
110	NC_017360	ATCACC	2	12	195847	195858	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384895367
111	NC_017360	TAATGA	2	12	197366	197377	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384895370
112	NC_017360	TGCAAA	2	12	197509	197520	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384895370
113	NC_017360	ATTATA	2	12	206388	206399	50 %	50 %	0 %	0 %	384895379
114	NC_017360	AAAAAG	2	12	209734	209745	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017360	GTCGTG	2	12	211242	211253	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384895382
116	NC_017360	GAAACC	2	12	212379	212390	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384895383
117	NC_017360	AAACAC	2	12	222962	222973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017360	AGAAAA	2	12	223312	223323	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384895392
119	NC_017360	GATAAA	2	12	226868	226879	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384895395
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235	NC_017360	GGTGAT	2	12	459453	459464	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384895608
236	NC_017360	TCAATA	2	12	459872	459883	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384895609
237	NC_017360	CACGCC	2	12	460352	460363	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384895609
238	NC_017360	CTTTGA	2	12	461684	461695	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384895610
239	NC_017360	GCTAGG	2	12	463065	463076	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384895611
240	NC_017360	TCTTTA	2	12	469420	469431	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384895620
241	NC_017360	GTTTTT	2	12	475057	475068	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384895627
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243	NC_017360	ATTGTC	2	12	478217	478228	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384895630
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246	NC_017360	TGAGCG	2	12	489071	489082	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384895639
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259	NC_017360	CTACAA	2	12	518684	518695	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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283	NC_017360	AAATTC	2	12	563906	563917	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384895719
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