MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori 35A chromosome

Total Repeats: 1039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017360	TGTAA	2	10	941	950	40 %	40 %	20 %	0 %	384895180
2	NC_017360	TCTTT	2	10	2260	2269	0 %	80 %	0 %	20 %	384895184
3	NC_017360	AAAAT	2	10	5495	5504	80 %	20 %	0 %	0 %	384895187
4	NC_017360	TTTTA	2	10	5733	5742	20 %	80 %	0 %	0 %	384895187
5	NC_017360	TCATT	2	10	6914	6923	20 %	60 %	0 %	20 %	384895189
6	NC_017360	CATTT	2	10	7219	7228	20 %	60 %	0 %	20 %	384895190
7	NC_017360	TGATT	2	10	8970	8979	20 %	60 %	20 %	0 %	384895191
8	NC_017360	TCAAA	2	10	9660	9669	60 %	20 %	0 %	20 %	384895192
9	NC_017360	CTGTT	2	10	10087	10096	0 %	60 %	20 %	20 %	384895192
10	NC_017360	ATCGC	2	10	12211	12220	20 %	20 %	20 %	40 %	384895193
11	NC_017360	TTTGG	2	10	12524	12533	0 %	60 %	40 %	0 %	384895194
12	NC_017360	CTTGC	2	10	20007	20016	0 %	40 %	20 %	40 %	384895203
13	NC_017360	TCCTT	2	10	21432	21441	0 %	60 %	0 %	40 %	384895203
14	NC_017360	GTTTT	2	10	22339	22348	0 %	80 %	20 %	0 %	384895204
15	NC_017360	CCTTC	2	10	23419	23428	0 %	40 %	0 %	60 %	384895205
16	NC_017360	GGGCG	2	10	23945	23954	0 %	0 %	80 %	20 %	384895205
17	NC_017360	AAAGG	2	10	25653	25662	60 %	0 %	40 %	0 %	384895209
18	NC_017360	AAAAT	2	10	25676	25685	80 %	20 %	0 %	0 %	384895209
19	NC_017360	CTTTG	2	10	26930	26939	0 %	60 %	20 %	20 %	384895211
20	NC_017360	TCTTT	2	10	29249	29258	0 %	80 %	0 %	20 %	384895212
21	NC_017360	TGAAG	2	10	31718	31727	40 %	20 %	40 %	0 %	384895216
22	NC_017360	GAAAC	2	10	33383	33392	60 %	0 %	20 %	20 %	384895219
23	NC_017360	ACCAA	2	10	34046	34055	60 %	0 %	0 %	40 %	384895221
24	NC_017360	TATTT	2	10	35334	35343	20 %	80 %	0 %	0 %	384895221
25	NC_017360	CAAAA	2	10	35574	35583	80 %	0 %	0 %	20 %	384895221
26	NC_017360	ATCTT	2	10	37409	37418	20 %	60 %	0 %	20 %	384895223
27	NC_017360	TTGCC	2	10	40859	40868	0 %	40 %	20 %	40 %	384895227
28	NC_017360	TTTGA	2	10	41056	41065	20 %	60 %	20 %	0 %	384895227
29	NC_017360	TTTTC	2	10	45841	45850	0 %	80 %	0 %	20 %	384895233
30	NC_017360	TGGGA	2	10	48978	48987	20 %	20 %	60 %	0 %	384895234
31	NC_017360	GTTTT	2	10	50570	50579	0 %	80 %	20 %	0 %	384895236
32	NC_017360	ATAAA	2	10	51839	51848	80 %	20 %	0 %	0 %	384895237
33	NC_017360	TTGAA	2	10	51934	51943	40 %	40 %	20 %	0 %	384895238
34	NC_017360	CTTCA	2	10	52649	52658	20 %	40 %	0 %	40 %	384895238
35	NC_017360	TAAAA	2	10	53161	53170	80 %	20 %	0 %	0 %	384895239
36	NC_017360	TGATA	2	10	53328	53337	40 %	40 %	20 %	0 %	384895239
37	NC_017360	AATAA	3	15	53383	53397	80 %	20 %	0 %	0 %	384895239
38	NC_017360	GATTG	2	10	54197	54206	20 %	40 %	40 %	0 %	384895240
39	NC_017360	GATTT	2	10	62907	62916	20 %	60 %	20 %	0 %	384895244
40	NC_017360	TGATT	2	10	64881	64890	20 %	60 %	20 %	0 %	384895248
41	NC_017360	TTTGA	2	10	66537	66546	20 %	60 %	20 %	0 %	384895249
42	NC_017360	TAATG	2	10	66899	66908	40 %	40 %	20 %	0 %	384895249
43	NC_017360	TTTGA	2	10	67080	67089	20 %	60 %	20 %	0 %	384895249
44	NC_017360	AATCC	2	10	71956	71965	40 %	20 %	0 %	40 %	384895252
45	NC_017360	GCGTT	2	10	74856	74865	0 %	40 %	40 %	20 %	384895257
46	NC_017360	GCCTT	2	10	75317	75326	0 %	40 %	20 %	40 %	384895258
47	NC_017360	TAAAA	2	10	75705	75714	80 %	20 %	0 %	0 %	384895258
48	NC_017360	CTTGT	2	10	76366	76375	0 %	60 %	20 %	20 %	384895258
49	NC_017360	AACAA	2	10	76400	76409	80 %	0 %	0 %	20 %	384895258
50	NC_017360	CCCTA	2	10	76446	76455	20 %	20 %	0 %	60 %	384895259
51	NC_017360	CGCCA	2	10	76971	76980	20 %	0 %	20 %	60 %	384895259
52	NC_017360	ATAAA	2	10	77432	77441	80 %	20 %	0 %	0 %	384895260
53	NC_017360	TTGTT	2	10	77850	77859	0 %	80 %	20 %	0 %	384895260
54	NC_017360	CAAGC	2	10	80470	80479	40 %	0 %	20 %	40 %	384895262
55	NC_017360	CGCCC	2	10	81737	81746	0 %	0 %	20 %	80 %	384895262
56	NC_017360	TTTTA	2	10	86712	86721	20 %	80 %	0 %	0 %	384895269
57	NC_017360	ATTAT	2	10	88114	88123	40 %	60 %	0 %	0 %	384895270
58	NC_017360	CATTT	2	10	93016	93025	20 %	60 %	0 %	20 %	384895273
59	NC_017360	TTGTA	2	10	97371	97380	20 %	60 %	20 %	0 %	384895278
60	NC_017360	TTTGA	2	10	97503	97512	20 %	60 %	20 %	0 %	384895278
61	NC_017360	TATTT	2	10	98759	98768	20 %	80 %	0 %	0 %	384895279
62	NC_017360	GGTAA	2	10	100356	100365	40 %	20 %	40 %	0 %	384895282
63	NC_017360	GAAAG	2	10	100413	100422	60 %	0 %	40 %	0 %	384895282
64	NC_017360	ATGAC	2	10	101521	101530	40 %	20 %	20 %	20 %	384895282
65	NC_017360	CTGGA	2	10	101719	101728	20 %	20 %	40 %	20 %	384895282
66	NC_017360	CCCAT	2	10	103252	103261	20 %	20 %	0 %	60 %	384895283
67	NC_017360	TTGAC	2	10	110551	110560	20 %	40 %	20 %	20 %	384895286
68	NC_017360	ATAAA	2	10	113881	113890	80 %	20 %	0 %	0 %	384895288
69	NC_017360	TCCCC	2	10	113968	113977	0 %	20 %	0 %	80 %	384895288
70	NC_017360	AATGA	2	10	116076	116085	60 %	20 %	20 %	0 %	384895289
71	NC_017360	TGATC	2	10	116803	116812	20 %	40 %	20 %	20 %	384895290
72	NC_017360	TTATT	2	10	119451	119460	20 %	80 %	0 %	0 %	384895293
73	NC_017360	TTGAA	2	10	120173	120182	40 %	40 %	20 %	0 %	384895294
74	NC_017360	CAAGC	2	10	122743	122752	40 %	0 %	20 %	40 %	384895297
75	NC_017360	CAAGC	2	10	124362	124371	40 %	0 %	20 %	40 %	384895298
76	NC_017360	AACAT	2	10	124734	124743	60 %	20 %	0 %	20 %	384895298
77	NC_017360	TCTTT	2	10	125449	125458	0 %	80 %	0 %	20 %	384895299
78	NC_017360	AAATA	2	10	125529	125538	80 %	20 %	0 %	0 %	384895299
79	NC_017360	ATAAA	2	10	126053	126062	80 %	20 %	0 %	0 %	384895299
80	NC_017360	TTTTG	2	10	126209	126218	0 %	80 %	20 %	0 %	384895299
81	NC_017360	AGAAA	2	10	132442	132451	80 %	0 %	20 %	0 %	384895302
82	NC_017360	AATAG	2	10	138816	138825	60 %	20 %	20 %	0 %	384895306
83	NC_017360	TTGAA	2	10	143436	143445	40 %	40 %	20 %	0 %	384895310
84	NC_017360	CAAAA	2	10	143477	143486	80 %	0 %	0 %	20 %	384895310
85	NC_017360	AACGC	2	10	143758	143767	40 %	0 %	20 %	40 %	384895310
86	NC_017360	GTGGG	2	10	144114	144123	0 %	20 %	80 %	0 %	384895311
87	NC_017360	ATTTT	2	10	145889	145898	20 %	80 %	0 %	0 %	384895312
88	NC_017360	GGGTA	2	10	147190	147199	20 %	20 %	60 %	0 %	384895313
89	NC_017360	GTGTT	2	10	147393	147402	0 %	60 %	40 %	0 %	384895314
90	NC_017360	GCAAT	2	10	148152	148161	40 %	20 %	20 %	20 %	384895315
91	NC_017360	AAGGC	2	10	151142	151151	40 %	0 %	40 %	20 %	384895319
92	NC_017360	TAGAA	2	10	152542	152551	60 %	20 %	20 %	0 %	384895321
93	NC_017360	CTTGC	2	10	154936	154945	0 %	40 %	20 %	40 %	384895325
94	NC_017360	TCAAT	2	10	154998	155007	40 %	40 %	0 %	20 %	384895325
95	NC_017360	CTTTT	2	10	156111	156120	0 %	80 %	0 %	20 %	384895326
96	NC_017360	CTTTT	2	10	156138	156147	0 %	80 %	0 %	20 %	384895326
97	NC_017360	GGGCT	2	10	160786	160795	0 %	20 %	60 %	20 %	384895328
98	NC_017360	TTTGG	2	10	161772	161781	0 %	60 %	40 %	0 %	384895330
99	NC_017360	TTTGG	2	10	162862	162871	0 %	60 %	40 %	0 %	384895330
100	NC_017360	AGAGA	2	10	163536	163545	60 %	0 %	40 %	0 %	384895331
101	NC_017360	GGGTC	2	10	163889	163898	0 %	20 %	60 %	20 %	384895332
102	NC_017360	ATCCA	2	10	165693	165702	40 %	20 %	0 %	40 %	384895333
103	NC_017360	GAATG	2	10	166056	166065	40 %	20 %	40 %	0 %	384895333
104	NC_017360	CTTGA	2	10	169762	169771	20 %	40 %	20 %	20 %	384895337
105	NC_017360	AAGAA	2	10	170492	170501	80 %	0 %	20 %	0 %	384895338
106	NC_017360	TGGCG	2	10	175132	175141	0 %	20 %	60 %	20 %	384895341
107	NC_017360	TGGTA	2	10	177267	177276	20 %	40 %	40 %	0 %	384895345
108	NC_017360	TTGTT	2	10	177833	177842	0 %	80 %	20 %	0 %	384895345
109	NC_017360	AAAAG	2	10	182417	182426	80 %	0 %	20 %	0 %	384895351
110	NC_017360	TGGGG	2	10	182492	182501	0 %	20 %	80 %	0 %	384895351
111	NC_017360	TCAAA	2	10	183238	183247	60 %	20 %	0 %	20 %	384895352
112	NC_017360	CTTTT	2	10	184553	184562	0 %	80 %	0 %	20 %	384895353
113	NC_017360	CCTTG	2	10	187237	187246	0 %	40 %	20 %	40 %	384895355
114	NC_017360	TTTTG	2	10	189317	189326	0 %	80 %	20 %	0 %	384895358
115	NC_017360	AGCGT	2	10	193695	193704	20 %	20 %	40 %	20 %	384895364
116	NC_017360	CTGTT	2	10	196456	196465	0 %	60 %	20 %	20 %	384895368
117	NC_017360	GTGAA	2	10	196782	196791	40 %	20 %	40 %	0 %	384895369
118	NC_017360	TAAAA	2	10	197412	197421	80 %	20 %	0 %	0 %	384895370
119	NC_017360	AAGGC	2	10	202739	202748	40 %	0 %	40 %	20 %	384895374
120	NC_017360	TAAAA	2	10	206194	206203	80 %	20 %	0 %	0 %	384895378
121	NC_017360	ATTAA	2	10	207517	207526	60 %	40 %	0 %	0 %	384895380
122	NC_017360	TTTCT	2	10	213043	213052	0 %	80 %	0 %	20 %	384895383
123	NC_017360	GCTTA	2	10	214964	214973	20 %	40 %	20 %	20 %	384895385
124	NC_017360	TTGAA	2	10	216543	216552	40 %	40 %	20 %	0 %	384895386
125	NC_017360	TTTTG	2	10	216559	216568	0 %	80 %	20 %	0 %	384895386
126	NC_017360	TGGTG	2	10	217396	217405	0 %	40 %	60 %	0 %	384895387
127	NC_017360	CAAAA	2	10	223277	223286	80 %	0 %	0 %	20 %	384895392
128	NC_017360	TGAAA	2	10	225621	225630	60 %	20 %	20 %	0 %	384895394
129	NC_017360	CCATG	2	10	227852	227861	20 %	20 %	20 %	40 %	384895397
130	NC_017360	CTCTT	2	10	227882	227891	0 %	60 %	0 %	40 %	384895397
131	NC_017360	TTTAC	2	10	230719	230728	20 %	60 %	0 %	20 %	384895400
132	NC_017360	ATTTT	2	10	232175	232184	20 %	80 %	0 %	0 %	384895401
133	NC_017360	GATTT	2	10	233417	233426	20 %	60 %	20 %	0 %	384895401
134	NC_017360	ATTTG	2	10	234265	234274	20 %	60 %	20 %	0 %	384895402
135	NC_017360	TTTTA	2	10	236952	236961	20 %	80 %	0 %	0 %	384895407
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