MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 35A chromosome

Total Repeats: 574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017360	TGAA	2	8	131	138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017360	TTGA	2	8	13272	13279	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017360	TAAT	2	8	13679	13686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017360	GGAA	2	8	13694	13701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017360	CTTT	2	8	19294	19301	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017360	AAAG	2	8	19575	19582	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017360	TTGG	2	8	19597	19604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017360	GCTT	2	8	19843	19850	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017360	TCAA	2	8	26314	26321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017360	AAAT	2	8	26660	26667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017360	TAAA	2	8	27089	27096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017360	AAGA	2	8	27097	27104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017360	CATC	2	8	27917	27924	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017360	ACCT	2	8	28071	28078	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017360	CTGA	2	8	28142	28149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017360	AGAA	2	8	28842	28849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017360	ATCA	2	8	28908	28915	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017360	CAAT	2	8	28923	28930	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017360	ACCA	2	8	33042	33049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017360	AGAC	2	8	40428	40435	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017360	CAAG	2	8	40825	40832	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017360	TTAA	2	8	43490	43497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017360	AACA	2	8	43510	43517	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017360	AAAG	2	8	43556	43563	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017360	TACC	2	8	48467	48474	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017360	ATGG	2	8	55690	55697	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017360	TCAA	2	8	59283	59290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017360	GTTT	2	8	59432	59439	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017360	CAAA	2	8	59886	59893	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017360	AATC	2	8	60583	60590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017360	CCAG	2	8	61529	61536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017360	TAAA	2	8	61902	61909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017360	CTTT	2	8	61912	61919	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017360	AAAG	2	8	62008	62015	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017360	GTTT	2	8	62312	62319	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017360	ATGG	2	8	62566	62573	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017360	TATT	2	8	88607	88614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017360	ATAA	2	8	88663	88670	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017360	GAAA	2	8	88673	88680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017360	CAAA	2	8	90129	90136	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017360	TAAA	2	8	100251	100258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017360	AAAT	2	8	104316	104323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017360	TAAA	2	8	109708	109715	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017360	TGAA	2	8	120060	120067	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017360	TGAA	2	8	120135	120142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017360	TGAA	2	8	121559	121566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017360	TGAA	2	8	121581	121588	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017360	TGAA	2	8	121592	121599	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017360	GTTG	2	8	134419	134426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017360	CATT	2	8	134720	134727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017360	TAAC	2	8	135686	135693	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017360	CAAC	2	8	139035	139042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017360	AACA	2	8	139069	139076	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017360	AAAG	2	8	139122	139129	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017360	GAGT	2	8	139148	139155	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017360	GCAA	2	8	140914	140921	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017360	CAAG	2	8	140948	140955	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017360	TTCA	2	8	141035	141042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017360	AGTT	2	8	154634	154641	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017360	GATT	2	8	169268	169275	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017360	AAAG	2	8	170090	170097	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017360	CTTT	2	8	185092	185099	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017360	AATT	2	8	185157	185164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017360	TTTA	2	8	193454	193461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017360	TTTG	2	8	196132	196139	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017360	AAGC	2	8	201287	201294	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017360	CAAT	2	8	201392	201399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017360	GCAA	2	8	201613	201620	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017360	TACT	2	8	201859	201866	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017360	AATT	2	8	201906	201913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017360	CATT	2	8	201953	201960	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017360	CTTG	2	8	201986	201993	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017360	TTAC	2	8	202921	202928	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017360	ATGC	2	8	208867	208874	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017360	ACTA	2	8	209637	209644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017360	ATAA	2	8	214303	214310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017360	ATTC	2	8	214506	214513	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017360	TTAA	2	8	218320	218327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017360	AGTT	2	8	221266	221273	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017360	AATC	2	8	227370	227377	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017360	TGCT	2	8	243667	243674	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017360	ATAA	2	8	243806	243813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017360	TTTA	2	8	244472	244479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017360	CAAA	2	8	244681	244688	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017360	TTTG	2	8	244845	244852	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017360	AAAT	2	8	245144	245151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017360	TTGT	2	8	245356	245363	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017360	TTCG	2	8	245416	245423	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017360	AAGC	2	8	262637	262644	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017360	TAGA	2	8	265201	265208	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017360	TTTA	2	8	269266	269273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017360	TAAA	2	8	269302	269309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017360	TTCA	2	8	273505	273512	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017360	TTAA	2	8	275142	275149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017360	TTTA	2	8	280270	280277	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017360	ACTA	2	8	281228	281235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017360	CTAA	2	8	281250	281257	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017360	CTGA	2	8	281271	281278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017360	CTAA	2	8	281292	281299	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017360	GAGC	3	12	281841	281852	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017360	GAAA	2	8	282112	282119	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017360	ATTG	2	8	282378	282385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017360	GATG	2	8	282416	282423	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017360	CAAA	2	8	284012	284019	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017360	ATTG	2	8	284452	284459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017360	TTGC	2	8	285236	285243	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017360	TTTA	2	8	285436	285443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017360	AATC	2	8	285718	285725	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017360	CAAA	2	8	287219	287226	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017360	ACGC	2	8	287356	287363	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017360	TATT	2	8	293420	293427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017360	TAGA	2	8	295626	295633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017360	TTTA	2	8	297314	297321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017360	CATG	2	8	297458	297465	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017360	AAAC	2	8	298094	298101	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017360	ATCA	2	8	298298	298305	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017360	TTTA	2	8	298980	298987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017360	CCAA	2	8	298988	298995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017360	AAAG	2	8	299002	299009	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017360	TCTA	2	8	299053	299060	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017360	CTTT	2	8	299088	299095	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017360	GTTT	2	8	299150	299157	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017360	TTTC	2	8	304543	304550	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017360	TCAA	2	8	309671	309678	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017360	AAGA	2	8	309851	309858	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017360	ATGC	2	8	309901	309908	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017360	CTAT	2	8	310594	310601	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017360	GGGT	2	8	311494	311501	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017360	AGTT	2	8	311901	311908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017360	TTGT	2	8	312781	312788	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017360	TTGT	2	8	313620	313627	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017360	ACAG	2	8	314007	314014	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017360	TTAT	2	8	314327	314334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017360	AAAG	2	8	314805	314812	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017360	ACAA	2	8	315176	315183	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017360	TGAT	2	8	317275	317282	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017360	AATT	2	8	317388	317395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017360	TTCC	2	8	318450	318457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017360	CTTT	2	8	318510	318517	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017360	CTTT	2	8	319005	319012	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017360	CTAA	2	8	321910	321917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017360	TCAG	2	8	325892	325899	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017360	AATG	2	8	330440	330447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017360	TAAA	2	8	335142	335149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017360	ATTT	2	8	336675	336682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017360	AAAG	2	8	336685	336692	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017360	GCGG	2	8	338588	338595	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017360	GCTT	2	8	338612	338619	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017360	TTGG	2	8	341404	341411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017360	TGAA	2	8	351757	351764	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_017360	AGGG	2	8	357321	357328	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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