MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori 35A chromosome

Total Repeats: 3856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017360	AATA	2	8	1091	1098	75 %	25 %	0 %	0 %	384895180
2	NC_017360	AATA	2	8	1538	1545	75 %	25 %	0 %	0 %	384895182
3	NC_017360	ACTT	2	8	1557	1564	25 %	50 %	0 %	25 %	384895182
4	NC_017360	CTTT	2	8	1973	1980	0 %	75 %	0 %	25 %	384895183
5	NC_017360	ATCC	2	8	2613	2620	25 %	25 %	0 %	50 %	384895184
6	NC_017360	CCAC	2	8	2665	2672	25 %	0 %	0 %	75 %	384895184
7	NC_017360	AAAG	2	8	2883	2890	75 %	0 %	25 %	0 %	384895184
8	NC_017360	TTTA	2	8	2896	2903	25 %	75 %	0 %	0 %	384895184
9	NC_017360	CTTT	2	8	3601	3608	0 %	75 %	0 %	25 %	384895185
10	NC_017360	CATC	2	8	3693	3700	25 %	25 %	0 %	50 %	384895185
11	NC_017360	TATT	2	8	3864	3871	25 %	75 %	0 %	0 %	384895185
12	NC_017360	CAAC	2	8	3894	3901	50 %	0 %	0 %	50 %	384895185
13	NC_017360	TTAA	2	8	4221	4228	50 %	50 %	0 %	0 %	384895186
14	NC_017360	ATGC	2	8	4610	4617	25 %	25 %	25 %	25 %	384895186
15	NC_017360	TGTA	2	8	4660	4667	25 %	50 %	25 %	0 %	384895186
16	NC_017360	TGAT	2	8	5356	5363	25 %	50 %	25 %	0 %	384895187
17	NC_017360	AACA	2	8	5751	5758	75 %	0 %	0 %	25 %	384895187
18	NC_017360	AATT	2	8	5798	5805	50 %	50 %	0 %	0 %	384895187
19	NC_017360	TGCT	2	8	5819	5826	0 %	50 %	25 %	25 %	384895187
20	NC_017360	GATT	2	8	5980	5987	25 %	50 %	25 %	0 %	384895187
21	NC_017360	GCCT	2	8	6194	6201	0 %	25 %	25 %	50 %	384895188
22	NC_017360	CATT	2	8	6452	6459	25 %	50 %	0 %	25 %	384895188
23	NC_017360	TAAC	2	8	6461	6468	50 %	25 %	0 %	25 %	384895188
24	NC_017360	ACCC	2	8	7861	7868	25 %	0 %	0 %	75 %	384895190
25	NC_017360	CCCT	2	8	8064	8071	0 %	25 %	0 %	75 %	384895190
26	NC_017360	CTTG	2	8	8703	8710	0 %	50 %	25 %	25 %	384895191
27	NC_017360	TAAA	2	8	9856	9863	75 %	25 %	0 %	0 %	384895192
28	NC_017360	TGAA	2	8	10784	10791	50 %	25 %	25 %	0 %	384895192
29	NC_017360	ATAG	2	8	11293	11300	50 %	25 %	25 %	0 %	384895192
30	NC_017360	CGCA	2	8	11484	11491	25 %	0 %	25 %	50 %	384895192
31	NC_017360	ATTC	2	8	11637	11644	25 %	50 %	0 %	25 %	384895192
32	NC_017360	TTTA	2	8	11845	11852	25 %	75 %	0 %	0 %	384895192
33	NC_017360	ATTG	2	8	12059	12066	25 %	50 %	25 %	0 %	384895192
34	NC_017360	TTTG	2	8	12447	12454	0 %	75 %	25 %	0 %	384895194
35	NC_017360	CTTG	2	8	12498	12505	0 %	50 %	25 %	25 %	384895194
36	NC_017360	TTCA	2	8	14121	14128	25 %	50 %	0 %	25 %	384895196
37	NC_017360	TCGC	2	8	14446	14453	0 %	25 %	25 %	50 %	384895196
38	NC_017360	GCCC	2	8	15277	15284	0 %	0 %	25 %	75 %	384895197
39	NC_017360	CATG	2	8	15601	15608	25 %	25 %	25 %	25 %	384895197
40	NC_017360	TTGT	2	8	16083	16090	0 %	75 %	25 %	0 %	384895198
41	NC_017360	CGCT	2	8	16496	16503	0 %	25 %	25 %	50 %	384895198
42	NC_017360	ATCA	2	8	17412	17419	50 %	25 %	0 %	25 %	384895198
43	NC_017360	CGCT	2	8	17498	17505	0 %	25 %	25 %	50 %	384895198
44	NC_017360	TTTC	2	8	18227	18234	0 %	75 %	0 %	25 %	384895199
45	NC_017360	CAAA	2	8	18308	18315	75 %	0 %	0 %	25 %	384895199
46	NC_017360	CTAT	2	8	18601	18608	25 %	50 %	0 %	25 %	384895199
47	NC_017360	AATT	2	8	18678	18685	50 %	50 %	0 %	0 %	384895199
48	NC_017360	ATTG	2	8	19241	19248	25 %	50 %	25 %	0 %	384895200
49	NC_017360	GTTT	2	8	19703	19710	0 %	75 %	25 %	0 %	384895202
50	NC_017360	GTTT	2	8	20165	20172	0 %	75 %	25 %	0 %	384895203
51	NC_017360	TCTT	2	8	20256	20263	0 %	75 %	0 %	25 %	384895203
52	NC_017360	GTTG	2	8	20727	20734	0 %	50 %	50 %	0 %	384895203
53	NC_017360	CTGT	2	8	21553	21560	0 %	50 %	25 %	25 %	384895203
54	NC_017360	TTCA	2	8	22503	22510	25 %	50 %	0 %	25 %	384895204
55	NC_017360	TCAA	2	8	22948	22955	50 %	25 %	0 %	25 %	384895204
56	NC_017360	TGCT	2	8	23354	23361	0 %	50 %	25 %	25 %	384895205
57	NC_017360	TCGC	2	8	23694	23701	0 %	25 %	25 %	50 %	384895205
58	NC_017360	TCAA	2	8	23832	23839	50 %	25 %	0 %	25 %	384895205
59	NC_017360	CTTT	2	8	23964	23971	0 %	75 %	0 %	25 %	384895205
60	NC_017360	CAAT	2	8	23992	23999	50 %	25 %	0 %	25 %	384895205
61	NC_017360	TTTG	2	8	24474	24481	0 %	75 %	25 %	0 %	384895207
62	NC_017360	ATTG	2	8	24781	24788	25 %	50 %	25 %	0 %	384895208
63	NC_017360	CAAG	2	8	25038	25045	50 %	0 %	25 %	25 %	384895208
64	NC_017360	CAGA	2	8	25853	25860	50 %	0 %	25 %	25 %	384895210
65	NC_017360	AAAG	2	8	25864	25871	75 %	0 %	25 %	0 %	384895210
66	NC_017360	CGCT	2	8	25964	25971	0 %	25 %	25 %	50 %	384895210
67	NC_017360	CGTT	2	8	26206	26213	0 %	50 %	25 %	25 %	384895210
68	NC_017360	TTTG	2	8	26243	26250	0 %	75 %	25 %	0 %	384895210
69	NC_017360	AAGT	2	8	26957	26964	50 %	25 %	25 %	0 %	384895211
70	NC_017360	CCTC	2	8	29340	29347	0 %	25 %	0 %	75 %	384895212
71	NC_017360	GAAA	2	8	29386	29393	75 %	0 %	25 %	0 %	384895212
72	NC_017360	CTGT	2	8	29432	29439	0 %	50 %	25 %	25 %	384895212
73	NC_017360	AGCT	2	8	29657	29664	25 %	25 %	25 %	25 %	384895212
74	NC_017360	GCTC	2	8	30391	30398	0 %	25 %	25 %	50 %	384895213
75	NC_017360	ATAG	2	8	30674	30681	50 %	25 %	25 %	0 %	384895214
76	NC_017360	ATGC	2	8	30832	30839	25 %	25 %	25 %	25 %	384895214
77	NC_017360	GAAA	2	8	32095	32102	75 %	0 %	25 %	0 %	384895217
78	NC_017360	ACAG	2	8	32210	32217	50 %	0 %	25 %	25 %	384895217
79	NC_017360	GACT	2	8	32247	32254	25 %	25 %	25 %	25 %	384895217
80	NC_017360	TTTA	2	8	33337	33344	25 %	75 %	0 %	0 %	384895219
81	NC_017360	GCTT	2	8	33449	33456	0 %	50 %	25 %	25 %	384895219
82	NC_017360	TCTT	2	8	34005	34012	0 %	75 %	0 %	25 %	384895221
83	NC_017360	CAAA	2	8	34259	34266	75 %	0 %	0 %	25 %	384895221
84	NC_017360	CTTT	2	8	34945	34952	0 %	75 %	0 %	25 %	384895221
85	NC_017360	GTTT	2	8	34964	34971	0 %	75 %	25 %	0 %	384895221
86	NC_017360	GCAA	2	8	35414	35421	50 %	0 %	25 %	25 %	384895221
87	NC_017360	AAAG	2	8	35762	35769	75 %	0 %	25 %	0 %	384895222
88	NC_017360	GAAA	2	8	35812	35819	75 %	0 %	25 %	0 %	384895222
89	NC_017360	ATTG	2	8	36034	36041	25 %	50 %	25 %	0 %	384895222
90	NC_017360	AATG	2	8	36380	36387	50 %	25 %	25 %	0 %	384895222
91	NC_017360	ATTT	2	8	36567	36574	25 %	75 %	0 %	0 %	384895223
92	NC_017360	GCTT	2	8	36660	36667	0 %	50 %	25 %	25 %	384895223
93	NC_017360	AGCG	2	8	36752	36759	25 %	0 %	50 %	25 %	384895223
94	NC_017360	TGAT	2	8	36889	36896	25 %	50 %	25 %	0 %	384895223
95	NC_017360	TTGA	2	8	37173	37180	25 %	50 %	25 %	0 %	384895223
96	NC_017360	TTTG	2	8	37964	37971	0 %	75 %	25 %	0 %	384895224
97	NC_017360	TGTA	2	8	38261	38268	25 %	50 %	25 %	0 %	384895224
98	NC_017360	TGGG	2	8	40158	40165	0 %	25 %	75 %	0 %	384895224
99	NC_017360	GTTT	2	8	40370	40377	0 %	75 %	25 %	0 %	384895225
100	NC_017360	CAAA	2	8	40785	40792	75 %	0 %	0 %	25 %	384895226
101	NC_017360	TCGC	2	8	40991	40998	0 %	25 %	25 %	50 %	384895227
102	NC_017360	CTGT	2	8	41036	41043	0 %	50 %	25 %	25 %	384895227
103	NC_017360	GATT	2	8	41442	41449	25 %	50 %	25 %	0 %	384895227
104	NC_017360	GTTT	2	8	41662	41669	0 %	75 %	25 %	0 %	384895227
105	NC_017360	AGCA	2	8	42082	42089	50 %	0 %	25 %	25 %	384895228
106	NC_017360	CTCC	2	8	42944	42951	0 %	25 %	0 %	75 %	384895230
107	NC_017360	TCAA	2	8	43073	43080	50 %	25 %	0 %	25 %	384895230
108	NC_017360	ACCC	2	8	43234	43241	25 %	0 %	0 %	75 %	384895230
109	NC_017360	AACG	2	8	44144	44151	50 %	0 %	25 %	25 %	384895232
110	NC_017360	GCAT	2	8	44428	44435	25 %	25 %	25 %	25 %	384895232
111	NC_017360	TGAT	2	8	44710	44717	25 %	50 %	25 %	0 %	384895232
112	NC_017360	ATCA	2	8	45506	45513	50 %	25 %	0 %	25 %	384895233
113	NC_017360	CCAT	2	8	45543	45550	25 %	25 %	0 %	50 %	384895233
114	NC_017360	AATC	2	8	47572	47579	50 %	25 %	0 %	25 %	384895233
115	NC_017360	TAAA	2	8	47885	47892	75 %	25 %	0 %	0 %	384895233
116	NC_017360	AATC	2	8	48274	48281	50 %	25 %	0 %	25 %	384895233
117	NC_017360	AAAT	2	8	49829	49836	75 %	25 %	0 %	0 %	384895235
118	NC_017360	CATA	2	8	50003	50010	50 %	25 %	0 %	25 %	384895235
119	NC_017360	TCTT	2	8	52451	52458	0 %	75 %	0 %	25 %	384895238
120	NC_017360	CTAA	2	8	53606	53613	50 %	25 %	0 %	25 %	384895239
121	NC_017360	TGGA	2	8	54703	54710	25 %	25 %	50 %	0 %	384895241
122	NC_017360	TAAA	2	8	55038	55045	75 %	25 %	0 %	0 %	384895241
123	NC_017360	GAGC	2	8	55325	55332	25 %	0 %	50 %	25 %	384895241
124	NC_017360	TAAA	2	8	56160	56167	75 %	25 %	0 %	0 %	384895242
125	NC_017360	GCTC	2	8	56426	56433	0 %	25 %	25 %	50 %	384895242
126	NC_017360	ATTC	2	8	56599	56606	25 %	50 %	0 %	25 %	384895243
127	NC_017360	CGCT	2	8	56781	56788	0 %	25 %	25 %	50 %	384895243
128	NC_017360	AGCA	2	8	57779	57786	50 %	0 %	25 %	25 %	384895243
129	NC_017360	CAAA	2	8	58935	58942	75 %	0 %	0 %	25 %	384895243
130	NC_017360	TTTG	2	8	59014	59021	0 %	75 %	25 %	0 %	384895243
131	NC_017360	TCAT	2	8	62618	62625	25 %	50 %	0 %	25 %	384895244
132	NC_017360	AAAG	2	8	63162	63169	75 %	0 %	25 %	0 %	384895244
133	NC_017360	CACT	2	8	65043	65050	25 %	25 %	0 %	50 %	384895248
134	NC_017360	CAAA	2	8	65091	65098	75 %	0 %	0 %	25 %	384895248
135	NC_017360	CTTG	2	8	65657	65664	0 %	50 %	25 %	25 %	384895249
136	NC_017360	TTGA	2	8	65817	65824	25 %	50 %	25 %	0 %	384895249
137	NC_017360	GGTT	2	8	66086	66093	0 %	50 %	50 %	0 %	384895249
138	NC_017360	CCTC	2	8	66140	66147	0 %	25 %	0 %	75 %	384895249
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