MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori 35A chromosome

Total Repeats: 13969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017360	CAA	2	6	233	238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895179
2	NC_017360	GGA	2	6	239	244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384895179
3	NC_017360	AAC	2	6	277	282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895179
4	NC_017360	GTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384895180
5	NC_017360	TAA	2	6	550	555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895180
6	NC_017360	ACT	3	9	611	619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895180
7	NC_017360	AGG	2	6	675	680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384895180
8	NC_017360	TTA	3	9	798	806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895180
9	NC_017360	TAA	2	6	832	837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895180
10	NC_017360	GAG	2	6	974	979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384895180
11	NC_017360	GTT	2	6	1054	1059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384895180
12	NC_017360	TTA	2	6	1130	1135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895180
13	NC_017360	TGA	2	6	1180	1185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895180
14	NC_017360	AGG	2	6	1206	1211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384895180
15	NC_017360	ATT	2	6	1335	1340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895181
16	NC_017360	TAA	2	6	1483	1488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895182
17	NC_017360	TAA	2	6	1708	1713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895182
18	NC_017360	TGT	2	6	1719	1724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384895182
19	NC_017360	TTA	2	6	1865	1870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895183
20	NC_017360	AGA	2	6	1930	1935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384895183
21	NC_017360	CCA	2	6	1947	1952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384895183
22	NC_017360	TGA	2	6	2079	2084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895183
23	NC_017360	GAA	2	6	2099	2104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384895183
24	NC_017360	TCA	2	6	2161	2166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895183
25	NC_017360	TGA	2	6	2372	2377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895184
26	NC_017360	TCT	2	6	2430	2435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895184
27	NC_017360	AGC	2	6	2499	2504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384895184
28	NC_017360	ATT	2	6	2732	2737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895184
29	NC_017360	ACA	2	6	2770	2775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895184
30	NC_017360	AGA	2	6	2816	2821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384895184
31	NC_017360	AAC	2	6	2908	2913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895184
32	NC_017360	AGA	2	6	2930	2935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384895184
33	NC_017360	CAA	2	6	2999	3004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895184
34	NC_017360	GAT	2	6	3073	3078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895184
35	NC_017360	CCT	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384895185
36	NC_017360	AAC	2	6	3232	3237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895185
37	NC_017360	AGC	2	6	3299	3304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384895185
38	NC_017360	ATT	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895185
39	NC_017360	CAT	3	9	3915	3923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895185
40	NC_017360	TCA	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895185
41	NC_017360	CAA	2	6	4081	4086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895185
42	NC_017360	ATT	2	6	4130	4135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895185
43	NC_017360	AAT	2	6	4295	4300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895186
44	NC_017360	ATT	2	6	4505	4510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895186
45	NC_017360	AAT	2	6	4685	4690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895186
46	NC_017360	TTG	2	6	4701	4706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384895186
47	NC_017360	TAC	2	6	4760	4765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895186
48	NC_017360	CTT	2	6	4774	4779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895186
49	NC_017360	GTT	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384895186
50	NC_017360	AAG	2	6	4983	4988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384895186
51	NC_017360	CAT	2	6	5014	5019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895186
52	NC_017360	TGT	2	6	5052	5057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384895186
53	NC_017360	ATT	2	6	5163	5168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895186
54	NC_017360	ATA	2	6	5308	5313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895187
55	NC_017360	TAC	2	6	5433	5438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895187
56	NC_017360	CCA	2	6	5615	5620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384895187
57	NC_017360	CAT	3	9	5696	5704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895187
58	NC_017360	AAT	2	6	5715	5720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895187
59	NC_017360	TTC	2	6	5762	5767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895187
60	NC_017360	CTT	3	9	6020	6028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895188
61	NC_017360	CTT	2	6	6089	6094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895188
62	NC_017360	CTT	2	6	6290	6295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895188
63	NC_017360	AAC	2	6	6333	6338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895188
64	NC_017360	TGC	3	9	6350	6358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384895188
65	NC_017360	TTA	2	6	6397	6402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895188
66	NC_017360	AAT	2	6	6530	6535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895188
67	NC_017360	TAA	2	6	6615	6620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895188
68	NC_017360	GTT	2	6	6654	6659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384895188
69	NC_017360	GCT	2	6	6744	6749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384895188
70	NC_017360	ATG	2	6	6766	6771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895188
71	NC_017360	CAC	2	6	6963	6968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384895189
72	NC_017360	ATC	2	6	6997	7002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895189
73	NC_017360	TCT	2	6	7076	7081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895190
74	NC_017360	TCA	2	6	7169	7174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895190
75	NC_017360	CGG	2	6	7250	7255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384895190
76	NC_017360	TAA	2	6	7287	7292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895190
77	NC_017360	ATC	2	6	7426	7431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895190
78	NC_017360	TTC	2	6	7477	7482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895190
79	NC_017360	ACA	2	6	7620	7625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895190
80	NC_017360	ATC	2	6	7702	7707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895190
81	NC_017360	ACC	2	6	7718	7723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384895190
82	NC_017360	TCA	2	6	7952	7957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895190
83	NC_017360	CCA	4	12	8187	8198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384895190
84	NC_017360	CAC	2	6	8236	8241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384895190
85	NC_017360	ATT	2	6	8410	8415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895191
86	NC_017360	CAC	2	6	8776	8781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384895191
87	NC_017360	TCA	2	6	9059	9064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895191
88	NC_017360	ATC	2	6	9297	9302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895192
89	NC_017360	TTC	2	6	9466	9471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895192
90	NC_017360	CTT	2	6	9540	9545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895192
91	NC_017360	CTT	2	6	9720	9725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895192
92	NC_017360	ATT	2	6	9814	9819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895192
93	NC_017360	CAC	2	6	10162	10167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384895192
94	NC_017360	AGC	2	6	10187	10192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384895192
95	NC_017360	GTT	2	6	10291	10296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384895192
96	NC_017360	ACC	2	6	10329	10334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384895192
97	NC_017360	TCT	2	6	10400	10405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895192
98	NC_017360	TGC	2	6	10422	10427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384895192
99	NC_017360	CAC	2	6	10526	10531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384895192
100	NC_017360	CAT	2	6	10776	10781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895192
101	NC_017360	TCC	2	6	10851	10856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384895192
102	NC_017360	TAA	2	6	10969	10974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895192
103	NC_017360	TCA	2	6	10994	10999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895192
104	NC_017360	TAG	2	6	11057	11062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895192
105	NC_017360	TCT	2	6	11108	11113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895192
106	NC_017360	CCA	2	6	11223	11228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384895192
107	NC_017360	GTC	2	6	11351	11356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384895192
108	NC_017360	CTT	2	6	11662	11667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895192
109	NC_017360	TGC	2	6	11747	11752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384895192
110	NC_017360	TTC	2	6	11798	11803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895192
111	NC_017360	GGC	2	6	11888	11893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384895192
112	NC_017360	TTG	2	6	11953	11958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384895192
113	NC_017360	GGT	2	6	12019	12024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384895192
114	NC_017360	TAT	2	6	12091	12096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895193
115	NC_017360	TTC	2	6	12180	12185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895193
116	NC_017360	CTT	2	6	12230	12235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895193
117	NC_017360	CGC	2	6	12304	12309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384895193
118	NC_017360	TTA	2	6	12488	12493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895194
119	NC_017360	CAT	2	6	12518	12523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895194
120	NC_017360	TCA	2	6	12550	12555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895194
121	NC_017360	TTA	2	6	12760	12765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895194
122	NC_017360	AAC	2	6	12854	12859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895194
123	NC_017360	TTC	2	6	12906	12911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895194
124	NC_017360	AAT	2	6	12974	12979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895194
125	NC_017360	CAA	2	6	13446	13451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895195
126	NC_017360	CTT	3	9	13453	13461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895195
127	NC_017360	GAT	2	6	13462	13467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895195
128	NC_017360	TGC	2	6	13480	13485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384895195
129	NC_017360	AAC	2	6	13486	13491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895195
130	NC_017360	CTT	2	6	13492	13497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895195
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