MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 35A chromosome

Total Repeats: 314

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017360	AT	3	6	19609	19614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017360	AG	4	8	25214	25221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017360	AT	3	6	25263	25268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017360	AG	3	6	26537	26542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017360	TG	4	8	27263	27270	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017360	GA	3	6	27439	27444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017360	GT	3	6	27506	27511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017360	CA	3	6	27738	27743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017360	GA	3	6	27891	27896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017360	GT	3	6	28402	28407	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017360	CT	3	6	28721	28726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017360	CA	3	6	33048	33053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017360	AC	3	6	33054	33059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017360	AT	3	6	37876	37881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017360	AC	3	6	43370	43375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017360	AT	3	6	53825	53830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017360	TC	3	6	53831	53836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017360	GT	3	6	60992	60997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017360	TG	3	6	62211	62216	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017360	TG	3	6	62392	62397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017360	GA	3	6	87599	87604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017360	AT	3	6	88697	88702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017360	CT	3	6	90058	90063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017360	CG	3	6	120097	120102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017360	CG	3	6	134211	134216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017360	GC	3	6	134269	134274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017360	CA	3	6	134679	134684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017360	TC	3	6	136212	136217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017360	AC	3	6	136273	136278	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017360	TG	3	6	140381	140386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017360	AC	3	6	140434	140439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017360	AG	3	6	140787	140792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017360	AG	4	8	140828	140835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017360	CT	3	6	141903	141908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017360	CT	3	6	142203	142208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017360	AG	3	6	152110	152115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017360	CA	3	6	152122	152127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017360	CA	3	6	153285	153290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017360	TG	3	6	156627	156632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017360	AG	3	6	173568	173573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017360	TG	3	6	186056	186061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017360	AT	3	6	201404	201409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017360	TA	3	6	201824	201829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017360	TC	3	6	209552	209557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017360	AC	3	6	218253	218258	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017360	CA	3	6	221327	221332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017360	TC	3	6	234061	234066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017360	AT	4	8	243913	243920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017360	AG	3	6	244263	244268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017360	AG	3	6	248628	248633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017360	TA	3	6	262214	262219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017360	CT	3	6	262253	262258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017360	TC	3	6	281093	281098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017360	AG	4	8	281750	281757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017360	GC	3	6	282199	282204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017360	GT	3	6	283042	283047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017360	AG	3	6	285062	285067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017360	TA	3	6	285277	285282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017360	AG	3	6	285916	285921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017360	GT	3	6	285994	285999	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017360	AG	4	8	286401	286408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017360	GA	3	6	286411	286416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017360	AC	3	6	286424	286429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017360	GA	3	6	287001	287006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017360	TA	8	16	297273	297288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017360	GA	3	6	298826	298831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017360	TC	3	6	299115	299120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017360	AG	3	6	303569	303574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017360	AG	3	6	303596	303601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017360	GA	3	6	303629	303634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017360	CA	3	6	311077	311082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017360	CT	3	6	311327	311332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017360	GC	3	6	311451	311456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017360	AT	3	6	313670	313675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017360	CA	3	6	314129	314134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017360	AG	3	6	314135	314140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017360	TA	3	6	314979	314984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017360	AC	3	6	315043	315048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017360	AG	3	6	315196	315201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017360	TA	4	8	325941	325948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017360	CT	3	6	343353	343358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017360	AC	3	6	351719	351724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017360	TA	3	6	353814	353819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017360	TA	3	6	357140	357145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017360	TC	3	6	357186	357191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017360	AG	3	6	360301	360306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017360	CA	3	6	360424	360429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017360	CT	3	6	360473	360478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017360	CG	3	6	360970	360975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017360	CT	3	6	363423	363428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017360	GC	3	6	363722	363727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017360	GC	3	6	366914	366919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017360	AG	3	6	368735	368740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017360	AG	3	6	368778	368783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017360	TA	4	8	390840	390847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017360	GC	3	6	392409	392414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017360	TC	3	6	394237	394242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017360	AC	3	6	402917	402922	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017360	GT	3	6	405452	405457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017360	GA	3	6	409055	409060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017360	AG	3	6	414028	414033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017360	AG	3	6	414181	414186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017360	GC	3	6	414253	414258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017360	TC	3	6	431023	431028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017360	GA	3	6	431092	431097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017360	TC	3	6	431410	431415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017360	CT	3	6	431505	431510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017360	AC	3	6	432265	432270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017360	GC	3	6	436770	436775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017360	AT	3	6	439627	439632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017360	AG	3	6	446881	446886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017360	GA	3	6	447687	447692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017360	AT	3	6	458343	458348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017360	GT	3	6	459783	459788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017360	AT	4	8	490442	490449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017360	GA	3	6	517368	517373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017360	GC	3	6	517856	517861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017360	TA	3	6	518467	518472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017360	AG	3	6	520753	520758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017360	AG	3	6	551104	551109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017360	CT	3	6	559547	559552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017360	AG	3	6	559578	559583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017360	GA	3	6	561100	561105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017360	TC	3	6	561483	561488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017360	TC	4	8	561491	561498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017360	AC	3	6	577405	577410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017360	AT	3	6	596295	596300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017360	AG	3	6	597979	597984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017360	AG	3	6	599435	599440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017360	GA	4	8	607538	607545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017360	GA	3	6	625917	625922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017360	AT	3	6	647625	647630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017360	TA	3	6	660416	660421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017360	GC	3	6	660508	660513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017360	AG	3	6	660546	660551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017360	AT	4	8	675098	675105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017360	CT	3	6	676673	676678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017360	AT	3	6	677268	677273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017360	AG	3	6	678296	678301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017360	AT	3	6	685389	685394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017360	CT	3	6	685564	685569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017360	GT	3	6	688241	688246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017360	CA	3	6	688312	688317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017360	TA	3	6	688491	688496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017360	GT	3	6	688552	688557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017360	GT	4	8	688798	688805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017360	CT	3	6	747063	747068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017360	AT	3	6	749996	750001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017360	GC	3	6	764115	764120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017360	GA	3	6	776253	776258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017360	GA	3	6	778920	778925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017360	TG	3	6	790080	790085	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017360	TC	3	6	790226	790231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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304	NC_017360	GT	3	6	1560907	1560912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
305	NC_017360	CA	3	6	1561228	1561233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
306	NC_017360	AT	3	6	1562336	1562341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_017360	CA	3	6	1562576	1562581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
308	NC_017360	AT	3	6	1562788	1562793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_017360	CT	3	6	1563473	1563478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
310	NC_017360	CT	3	6	1563593	1563598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
311	NC_017360	GA	3	6	1564514	1564519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
312	NC_017360	AG	3	6	1565178	1565183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
313	NC_017360	CT	4	8	1566083	1566090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
314	NC_017360	GC	3	6	1566103	1566108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.