MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Sat464 chromosome

Total Repeats: 747

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017359	TTGCAA	2	12	867	878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384893618
2	NC_017359	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	384893620
3	NC_017359	GCGATA	2	12	3727	3738	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384893622
4	NC_017359	GAAACC	2	12	5554	5565	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384893625
5	NC_017359	AAACAC	2	12	16131	16142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017359	AGAAAA	2	12	16481	16492	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384893635
7	NC_017359	GATAAA	2	12	20043	20054	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384893638
8	NC_017359	TTTTAG	2	12	27045	27056	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384893644
9	NC_017359	CATGAA	2	12	28308	28319	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384893647
10	NC_017359	GCGTGG	2	12	28885	28896	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384893649
11	NC_017359	TTGGAT	2	12	28995	29006	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384893649
12	NC_017359	TTGAAT	2	12	30078	30089	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384893649
13	NC_017359	TAAGGA	2	12	30377	30388	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384893649
14	NC_017359	TAGGGG	2	12	31889	31900	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384893652
15	NC_017359	AAAGAA	2	12	33401	33412	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384893653
16	NC_017359	GCCTTA	2	12	40323	40334	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384893662
17	NC_017359	CGCAAA	2	12	41114	41125	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384893662
18	NC_017359	TCTTTG	2	12	46597	46608	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384893667
19	NC_017359	TGAAAT	2	12	47102	47113	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384893667
20	NC_017359	TAAAAA	2	12	49254	49265	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384893669
21	NC_017359	GAAAAA	2	12	54297	54308	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384893672
22	NC_017359	ACGCCC	2	12	63814	63825	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384893683
23	NC_017359	TAAGGG	2	12	66533	66544	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384893686
24	NC_017359	CGCCCA	2	12	67070	67081	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384893686
25	NC_017359	GGCATG	2	12	69893	69904	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384893689
26	NC_017359	ATATTG	2	12	71732	71743	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384893691
27	NC_017359	AACAGG	2	12	79653	79664	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384893697
28	NC_017359	ATTAGA	2	12	83652	83663	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384893701
29	NC_017359	GATTTT	2	12	85414	85425	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384893703
30	NC_017359	AAACTC	2	12	85531	85542	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384893703
31	NC_017359	TCAAAA	2	12	87023	87034	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384893704
32	NC_017359	GCGGTG	2	12	87722	87733	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384893705
33	NC_017359	TTAATT	2	12	88257	88268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384893705
34	NC_017359	CAATAT	2	12	90928	90939	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384893706
35	NC_017359	TTCCAC	2	12	94031	94042	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384893710
36	NC_017359	AGCGTT	2	12	97530	97541	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384893711
37	NC_017359	TTTTCT	2	12	103103	103114	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384893717
38	NC_017359	GCAAGC	2	12	103510	103521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384893717
39	NC_017359	CGCTCG	2	12	108117	108128	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384893722
40	NC_017359	GGGAAG	2	12	109511	109522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384893723
41	NC_017359	TAGGCA	2	12	110654	110665	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384893723
42	NC_017359	CTTCTA	2	12	112989	113000	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384893725
43	NC_017359	CTTCTA	2	12	114458	114469	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384893726
44	NC_017359	GTTCTA	2	12	114728	114739	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384893726
45	NC_017359	CTAAGG	2	12	115991	116002	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384893727
46	NC_017359	TGAATT	2	12	116525	116536	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384893727
47	NC_017359	TTTCAA	2	12	116684	116695	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384893727
48	NC_017359	AGCAAA	2	12	120031	120042	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384893730
49	NC_017359	GTTTTA	2	12	121042	121053	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017359	TCATGA	2	12	122814	122825	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384893734
51	NC_017359	TTAAAA	2	12	129562	129573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017359	TAGCGA	2	12	131502	131513	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384893744
53	NC_017359	TTAGCG	2	12	134395	134406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384893746
54	NC_017359	TATCGC	2	12	134607	134618	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384893746
55	NC_017359	ATCGCT	2	12	136315	136326	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384893747
56	NC_017359	CCTAAA	2	12	138538	138549	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384893749
57	NC_017359	TTCTAT	2	12	139700	139711	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384893750
58	NC_017359	TTGTTT	2	12	142688	142699	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384893755
59	NC_017359	CTTGGG	2	12	143349	143360	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384893757
60	NC_017359	TTGGGT	2	12	148128	148139	0 %	50 %	50 %	0 %	384893762
61	NC_017359	GATTTT	2	12	148640	148651	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384893763
62	NC_017359	TTATAA	2	12	151624	151635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017359	GATGGC	2	12	151857	151868	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384893767
64	NC_017359	GATGGC	2	12	151965	151976	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384893767
65	NC_017359	CTTTCT	2	12	152109	152120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893767
66	NC_017359	CCGCTC	2	12	154107	154118	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384893771
67	NC_017359	GCTCTC	2	12	156534	156545	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384893773
68	NC_017359	TAAAAA	2	12	157192	157203	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017359	TTCTAA	2	12	158856	158867	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384893776
70	NC_017359	TCAATA	2	12	160538	160549	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384893778
71	NC_017359	CATTTT	2	12	160647	160658	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384893778
72	NC_017359	ATCGTT	2	12	160960	160971	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384893778
73	NC_017359	AATTTC	2	12	161311	161322	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384893779
74	NC_017359	TAAAAT	2	12	162835	162846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384893780
75	NC_017359	ATTTTG	2	12	164641	164652	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384893783
76	NC_017359	AAAGAG	2	12	164661	164672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893783
77	NC_017359	GTTTAA	2	12	165903	165914	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384893784
78	NC_017359	CCGCTC	2	12	168556	168567	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384893787
79	NC_017359	GAAAAA	2	12	172331	172342	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384893792
80	NC_017359	AGGCAT	2	12	172420	172431	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384893792
81	NC_017359	GCATTT	2	12	174133	174144	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384893794
82	NC_017359	TCAAAC	2	12	174700	174711	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384893795
83	NC_017359	ATAAAG	2	12	174867	174878	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384893795
84	NC_017359	ATTCTT	2	12	175191	175202	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017359	GGTATT	2	12	178638	178649	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384893798
86	NC_017359	TCTAAA	2	12	178868	178879	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384893798
87	NC_017359	TGGGCA	2	12	179937	179948	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384893799
88	NC_017359	TTCTAA	2	12	180416	180427	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384893800
89	NC_017359	ATTTTC	2	12	182361	182372	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384893800
90	NC_017359	TGGGGC	2	12	189762	189773	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384893810
91	NC_017359	AAATCC	2	12	191206	191217	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384893812
92	NC_017359	TAAAGA	2	12	199642	199653	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384893817
93	NC_017359	TATAAT	2	12	201267	201278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017359	ATTCTA	2	12	201592	201603	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384893819
95	NC_017359	GTTTTG	2	12	203868	203879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384893820
96	NC_017359	TTATTT	2	12	205500	205511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384893821
97	NC_017359	GCTAAA	2	12	210944	210955	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384893828
98	NC_017359	ATTAAA	2	12	213781	213792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017359	AGTGAG	2	12	215096	215107	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017359	AATGCC	2	12	215452	215463	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384893833
101	NC_017359	GGATTG	2	12	217738	217749	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384893835
102	NC_017359	GTGATG	2	12	219700	219711	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384893836
103	NC_017359	TCAATA	2	12	220122	220133	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384893837
104	NC_017359	CACGCC	2	12	220602	220613	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384893837
105	NC_017359	GCTTTG	2	12	221839	221850	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384893838
106	NC_017359	GCTAGG	2	12	223220	223231	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384893839
107	NC_017359	TCTTTA	2	12	229571	229582	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384893846
108	NC_017359	GTTTTT	2	12	235161	235172	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384893853
109	NC_017359	ATTTTA	2	12	236621	236632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017359	ATTGTC	2	12	238321	238332	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384893856
111	NC_017359	AGCGGC	2	12	239442	239453	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384893857
112	NC_017359	TCCCGC	2	12	240477	240488	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384893858
113	NC_017359	TCCCGC	2	12	241290	241301	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384893858
114	NC_017359	CAAAGC	2	12	242756	242767	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384893860
115	NC_017359	TTTAGC	2	12	244511	244522	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384893862
116	NC_017359	TGAGCG	2	12	249158	249169	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384893867
117	NC_017359	GCTTTA	2	12	253965	253976	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384893872
118	NC_017359	GGGGCT	2	12	254751	254762	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384893872
119	NC_017359	TGGAAA	2	12	255163	255174	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384893872
120	NC_017359	GATTTT	2	12	256043	256054	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384893872
121	NC_017359	AGCTTT	2	12	259452	259463	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384893875
122	NC_017359	GATTTT	2	12	263988	263999	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384893882
123	NC_017359	ATTAGA	2	12	264110	264121	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384893882
124	NC_017359	TAAAGA	2	12	265430	265441	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384893883
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128	NC_017359	AAATCA	2	12	266891	266902	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384893886
129	NC_017359	GCGTTA	2	12	268647	268658	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384893887
130	NC_017359	AGCGAG	2	12	277868	277879	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384893894
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133	NC_017359	TTTGAA	2	12	283280	283291	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384893897
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139	NC_017359	TTATCG	2	12	295132	295143	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384893903
140	NC_017359	GGCATG	2	12	297275	297286	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384893906
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147	NC_017359	GATTTA	2	12	310716	310727	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017359	GCTCAA	2	12	314575	314586	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384893925
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226	NC_017359	CTACAA	2	12	460881	460892	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384894072
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348	NC_017359	TTTTGA	2	12	696122	696133	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384894302
349	NC_017359	AACGCT	2	12	697334	697345	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384894304
350	NC_017359	GGCTAT	2	12	697496	697507	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384894304
351	NC_017359	TTTAAA	2	12	700741	700752	50 %	50 %	0 %	0 %	384894307
352	NC_017359	CTTTTT	2	12	701431	701442	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384894308
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449	NC_017359	CTCACT	2	12	904557	904568	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384894493
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458	NC_017359	ATATTA	2	12	917381	917392	50 %	50 %	0 %	0 %	384894497
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462	NC_017359	TGAATG	2	12	923607	923618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384894505
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464	NC_017359	AATATC	2	12	931288	931299	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
465	NC_017359	TCAAAT	2	12	931647	931658	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
466	NC_017359	CAAGCT	2	12	932285	932296	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384894512
467	NC_017359	CTTCCA	2	12	934209	934220	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384894514
468	NC_017359	AAATTT	2	12	944822	944833	50 %	50 %	0 %	0 %	384894526
469	NC_017359	TATCCT	2	12	948334	948345	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
470	NC_017359	TTCCAA	2	12	949866	949877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384894532
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474	NC_017359	GCGCGA	2	12	957333	957344	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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476	NC_017359	GCTGAA	2	12	967933	967944	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
477	NC_017359	CTGAAA	2	12	969395	969406	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384894546
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489	NC_017359	GCCAGT	2	12	995770	995781	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384894563
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