MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Sat464 chromosome

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017359	AAACAC	2	12	16131	16142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017359	GTTTTA	2	12	121042	121053	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017359	TTAAAA	2	12	129562	129573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017359	TTATAA	2	12	151624	151635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017359	TAAAAA	2	12	157192	157203	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017359	ATTCTT	2	12	175191	175202	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017359	TATAAT	2	12	201267	201278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017359	ATTAAA	2	12	213781	213792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017359	AGTGAG	2	12	215096	215107	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017359	ATTTTA	2	12	236621	236632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017359	GATTTA	2	12	310716	310727	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017359	AGGCGA	2	12	339245	339256	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017359	TTTATT	2	12	369552	369563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017359	TAAAAA	2	12	421258	421269	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017359	TAAAAA	2	12	435434	435445	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017359	TATTTT	2	12	460404	460415	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017359	AGTTTT	2	12	499447	499458	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017359	TTTTTC	2	12	499612	499623	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017359	AAAATG	2	12	581527	581538	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017359	AAGCCG	2	12	602265	602276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017359	AAAGAA	2	12	614616	614627	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017359	TTCAAA	2	12	614960	614971	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017359	CTCATT	2	12	666407	666418	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017359	GCTCTT	2	12	706886	706897	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017359	GCTTTG	2	12	737525	737536	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017359	TTTGAT	2	12	764669	764680	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017359	TTAAAA	2	12	771758	771769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017359	CCCTAA	2	12	790867	790878	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017359	CTTTAA	2	12	800336	800347	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017359	ATTAAA	2	12	855027	855038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017359	TTTCAT	2	12	884539	884550	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017359	ATTATA	2	12	901743	901754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017359	TAAAAT	2	12	901768	901779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017359	ATTGAA	2	12	909137	909148	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017359	AATATC	2	12	931288	931299	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017359	TCAAAT	2	12	931647	931658	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017359	TATCCT	2	12	948334	948345	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017359	TCTTTT	2	12	957320	957331	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017359	GCGCGA	2	12	957333	957344	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017359	CAAACC	2	12	959876	959887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017359	GCTGAA	2	12	967933	967944	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017359	TAGACT	2	12	982756	982767	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017359	TTATAC	2	12	984407	984418	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017359	AGTAGA	2	12	988442	988453	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017359	CTAAAA	2	12	991683	991694	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017359	AATTAA	2	12	1031338	1031349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017359	ATTTGA	2	12	1056059	1056070	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017359	AATTCA	2	12	1109266	1109277	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017359	AAAACA	2	12	1111365	1111376	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017359	TTGTAT	2	12	1164651	1164662	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017359	ACTTAA	2	12	1181750	1181761	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017359	TCATTT	2	12	1203936	1203947	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017359	AAACTT	2	12	1203959	1203970	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017359	ATTTTT	2	12	1234890	1234901	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017359	TAAAAA	2	12	1262757	1262768	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017359	ATTTTT	2	12	1280912	1280923	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017359	CAAAAA	2	12	1298489	1298500	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017359	AGTTTT	2	12	1347029	1347040	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017359	TTATAC	2	12	1349911	1349922	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017359	AGCGGG	2	12	1358304	1358315	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017359	TGTTTA	2	12	1360568	1360579	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017359	AAAGAC	2	12	1361622	1361633	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017359	GTTTTA	2	12	1368423	1368434	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017359	AAAACA	2	12	1382134	1382145	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017359	ATAAAA	2	12	1496723	1496734	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.