MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Sat464 chromosome

Total Repeats: 682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017359	TTGCAA	2	12	867	878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384893618
2	NC_017359	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	384893620
3	NC_017359	GCGATA	2	12	3727	3738	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384893622
4	NC_017359	GAAACC	2	12	5554	5565	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384893625
5	NC_017359	AGAAAA	2	12	16481	16492	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384893635
6	NC_017359	GATAAA	2	12	20043	20054	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384893638
7	NC_017359	TTTTAG	2	12	27045	27056	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384893644
8	NC_017359	CATGAA	2	12	28308	28319	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384893647
9	NC_017359	GCGTGG	2	12	28885	28896	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384893649
10	NC_017359	TTGGAT	2	12	28995	29006	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384893649
11	NC_017359	TTGAAT	2	12	30078	30089	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384893649
12	NC_017359	TAAGGA	2	12	30377	30388	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384893649
13	NC_017359	TAGGGG	2	12	31889	31900	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384893652
14	NC_017359	AAAGAA	2	12	33401	33412	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384893653
15	NC_017359	GCCTTA	2	12	40323	40334	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384893662
16	NC_017359	CGCAAA	2	12	41114	41125	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384893662
17	NC_017359	TCTTTG	2	12	46597	46608	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384893667
18	NC_017359	TGAAAT	2	12	47102	47113	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384893667
19	NC_017359	TAAAAA	2	12	49254	49265	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384893669
20	NC_017359	GAAAAA	2	12	54297	54308	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384893672
21	NC_017359	ACGCCC	2	12	63814	63825	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384893683
22	NC_017359	TAAGGG	2	12	66533	66544	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384893686
23	NC_017359	CGCCCA	2	12	67070	67081	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384893686
24	NC_017359	GGCATG	2	12	69893	69904	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384893689
25	NC_017359	ATATTG	2	12	71732	71743	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384893691
26	NC_017359	AACAGG	2	12	79653	79664	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384893697
27	NC_017359	ATTAGA	2	12	83652	83663	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384893701
28	NC_017359	GATTTT	2	12	85414	85425	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384893703
29	NC_017359	AAACTC	2	12	85531	85542	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384893703
30	NC_017359	TCAAAA	2	12	87023	87034	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384893704
31	NC_017359	GCGGTG	2	12	87722	87733	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384893705
32	NC_017359	TTAATT	2	12	88257	88268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384893705
33	NC_017359	CAATAT	2	12	90928	90939	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384893706
34	NC_017359	TTCCAC	2	12	94031	94042	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384893710
35	NC_017359	AGCGTT	2	12	97530	97541	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384893711
36	NC_017359	TTTTCT	2	12	103103	103114	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384893717
37	NC_017359	GCAAGC	2	12	103510	103521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384893717
38	NC_017359	CGCTCG	2	12	108117	108128	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384893722
39	NC_017359	GGGAAG	2	12	109511	109522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384893723
40	NC_017359	TAGGCA	2	12	110654	110665	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384893723
41	NC_017359	CTTCTA	2	12	112989	113000	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384893725
42	NC_017359	CTTCTA	2	12	114458	114469	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384893726
43	NC_017359	GTTCTA	2	12	114728	114739	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384893726
44	NC_017359	CTAAGG	2	12	115991	116002	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384893727
45	NC_017359	TGAATT	2	12	116525	116536	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384893727
46	NC_017359	TTTCAA	2	12	116684	116695	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384893727
47	NC_017359	AGCAAA	2	12	120031	120042	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384893730
48	NC_017359	TCATGA	2	12	122814	122825	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384893734
49	NC_017359	TAGCGA	2	12	131502	131513	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384893744
50	NC_017359	TTAGCG	2	12	134395	134406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384893746
51	NC_017359	TATCGC	2	12	134607	134618	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384893746
52	NC_017359	ATCGCT	2	12	136315	136326	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384893747
53	NC_017359	CCTAAA	2	12	138538	138549	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384893749
54	NC_017359	TTCTAT	2	12	139700	139711	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384893750
55	NC_017359	TTGTTT	2	12	142688	142699	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384893755
56	NC_017359	CTTGGG	2	12	143349	143360	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384893757
57	NC_017359	TTGGGT	2	12	148128	148139	0 %	50 %	50 %	0 %	384893762
58	NC_017359	GATTTT	2	12	148640	148651	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384893763
59	NC_017359	GATGGC	2	12	151857	151868	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384893767
60	NC_017359	GATGGC	2	12	151965	151976	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384893767
61	NC_017359	CTTTCT	2	12	152109	152120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893767
62	NC_017359	CCGCTC	2	12	154107	154118	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384893771
63	NC_017359	GCTCTC	2	12	156534	156545	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384893773
64	NC_017359	TTCTAA	2	12	158856	158867	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384893776
65	NC_017359	TCAATA	2	12	160538	160549	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384893778
66	NC_017359	CATTTT	2	12	160647	160658	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384893778
67	NC_017359	ATCGTT	2	12	160960	160971	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384893778
68	NC_017359	AATTTC	2	12	161311	161322	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384893779
69	NC_017359	TAAAAT	2	12	162835	162846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384893780
70	NC_017359	ATTTTG	2	12	164641	164652	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384893783
71	NC_017359	AAAGAG	2	12	164661	164672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893783
72	NC_017359	GTTTAA	2	12	165903	165914	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384893784
73	NC_017359	CCGCTC	2	12	168556	168567	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384893787
74	NC_017359	GAAAAA	2	12	172331	172342	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384893792
75	NC_017359	AGGCAT	2	12	172420	172431	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384893792
76	NC_017359	GCATTT	2	12	174133	174144	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384893794
77	NC_017359	TCAAAC	2	12	174700	174711	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384893795
78	NC_017359	ATAAAG	2	12	174867	174878	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384893795
79	NC_017359	GGTATT	2	12	178638	178649	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384893798
80	NC_017359	TCTAAA	2	12	178868	178879	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384893798
81	NC_017359	TGGGCA	2	12	179937	179948	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384893799
82	NC_017359	TTCTAA	2	12	180416	180427	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384893800
83	NC_017359	ATTTTC	2	12	182361	182372	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384893800
84	NC_017359	TGGGGC	2	12	189762	189773	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384893810
85	NC_017359	AAATCC	2	12	191206	191217	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384893812
86	NC_017359	TAAAGA	2	12	199642	199653	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384893817
87	NC_017359	ATTCTA	2	12	201592	201603	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384893819
88	NC_017359	GTTTTG	2	12	203868	203879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384893820
89	NC_017359	TTATTT	2	12	205500	205511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384893821
90	NC_017359	GCTAAA	2	12	210944	210955	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384893828
91	NC_017359	AATGCC	2	12	215452	215463	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384893833
92	NC_017359	GGATTG	2	12	217738	217749	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384893835
93	NC_017359	GTGATG	2	12	219700	219711	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384893836
94	NC_017359	TCAATA	2	12	220122	220133	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384893837
95	NC_017359	CACGCC	2	12	220602	220613	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384893837
96	NC_017359	GCTTTG	2	12	221839	221850	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384893838
97	NC_017359	GCTAGG	2	12	223220	223231	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384893839
98	NC_017359	TCTTTA	2	12	229571	229582	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384893846
99	NC_017359	GTTTTT	2	12	235161	235172	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384893853
100	NC_017359	ATTGTC	2	12	238321	238332	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384893856
101	NC_017359	AGCGGC	2	12	239442	239453	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384893857
102	NC_017359	TCCCGC	2	12	240477	240488	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384893858
103	NC_017359	TCCCGC	2	12	241290	241301	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384893858
104	NC_017359	CAAAGC	2	12	242756	242767	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384893860
105	NC_017359	TTTAGC	2	12	244511	244522	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384893862
106	NC_017359	TGAGCG	2	12	249158	249169	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384893867
107	NC_017359	GCTTTA	2	12	253965	253976	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384893872
108	NC_017359	GGGGCT	2	12	254751	254762	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384893872
109	NC_017359	TGGAAA	2	12	255163	255174	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384893872
110	NC_017359	GATTTT	2	12	256043	256054	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384893872
111	NC_017359	AGCTTT	2	12	259452	259463	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384893875
112	NC_017359	GATTTT	2	12	263988	263999	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384893882
113	NC_017359	ATTAGA	2	12	264110	264121	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384893882
114	NC_017359	TAAAGA	2	12	265430	265441	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384893883
115	NC_017359	CCGAAC	2	12	265660	265671	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384893883
116	NC_017359	TCAAAA	2	12	266224	266235	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384893884
117	NC_017359	AAATAC	2	12	266530	266541	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384893885
118	NC_017359	AAATCA	2	12	266891	266902	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384893886
119	NC_017359	GCGTTA	2	12	268647	268658	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384893887
120	NC_017359	AGCGAG	2	12	277868	277879	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384893894
121	NC_017359	TTTTAA	2	12	280154	280165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384893897
122	NC_017359	TATGGA	2	12	282392	282403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384893897
123	NC_017359	TTTGAA	2	12	283280	283291	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384893897
124	NC_017359	TCAATT	2	12	283411	283422	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384893897
125	NC_017359	TAACAT	2	12	285704	285715	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384893897
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129	NC_017359	TTATCG	2	12	295132	295143	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384893903
130	NC_017359	GGCATG	2	12	297275	297286	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384893906
131	NC_017359	GAAAAA	2	12	299969	299980	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384893908
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141	NC_017359	TTATGA	2	12	319068	319079	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384893930
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342	NC_017359	ACTATA	2	12	738372	738383	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384894344
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459	NC_017359	TGAGCG	2	12	1040177	1040188	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384894604
460	NC_017359	CATAGC	2	12	1040987	1040998	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384894605
461	NC_017359	AGCGTT	2	12	1041150	1041161	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384894605
462	NC_017359	ATTAAA	2	12	1043488	1043499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384894606
463	NC_017359	GCCGTT	2	12	1049382	1049393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384894611
464	NC_017359	CGCATG	2	12	1052195	1052206	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384894614
465	NC_017359	ATTGAC	2	12	1054490	1054501	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384894617
466	NC_017359	TACCAA	2	12	1055674	1055685	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384894618
467	NC_017359	ATTTAG	2	12	1055771	1055782	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384894618
468	NC_017359	CGCCAT	2	12	1063871	1063882	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384894626
469	NC_017359	CCATCG	2	12	1064020	1064031	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384894626
470	NC_017359	TAGCGA	2	12	1066154	1066165	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384894628
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474	NC_017359	GAGCGG	2	12	1069689	1069700	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384894631
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479	NC_017359	TCGCAT	2	12	1087166	1087177	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384894648
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488	NC_017359	TCTTTA	2	12	1106964	1106975	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384894672
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