MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Sat464 chromosome

Total Repeats: 1243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017359	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	384893619
2	NC_017359	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	384893620
3	NC_017359	TAAAA	2	10	5247	5256	80 %	20 %	0 %	0 %	384893624
4	NC_017359	ATAAA	2	10	5266	5275	80 %	20 %	0 %	0 %	384893624
5	NC_017359	TTTCT	2	10	6218	6227	0 %	80 %	0 %	20 %	384893625
6	NC_017359	AGGAG	2	10	8677	8686	40 %	0 %	60 %	0 %	384893627
7	NC_017359	TTGAA	2	10	9715	9724	40 %	40 %	20 %	0 %	384893628
8	NC_017359	TTTTG	2	10	9731	9740	0 %	80 %	20 %	0 %	384893628
9	NC_017359	TGGTG	2	10	10569	10578	0 %	40 %	60 %	0 %	384893630
10	NC_017359	GCTTT	2	10	11396	11405	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017359	CAAAA	2	10	16446	16455	80 %	0 %	0 %	20 %	384893635
12	NC_017359	CATCA	2	10	17822	17831	40 %	20 %	0 %	40 %	384893636
13	NC_017359	TGAAA	2	10	18790	18799	60 %	20 %	20 %	0 %	384893637
14	NC_017359	TAGGG	2	10	20680	20689	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017359	AAAAG	2	10	20808	20817	80 %	0 %	20 %	0 %	384893639
16	NC_017359	CCATG	2	10	20996	21005	20 %	20 %	20 %	40 %	384893640
17	NC_017359	CTCTT	2	10	21026	21035	0 %	60 %	0 %	40 %	384893640
18	NC_017359	ATACC	2	10	23017	23026	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017359	CAAGC	2	10	25641	25650	40 %	0 %	20 %	40 %	384893642
20	NC_017359	TTTTA	2	10	26571	26580	20 %	80 %	0 %	0 %	384893643
21	NC_017359	GATAA	2	10	28581	28590	60 %	20 %	20 %	0 %	384893648
22	NC_017359	GTGGG	2	10	30040	30049	0 %	20 %	80 %	0 %	384893649
23	NC_017359	TGGGG	2	10	31291	31300	0 %	20 %	80 %	0 %	384893651
24	NC_017359	AAGCC	2	10	37054	37063	40 %	0 %	20 %	40 %	384893658
25	NC_017359	AGAAA	2	10	38354	38363	80 %	0 %	20 %	0 %	384893659
26	NC_017359	TAAAA	2	10	41049	41058	80 %	20 %	0 %	0 %	384893662
27	NC_017359	TCCCA	2	10	42061	42070	20 %	20 %	0 %	60 %	384893663
28	NC_017359	GCTCC	2	10	42382	42391	0 %	20 %	20 %	60 %	384893663
29	NC_017359	TCGCA	2	10	42919	42928	20 %	20 %	20 %	40 %	384893663
30	NC_017359	AGGCT	2	10	44806	44815	20 %	20 %	40 %	20 %	384893665
31	NC_017359	TGCCT	2	10	45181	45190	0 %	40 %	20 %	40 %	384893665
32	NC_017359	TAAAA	2	10	47370	47379	80 %	20 %	0 %	0 %	384893667
33	NC_017359	TGAAA	2	10	48173	48182	60 %	20 %	20 %	0 %	384893669
34	NC_017359	TCAAA	2	10	48427	48436	60 %	20 %	0 %	20 %	384893669
35	NC_017359	CAGCA	2	10	49374	49383	40 %	0 %	20 %	40 %	384893670
36	NC_017359	TAAAA	2	10	51466	51475	80 %	20 %	0 %	0 %	384893670
37	NC_017359	TCAAA	2	10	52182	52191	60 %	20 %	0 %	20 %	384893670
38	NC_017359	ATTAT	2	10	53149	53158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017359	TTAAA	2	10	53203	53212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017359	ACAAA	2	10	53232	53241	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017359	GGTGG	2	10	56033	56042	0 %	20 %	80 %	0 %	384893674
42	NC_017359	GCGTT	2	10	58291	58300	0 %	40 %	40 %	20 %	384893676
43	NC_017359	TCAAT	2	10	59145	59154	40 %	40 %	0 %	20 %	384893677
44	NC_017359	TGCCT	2	10	60061	60070	0 %	40 %	20 %	40 %	384893678
45	NC_017359	TCCAA	2	10	60473	60482	40 %	20 %	0 %	40 %	384893679
46	NC_017359	TTTTA	2	10	63739	63748	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017359	TTTTG	2	10	63770	63779	0 %	80 %	20 %	0 %	384893683
48	NC_017359	ACGCC	2	10	64076	64085	20 %	0 %	20 %	60 %	384893683
49	NC_017359	AAAGC	2	10	64842	64851	60 %	0 %	20 %	20 %	384893684
50	NC_017359	TTACA	2	10	65624	65633	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017359	AAAAC	2	10	69199	69208	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017359	ATCTT	2	10	72887	72896	20 %	60 %	0 %	20 %	384893691
53	NC_017359	TGGCT	2	10	73428	73437	0 %	40 %	40 %	20 %	384893691
54	NC_017359	ATGCC	2	10	73848	73857	20 %	20 %	20 %	40 %	384893692
55	NC_017359	TTGAT	2	10	74875	74884	20 %	60 %	20 %	0 %	384893694
56	NC_017359	GGCGT	2	10	76688	76697	0 %	20 %	60 %	20 %	384893696
57	NC_017359	ATTTT	2	10	79732	79741	20 %	80 %	0 %	0 %	384893697
58	NC_017359	AGATA	2	10	79854	79863	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017359	TAAAA	2	10	79923	79932	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017359	CTTTC	2	10	80206	80215	0 %	60 %	0 %	40 %	384893698
61	NC_017359	TTTGA	2	10	82996	83005	20 %	60 %	20 %	0 %	384893701
62	NC_017359	TCTTT	2	10	83207	83216	0 %	80 %	0 %	20 %	384893701
63	NC_017359	GGCTT	2	10	84319	84328	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017359	CGGCA	2	10	86989	86998	20 %	0 %	40 %	40 %	384893704
65	NC_017359	CTTCT	2	10	87865	87874	0 %	60 %	0 %	40 %	384893705
66	NC_017359	AATTT	2	10	89022	89031	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017359	ACGAT	2	10	89469	89478	40 %	20 %	20 %	20 %	384893706
68	NC_017359	TTTTC	2	10	89664	89673	0 %	80 %	0 %	20 %	384893706
69	NC_017359	AATTG	2	10	91311	91320	40 %	40 %	20 %	0 %	384893707
70	NC_017359	TACGA	2	10	95573	95582	40 %	20 %	20 %	20 %	384893710
71	NC_017359	CAAAA	2	10	95702	95711	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017359	TCTTT	2	10	96420	96429	0 %	80 %	0 %	20 %	384893711
73	NC_017359	AAAGC	2	10	99193	99202	60 %	0 %	20 %	20 %	384893713
74	NC_017359	GAATG	2	10	100414	100423	40 %	20 %	40 %	0 %	384893715
75	NC_017359	TGTCT	2	10	101230	101239	0 %	60 %	20 %	20 %	384893716
76	NC_017359	CAAAT	2	10	101623	101632	60 %	20 %	0 %	20 %	384893716
77	NC_017359	ACCCT	2	10	103052	103061	20 %	20 %	0 %	60 %	384893717
78	NC_017359	ATGCC	2	10	103184	103193	20 %	20 %	20 %	40 %	384893717
79	NC_017359	TTAAT	2	10	104570	104579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017359	TGATT	2	10	105188	105197	20 %	60 %	20 %	0 %	384893719
81	NC_017359	CTAAA	2	10	105658	105667	60 %	20 %	0 %	20 %	384893721
82	NC_017359	GAATT	2	10	105807	105816	40 %	40 %	20 %	0 %	384893721
83	NC_017359	GGATC	2	10	109683	109692	20 %	20 %	40 %	20 %	384893723
84	NC_017359	AAGCC	2	10	111591	111600	40 %	0 %	20 %	40 %	384893724
85	NC_017359	GTTTG	2	10	112949	112958	0 %	60 %	40 %	0 %	384893725
86	NC_017359	CAATC	2	10	113828	113837	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017359	GTTTG	2	10	114418	114427	0 %	60 %	40 %	0 %	384893726
88	NC_017359	TTTGA	2	10	116010	116019	20 %	60 %	20 %	0 %	384893727
89	NC_017359	GACTT	2	10	116544	116553	20 %	40 %	20 %	20 %	384893727
90	NC_017359	ATCTC	2	10	117295	117304	20 %	40 %	0 %	40 %	384893727
91	NC_017359	CGCTT	2	10	117453	117462	0 %	40 %	20 %	40 %	384893727
92	NC_017359	TTTGT	2	10	117809	117818	0 %	80 %	20 %	0 %	384893728
93	NC_017359	TGCGT	2	10	119842	119851	0 %	40 %	40 %	20 %	384893730
94	NC_017359	GAAAA	2	10	120003	120012	80 %	0 %	20 %	0 %	384893730
95	NC_017359	GAAAA	2	10	120321	120330	80 %	0 %	20 %	0 %	384893730
96	NC_017359	ATTTT	2	10	123287	123296	20 %	80 %	0 %	0 %	384893735
97	NC_017359	ATGTT	2	10	123369	123378	20 %	60 %	20 %	0 %	384893735
98	NC_017359	AAAAG	2	10	123781	123790	80 %	0 %	20 %	0 %	384893735
99	NC_017359	TAGGG	2	10	124775	124784	20 %	20 %	60 %	0 %	384893736
100	NC_017359	AAATC	2	10	126041	126050	60 %	20 %	0 %	20 %	384893737
101	NC_017359	AAAAT	2	10	127513	127522	80 %	20 %	0 %	0 %	384893738
102	NC_017359	TTTTC	2	10	129866	129875	0 %	80 %	0 %	20 %	384893742
103	NC_017359	GTAAA	2	10	130418	130427	60 %	20 %	20 %	0 %	384893743
104	NC_017359	TTCTT	2	10	131822	131831	0 %	80 %	0 %	20 %	384893744
105	NC_017359	TCTTT	2	10	132316	132325	0 %	80 %	0 %	20 %	384893745
106	NC_017359	ACTTG	2	10	132529	132538	20 %	40 %	20 %	20 %	384893745
107	NC_017359	TTTTG	2	10	133480	133489	0 %	80 %	20 %	0 %	384893746
108	NC_017359	AATTC	2	10	134114	134123	40 %	40 %	0 %	20 %	384893746
109	NC_017359	GCGAT	2	10	134273	134282	20 %	20 %	40 %	20 %	384893746
110	NC_017359	GCTTG	2	10	134529	134538	0 %	40 %	40 %	20 %	384893746
111	NC_017359	TTTTG	2	10	135181	135190	0 %	80 %	20 %	0 %	384893747
112	NC_017359	CCAAA	2	10	137021	137030	60 %	0 %	0 %	40 %	384893748
113	NC_017359	ATAGT	2	10	138949	138958	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017359	TACGC	2	10	140544	140553	20 %	20 %	20 %	40 %	384893750
115	NC_017359	TGATT	2	10	141450	141459	20 %	60 %	20 %	0 %	384893752
116	NC_017359	TTATT	2	10	142441	142450	20 %	80 %	0 %	0 %	384893754
117	NC_017359	GCGTT	2	10	142799	142808	0 %	40 %	40 %	20 %	384893756
118	NC_017359	CCCAG	2	10	143719	143728	20 %	0 %	20 %	60 %	384893757
119	NC_017359	CAAAT	2	10	145674	145683	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017359	AAAAC	2	10	146398	146407	80 %	0 %	0 %	20 %	384893760
121	NC_017359	GGGGA	2	10	146498	146507	20 %	0 %	80 %	0 %	384893760
122	NC_017359	AAGCC	2	10	149634	149643	40 %	0 %	20 %	40 %	384893765
123	NC_017359	GGGTG	2	10	152033	152042	0 %	20 %	80 %	0 %	384893767
124	NC_017359	AACAA	2	10	152930	152939	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017359	ATTCA	2	10	153415	153424	40 %	40 %	0 %	20 %	384893770
126	NC_017359	CACTT	2	10	153619	153628	20 %	40 %	0 %	40 %	384893770
127	NC_017359	AAAAC	2	10	155752	155761	80 %	0 %	0 %	20 %	384893772
128	NC_017359	ATCTT	2	10	156817	156826	20 %	60 %	0 %	20 %	384893773
129	NC_017359	AGGCT	2	10	162504	162513	20 %	20 %	40 %	20 %	384893780
130	NC_017359	TATCA	2	10	165177	165186	40 %	40 %	0 %	20 %	384893783
131	NC_017359	ATTTG	2	10	166185	166194	20 %	60 %	20 %	0 %	384893784
132	NC_017359	AATTG	2	10	166341	166350	40 %	40 %	20 %	0 %	384893785
133	NC_017359	TTTCT	2	10	167005	167014	0 %	80 %	0 %	20 %	384893786
134	NC_017359	AAATG	2	10	167342	167351	60 %	20 %	20 %	0 %	384893786
135	NC_017359	TGTAA	2	10	168132	168141	40 %	40 %	20 %	0 %	384893787
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137	NC_017359	GAATA	2	10	169925	169934	60 %	20 %	20 %	0 %	384893788
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