MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Sat464 chromosome

Total Repeats: 483

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017359	ATGC	2	8	4282	4289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017359	TAAA	2	8	4684	4691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017359	ATAA	2	8	7475	7482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017359	ATTC	2	8	7678	7685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017359	TTAA	2	8	11494	11501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017359	AGTT	2	8	14440	14447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017359	AATC	2	8	20545	20552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017359	CTCC	2	8	20605	20612	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_017359	GATT	2	8	22973	22980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017359	GTAT	2	8	23002	23009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017359	ATTA	2	8	23069	23076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017359	GTTT	2	8	23227	23234	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017359	CGCT	2	8	23363	23370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017359	GGTT	2	8	27883	27890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017359	GATT	2	8	40271	40278	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017359	TTTA	2	8	52934	52941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017359	GCGG	2	8	52972	52979	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017359	TAAT	2	8	53034	53041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017359	TTGT	2	8	53112	53119	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017359	GATC	2	8	53942	53949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017359	TCTG	2	8	59660	59667	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017359	CAAA	2	8	60790	60797	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017359	TAGA	2	8	65603	65610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017359	TTTA	2	8	67278	67285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017359	CATG	2	8	67429	67436	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017359	GTTT	2	8	69127	69134	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017359	TTAG	2	8	71310	71317	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017359	TCCT	2	8	71323	71330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017359	GGTG	2	8	81765	81772	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017359	TCCC	2	8	81835	81842	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_017359	AAAG	2	8	84175	84182	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017359	TTTC	2	8	84442	84449	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017359	CTAA	2	8	86368	86375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017359	TTCA	2	8	87356	87363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017359	CCAA	2	8	97704	97711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017359	AGCA	2	8	101065	101072	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017359	CCGC	2	8	101087	101094	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_017359	CTTT	2	8	102990	102997	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017359	AAAT	2	8	103000	103007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017359	ATTT	2	8	104532	104539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017359	TCAT	2	8	109217	109224	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017359	ACTG	2	8	113946	113953	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017359	TTAG	2	8	117753	117760	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017359	AAAG	2	8	120658	120665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017359	AAAG	2	8	121154	121161	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017359	GAAG	2	8	121211	121218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017359	AATC	2	8	122389	122396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017359	TAAA	2	8	124848	124855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017359	TATC	2	8	129196	129203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017359	CAAA	2	8	129512	129519	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017359	TAAG	2	8	133074	133081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017359	TTTG	2	8	142732	142739	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017359	ATTT	2	8	151548	151555	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017359	GAGC	2	8	151610	151617	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017359	TCAA	2	8	152950	152957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017359	CTTG	2	8	153284	153291	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017359	CACT	2	8	163984	163991	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017359	GAAT	2	8	164313	164320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017359	TTTA	2	8	166945	166952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017359	GCGT	2	8	166969	166976	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017359	GATT	2	8	170009	170016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017359	CATT	2	8	175375	175382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017359	TTTG	2	8	175394	175401	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017359	TCTT	2	8	175797	175804	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017359	CTTG	2	8	176971	176978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017359	TCGT	2	8	177031	177038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017359	TGCA	2	8	177275	177282	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017359	TAAG	2	8	187638	187645	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017359	CTTT	2	8	190822	190829	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017359	CTAG	2	8	190856	190863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017359	CTTT	2	8	191358	191365	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017359	CACC	2	8	191407	191414	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_017359	TTTG	2	8	191524	191531	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017359	CTCA	2	8	192248	192255	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017359	AATG	2	8	192946	192953	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017359	TTTG	2	8	193052	193059	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017359	CAAA	2	8	193242	193249	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017359	TCTT	2	8	193587	193594	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017359	TTGA	2	8	193891	193898	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017359	AATG	2	8	200356	200363	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017359	TATT	2	8	208987	208994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017359	TTTA	2	8	212293	212300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017359	CGCT	2	8	214958	214965	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017359	ATTT	2	8	214967	214974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017359	AAAT	2	8	215247	215254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017359	TGAT	2	8	215312	215319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017359	TTTA	2	8	221632	221639	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017359	TCAA	2	8	227353	227360	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017359	TAAA	2	8	239846	239853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017359	TAAT	2	8	242472	242479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017359	AATA	2	8	242514	242521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017359	GCTT	2	8	252319	252326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017359	TGAT	2	8	252364	252371	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017359	AACA	2	8	295859	295866	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017359	TTTG	2	8	313573	313580	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017359	TGAG	2	8	313689	313696	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017359	TTGG	2	8	316404	316411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017359	AAAT	2	8	324918	324925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017359	TCAA	2	8	330629	330636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017359	ATTT	2	8	330859	330866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017359	AATC	2	8	331188	331195	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017359	CAAT	2	8	333543	333550	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017359	TGAA	2	8	337844	337851	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017359	CTAA	2	8	337852	337859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017359	CTTG	2	8	338681	338688	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017359	TGAA	2	8	339223	339230	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017359	ACAA	2	8	339301	339308	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017359	GAGC	2	8	339461	339468	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017359	TATT	2	8	339966	339973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017359	TAAA	2	8	348423	348430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017359	TTAA	2	8	359970	359977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017359	TAAA	2	8	359981	359988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017359	TGAT	2	8	370275	370282	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017359	TTGT	2	8	370292	370299	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017359	TTCG	2	8	370317	370324	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017359	ATCT	2	8	370338	370345	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017359	CTTT	2	8	370355	370362	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017359	CAAA	2	8	370493	370500	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017359	GTTT	2	8	377415	377422	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017359	TTTC	2	8	381760	381767	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017359	GGGT	2	8	383650	383657	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017359	AACA	2	8	383720	383727	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017359	CCAA	2	8	395752	395759	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017359	TCAA	2	8	413623	413630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017359	CAAT	2	8	415002	415009	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017359	AAGC	2	8	415028	415035	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017359	CAAT	2	8	415852	415859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017359	CACC	2	8	428847	428854	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
129	NC_017359	GTGG	2	8	429121	429128	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017359	TCTT	2	8	429327	429334	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017359	TATC	2	8	443614	443621	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017359	GAAA	2	8	443823	443830	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017359	TGTT	2	8	457388	457395	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017359	TCAA	2	8	457519	457526	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017359	AAAG	2	8	463107	463114	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017359	AAAC	2	8	464253	464260	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017359	TCTT	2	8	467260	467267	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017359	TCAT	2	8	469078	469085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017359	CAAT	2	8	471894	471901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017359	AAAG	2	8	484374	484381	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017359	ATCT	2	8	485540	485547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017359	TAAA	2	8	485578	485585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017359	CTTT	2	8	488237	488244	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017359	CCAA	2	8	491198	491205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017359	CGCA	2	8	499515	499522	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017359	GGAG	2	8	499587	499594	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017359	TAAA	2	8	499627	499634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017359	GGCA	2	8	499767	499774	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017359	AAAT	2	8	503250	503257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017359	ATTT	2	8	513408	513415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_017359	TTGA	2	8	514296	514303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.