MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Cuz20 chromosome

Total Repeats: 793

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017358	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	384892012
2	NC_017358	CAATAT	2	12	15215	15226	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384892024
3	NC_017358	AAACAC	2	12	16142	16153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017358	AGAAAA	2	12	16492	16503	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384892025
5	NC_017358	GATAAA	2	12	20048	20059	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384892028
6	NC_017358	TATTTG	2	12	24499	24510	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384892031
7	NC_017358	TTTTAG	2	12	27034	27045	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384892034
8	NC_017358	CATGAA	2	12	28368	28379	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384892037
9	NC_017358	GCGTGG	2	12	28945	28956	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384892038
10	NC_017358	TTGGAT	2	12	29055	29066	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384892038
11	NC_017358	CTTGAA	2	12	30134	30145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384892038
12	NC_017358	TAAGGA	2	12	30434	30445	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384892038
13	NC_017358	TAGGGG	2	12	31958	31969	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384892041
14	NC_017358	AAAGAA	2	12	33470	33481	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384892042
15	NC_017358	CAAAAT	2	12	37383	37394	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384892046
16	NC_017358	TAGACT	2	12	40353	40364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017358	GCCTTA	2	12	40416	40427	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384892049
18	NC_017358	CGCAAA	2	12	41207	41218	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384892049
19	NC_017358	TCTTTG	2	12	46683	46694	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384892055
20	NC_017358	TGAAAT	2	12	47183	47194	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384892055
21	NC_017358	TAAAAA	2	12	51834	51845	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384892060
22	NC_017358	GAAAAA	2	12	56904	56915	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017358	AGCGGG	2	12	59068	59079	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017358	AGTAAT	2	12	66687	66698	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017358	ACGCCC	2	12	66855	66866	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384892072
26	NC_017358	CGCCCA	2	12	70110	70121	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384892075
27	NC_017358	GCGCAT	2	12	71773	71784	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384892078
28	NC_017358	CTAACA	2	12	72884	72895	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384892078
29	NC_017358	ATACCG	2	12	73061	73072	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384892078
30	NC_017358	AACAGG	2	12	81843	81854	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384892085
31	NC_017358	ATTAGA	2	12	85858	85869	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384892089
32	NC_017358	GATTTT	2	12	87622	87633	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384892091
33	NC_017358	AAACTC	2	12	87739	87750	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384892091
34	NC_017358	TCAAAA	2	12	89204	89215	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384892092
35	NC_017358	GCGGTG	2	12	89904	89915	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384892093
36	NC_017358	TTAATT	2	12	90439	90450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384892093
37	NC_017358	TTAAGG	2	12	91450	91461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892094
38	NC_017358	GCATTG	2	12	91495	91506	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384892094
39	NC_017358	CAATAT	2	12	93119	93130	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384892094
40	NC_017358	AGCGTT	2	12	99721	99732	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384892099
41	NC_017358	TGCATG	2	12	101507	101518	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384892101
42	NC_017358	GCAAGC	2	12	105520	105531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384892105
43	NC_017358	AGGGAG	2	12	111799	111810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384892111
44	NC_017358	TAGGCA	2	12	112664	112675	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384892111
45	NC_017358	CTTCTA	2	12	114994	115005	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384892113
46	NC_017358	GTTCTA	2	12	115126	115137	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384892113
47	NC_017358	GTTCTA	2	12	115294	115305	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384892113
48	NC_017358	CTAAGG	2	12	116628	116639	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384892114
49	NC_017358	TGAATT	2	12	117162	117173	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384892114
50	NC_017358	TTTCAA	2	12	117321	117332	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384892114
51	NC_017358	TCACTA	2	12	118927	118938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892116
52	NC_017358	TGCTTT	2	12	120176	120187	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384892116
53	NC_017358	AGCAAA	2	12	120669	120680	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384892117
54	NC_017358	GTTTTA	2	12	121680	121691	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017358	TCATGA	2	12	123448	123459	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384892121
56	NC_017358	AAAAAT	2	12	129979	129990	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384892128
57	NC_017358	ATCCTT	2	12	130671	130682	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384892129
58	NC_017358	ATTCAA	2	12	131063	131074	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384892130
59	NC_017358	TAGCGA	2	12	132119	132130	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384892131
60	NC_017358	TTAGCG	2	12	135011	135022	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384892133
61	NC_017358	TATCGC	2	12	135223	135234	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384892133
62	NC_017358	ATCGCT	2	12	136930	136941	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384892134
63	NC_017358	CCTAAA	2	12	139153	139164	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384892136
64	NC_017358	TTGTTT	2	12	143301	143312	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384892142
65	NC_017358	CTTGGG	2	12	143962	143973	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384892144
66	NC_017358	TTGGGT	2	12	148736	148747	0 %	50 %	50 %	0 %	384892149
67	NC_017358	GATTTT	2	12	149248	149259	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384892150
68	NC_017358	GATGGC	2	12	152577	152588	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384892154
69	NC_017358	CTTTCT	2	12	152721	152732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892154
70	NC_017358	CCGCTC	2	12	154731	154742	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384892156
71	NC_017358	GCTCTC	2	12	157158	157169	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384892158
72	NC_017358	TAAAAA	2	12	157816	157827	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017358	TTCTAA	2	12	159481	159492	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384892161
74	NC_017358	TCAATA	2	12	161163	161174	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384892163
75	NC_017358	ATCGTT	2	12	161585	161596	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384892163
76	NC_017358	AATTTC	2	12	161936	161947	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384892164
77	NC_017358	TAAAAT	2	12	163460	163471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892165
78	NC_017358	ATTTTG	2	12	165268	165279	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384892168
79	NC_017358	AAAGAG	2	12	165288	165299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892168
80	NC_017358	CGCTTT	2	12	165746	165757	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384892168
81	NC_017358	GTTTAA	2	12	166530	166541	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384892169
82	NC_017358	CCGCTC	2	12	169185	169196	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384892172
83	NC_017358	AAAGCA	2	12	170381	170392	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384892173
84	NC_017358	GAAAAA	2	12	172815	172826	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384892176
85	NC_017358	AGGCAT	2	12	172904	172915	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384892176
86	NC_017358	GCATTT	2	12	174617	174628	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384892178
87	NC_017358	TCAAAC	2	12	175184	175195	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384892179
88	NC_017358	ATAAAG	2	12	175345	175356	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384892179
89	NC_017358	GGTATT	2	12	179114	179125	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384892183
90	NC_017358	TCTAAA	2	12	179344	179355	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384892183
91	NC_017358	TGGGCA	2	12	180413	180424	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384892184
92	NC_017358	TTCTAA	2	12	180892	180903	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384892185
93	NC_017358	ATTTTC	2	12	182837	182848	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384892185
94	NC_017358	TCAAAA	2	12	186734	186745	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017358	CGCTAA	2	12	187031	187042	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384892190
96	NC_017358	GCTCAT	2	12	187049	187060	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384892190
97	NC_017358	TTTCTT	2	12	187465	187476	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384892190
98	NC_017358	CGCTAA	2	12	189817	189828	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384892193
99	NC_017358	CATAAA	2	12	192640	192651	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384892198
100	NC_017358	ATATTT	2	12	193876	193887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384892201
101	NC_017358	TAGCGT	2	12	195924	195935	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384892204
102	NC_017358	AATTTC	2	12	197005	197016	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384892204
103	NC_017358	ATCGCT	2	12	198744	198755	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384892207
104	NC_017358	TTCTTT	2	12	200977	200988	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384892210
105	NC_017358	AATATC	2	12	202062	202073	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384892211
106	NC_017358	CTTTTT	2	12	206759	206770	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384892211
107	NC_017358	CATTAT	2	12	206840	206851	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384892211
108	NC_017358	TAATTT	2	12	207371	207382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384892212
109	NC_017358	GCTCTT	2	12	207927	207938	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384892212
110	NC_017358	TCTTGT	2	12	208556	208567	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384892212
111	NC_017358	CGTTAT	2	12	209688	209699	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384892213
112	NC_017358	TCAAAT	2	12	211526	211537	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384892214
113	NC_017358	TTTATT	2	12	212733	212744	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384892216
114	NC_017358	ATCGCT	2	12	213097	213108	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384892216
115	NC_017358	TTCAAG	2	12	213889	213900	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384892219
116	NC_017358	TTTTTG	2	12	215449	215460	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017358	TGGGGC	2	12	219337	219348	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384892227
118	NC_017358	ATTTTT	2	12	223172	223183	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384892230
119	NC_017358	TAGTAA	2	12	228759	228770	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384892236
120	NC_017358	CAATCT	2	12	234023	234034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892240
121	NC_017358	AAAGCT	2	12	235011	235022	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384892240
122	NC_017358	TTTGAA	2	12	236466	236477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384892242
123	NC_017358	ACAAAT	2	12	237332	237343	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384892243
124	NC_017358	TAAAAT	2	12	239484	239495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892245
125	NC_017358	GCTGTG	2	12	242890	242901	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384892253
126	NC_017358	TTAAAA	2	12	244243	244254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892253
127	NC_017358	CTTTCT	2	12	244894	244905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892255
128	NC_017358	CGCATG	2	12	246002	246013	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384892256
129	NC_017358	GAAAAA	2	12	246373	246384	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384892256
130	NC_017358	CTCTTT	2	12	251420	251431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017358	AGCTTG	2	12	253834	253845	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017358	TCTTGC	2	12	255740	255751	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017358	ACCACT	2	12	262123	262134	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384892262
134	NC_017358	AATTGA	2	12	262247	262258	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384892262
135	NC_017358	CGCTCT	2	12	262856	262867	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017358	TTAGAA	2	12	266469	266480	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017358	TATAAT	2	12	269663	269674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017358	ATTCTA	2	12	269988	269999	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384892268
139	NC_017358	CATAGC	2	12	271759	271770	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384892269
140	NC_017358	GTTTTG	2	12	272264	272275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384892269
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142	NC_017358	TAATTA	2	12	276767	276778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017358	TAAAGA	2	12	277441	277452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017358	GCTAAA	2	12	280278	280289	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384892276
145	NC_017358	AATGCC	2	12	284729	284740	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384892281
146	NC_017358	GGATTG	2	12	287013	287024	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384892284
147	NC_017358	GCTGTA	2	12	287290	287301	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384892284
148	NC_017358	GGTGAT	2	12	288969	288980	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384892285
149	NC_017358	TCAATA	2	12	289393	289404	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384892286
150	NC_017358	CACGCC	2	12	289873	289884	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384892286
151	NC_017358	GCTTTG	2	12	291117	291128	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384892287
152	NC_017358	GCTAGG	2	12	292498	292509	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384892288
153	NC_017358	TCTTTA	2	12	298838	298849	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384892295
154	NC_017358	GTTTTT	2	12	304474	304485	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384892302
155	NC_017358	ATTTTA	2	12	305934	305945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017358	ATTGTC	2	12	307634	307645	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384892305
157	NC_017358	TCCCGC	2	12	309817	309828	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384892307
158	NC_017358	TCCCGC	2	12	310630	310641	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384892307
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181	NC_017358	ATTTCA	2	12	360893	360904	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384892348
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217	NC_017358	ATCCCC	2	12	425224	425235	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384892413
218	NC_017358	GGTTTA	2	12	425541	425552	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384892413
219	NC_017358	AAACGC	2	12	430117	430128	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384892418
220	NC_017358	TTTGAA	2	12	433116	433127	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384892421
221	NC_017358	ATTACA	2	12	433710	433721	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
222	NC_017358	CTTGCA	2	12	435773	435784	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384892424
223	NC_017358	TTTATT	2	12	436822	436833	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
224	NC_017358	ATAGCG	2	12	439235	439246	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384892429
225	NC_017358	TTTTAT	2	12	440297	440308	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384892430
226	NC_017358	ATCATA	2	12	447714	447725	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384892439
227	NC_017358	AAAAGT	2	12	449081	449092	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
228	NC_017358	TTGCTT	2	12	450106	450117	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384892442
229	NC_017358	GTTTAG	2	12	454038	454049	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384892445
230	NC_017358	TTGAAT	2	12	454140	454151	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384892445
231	NC_017358	TTGAAA	2	12	457415	457426	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384892449
232	NC_017358	GCGTTT	2	12	459705	459716	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384892452
233	NC_017358	GGTGAT	2	12	459881	459892	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384892452
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338	NC_017358	ATTTCT	2	12	673389	673400	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384892649
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349	NC_017358	AGAAAA	2	12	703123	703134	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384892676
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351	NC_017358	TAAAGA	2	12	707175	707186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384892680
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