MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Cuz20 chromosome

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017358	AAACAC	2	12	16142	16153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017358	TAGACT	2	12	40353	40364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017358	GAAAAA	2	12	56904	56915	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017358	AGCGGG	2	12	59068	59079	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017358	AGTAAT	2	12	66687	66698	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017358	GTTTTA	2	12	121680	121691	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017358	TAAAAA	2	12	157816	157827	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017358	TCAAAA	2	12	186734	186745	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017358	TTTTTG	2	12	215449	215460	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017358	CTCTTT	2	12	251420	251431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017358	AGCTTG	2	12	253834	253845	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017358	TCTTGC	2	12	255740	255751	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017358	CGCTCT	2	12	262856	262867	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017358	TTAGAA	2	12	266469	266480	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017358	TATAAT	2	12	269663	269674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017358	TAATTA	2	12	276767	276778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017358	TAAAGA	2	12	277441	277452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017358	ATTTTA	2	12	305934	305945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017358	TTTAGA	2	12	357883	357894	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017358	GATTTA	2	12	380031	380042	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017358	ATTACA	2	12	433710	433721	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017358	TTTATT	2	12	436822	436833	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017358	AAAAGT	2	12	449081	449092	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017358	AAAATA	2	12	493175	493186	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017358	TAAAAA	2	12	507240	507251	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017358	ATTTTT	2	12	518671	518682	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017358	TATTTT	2	12	530309	530320	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017358	TTTAAT	2	12	539843	539854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017358	TTTAAA	2	12	603200	603211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017358	TTAGGG	2	12	616860	616871	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017358	ATTTTA	2	12	635965	635976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017358	AAAATC	2	12	643053	643064	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017358	CAAAGC	2	12	671361	671372	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017358	AAGAAA	2	12	742219	742230	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017358	AATGAG	2	12	742255	742266	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017358	AAAAAT	2	12	748005	748016	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017358	ACAATA	2	12	770796	770807	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017358	TAAAAT	2	12	780144	780155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017358	ATAAAA	2	12	877038	877049	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017358	ATTTTT	2	12	937543	937554	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017358	AAAAAG	2	12	957124	957135	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017358	ATTATA	2	12	977858	977869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017358	TAAAAT	2	12	977883	977894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017358	ATTGAA	2	12	985257	985268	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017358	TCAAAT	2	12	1007731	1007742	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017358	TATCCT	2	12	1024579	1024590	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017358	GCTTAG	2	12	1058571	1058582	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017358	TTATAC	2	12	1060589	1060600	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017358	CTAAAA	2	12	1067765	1067776	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017358	GCAACA	2	12	1081986	1081997	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017358	ATTTGA	2	12	1131462	1131473	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017358	ATAAAG	2	12	1206983	1206994	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017358	TTGTAT	2	12	1239973	1239984	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017358	ACTTAA	2	12	1257026	1257037	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017358	TCATTT	2	12	1279153	1279164	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017358	AAACTT	2	12	1279176	1279187	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017358	ACCCTA	2	12	1283712	1283723	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017358	CTTATA	2	12	1294321	1294332	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017358	ATTTTT	2	12	1310419	1310430	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017358	TAAAAA	2	12	1339263	1339274	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017358	AGTTTT	2	12	1423758	1423769	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017358	TTATAC	2	12	1427270	1427281	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017358	AGCGGG	2	12	1434490	1434501	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017358	TGTTTA	2	12	1436755	1436766	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017358	AAAGAC	2	12	1437651	1437662	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017358	GTTTTA	2	12	1444431	1444442	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017358	TAAAAA	2	12	1445268	1445279	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017358	TCTAAG	3	18	1455156	1455173	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017358	AAACAA	2	12	1457753	1457764	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017358	TGTTTA	2	12	1463686	1463697	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017358	CGCTAA	2	12	1555414	1555425	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017358	ATCAGC	2	12	1559518	1559529	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017358	CCTAAA	2	12	1570839	1570850	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017358	GAAAAA	2	12	1578549	1578560	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017358	TTTAAA	2	12	1585613	1585624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017358	ATTGCT	2	12	1586120	1586131	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.