MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Cuz20 chromosome

Total Repeats: 717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017358	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	384892012
2	NC_017358	CAATAT	2	12	15215	15226	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384892024
3	NC_017358	AGAAAA	2	12	16492	16503	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384892025
4	NC_017358	GATAAA	2	12	20048	20059	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384892028
5	NC_017358	TATTTG	2	12	24499	24510	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384892031
6	NC_017358	TTTTAG	2	12	27034	27045	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384892034
7	NC_017358	CATGAA	2	12	28368	28379	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384892037
8	NC_017358	GCGTGG	2	12	28945	28956	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384892038
9	NC_017358	TTGGAT	2	12	29055	29066	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384892038
10	NC_017358	CTTGAA	2	12	30134	30145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384892038
11	NC_017358	TAAGGA	2	12	30434	30445	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384892038
12	NC_017358	TAGGGG	2	12	31958	31969	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384892041
13	NC_017358	AAAGAA	2	12	33470	33481	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384892042
14	NC_017358	CAAAAT	2	12	37383	37394	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384892046
15	NC_017358	GCCTTA	2	12	40416	40427	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384892049
16	NC_017358	CGCAAA	2	12	41207	41218	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384892049
17	NC_017358	TCTTTG	2	12	46683	46694	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384892055
18	NC_017358	TGAAAT	2	12	47183	47194	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384892055
19	NC_017358	TAAAAA	2	12	51834	51845	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384892060
20	NC_017358	ACGCCC	2	12	66855	66866	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384892072
21	NC_017358	CGCCCA	2	12	70110	70121	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384892075
22	NC_017358	GCGCAT	2	12	71773	71784	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384892078
23	NC_017358	CTAACA	2	12	72884	72895	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384892078
24	NC_017358	ATACCG	2	12	73061	73072	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384892078
25	NC_017358	AACAGG	2	12	81843	81854	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384892085
26	NC_017358	ATTAGA	2	12	85858	85869	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384892089
27	NC_017358	GATTTT	2	12	87622	87633	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384892091
28	NC_017358	AAACTC	2	12	87739	87750	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384892091
29	NC_017358	TCAAAA	2	12	89204	89215	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384892092
30	NC_017358	GCGGTG	2	12	89904	89915	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384892093
31	NC_017358	TTAATT	2	12	90439	90450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384892093
32	NC_017358	TTAAGG	2	12	91450	91461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384892094
33	NC_017358	GCATTG	2	12	91495	91506	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384892094
34	NC_017358	CAATAT	2	12	93119	93130	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384892094
35	NC_017358	AGCGTT	2	12	99721	99732	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384892099
36	NC_017358	TGCATG	2	12	101507	101518	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384892101
37	NC_017358	GCAAGC	2	12	105520	105531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384892105
38	NC_017358	AGGGAG	2	12	111799	111810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384892111
39	NC_017358	TAGGCA	2	12	112664	112675	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384892111
40	NC_017358	CTTCTA	2	12	114994	115005	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384892113
41	NC_017358	GTTCTA	2	12	115126	115137	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384892113
42	NC_017358	GTTCTA	2	12	115294	115305	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384892113
43	NC_017358	CTAAGG	2	12	116628	116639	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384892114
44	NC_017358	TGAATT	2	12	117162	117173	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384892114
45	NC_017358	TTTCAA	2	12	117321	117332	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384892114
46	NC_017358	TCACTA	2	12	118927	118938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892116
47	NC_017358	TGCTTT	2	12	120176	120187	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384892116
48	NC_017358	AGCAAA	2	12	120669	120680	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384892117
49	NC_017358	TCATGA	2	12	123448	123459	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384892121
50	NC_017358	AAAAAT	2	12	129979	129990	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384892128
51	NC_017358	ATCCTT	2	12	130671	130682	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384892129
52	NC_017358	ATTCAA	2	12	131063	131074	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384892130
53	NC_017358	TAGCGA	2	12	132119	132130	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384892131
54	NC_017358	TTAGCG	2	12	135011	135022	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384892133
55	NC_017358	TATCGC	2	12	135223	135234	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384892133
56	NC_017358	ATCGCT	2	12	136930	136941	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384892134
57	NC_017358	CCTAAA	2	12	139153	139164	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384892136
58	NC_017358	TTGTTT	2	12	143301	143312	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384892142
59	NC_017358	CTTGGG	2	12	143962	143973	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384892144
60	NC_017358	TTGGGT	2	12	148736	148747	0 %	50 %	50 %	0 %	384892149
61	NC_017358	GATTTT	2	12	149248	149259	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384892150
62	NC_017358	GATGGC	2	12	152577	152588	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384892154
63	NC_017358	CTTTCT	2	12	152721	152732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892154
64	NC_017358	CCGCTC	2	12	154731	154742	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384892156
65	NC_017358	GCTCTC	2	12	157158	157169	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384892158
66	NC_017358	TTCTAA	2	12	159481	159492	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384892161
67	NC_017358	TCAATA	2	12	161163	161174	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384892163
68	NC_017358	ATCGTT	2	12	161585	161596	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384892163
69	NC_017358	AATTTC	2	12	161936	161947	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384892164
70	NC_017358	TAAAAT	2	12	163460	163471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892165
71	NC_017358	ATTTTG	2	12	165268	165279	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384892168
72	NC_017358	AAAGAG	2	12	165288	165299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384892168
73	NC_017358	CGCTTT	2	12	165746	165757	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384892168
74	NC_017358	GTTTAA	2	12	166530	166541	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384892169
75	NC_017358	CCGCTC	2	12	169185	169196	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384892172
76	NC_017358	AAAGCA	2	12	170381	170392	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384892173
77	NC_017358	GAAAAA	2	12	172815	172826	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384892176
78	NC_017358	AGGCAT	2	12	172904	172915	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384892176
79	NC_017358	GCATTT	2	12	174617	174628	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384892178
80	NC_017358	TCAAAC	2	12	175184	175195	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384892179
81	NC_017358	ATAAAG	2	12	175345	175356	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384892179
82	NC_017358	GGTATT	2	12	179114	179125	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384892183
83	NC_017358	TCTAAA	2	12	179344	179355	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384892183
84	NC_017358	TGGGCA	2	12	180413	180424	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384892184
85	NC_017358	TTCTAA	2	12	180892	180903	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384892185
86	NC_017358	ATTTTC	2	12	182837	182848	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384892185
87	NC_017358	CGCTAA	2	12	187031	187042	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384892190
88	NC_017358	GCTCAT	2	12	187049	187060	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384892190
89	NC_017358	TTTCTT	2	12	187465	187476	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384892190
90	NC_017358	CGCTAA	2	12	189817	189828	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384892193
91	NC_017358	CATAAA	2	12	192640	192651	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384892198
92	NC_017358	ATATTT	2	12	193876	193887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384892201
93	NC_017358	TAGCGT	2	12	195924	195935	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384892204
94	NC_017358	AATTTC	2	12	197005	197016	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384892204
95	NC_017358	ATCGCT	2	12	198744	198755	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384892207
96	NC_017358	TTCTTT	2	12	200977	200988	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384892210
97	NC_017358	AATATC	2	12	202062	202073	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384892211
98	NC_017358	CTTTTT	2	12	206759	206770	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384892211
99	NC_017358	CATTAT	2	12	206840	206851	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384892211
100	NC_017358	TAATTT	2	12	207371	207382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384892212
101	NC_017358	GCTCTT	2	12	207927	207938	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384892212
102	NC_017358	TCTTGT	2	12	208556	208567	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384892212
103	NC_017358	CGTTAT	2	12	209688	209699	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384892213
104	NC_017358	TCAAAT	2	12	211526	211537	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384892214
105	NC_017358	TTTATT	2	12	212733	212744	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384892216
106	NC_017358	ATCGCT	2	12	213097	213108	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384892216
107	NC_017358	TTCAAG	2	12	213889	213900	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384892219
108	NC_017358	TGGGGC	2	12	219337	219348	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384892227
109	NC_017358	ATTTTT	2	12	223172	223183	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384892230
110	NC_017358	TAGTAA	2	12	228759	228770	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384892236
111	NC_017358	CAATCT	2	12	234023	234034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384892240
112	NC_017358	AAAGCT	2	12	235011	235022	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384892240
113	NC_017358	TTTGAA	2	12	236466	236477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384892242
114	NC_017358	ACAAAT	2	12	237332	237343	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384892243
115	NC_017358	TAAAAT	2	12	239484	239495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892245
116	NC_017358	GCTGTG	2	12	242890	242901	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384892253
117	NC_017358	TTAAAA	2	12	244243	244254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384892253
118	NC_017358	CTTTCT	2	12	244894	244905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384892255
119	NC_017358	CGCATG	2	12	246002	246013	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384892256
120	NC_017358	GAAAAA	2	12	246373	246384	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384892256
121	NC_017358	ACCACT	2	12	262123	262134	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384892262
122	NC_017358	AATTGA	2	12	262247	262258	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384892262
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130	NC_017358	GCTGTA	2	12	287290	287301	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384892284
131	NC_017358	GGTGAT	2	12	288969	288980	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384892285
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140	NC_017358	TCCCGC	2	12	310630	310641	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384892307
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342	NC_017358	TGCGTG	2	12	739484	739495	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384892707
343	NC_017358	TTTCTT	2	12	744176	744187	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384892711
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345	NC_017358	TTTTAG	2	12	744904	744915	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384892713
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452	NC_017358	TTGATA	2	12	994952	994963	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384892943
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