MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Cuz20 chromosome

Total Repeats: 1142

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017358	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	384892011
2	NC_017358	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	384892012
3	NC_017358	TTGAA	2	10	9724	9733	40 %	40 %	20 %	0 %	384892019
4	NC_017358	TTTTG	2	10	9740	9749	0 %	80 %	20 %	0 %	384892019
5	NC_017358	TGGTG	2	10	10578	10587	0 %	40 %	60 %	0 %	384892020
6	NC_017358	CAAAA	2	10	16457	16466	80 %	0 %	0 %	20 %	384892025
7	NC_017358	CATCA	2	10	17833	17842	40 %	20 %	0 %	40 %	384892026
8	NC_017358	TGAAA	2	10	18801	18810	60 %	20 %	20 %	0 %	384892027
9	NC_017358	CCATG	2	10	20992	21001	20 %	20 %	20 %	40 %	384892030
10	NC_017358	CTCTT	2	10	21022	21031	0 %	60 %	0 %	40 %	384892030
11	NC_017358	CAAGC	2	10	25630	25639	40 %	0 %	20 %	40 %	384892032
12	NC_017358	TTTTA	2	10	26560	26569	20 %	80 %	0 %	0 %	384892033
13	NC_017358	GATAA	2	10	28641	28650	60 %	20 %	20 %	0 %	384892037
14	NC_017358	GTGGG	2	10	30097	30106	0 %	20 %	80 %	0 %	384892038
15	NC_017358	TGGGG	2	10	31348	31357	0 %	20 %	80 %	0 %	384892040
16	NC_017358	AAGCC	2	10	37123	37132	40 %	0 %	20 %	40 %	384892046
17	NC_017358	AGAAA	2	10	38423	38432	80 %	0 %	20 %	0 %	384892047
18	NC_017358	TACTC	2	10	39276	39285	20 %	40 %	0 %	40 %	384892048
19	NC_017358	TAAAA	2	10	41142	41151	80 %	20 %	0 %	0 %	384892049
20	NC_017358	TCCCA	2	10	42154	42163	20 %	20 %	0 %	60 %	384892050
21	NC_017358	GCTCC	2	10	42475	42484	0 %	20 %	20 %	60 %	384892050
22	NC_017358	TCGCA	2	10	43012	43021	20 %	20 %	20 %	40 %	384892050
23	NC_017358	TGCCT	2	10	45267	45276	0 %	40 %	20 %	40 %	384892052
24	NC_017358	GCTTT	2	10	47551	47560	0 %	60 %	20 %	20 %	384892055
25	NC_017358	TAAAA	2	10	48742	48751	80 %	20 %	0 %	0 %	384892056
26	NC_017358	ATTTC	2	10	48817	48826	20 %	60 %	0 %	20 %	384892056
27	NC_017358	TGAAA	2	10	50753	50762	60 %	20 %	20 %	0 %	384892060
28	NC_017358	TCAAA	2	10	51007	51016	60 %	20 %	0 %	20 %	384892060
29	NC_017358	TCGCC	2	10	53750	53759	0 %	20 %	20 %	60 %	384892061
30	NC_017358	TAAAA	2	10	54046	54055	80 %	20 %	0 %	0 %	384892061
31	NC_017358	TCAAA	2	10	54762	54771	60 %	20 %	0 %	20 %	384892061
32	NC_017358	GCGTT	2	10	61316	61325	0 %	40 %	40 %	20 %	384892066
33	NC_017358	TCAAT	2	10	62170	62179	40 %	40 %	0 %	20 %	384892067
34	NC_017358	CTTCT	2	10	63012	63021	0 %	60 %	0 %	40 %	384892068
35	NC_017358	TGCCT	2	10	63089	63098	0 %	40 %	20 %	40 %	384892068
36	NC_017358	TCCAA	2	10	63501	63510	40 %	20 %	0 %	40 %	384892069
37	NC_017358	ACGCC	2	10	67117	67126	20 %	0 %	20 %	60 %	384892072
38	NC_017358	AAAGC	2	10	67883	67892	60 %	0 %	20 %	20 %	384892073
39	NC_017358	GTATG	2	10	72048	72057	20 %	40 %	40 %	0 %	384892078
40	NC_017358	ATCTT	2	10	75046	75055	20 %	60 %	0 %	20 %	384892079
41	NC_017358	TGGCT	2	10	75587	75596	0 %	40 %	40 %	20 %	384892079
42	NC_017358	ATGCC	2	10	76009	76018	20 %	20 %	20 %	40 %	384892080
43	NC_017358	TTGAT	2	10	77065	77074	20 %	60 %	20 %	0 %	384892082
44	NC_017358	GGCGT	2	10	78878	78887	0 %	20 %	60 %	20 %	384892084
45	NC_017358	CTTTC	2	10	82412	82421	0 %	60 %	0 %	40 %	384892086
46	NC_017358	TTTGA	2	10	85202	85211	20 %	60 %	20 %	0 %	384892089
47	NC_017358	TCTTT	2	10	85413	85422	0 %	80 %	0 %	20 %	384892089
48	NC_017358	CGGCA	2	10	89170	89179	20 %	0 %	40 %	40 %	384892092
49	NC_017358	CTTCT	2	10	90047	90056	0 %	60 %	0 %	40 %	384892093
50	NC_017358	ACGAT	2	10	91651	91660	40 %	20 %	20 %	20 %	384892094
51	NC_017358	TTTTC	2	10	91846	91855	0 %	80 %	0 %	20 %	384892094
52	NC_017358	AATTG	2	10	93502	93511	40 %	40 %	20 %	0 %	384892095
53	NC_017358	TCGTT	2	10	95302	95311	0 %	60 %	20 %	20 %	384892096
54	NC_017358	TTTAT	2	10	100374	100383	20 %	80 %	0 %	0 %	384892101
55	NC_017358	AAAGC	2	10	101354	101363	60 %	0 %	20 %	20 %	384892101
56	NC_017358	TGTCT	2	10	103240	103249	0 %	60 %	20 %	20 %	384892104
57	NC_017358	CAAAT	2	10	103633	103642	60 %	20 %	0 %	20 %	384892104
58	NC_017358	ACCCT	2	10	105062	105071	20 %	20 %	0 %	60 %	384892105
59	NC_017358	TTTTC	2	10	105113	105122	0 %	80 %	0 %	20 %	384892105
60	NC_017358	ATGCC	2	10	105194	105203	20 %	20 %	20 %	40 %	384892105
61	NC_017358	TGATT	2	10	107198	107207	20 %	60 %	20 %	0 %	384892107
62	NC_017358	TCTGA	2	10	109681	109690	20 %	40 %	20 %	20 %	384892110
63	NC_017358	GGATC	2	10	111693	111702	20 %	20 %	40 %	20 %	384892111
64	NC_017358	AAGCC	2	10	113601	113610	40 %	0 %	20 %	40 %	384892112
65	NC_017358	GTTTG	2	10	114954	114963	0 %	60 %	40 %	0 %	384892113
66	NC_017358	ATTCT	2	10	115386	115395	20 %	60 %	0 %	20 %	384892113
67	NC_017358	TGATC	2	10	115560	115569	20 %	40 %	20 %	20 %	384892113
68	NC_017358	CGCTG	2	10	116500	116509	0 %	20 %	40 %	40 %	384892114
69	NC_017358	TTTGA	2	10	116647	116656	20 %	60 %	20 %	0 %	384892114
70	NC_017358	GACTT	2	10	117181	117190	20 %	40 %	20 %	20 %	384892114
71	NC_017358	ATCTC	2	10	117932	117941	20 %	40 %	0 %	40 %	384892114
72	NC_017358	CGCTT	2	10	118090	118099	0 %	40 %	20 %	40 %	384892114
73	NC_017358	TTTGT	2	10	118447	118456	0 %	80 %	20 %	0 %	384892115
74	NC_017358	TGCGT	2	10	120480	120489	0 %	40 %	40 %	20 %	384892117
75	NC_017358	GAAAA	2	10	120641	120650	80 %	0 %	20 %	0 %	384892117
76	NC_017358	GAAAA	2	10	120959	120968	80 %	0 %	20 %	0 %	384892117
77	NC_017358	ATTTT	2	10	123917	123926	20 %	80 %	0 %	0 %	384892122
78	NC_017358	ATGTT	2	10	123999	124008	20 %	60 %	20 %	0 %	384892122
79	NC_017358	AAAAG	2	10	124411	124420	80 %	0 %	20 %	0 %	384892122
80	NC_017358	TAGGG	2	10	125396	125405	20 %	20 %	60 %	0 %	384892123
81	NC_017358	AAATC	2	10	126662	126671	60 %	20 %	0 %	20 %	384892124
82	NC_017358	AAAAT	2	10	128134	128143	80 %	20 %	0 %	0 %	384892125
83	NC_017358	TGAAA	2	10	129848	129857	60 %	20 %	20 %	0 %	384892128
84	NC_017358	TTTTC	2	10	130483	130492	0 %	80 %	0 %	20 %	384892129
85	NC_017358	GTAAA	2	10	131035	131044	60 %	20 %	20 %	0 %	384892130
86	NC_017358	TTCTT	2	10	132439	132448	0 %	80 %	0 %	20 %	384892131
87	NC_017358	TCTTT	2	10	132933	132942	0 %	80 %	0 %	20 %	384892132
88	NC_017358	TTTTG	2	10	134096	134105	0 %	80 %	20 %	0 %	384892133
89	NC_017358	AATTC	2	10	134730	134739	40 %	40 %	0 %	20 %	384892133
90	NC_017358	GCGAT	2	10	134889	134898	20 %	20 %	40 %	20 %	384892133
91	NC_017358	GCTTG	2	10	135145	135154	0 %	40 %	40 %	20 %	384892133
92	NC_017358	TTTTG	2	10	135796	135805	0 %	80 %	20 %	0 %	384892134
93	NC_017358	CCAAA	2	10	137636	137645	60 %	0 %	0 %	40 %	384892135
94	NC_017358	ACGCC	2	10	141158	141167	20 %	0 %	20 %	60 %	384892137
95	NC_017358	TTATT	2	10	143054	143063	20 %	80 %	0 %	0 %	384892141
96	NC_017358	GCGTT	2	10	143412	143421	0 %	40 %	40 %	20 %	384892143
97	NC_017358	CCCAG	2	10	144332	144341	20 %	0 %	20 %	60 %	384892144
98	NC_017358	AAAAC	2	10	147006	147015	80 %	0 %	0 %	20 %	384892147
99	NC_017358	GCAAA	2	10	148845	148854	60 %	0 %	20 %	20 %	384892149
100	NC_017358	AAGCC	2	10	150241	150250	40 %	0 %	20 %	40 %	384892152
101	NC_017358	GGGTG	2	10	152645	152654	0 %	20 %	80 %	0 %	384892154
102	NC_017358	ATTCA	2	10	154039	154048	40 %	40 %	0 %	20 %	384892155
103	NC_017358	CACTT	2	10	154243	154252	20 %	40 %	0 %	40 %	384892155
104	NC_017358	AAAAC	2	10	156376	156385	80 %	0 %	0 %	20 %	384892157
105	NC_017358	ATCTT	2	10	157441	157450	20 %	60 %	0 %	20 %	384892158
106	NC_017358	CGCAC	2	10	165327	165336	20 %	0 %	20 %	60 %	384892168
107	NC_017358	ATTTG	2	10	166812	166821	20 %	60 %	20 %	0 %	384892169
108	NC_017358	AATTG	2	10	166968	166977	40 %	40 %	20 %	0 %	384892170
109	NC_017358	TTTCT	2	10	167634	167643	0 %	80 %	0 %	20 %	384892171
110	NC_017358	AAATG	2	10	167971	167980	60 %	20 %	20 %	0 %	384892171
111	NC_017358	TGTAA	2	10	168761	168770	40 %	40 %	20 %	0 %	384892172
112	NC_017358	AGCTT	2	10	169799	169808	20 %	40 %	20 %	20 %	384892173
113	NC_017358	ATAAA	2	10	170257	170266	80 %	20 %	0 %	0 %	384892173
114	NC_017358	GAATA	2	10	170554	170563	60 %	20 %	20 %	0 %	384892173
115	NC_017358	AAAAG	2	10	171413	171422	80 %	0 %	20 %	0 %	384892175
116	NC_017358	ATTCA	2	10	178911	178920	40 %	40 %	0 %	20 %	384892183
117	NC_017358	GCGAA	2	10	181485	181494	40 %	0 %	40 %	20 %	384892185
118	NC_017358	TCATT	2	10	184522	184531	20 %	60 %	0 %	20 %	384892187
119	NC_017358	CATAA	2	10	185082	185091	60 %	20 %	0 %	20 %	384892188
120	NC_017358	CTATT	2	10	185411	185420	20 %	60 %	0 %	20 %	384892189
121	NC_017358	TAATT	2	10	187862	187871	40 %	60 %	0 %	0 %	384892191
122	NC_017358	CTTGC	2	10	188708	188717	0 %	40 %	20 %	40 %	384892192
123	NC_017358	CTTCG	2	10	189649	189658	0 %	40 %	20 %	40 %	384892193
124	NC_017358	TTGGT	2	10	190815	190824	0 %	60 %	40 %	0 %	384892195
125	NC_017358	TTTTG	2	10	191542	191551	0 %	80 %	20 %	0 %	384892196
126	NC_017358	GTTTT	2	10	191684	191693	0 %	80 %	20 %	0 %	384892196
127	NC_017358	AGCTC	2	10	193700	193709	20 %	20 %	20 %	40 %	384892201
128	NC_017358	GAAAT	2	10	193759	193768	60 %	20 %	20 %	0 %	384892201
129	NC_017358	AAACC	2	10	194319	194328	60 %	0 %	0 %	40 %	384892202
130	NC_017358	ATCAA	2	10	196106	196115	60 %	20 %	0 %	20 %	384892204
131	NC_017358	TTGTT	2	10	199943	199952	0 %	80 %	20 %	0 %	384892208
132	NC_017358	AAAAC	2	10	199958	199967	80 %	0 %	0 %	20 %	384892208
133	NC_017358	CTTAT	2	10	200646	200655	20 %	60 %	0 %	20 %	384892209
134	NC_017358	TCATG	2	10	202412	202421	20 %	40 %	20 %	20 %	384892211
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