MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Cuz20 chromosome

Total Repeats: 4599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017358	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	384892009
2	NC_017358	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	384892009
3	NC_017358	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	384892010
4	NC_017358	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	384892011
5	NC_017358	CTTG	2	8	1456	1463	0 %	50 %	25 %	25 %	384892011
6	NC_017358	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	384892012
7	NC_017358	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	384892012
8	NC_017358	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	384892012
9	NC_017358	TTAA	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	384892012
10	NC_017358	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	384892012
11	NC_017358	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	384892013
12	NC_017358	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	384892014
13	NC_017358	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	384892014
14	NC_017358	CAAG	2	8	3824	3831	50 %	0 %	25 %	25 %	384892014
15	NC_017358	ATGC	2	8	4282	4289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017358	TAAA	2	8	4690	4697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017358	CAAA	2	8	5391	5398	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017358	TTCA	2	8	5687	5694	25 %	50 %	0 %	25 %	384892016
19	NC_017358	TCTT	2	8	5981	5988	0 %	75 %	0 %	25 %	384892016
20	NC_017358	AAGC	2	8	6796	6803	50 %	0 %	25 %	25 %	384892016
21	NC_017358	ATAA	2	8	7484	7491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017358	ATTC	2	8	7687	7694	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017358	GATA	2	8	7776	7783	50 %	25 %	25 %	0 %	384892018
24	NC_017358	TCAA	2	8	7883	7890	50 %	25 %	0 %	25 %	384892018
25	NC_017358	GCTC	2	8	9326	9333	0 %	25 %	25 %	50 %	384892018
26	NC_017358	ATTG	2	8	9678	9685	25 %	50 %	25 %	0 %	384892019
27	NC_017358	GCAA	2	8	9869	9876	50 %	0 %	25 %	25 %	384892019
28	NC_017358	TGCT	2	8	10074	10081	0 %	50 %	25 %	25 %	384892019
29	NC_017358	GGCC	2	8	10337	10344	0 %	0 %	50 %	50 %	384892019
30	NC_017358	TTTG	2	8	10454	10461	0 %	75 %	25 %	0 %	384892019
31	NC_017358	TGCA	2	8	10555	10562	25 %	25 %	25 %	25 %	384892020
32	NC_017358	GTTT	2	8	10968	10975	0 %	75 %	25 %	0 %	384892020
33	NC_017358	TCTT	2	8	11355	11362	0 %	75 %	0 %	25 %	384892020
34	NC_017358	TTAA	2	8	11503	11510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017358	AGCG	2	8	11828	11835	25 %	0 %	50 %	25 %	384892022
36	NC_017358	GATT	2	8	11936	11943	25 %	50 %	25 %	0 %	384892022
37	NC_017358	CAAA	2	8	12105	12112	75 %	0 %	0 %	25 %	384892023
38	NC_017358	ATGC	2	8	12520	12527	25 %	25 %	25 %	25 %	384892023
39	NC_017358	GAGC	2	8	12825	12832	25 %	0 %	50 %	25 %	384892023
40	NC_017358	TTTA	2	8	13107	13114	25 %	75 %	0 %	0 %	384892023
41	NC_017358	CAGG	2	8	14265	14272	25 %	0 %	50 %	25 %	384892023
42	NC_017358	TGAT	2	8	14309	14316	25 %	50 %	25 %	0 %	384892023
43	NC_017358	AGTT	2	8	14437	14444	25 %	50 %	25 %	0 %	384892023
44	NC_017358	AGTT	2	8	14451	14458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017358	GCTT	2	8	15304	15311	0 %	50 %	25 %	25 %	384892024
46	NC_017358	ATCT	2	8	15861	15868	25 %	50 %	0 %	25 %	384892024
47	NC_017358	GTTT	2	8	16079	16086	0 %	75 %	25 %	0 %	384892024
48	NC_017358	TTGA	2	8	16421	16428	25 %	50 %	25 %	0 %	384892025
49	NC_017358	TGCT	2	8	16797	16804	0 %	50 %	25 %	25 %	384892025
50	NC_017358	AGCG	2	8	16969	16976	25 %	0 %	50 %	25 %	384892025
51	NC_017358	TAAA	2	8	18475	18482	75 %	25 %	0 %	0 %	384892027
52	NC_017358	GCGA	2	8	18484	18491	25 %	0 %	50 %	25 %	384892027
53	NC_017358	AGGC	2	8	18916	18923	25 %	0 %	50 %	25 %	384892027
54	NC_017358	TGAT	2	8	19068	19075	25 %	50 %	25 %	0 %	384892028
55	NC_017358	CTTT	2	8	19335	19342	0 %	75 %	0 %	25 %	384892028
56	NC_017358	AAGT	2	8	19647	19654	50 %	25 %	25 %	0 %	384892028
57	NC_017358	GCTT	2	8	19780	19787	0 %	50 %	25 %	25 %	384892028
58	NC_017358	CACT	2	8	19936	19943	25 %	25 %	0 %	50 %	384892028
59	NC_017358	TTTA	2	8	20234	20241	25 %	75 %	0 %	0 %	384892028
60	NC_017358	CTTT	2	8	20412	20419	0 %	75 %	0 %	25 %	384892028
61	NC_017358	ATCA	2	8	20551	20558	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017358	CTCC	2	8	20618	20625	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_017358	TTAG	2	8	20761	20768	25 %	50 %	25 %	0 %	384892029
64	NC_017358	CTTT	2	8	20776	20783	0 %	75 %	0 %	25 %	384892029
65	NC_017358	GTTT	2	8	21349	21356	0 %	75 %	25 %	0 %	384892030
66	NC_017358	ACTG	2	8	21646	21653	25 %	25 %	25 %	25 %	384892030
67	NC_017358	TTCC	2	8	22147	22154	0 %	50 %	0 %	50 %	384892030
68	NC_017358	TCCC	2	8	22492	22499	0 %	25 %	0 %	75 %	384892030
69	NC_017358	GTAT	2	8	22997	23004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017358	ATTA	2	8	23064	23071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017358	ATAA	2	8	24183	24190	75 %	25 %	0 %	0 %	384892031
72	NC_017358	GCTC	2	8	25708	25715	0 %	25 %	25 %	50 %	384892032
73	NC_017358	ATGG	2	8	26156	26163	25 %	25 %	50 %	0 %	384892032
74	NC_017358	ATGA	2	8	26419	26426	50 %	25 %	25 %	0 %	384892033
75	NC_017358	TTTA	2	8	26793	26800	25 %	75 %	0 %	0 %	384892033
76	NC_017358	TGGT	2	8	27311	27318	0 %	50 %	50 %	0 %	384892034
77	NC_017358	AGTC	2	8	27592	27599	25 %	25 %	25 %	25 %	384892035
78	NC_017358	AGCA	2	8	27715	27722	50 %	0 %	25 %	25 %	384892035
79	NC_017358	GGTT	2	8	27943	27950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017358	TTTA	2	8	28077	28084	25 %	75 %	0 %	0 %	384892036
81	NC_017358	TGAT	2	8	28222	28229	25 %	50 %	25 %	0 %	384892036
82	NC_017358	GCGA	2	8	28275	28282	25 %	0 %	50 %	25 %	384892036
83	NC_017358	ACCC	2	8	28392	28399	25 %	0 %	0 %	75 %	384892037
84	NC_017358	CATC	2	8	28518	28525	25 %	25 %	0 %	50 %	384892037
85	NC_017358	TCAA	2	8	28660	28667	50 %	25 %	0 %	25 %	384892038
86	NC_017358	CATG	2	8	29777	29784	25 %	25 %	25 %	25 %	384892038
87	NC_017358	TTGC	2	8	30281	30288	0 %	50 %	25 %	25 %	384892038
88	NC_017358	GCTT	2	8	30792	30799	0 %	50 %	25 %	25 %	384892038
89	NC_017358	GAAA	2	8	30824	30831	75 %	0 %	25 %	0 %	384892038
90	NC_017358	GAAA	2	8	30851	30858	75 %	0 %	25 %	0 %	384892038
91	NC_017358	GATC	2	8	30929	30936	25 %	25 %	25 %	25 %	384892039
92	NC_017358	ATGA	2	8	31132	31139	50 %	25 %	25 %	0 %	384892039
93	NC_017358	TTGT	2	8	32744	32751	0 %	75 %	25 %	0 %	384892042
94	NC_017358	CTTT	2	8	32891	32898	0 %	75 %	0 %	25 %	384892042
95	NC_017358	AATA	2	8	33568	33575	75 %	25 %	0 %	0 %	384892042
96	NC_017358	TAAA	2	8	33590	33597	75 %	25 %	0 %	0 %	384892042
97	NC_017358	GAAA	2	8	33720	33727	75 %	0 %	25 %	0 %	384892043
98	NC_017358	GTGA	2	8	33817	33824	25 %	25 %	50 %	0 %	384892043
99	NC_017358	ATGA	2	8	34297	34304	50 %	25 %	25 %	0 %	384892043
100	NC_017358	TTTG	2	8	34350	34357	0 %	75 %	25 %	0 %	384892043
101	NC_017358	TGAT	2	8	34840	34847	25 %	50 %	25 %	0 %	384892044
102	NC_017358	TTGT	2	8	35153	35160	0 %	75 %	25 %	0 %	384892044
103	NC_017358	AACC	2	8	35521	35528	50 %	0 %	0 %	50 %	384892045
104	NC_017358	CAAA	2	8	35811	35818	75 %	0 %	0 %	25 %	384892045
105	NC_017358	ATTG	2	8	36225	36232	25 %	50 %	25 %	0 %	384892045
106	NC_017358	ATCA	2	8	36400	36407	50 %	25 %	0 %	25 %	384892045
107	NC_017358	TCAA	2	8	36413	36420	50 %	25 %	0 %	25 %	384892045
108	NC_017358	GATT	2	8	37005	37012	25 %	50 %	25 %	0 %	384892046
109	NC_017358	TGTT	2	8	37187	37194	0 %	75 %	25 %	0 %	384892046
110	NC_017358	CTTT	2	8	37780	37787	0 %	75 %	0 %	25 %	384892046
111	NC_017358	ATAA	2	8	38034	38041	75 %	25 %	0 %	0 %	384892046
112	NC_017358	GAAA	2	8	38054	38061	75 %	0 %	25 %	0 %	384892047
113	NC_017358	GATC	2	8	38183	38190	25 %	25 %	25 %	25 %	384892047
114	NC_017358	TTTG	2	8	38585	38592	0 %	75 %	25 %	0 %	384892047
115	NC_017358	ATGA	2	8	39190	39197	50 %	25 %	25 %	0 %	384892047
116	NC_017358	CAAA	2	8	40029	40036	75 %	0 %	0 %	25 %	384892048
117	NC_017358	TGAT	2	8	40600	40607	25 %	50 %	25 %	0 %	384892049
118	NC_017358	AAAC	2	8	40613	40620	75 %	0 %	0 %	25 %	384892049
119	NC_017358	CGCT	2	8	40754	40761	0 %	25 %	25 %	50 %	384892049
120	NC_017358	GTTT	2	8	41376	41383	0 %	75 %	25 %	0 %	384892049
121	NC_017358	CAAA	2	8	41872	41879	75 %	0 %	0 %	25 %	384892050
122	NC_017358	GGGT	2	8	42328	42335	0 %	25 %	75 %	0 %	384892050
123	NC_017358	TCGC	2	8	42687	42694	0 %	25 %	25 %	50 %	384892050
124	NC_017358	AGGG	2	8	42698	42705	25 %	0 %	75 %	0 %	384892050
125	NC_017358	GCAA	2	8	43351	43358	50 %	0 %	25 %	25 %	384892050
126	NC_017358	CAAC	2	8	43483	43490	50 %	0 %	0 %	50 %	384892050
127	NC_017358	TAAA	2	8	43620	43627	75 %	25 %	0 %	0 %	384892050
128	NC_017358	AGCG	3	12	44043	44054	25 %	0 %	50 %	25 %	384892051
129	NC_017358	TTCA	2	8	44663	44670	25 %	50 %	0 %	25 %	384892051
130	NC_017358	CTTT	2	8	45009	45016	0 %	75 %	0 %	25 %	384892052
131	NC_017358	AGGC	2	8	45705	45712	25 %	0 %	50 %	25 %	384892053
132	NC_017358	TGGT	2	8	45769	45776	0 %	50 %	50 %	0 %	384892053
133	NC_017358	AAAT	2	8	46455	46462	75 %	25 %	0 %	0 %	384892053
134	NC_017358	TCAA	2	8	46584	46591	50 %	25 %	0 %	25 %	384892054
135	NC_017358	CTTT	2	8	46774	46781	0 %	75 %	0 %	25 %	384892055
136	NC_017358	ATCC	2	8	46882	46889	25 %	25 %	0 %	50 %	384892055
137	NC_017358	TAAA	2	8	47118	47125	75 %	25 %	0 %	0 %	384892055
138	NC_017358	GTTG	2	8	47144	47151	0 %	50 %	50 %	0 %	384892055
139	NC_017358	TCAA	2	8	48496	48503	50 %	25 %	0 %	25 %	384892056
140	NC_017358	TGTA	2	8	48891	48898	25 %	50 %	25 %	0 %	384892056
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142	NC_017358	GTTT	2	8	49626	49633	0 %	75 %	25 %	0 %	384892057
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