MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori 908 chromosome

Total Repeats: 759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017357	CCGCAG	2	12	1087	1098	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384890376
2	NC_017357	ATTATA	2	12	1839	1850	50 %	50 %	0 %	0 %	384890377
3	NC_017357	GCTTGC	2	12	5767	5778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384890382
4	NC_017357	CCCATT	2	12	6276	6287	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384890382
5	NC_017357	TGCCAT	2	12	6452	6463	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384890382
6	NC_017357	GAAACC	2	12	7270	7281	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384890385
7	NC_017357	ATTATA	2	12	9290	9301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017357	ATTTGA	2	12	12482	12493	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384890389
9	NC_017357	AAACAC	2	12	17861	17872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017357	AGAAAA	2	12	18211	18222	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384890396
11	NC_017357	AGCTTT	2	12	19912	19923	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384890397
12	NC_017357	GTTTGG	2	12	20818	20829	0 %	50 %	50 %	0 %	384890399
13	NC_017357	GAATGG	2	12	21610	21621	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384890399
14	NC_017357	GATAAA	2	12	21786	21797	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384890399
15	NC_017357	TATCAA	2	12	28869	28880	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384890406
16	NC_017357	ACTTTT	2	12	29170	29181	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384890406
17	NC_017357	AAGGCT	2	12	30756	30767	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384890407
18	NC_017357	GCGTGG	2	12	31558	31569	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384890409
19	NC_017357	TAATGA	2	12	31694	31705	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384890409
20	NC_017357	TTGAAT	2	12	32757	32768	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384890409
21	NC_017357	TAAGGA	2	12	33056	33067	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384890409
22	NC_017357	TAGGGG	2	12	34572	34583	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384890412
23	NC_017357	TTCTAC	2	12	36056	36067	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384890413
24	NC_017357	AAAGAA	2	12	37672	37683	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384890416
25	NC_017357	CAAAAT	2	12	40012	40023	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384890418
26	NC_017357	CACTAC	2	12	43420	43431	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384890422
27	NC_017357	ACTTAG	2	12	43556	43567	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017357	CGCAAA	2	12	44406	44417	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384890424
29	NC_017357	TTTTCA	2	12	48174	48185	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384890427
30	NC_017357	GGCTAG	2	12	48648	48659	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384890428
31	NC_017357	CTTTTT	2	12	50757	50768	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384890430
32	NC_017357	CCACGC	2	12	56234	56245	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384890432
33	NC_017357	CTAAAG	2	12	57521	57532	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384890432
34	NC_017357	AGAAAA	2	12	59122	59133	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017357	GATGTG	2	12	60684	60695	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384890437
36	NC_017357	AGCCAA	2	12	60762	60773	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384890437
37	NC_017357	CCAACA	2	12	62634	62645	50 %	0 %	0 %	50 %	384890439
38	NC_017357	TTTTGT	2	12	62972	62983	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384890440
39	NC_017357	AAAGAG	2	12	63251	63262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384890440
40	NC_017357	ACAGAA	2	12	64528	64539	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384890442
41	NC_017357	AGCGGG	2	12	66324	66335	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384890446
42	NC_017357	ACGCCC	2	12	74153	74164	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384890454
43	NC_017357	AAGGGC	2	12	76883	76894	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384890458
44	NC_017357	CGCTAA	2	12	77245	77256	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384890458
45	NC_017357	CGCTCA	2	12	77419	77430	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384890458
46	NC_017357	AGTGGC	2	12	78515	78526	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384890461
47	NC_017357	GTGAGC	2	12	78728	78739	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384890461
48	NC_017357	CAACGA	2	12	79074	79085	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384890461
49	NC_017357	GGGGGT	2	12	79853	79864	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	384890462
50	NC_017357	GGCATG	2	12	80595	80606	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384890463
51	NC_017357	ACACCG	2	12	81529	81540	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384890463
52	NC_017357	ATATTG	2	12	82409	82420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384890464
53	NC_017357	AACAGG	2	12	90408	90419	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384890470
54	NC_017357	TTGTTT	2	12	90490	90501	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384890470
55	NC_017357	GGCTTT	2	12	91743	91754	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384890472
56	NC_017357	TACAAA	2	12	92780	92791	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017357	CAAGCA	2	12	94357	94368	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384890474
58	NC_017357	ATTAGA	2	12	94657	94668	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384890474
59	NC_017357	CAAGAT	2	12	94995	95006	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384890475
60	NC_017357	GATTTT	2	12	96419	96430	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384890477
61	NC_017357	AAACTC	2	12	96536	96547	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384890477
62	NC_017357	TCAAAA	2	12	97851	97862	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384890478
63	NC_017357	TATCGT	2	12	98430	98441	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384890479
64	NC_017357	GCGGTG	2	12	98549	98560	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384890479
65	NC_017357	TTAATT	2	12	99084	99095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384890479
66	NC_017357	AATATT	2	12	101734	101745	50 %	50 %	0 %	0 %	384890480
67	NC_017357	TAAAAT	2	12	106655	106666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384890485
68	NC_017357	GATAAC	2	12	111261	111272	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017357	TTTTCT	2	12	114177	114188	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384890493
70	NC_017357	TTGTCT	2	12	117369	117380	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384890497
71	NC_017357	ATTGCC	2	12	118280	118291	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384890497
72	NC_017357	CGCTCG	2	12	119200	119211	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384890498
73	NC_017357	TAGGCA	2	12	121738	121749	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384890499
74	NC_017357	TGAATT	2	12	125493	125504	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384890502
75	NC_017357	TTTCAA	2	12	125652	125663	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384890502
76	NC_017357	ATGATA	2	12	126612	126623	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017357	TCGCTA	2	12	127252	127263	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384890504
78	NC_017357	AGCAAA	2	12	128994	129005	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384890505
79	NC_017357	GTTTTA	2	12	130005	130016	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017357	TGGTTT	2	12	130518	130529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890508
81	NC_017357	TCATGA	2	12	131857	131868	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384890510
82	NC_017357	AAAAAT	2	12	138370	138381	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384890516
83	NC_017357	TTGGCT	2	12	139658	139669	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384890518
84	NC_017357	TAGCGA	2	12	140506	140517	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384890519
85	NC_017357	ACGATT	2	12	142966	142977	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384890521
86	NC_017357	TTAGCG	2	12	143335	143346	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384890521
87	NC_017357	TATCGC	2	12	143529	143540	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384890521
88	NC_017357	TTTTAG	2	12	144641	144652	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384890522
89	NC_017357	TATCGC	2	12	145233	145244	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384890522
90	NC_017357	TTCTAT	2	12	148617	148628	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384890525
91	NC_017357	TTGTTT	2	12	151605	151616	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017357	TTGGGT	2	12	157574	157585	0 %	50 %	50 %	0 %	384890536
93	NC_017357	GATTTT	2	12	158087	158098	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384890537
94	NC_017357	CATGCT	2	12	159067	159078	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384890539
95	NC_017357	CTTTCT	2	12	161553	161564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890541
96	NC_017357	TTTCAC	2	12	162617	162628	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017357	CCGCTC	2	12	163445	163456	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384890544
98	NC_017357	TAAAAA	2	12	166527	166538	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017357	ATCGTT	2	12	170266	170277	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384890551
100	NC_017357	AATTTC	2	12	170617	170628	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384890552
101	NC_017357	TAAAAT	2	12	172141	172152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384890553
102	NC_017357	TTCTTT	2	12	172551	172562	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384890553
103	NC_017357	ATTTTG	2	12	173949	173960	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384890555
104	NC_017357	CGCTTT	2	12	174427	174438	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384890555
105	NC_017357	ACTTAT	2	12	174524	174535	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384890555
106	NC_017357	GTTTAA	2	12	175211	175222	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384890556
107	NC_017357	TGGTTA	2	12	177874	177885	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384890559
108	NC_017357	CCGCTC	2	12	178456	178467	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384890560
109	NC_017357	GAGATA	2	12	180040	180051	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384890562
110	NC_017357	TGGTAG	2	12	180106	180117	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384890563
111	NC_017357	TAAAAA	2	12	180611	180622	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384890563
112	NC_017357	GAAAAA	2	12	182094	182105	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384890564
113	NC_017357	AGGCAT	2	12	182183	182194	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384890564
114	NC_017357	GCATTT	2	12	183896	183907	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384890566
115	NC_017357	GGGCGA	2	12	183935	183946	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384890566
116	NC_017357	ATAAAG	2	12	184609	184620	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384890567
117	NC_017357	ATAAAG	2	12	184627	184638	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384890567
118	NC_017357	TTAAAG	2	12	187503	187514	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384890570
119	NC_017357	GGTATT	2	12	188405	188416	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384890571
120	NC_017357	TCTAAA	2	12	188635	188646	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384890571
121	NC_017357	TGGGCA	2	12	189699	189710	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384890572
122	NC_017357	ATTTTC	2	12	192123	192134	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384890573
123	NC_017357	TCGCTT	2	12	196172	196183	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384890578
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128	NC_017357	TCTTTG	2	12	205922	205933	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384890588
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232	NC_017357	AATTTA	2	12	401981	401992	50 %	50 %	0 %	0 %	384890790
233	NC_017357	AAAATC	2	12	403702	403713	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384890792
234	NC_017357	TGTTTT	2	12	404289	404300	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384890792
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236	NC_017357	TTATGG	2	12	410034	410045	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384890797
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353	NC_017357	AAAAGA	2	12	650975	650986	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384891037
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453	NC_017357	CAAACT	2	12	880972	880983	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384891271
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