MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori 908 chromosome

Total Repeats: 1257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017357	GATTA	2	10	2292	2301	40 %	40 %	20 %	0 %	384890377
2	NC_017357	TCATT	2	10	4955	4964	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017357	TTGAT	2	10	5737	5746	20 %	60 %	20 %	0 %	384890382
4	NC_017357	TTGCT	2	10	5854	5863	0 %	60 %	20 %	20 %	384890382
5	NC_017357	TTTTA	2	10	7007	7016	20 %	80 %	0 %	0 %	384890383
6	NC_017357	TTTCT	2	10	7934	7943	0 %	80 %	0 %	20 %	384890385
7	NC_017357	AATTT	2	10	8773	8782	40 %	60 %	0 %	0 %	384890385
8	NC_017357	AAAGG	2	10	10408	10417	60 %	0 %	40 %	0 %	384890387
9	NC_017357	TTTTG	2	10	11464	11473	0 %	80 %	20 %	0 %	384890388
10	NC_017357	TGGTG	2	10	12303	12312	0 %	40 %	60 %	0 %	384890389
11	NC_017357	GCTTT	2	10	13130	13139	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017357	TTGAT	2	10	23687	23696	20 %	60 %	20 %	0 %	384890400
13	NC_017357	CTTTA	2	10	24142	24151	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017357	AGCCT	2	10	24706	24715	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017357	CAAGC	2	10	26888	26897	40 %	0 %	20 %	40 %	384890403
16	NC_017357	TTTTA	2	10	27817	27826	20 %	80 %	0 %	0 %	384890404
17	NC_017357	TAGCG	2	10	28479	28488	20 %	20 %	40 %	20 %	384890405
18	NC_017357	TGATT	2	10	30836	30845	20 %	60 %	20 %	0 %	384890407
19	NC_017357	GTGGG	2	10	32719	32728	0 %	20 %	80 %	0 %	384890409
20	NC_017357	ATCAA	2	10	34851	34860	60 %	20 %	0 %	20 %	384890412
21	NC_017357	TTTTG	2	10	37347	37356	0 %	80 %	20 %	0 %	384890416
22	NC_017357	TGAGT	2	10	39367	39376	20 %	40 %	40 %	0 %	384890418
23	NC_017357	CAAAA	2	10	39470	39479	80 %	0 %	0 %	20 %	384890418
24	NC_017357	AAGCC	2	10	39752	39761	40 %	0 %	20 %	40 %	384890418
25	NC_017357	CAAAC	2	10	40393	40402	60 %	0 %	0 %	40 %	384890418
26	NC_017357	AGAAA	2	10	41078	41087	80 %	0 %	20 %	0 %	384890419
27	NC_017357	TCGCT	2	10	42900	42909	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017357	TAAAA	2	10	44341	44350	80 %	20 %	0 %	0 %	384890424
29	NC_017357	GCGAT	2	10	44872	44881	20 %	20 %	40 %	20 %	384890425
30	NC_017357	GCTCC	2	10	45674	45683	0 %	20 %	20 %	60 %	384890425
31	NC_017357	ATGAA	2	10	45856	45865	60 %	20 %	20 %	0 %	384890425
32	NC_017357	TCGCA	2	10	46211	46220	20 %	20 %	20 %	40 %	384890425
33	NC_017357	CAATA	2	10	47779	47788	60 %	20 %	0 %	20 %	384890426
34	NC_017357	AGGCT	2	10	48091	48100	20 %	20 %	40 %	20 %	384890427
35	NC_017357	TGCCT	2	10	48466	48475	0 %	40 %	20 %	40 %	384890427
36	NC_017357	GATTG	2	10	48950	48959	20 %	40 %	40 %	0 %	384890428
37	NC_017357	GCTTT	2	10	49006	49015	0 %	60 %	20 %	20 %	384890428
38	NC_017357	GATAA	2	10	49258	49267	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017357	AAATA	2	10	50252	50261	80 %	20 %	0 %	0 %	384890429
40	NC_017357	ATATT	2	10	50418	50427	40 %	60 %	0 %	0 %	384890429
41	NC_017357	CCAAA	2	10	50585	50594	60 %	0 %	0 %	40 %	384890430
42	NC_017357	TAAAA	2	10	52636	52645	80 %	20 %	0 %	0 %	384890430
43	NC_017357	ATCAA	2	10	52667	52676	60 %	20 %	0 %	20 %	384890430
44	NC_017357	TGAAA	2	10	53398	53407	60 %	20 %	20 %	0 %	384890431
45	NC_017357	TCAAA	2	10	53652	53661	60 %	20 %	0 %	20 %	384890431
46	NC_017357	TCGTT	2	10	54462	54471	0 %	60 %	20 %	20 %	384890431
47	NC_017357	TAAAA	2	10	56691	56700	80 %	20 %	0 %	0 %	384890432
48	NC_017357	TCAAA	2	10	57407	57416	60 %	20 %	0 %	20 %	384890432
49	NC_017357	AACGA	2	10	58410	58419	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017357	TTAAA	2	10	58422	58431	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017357	ACAAA	2	10	58450	58459	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017357	TGATA	2	10	58764	58773	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017357	AAGCC	2	10	59224	59233	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_017357	GGTGG	2	10	66245	66254	0 %	20 %	80 %	0 %	384890446
55	NC_017357	CTTGG	2	10	70238	70247	0 %	40 %	40 %	20 %	384890450
56	NC_017357	TGCCT	2	10	70369	70378	0 %	40 %	20 %	40 %	384890450
57	NC_017357	TCCAA	2	10	70781	70790	40 %	20 %	0 %	40 %	384890451
58	NC_017357	CAAAA	2	10	71098	71107	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017357	TTTTG	2	10	74109	74118	0 %	80 %	20 %	0 %	384890454
60	NC_017357	ACGCC	2	10	74415	74424	20 %	0 %	20 %	60 %	384890454
61	NC_017357	AAAGC	2	10	75181	75190	60 %	0 %	20 %	20 %	384890455
62	NC_017357	TTACA	2	10	75963	75972	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017357	TAAAA	2	10	77646	77655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017357	TTTTG	2	10	79923	79932	0 %	80 %	20 %	0 %	384890462
65	NC_017357	GATTT	2	10	79934	79943	20 %	60 %	20 %	0 %	384890462
66	NC_017357	TTTTC	2	10	83411	83420	0 %	80 %	0 %	20 %	384890464
67	NC_017357	CCATA	2	10	83739	83748	40 %	20 %	0 %	40 %	384890464
68	NC_017357	TGGCT	2	10	84105	84114	0 %	40 %	40 %	20 %	384890464
69	NC_017357	ATGCC	2	10	84547	84556	20 %	20 %	20 %	40 %	384890465
70	NC_017357	TTGAT	2	10	85633	85642	20 %	60 %	20 %	0 %	384890467
71	NC_017357	GGCGT	2	10	87447	87456	0 %	20 %	60 %	20 %	384890469
72	NC_017357	TAAGA	2	10	90654	90663	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017357	ATTAT	2	10	90710	90719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017357	CTTTC	2	10	91039	91048	0 %	60 %	0 %	40 %	384890471
75	NC_017357	CGAGA	2	10	93059	93068	40 %	0 %	40 %	20 %	384890473
76	NC_017357	TGATT	2	10	94003	94012	20 %	60 %	20 %	0 %	384890474
77	NC_017357	GGCTT	2	10	95328	95337	0 %	40 %	40 %	20 %	384890475
78	NC_017357	ATAAA	2	10	97330	97339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017357	ACGAT	2	10	100289	100298	40 %	20 %	20 %	20 %	384890480
80	NC_017357	TTTTC	2	10	100484	100493	0 %	80 %	0 %	20 %	384890480
81	NC_017357	AATTG	2	10	102116	102125	40 %	40 %	20 %	0 %	384890481
82	NC_017357	TCGTT	2	10	104018	104027	0 %	60 %	20 %	20 %	384890482
83	NC_017357	GTGGG	2	10	104340	104349	0 %	20 %	80 %	0 %	384890483
84	NC_017357	TTAGA	2	10	105031	105040	40 %	40 %	20 %	0 %	384890484
85	NC_017357	CAAGC	2	10	106136	106145	40 %	0 %	20 %	40 %	384890484
86	NC_017357	AAAGC	2	10	110141	110150	60 %	0 %	20 %	20 %	384890488
87	NC_017357	GAATG	2	10	111373	111382	40 %	20 %	40 %	0 %	384890490
88	NC_017357	CAAAT	2	10	112698	112707	60 %	20 %	0 %	20 %	384890492
89	NC_017357	CGTTT	2	10	113331	113340	0 %	60 %	20 %	20 %	384890492
90	NC_017357	ACCCT	2	10	114126	114135	20 %	20 %	0 %	60 %	384890493
91	NC_017357	ATGCC	2	10	114258	114267	20 %	20 %	20 %	40 %	384890493
92	NC_017357	GATTT	2	10	115641	115650	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017357	TGATT	2	10	116253	116262	20 %	60 %	20 %	0 %	384890495
94	NC_017357	GATCG	2	10	120768	120777	20 %	20 %	40 %	20 %	384890499
95	NC_017357	AGCTC	2	10	120787	120796	20 %	20 %	20 %	40 %	384890499
96	NC_017357	AAGCC	2	10	122675	122684	40 %	0 %	20 %	40 %	384890500
97	NC_017357	CCATA	2	10	123553	123562	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_017357	TTGAT	2	10	123740	123749	20 %	60 %	20 %	0 %	384890501
99	NC_017357	TTTGA	2	10	124978	124987	20 %	60 %	20 %	0 %	384890502
100	NC_017357	ATCTC	2	10	126263	126272	20 %	40 %	0 %	40 %	384890502
101	NC_017357	TTTGT	2	10	126773	126782	0 %	80 %	20 %	0 %	384890503
102	NC_017357	TGCGT	2	10	128805	128814	0 %	40 %	40 %	20 %	384890505
103	NC_017357	ATTTT	2	10	131456	131465	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017357	ATTTT	2	10	132333	132342	20 %	80 %	0 %	0 %	384890511
105	NC_017357	ATGTT	2	10	132415	132424	20 %	60 %	20 %	0 %	384890512
106	NC_017357	AAAAG	2	10	132827	132836	80 %	0 %	20 %	0 %	384890512
107	NC_017357	AATAA	2	10	133682	133691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017357	AAATC	2	10	134842	134851	60 %	20 %	0 %	20 %	384890513
109	NC_017357	AAAAT	2	10	136314	136323	80 %	20 %	0 %	0 %	384890514
110	NC_017357	ATAAA	2	10	138092	138101	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017357	AGAGC	2	10	138555	138564	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017357	TTTTC	2	10	138870	138879	0 %	80 %	0 %	20 %	384890517
113	NC_017357	TTCTT	2	10	140826	140835	0 %	80 %	0 %	20 %	384890519
114	NC_017357	TCTTT	2	10	141320	141329	0 %	80 %	0 %	20 %	384890520
115	NC_017357	GTTTT	2	10	142482	142491	0 %	80 %	20 %	0 %	384890521
116	NC_017357	AATTC	2	10	143054	143063	40 %	40 %	0 %	20 %	384890521
117	NC_017357	GCGAT	2	10	143213	143222	20 %	20 %	40 %	20 %	384890521
118	NC_017357	GCTTG	2	10	143451	143460	0 %	40 %	40 %	20 %	384890521
119	NC_017357	TTTTG	2	10	144103	144112	0 %	80 %	20 %	0 %	384890522
120	NC_017357	ACGCC	2	10	149462	149471	20 %	0 %	20 %	60 %	384890525
121	NC_017357	GCGTT	2	10	151725	151734	0 %	40 %	40 %	20 %	384890530
122	NC_017357	ATTTG	2	10	152702	152711	20 %	60 %	20 %	0 %	384890531
123	NC_017357	CAAAT	2	10	155121	155130	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017357	GGATT	2	10	155284	155293	20 %	40 %	40 %	0 %	384890534
125	NC_017357	AGATT	2	10	157743	157752	40 %	40 %	20 %	0 %	384890536
126	NC_017357	AAGCC	2	10	159080	159089	40 %	0 %	20 %	40 %	384890539
127	NC_017357	TGGCG	2	10	159754	159763	0 %	20 %	60 %	20 %	384890539
128	NC_017357	GTTTT	2	10	160836	160845	0 %	80 %	20 %	0 %	384890540
129	NC_017357	ATTTT	2	10	161121	161130	20 %	80 %	0 %	0 %	384890541
130	NC_017357	TTGAA	2	10	162392	162401	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017357	ATTCA	2	10	162753	162762	40 %	40 %	0 %	20 %	384890543
132	NC_017357	CACTT	2	10	162957	162966	20 %	40 %	0 %	40 %	384890543
133	NC_017357	ATCTT	2	10	166152	166161	20 %	60 %	0 %	20 %	384890546
134	NC_017357	TTTAA	2	10	170819	170828	40 %	60 %	0 %	0 %	384890552
135	NC_017357	AATAT	2	10	173478	173487	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017357	TTTCC	2	10	173530	173539	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017357	GAATG	2	10	173616	173625	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017357	CCGCA	2	10	174007	174016	20 %	0 %	20 %	60 %	384890555
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