MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 908 chromosome

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017357	TCATT	2	10	4955	4964	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017357	GCTTT	2	10	13130	13139	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017357	CTTTA	2	10	24142	24151	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017357	AGCCT	2	10	24706	24715	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017357	TCGCT	2	10	42900	42909	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017357	GATAA	2	10	49258	49267	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017357	AACGA	2	10	58410	58419	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017357	TTAAA	2	10	58422	58431	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017357	ACAAA	2	10	58450	58459	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017357	TGATA	2	10	58764	58773	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017357	AAGCC	2	10	59224	59233	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017357	CAAAA	2	10	71098	71107	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017357	TTACA	2	10	75963	75972	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017357	TAAAA	2	10	77646	77655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017357	TAAGA	2	10	90654	90663	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017357	ATTAT	2	10	90710	90719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017357	ATAAA	2	10	97330	97339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017357	GATTT	2	10	115641	115650	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017357	CCATA	2	10	123553	123562	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017357	ATTTT	2	10	131456	131465	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017357	AATAA	2	10	133682	133691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017357	ATAAA	2	10	138092	138101	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017357	AGAGC	2	10	138555	138564	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017357	CAAAT	2	10	155121	155130	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017357	TTGAA	2	10	162392	162401	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017357	AATAT	2	10	173478	173487	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017357	TTTCC	2	10	173530	173539	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017357	GAATG	2	10	173616	173625	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017357	TTTCT	2	10	176496	176505	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017357	AAATC	2	10	176840	176849	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017357	TTTAA	2	10	179891	179900	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017357	TTCAA	2	10	193027	193036	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017357	AAACA	2	10	204527	204536	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017357	TAAGA	2	10	211566	211575	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017357	ATTTT	2	10	214838	214847	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017357	TTTAG	2	10	223667	223676	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017357	AAAAC	2	10	223695	223704	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017357	CTTAA	2	10	227969	227978	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017357	TTTTA	2	10	229292	229301	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017357	ATTTA	2	10	233490	233499	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017357	CTAAC	2	10	235755	235764	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017357	AATTT	2	10	279643	279652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017357	AACAT	2	10	302013	302022	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017357	GTGGG	2	10	313173	313182	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017357	ACACT	2	10	313470	313479	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017357	TTTTA	2	10	330304	330313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017357	ATTAA	2	10	336135	336144	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017357	AATAA	2	10	339932	339941	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017357	AATAA	2	10	339944	339953	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017357	TAAAA	2	10	344203	344212	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017357	TAAAA	2	10	355991	356000	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017357	TAAAA	2	10	364978	364987	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017357	TAGTG	2	10	403059	403068	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017357	TAAAG	2	10	415967	415976	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017357	ATAAA	2	10	427943	427952	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017357	AAAAT	2	10	427977	427986	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017357	AAAAT	2	10	437039	437048	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017357	TAACA	2	10	448196	448205	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017357	ATTAA	2	10	449582	449591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017357	TAAAA	2	10	449680	449689	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017357	TTTGA	2	10	449781	449790	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017357	AAAAT	2	10	454412	454421	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017357	AGTAA	2	10	463658	463667	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017357	AAAAC	2	10	466849	466858	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017357	TAACT	2	10	473096	473105	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017357	AGGCT	2	10	482453	482462	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017357	ATTTT	2	10	488848	488857	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017357	TAAAA	2	10	489053	489062	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017357	CTGAT	2	10	501845	501854	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017357	AAAAT	2	10	508446	508455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017357	GTTTT	2	10	517298	517307	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017357	ATACC	2	10	529067	529076	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017357	AAATT	2	10	532823	532832	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017357	GAGTT	2	10	533447	533456	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017357	TTTAA	2	10	534246	534255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017357	ATTTT	2	10	535771	535780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017357	ACAAG	2	10	538320	538329	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017357	TTGTA	2	10	540002	540011	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017357	TATAA	2	10	548863	548872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017357	AAAAG	2	10	548983	548992	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017357	ACTCT	2	10	564460	564469	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017357	TAAGG	2	10	576135	576144	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017357	ATTTT	2	10	583361	583370	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017357	TTTAA	2	10	607362	607371	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017357	TTTAA	2	10	617797	617806	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017357	ATTTT	2	10	672279	672288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017357	TTGTA	2	10	672295	672304	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017357	AAATC	2	10	679474	679483	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017357	CTTAT	2	10	681632	681641	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017357	GTTTT	2	10	700549	700558	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017357	TCTAT	2	10	700637	700646	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017357	CTTTT	2	10	706437	706446	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017357	GGAAT	2	10	709943	709952	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017357	ATTTA	2	10	721383	721392	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017357	AAAAT	2	10	739601	739610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017357	TCTTT	2	10	754185	754194	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017357	TCTCT	2	10	760646	760655	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_017357	GGTTT	2	10	776623	776632	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017357	TTTTA	2	10	781190	781199	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017357	AATAA	2	10	787116	787125	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017357	TTCTT	2	10	794945	794954	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017357	TAAGA	2	10	817774	817783	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017357	CAAGC	2	10	828672	828681	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_017357	TATTT	2	10	829265	829274	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017357	ATAAA	2	10	829467	829476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017357	GATTA	2	10	846758	846767	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017357	TTTAA	2	10	860084	860093	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017357	AAAGA	2	10	863072	863081	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017357	ATTTT	2	10	864796	864805	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017357	GATTG	2	10	884602	884611	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017357	GATTG	2	10	886451	886460	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017357	ATAAA	2	10	887124	887133	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017357	TAAAA	2	10	893448	893457	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017357	ATGAT	2	10	901766	901775	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017357	TTTGT	2	10	906286	906295	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017357	TCAAG	2	10	925440	925449	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017357	TATTT	2	10	937056	937065	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017357	GATTG	2	10	937094	937103	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017357	TGATT	2	10	938637	938646	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017357	GATTT	2	10	943339	943348	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017357	AAACA	2	10	946282	946291	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017357	CAATA	2	10	978747	978756	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017357	TTTTA	2	10	990308	990317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017357	TTAAA	2	10	990331	990340	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017357	TTTTA	2	10	991847	991856	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017357	ATTTT	2	10	991866	991875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017357	CCCAC	2	10	994517	994526	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
128	NC_017357	TTAAT	2	10	994596	994605	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017357	AAAAT	2	10	1014772	1014781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017357	TAAAA	2	10	1046740	1046749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017357	AAAAT	2	10	1047918	1047927	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017357	AACTT	2	10	1047934	1047943	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017357	TGAAA	2	10	1061250	1061259	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017357	ATTTA	2	10	1061318	1061327	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017357	GATTA	2	10	1061595	1061604	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017357	TAAGT	2	10	1072806	1072815	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017357	TAAAA	2	10	1086002	1086011	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017357	AAAAC	2	10	1092382	1092391	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017357	CACGA	2	10	1112352	1112361	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_017357	TTACC	2	10	1113150	1113159	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_017357	CCAAT	2	10	1114302	1114311	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017357	TTAAA	2	10	1120829	1120838	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017357	TAATT	2	10	1143774	1143783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017357	AAAAC	2	10	1143812	1143821	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017357	TTAAT	2	10	1146559	1146568	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017357	TATTT	2	10	1146595	1146604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017357	AAATC	2	10	1152504	1152513	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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184	NC_017357	TATAT	2	10	1398548	1398557	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017357	TTATT	2	10	1427390	1427399	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_017357	GTTTG	2	10	1479849	1479858	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_017357	TAAAA	2	10	1529224	1529233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_017357	AATTC	2	10	1539683	1539692	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
197	NC_017357	TTTTG	2	10	1541851	1541860	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
198	NC_017357	ATAAA	2	10	1541951	1541960	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_017357	ATCTC	2	10	1543731	1543740	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
200	NC_017357	TAGTG	2	10	1545232	1545241	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
201	NC_017357	TAAAA	2	10	1545457	1545466	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_017357	ATATT	2	10	1547474	1547483	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.