MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 908 chromosome

Total Repeats: 473

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017357	GTTT	2	8	4967	4974	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017357	CCCT	2	8	5033	5040	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_017357	ACTA	2	8	5092	5099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017357	ATAA	2	8	9196	9203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017357	TATT	2	8	9395	9402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017357	TTAA	2	8	13228	13235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017357	AATC	2	8	22288	22295	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017357	TAAG	2	8	24199	24206	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017357	GGTT	2	8	30562	30569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017357	GCTT	2	8	43013	43020	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017357	CTGT	2	8	43127	43134	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017357	TAGC	2	8	49285	49292	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017357	TTTA	2	8	58159	58166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017357	ACTG	2	8	59155	59162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017357	TTTA	2	8	74080	74087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017357	TAGA	2	8	75942	75949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017357	TTTC	2	8	79816	79823	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017357	CCAA	2	8	81962	81969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017357	TTTG	2	8	85318	85325	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017357	TATT	2	8	85498	85505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017357	TCAA	2	8	90634	90641	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017357	AAAC	2	8	90818	90825	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017357	ATTT	2	8	92559	92566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017357	GGTG	2	8	92598	92605	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017357	TCCC	2	8	92668	92675	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_017357	TTCA	2	8	98184	98191	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017357	TTTA	2	8	98211	98218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017357	GATC	2	8	99819	99826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017357	ATCA	2	8	106532	106539	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017357	AAGC	2	8	112140	112147	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017357	CGCT	2	8	112164	112171	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017357	CTTT	2	8	114065	114072	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017357	AAAT	2	8	114075	114082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017357	ATTT	2	8	115606	115613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017357	TCAT	2	8	120301	120308	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017357	GTTA	2	8	123973	123980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017357	GTTA	2	8	126716	126723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017357	AAAG	2	8	126894	126901	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017357	AAAG	2	8	129621	129628	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017357	ATTT	2	8	130082	130089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017357	AAAG	2	8	130115	130122	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017357	GAAG	2	8	130172	130179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017357	GTCA	2	8	131178	131185	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017357	CTAT	2	8	132048	132055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017357	CTTT	2	8	133220	133227	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017357	CAAT	2	8	133496	133503	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017357	TAAA	2	8	133646	133653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017357	ATCT	2	8	138179	138186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017357	TAAG	2	8	142077	142084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017357	ACAA	2	8	153045	153052	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017357	ATTT	2	8	160990	160997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017357	CCCT	2	8	162258	162265	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_017357	AAAT	2	8	173413	173420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017357	ATAC	2	8	173457	173464	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017357	TCAA	2	8	176581	176588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017357	TCAA	2	8	176886	176893	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017357	GATT	2	8	179909	179916	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017357	CATT	2	8	185139	185146	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017357	TTTG	2	8	185158	185165	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017357	TTGC	2	8	185206	185213	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017357	TCCT	2	8	186995	187002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017357	TTCA	2	8	187029	187036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017357	TGCA	2	8	187049	187056	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017357	TAAG	2	8	197392	197399	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017357	CAAC	2	8	200760	200767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017357	AAAC	2	8	200961	200968	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017357	GTTT	2	8	207020	207027	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017357	GTTT	2	8	211533	211540	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017357	TTGA	2	8	211548	211555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017357	TTGC	2	8	218496	218503	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017357	AATC	2	8	218663	218670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017357	ATCC	2	8	218869	218876	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017357	GTTT	2	8	219008	219015	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017357	CTTT	2	8	219202	219209	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017357	ATTG	2	8	219238	219245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017357	GCTT	2	8	219683	219690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017357	ATCA	2	8	219694	219701	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017357	ACAA	2	8	219750	219757	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017357	TATT	2	8	220425	220432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017357	ATTT	2	8	226398	226405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017357	GAAA	2	8	228121	228128	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017357	TTTA	2	8	231032	231039	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017357	ATCT	2	8	235460	235467	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017357	ATTT	2	8	246342	246349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017357	TAAT	2	8	252343	252350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017357	ATCA	2	8	252382	252389	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017357	TACC	2	8	252624	252631	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017357	GCCA	2	8	261709	261716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017357	ATTT	2	8	269170	269177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017357	ATTG	2	8	279793	279800	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017357	CATT	2	8	301931	301938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017357	TTAA	2	8	306704	306711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017357	AAAC	2	8	313575	313582	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017357	TCAG	2	8	314390	314397	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017357	TTTA	2	8	323227	323234	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017357	GACA	2	8	323291	323298	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017357	CGAT	2	8	323517	323524	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017357	GCTT	2	8	323603	323610	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017357	TTGG	2	8	326665	326672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017357	GGTT	2	8	328954	328961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017357	AAGT	2	8	330296	330303	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017357	ACTT	2	8	330339	330346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017357	AAAT	2	8	335101	335108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017357	TTTA	2	8	339885	339892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017357	TGAA	2	8	344292	344299	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017357	GCGG	2	8	355889	355896	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017357	TAAA	2	8	366142	366149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017357	TTAT	2	8	370652	370659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017357	TCAG	2	8	371217	371224	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017357	GTTT	2	8	383447	383454	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017357	TTTC	2	8	387790	387797	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017357	GAAA	2	8	389738	389745	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017357	AACA	2	8	389751	389758	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017357	CAAA	2	8	401689	401696	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017357	CCAA	2	8	401807	401814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017357	AAAT	2	8	402885	402892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017357	CAAT	2	8	403275	403282	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017357	AAAT	2	8	408637	408644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017357	AAGG	2	8	415977	415984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017357	TCAA	2	8	417598	417605	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017357	TCAA	2	8	420131	420138	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017357	CAAT	2	8	421509	421516	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017357	ACCC	2	8	424980	424987	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_017357	TTTG	2	8	435435	435442	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017357	CACC	2	8	435526	435533	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
126	NC_017357	GTGG	2	8	435798	435805	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017357	TCTT	2	8	436021	436028	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017357	AATC	2	8	445929	445936	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017357	AAAC	2	8	449718	449725	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017357	CAAC	2	8	462415	462422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017357	ATTG	2	8	467393	467400	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017357	AAAT	2	8	468645	468652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017357	CTTA	2	8	473055	473062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017357	GAAT	2	8	482355	482362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017357	TTGA	2	8	482518	482525	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017357	CTAA	2	8	488025	488032	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017357	TTAG	2	8	488049	488056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017357	TCAA	2	8	488210	488217	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017357	CATT	2	8	488776	488783	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017357	TTTA	2	8	488830	488837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017357	ATTT	2	8	488996	489003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017357	TGAT	2	8	490644	490651	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017357	TTAC	2	8	492862	492869	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017357	CTAG	2	8	498087	498094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017357	AACT	2	8	501432	501439	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017357	ATAA	2	8	510427	510434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017357	GTTG	2	8	513089	513096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017357	GAAA	2	8	514976	514983	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017357	GTTA	2	8	515119	515126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017357	CAAA	2	8	516645	516652	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.