MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori 908 chromosome

Total Repeats: 15575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017357	CAT	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017357	GAT	3	9	166	174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384890374
3	NC_017357	GTT	2	6	349	354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890374
4	NC_017357	TTC	2	6	400	405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890374
5	NC_017357	ACA	2	6	426	431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384890374
6	NC_017357	AAT	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384890375
7	NC_017357	TAA	2	6	694	699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384890375
8	NC_017357	CTT	2	6	844	849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890375
9	NC_017357	TGA	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384890375
10	NC_017357	AAC	2	6	1068	1073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384890376
11	NC_017357	CCA	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384890376
12	NC_017357	GCT	2	6	1256	1261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384890376
13	NC_017357	GGC	2	6	1447	1452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384890376
14	NC_017357	GTT	2	6	1667	1672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890376
15	NC_017357	TAG	2	6	1690	1695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384890376
16	NC_017357	CTT	2	6	1701	1706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890376
17	NC_017357	TTC	2	6	1806	1811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890377
18	NC_017357	TCA	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384890377
19	NC_017357	GTT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890377
20	NC_017357	TTC	2	6	2028	2033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890377
21	NC_017357	TGG	2	6	2087	2092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384890377
22	NC_017357	TCA	2	6	2095	2100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384890377
23	NC_017357	AGG	2	6	2232	2237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384890377
24	NC_017357	TTC	2	6	2504	2509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017357	TGA	2	6	2707	2712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384890378
26	NC_017357	AGC	2	6	2822	2827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384890378
27	NC_017357	GTG	2	6	3011	3016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384890378
28	NC_017357	AGA	2	6	3109	3114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384890378
29	NC_017357	GTG	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384890378
30	NC_017357	GCC	2	6	3177	3182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384890378
31	NC_017357	GTT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890379
32	NC_017357	ATC	2	6	3707	3712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384890379
33	NC_017357	CAG	2	6	3869	3874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384890379
34	NC_017357	ATT	2	6	3951	3956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384890379
35	NC_017357	TGT	2	6	3962	3967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890379
36	NC_017357	GGC	2	6	4024	4029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384890379
37	NC_017357	GGT	2	6	4130	4135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017357	TAT	2	6	4178	4183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017357	TGG	2	6	4218	4223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017357	TGG	2	6	4348	4353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017357	GTG	2	6	4460	4465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017357	ACC	2	6	4492	4497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017357	GGT	2	6	4505	4510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017357	TAA	2	6	4852	4857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384890381
45	NC_017357	TTA	2	6	4861	4866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384890381
46	NC_017357	TGT	2	6	4944	4949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017357	AAG	2	6	5042	5047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017357	ATC	2	6	5100	5105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017357	CTT	2	6	5203	5208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890382
50	NC_017357	GTT	2	6	5265	5270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890382
51	NC_017357	TAA	2	6	5334	5339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384890382
52	NC_017357	TTA	2	6	5392	5397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384890382
53	NC_017357	GTG	2	6	5461	5466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384890382
54	NC_017357	TGT	2	6	5582	5587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890382
55	NC_017357	GTT	2	6	5637	5642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890382
56	NC_017357	GCT	2	6	5686	5691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384890382
57	NC_017357	AGT	2	6	5693	5698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384890382
58	NC_017357	GCG	2	6	5840	5845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384890382
59	NC_017357	CGA	2	6	5891	5896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384890382
60	NC_017357	TCA	2	6	6010	6015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384890382
61	NC_017357	TGT	2	6	6125	6130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890382
62	NC_017357	CTG	2	6	6157	6162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384890382
63	NC_017357	CAC	2	6	6188	6193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384890382
64	NC_017357	TAT	2	6	6203	6208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384890382
65	NC_017357	ATT	2	6	6417	6422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384890382
66	NC_017357	CCG	2	6	6506	6511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384890382
67	NC_017357	GCT	2	6	6621	6626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384890382
68	NC_017357	GTT	2	6	6651	6656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890382
69	NC_017357	AGC	2	6	6801	6806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017357	GGT	2	6	6983	6988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384890383
71	NC_017357	AAG	2	6	7110	7115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384890384
72	NC_017357	CAT	2	6	7155	7160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384890385
73	NC_017357	GCC	2	6	7161	7166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384890385
74	NC_017357	TCT	2	6	7222	7227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890385
75	NC_017357	AAT	2	6	7320	7325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384890385
76	NC_017357	CTT	2	6	7328	7333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890385
77	NC_017357	CAT	2	6	7418	7423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384890385
78	NC_017357	ATG	2	6	7471	7476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384890385
79	NC_017357	TCA	2	6	7495	7500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384890385
80	NC_017357	CTT	2	6	7568	7573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890385
81	NC_017357	CCG	2	6	7577	7582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384890385
82	NC_017357	GTG	2	6	7804	7809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384890385
83	NC_017357	TTC	2	6	7884	7889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890385
84	NC_017357	CCG	2	6	7903	7908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384890385
85	NC_017357	CAC	2	6	8004	8009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384890385
86	NC_017357	GAT	2	6	8046	8051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384890385
87	NC_017357	GGA	2	6	8093	8098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384890385
88	NC_017357	CTT	2	6	8258	8263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890385
89	NC_017357	TCT	2	6	8368	8373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890385
90	NC_017357	CTT	2	6	8489	8494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890385
91	NC_017357	GCA	2	6	8542	8547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384890385
92	NC_017357	CTT	2	6	8567	8572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890385
93	NC_017357	TAA	3	9	8803	8811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017357	TCT	2	6	8925	8930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890386
95	NC_017357	GAT	3	9	9095	9103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384890386
96	NC_017357	TCT	2	6	9123	9128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890386
97	NC_017357	CTA	2	6	9139	9144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384890386
98	NC_017357	TTA	2	6	9226	9231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017357	ATT	2	6	9305	9310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017357	TTA	2	6	9331	9336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017357	CAA	2	6	9373	9378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017357	TTG	2	6	9566	9571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890387
103	NC_017357	GAA	2	6	9582	9587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384890387
104	NC_017357	TTA	2	6	9761	9766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384890387
105	NC_017357	AGA	2	6	9776	9781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384890387
106	NC_017357	ACC	2	6	9784	9789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384890387
107	NC_017357	AAG	2	6	9817	9822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384890387
108	NC_017357	ATT	2	6	9850	9855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384890387
109	NC_017357	CAT	2	6	10031	10036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384890387
110	NC_017357	GTG	2	6	10065	10070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384890387
111	NC_017357	ATG	2	6	10345	10350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384890387
112	NC_017357	GGC	2	6	10370	10375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384890387
113	NC_017357	AAC	2	6	10437	10442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384890387
114	NC_017357	ATC	2	6	10468	10473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384890387
115	NC_017357	AGA	2	6	10823	10828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384890387
116	NC_017357	GAC	2	6	10923	10928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384890387
117	NC_017357	TTA	3	9	10944	10952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384890387
118	NC_017357	TTG	2	6	11001	11006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890387
119	NC_017357	TGT	2	6	11187	11192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890388
120	NC_017357	TGT	2	6	11355	11360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890388
121	NC_017357	AAG	2	6	11514	11519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384890388
122	NC_017357	TTG	2	6	11691	11696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890388
123	NC_017357	TGG	3	9	11925	11933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384890388
124	NC_017357	GAA	3	9	11942	11950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384890388
125	NC_017357	TGG	2	6	12024	12029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384890388
126	NC_017357	AGA	2	6	12046	12051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384890388
127	NC_017357	AGG	2	6	12272	12277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017357	TTA	2	6	12359	12364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384890389
129	NC_017357	GAA	2	6	12376	12381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384890389
130	NC_017357	GTT	2	6	12443	12448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890389
131	NC_017357	TAA	2	6	12453	12458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384890389
132	NC_017357	ATT	2	6	12466	12471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384890389
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