MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 908 chromosome

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017357	GA	8	16	6807	6822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017357	CA	3	6	16217	16222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017357	GT	3	6	24190	24195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017357	TA	3	6	26144	26149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017357	AG	3	6	39232	39237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017357	GT	3	6	42939	42944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017357	AG	3	6	63609	63614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017357	AG	3	6	71233	71238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017357	TA	5	10	77624	77633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017357	TC	3	6	79804	79809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017357	AG	3	6	84337	84342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017357	GA	3	6	92727	92732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017357	AG	3	6	92807	92812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017357	TA	3	6	96303	96308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017357	AG	3	6	97451	97456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017357	GT	3	6	98224	98229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017357	AT	3	6	103146	103151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017357	AG	3	6	108627	108632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017357	GA	3	6	111811	111816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017357	CT	3	6	123876	123881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017357	TC	3	6	130214	130219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017357	CT	3	6	133267	133272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017357	GC	3	6	136519	136524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017357	AG	3	6	153190	153195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017357	TC	3	6	164363	164368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017357	AT	3	6	173419	173424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017357	AC	3	6	173743	173748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017357	CT	3	6	176389	176394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017357	GT	3	6	176431	176436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017357	AG	3	6	185292	185297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017357	CT	3	6	185327	185332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017357	TA	3	6	200604	200609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017357	TA	3	6	200656	200661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017357	AT	3	6	211340	211345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017357	GC	3	6	211693	211698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017357	AG	3	6	218570	218575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017357	TG	3	6	223734	223739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017357	GA	3	6	223751	223756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017357	GT	3	6	229428	229433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017357	AG	3	6	235372	235377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017357	AC	3	6	235784	235789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017357	GA	3	6	288965	288970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017357	AG	3	6	299306	299311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017357	GA	3	6	303082	303087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017357	AC	3	6	313203	313208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017357	GA	3	6	313289	313294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017357	AG	3	6	313492	313497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017357	CT	3	6	314086	314091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017357	TC	3	6	323442	323447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017357	AG	3	6	330371	330376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017357	AG	3	6	338877	338882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017357	TA	3	6	370624	370629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017357	AT	3	6	372527	372532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017357	AG	3	6	374219	374224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017357	GA	4	8	384174	384181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017357	GT	3	6	406811	406816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017357	AT	3	6	422658	422663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017357	TA	3	6	435450	435455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017357	GC	3	6	435542	435547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017357	GT	3	6	462312	462317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017357	AG	3	6	462330	462335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017357	GC	3	6	462353	462358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017357	TA	3	6	463468	463473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017357	GC	3	6	467034	467039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017357	TG	3	6	467482	467487	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017357	TG	3	6	487964	487969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017357	AT	3	6	501547	501552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017357	AT	3	6	501621	501626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017357	AT	3	6	505861	505866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017357	GA	3	6	507716	507721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017357	CT	3	6	507745	507750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017357	GA	3	6	513105	513110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017357	AG	4	8	513380	513387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017357	GA	3	6	514986	514991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017357	AG	3	6	515010	515015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017357	TG	3	6	516507	516512	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017357	AC	3	6	516768	516773	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017357	TG	3	6	516931	516936	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017357	GA	3	6	517079	517084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017357	AT	3	6	523045	523050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017357	TG	3	6	523055	523060	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017357	CT	4	8	527327	527334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017357	CT	3	6	528640	528645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017357	GT	3	6	529040	529045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017357	AG	3	6	532881	532886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017357	TC	3	6	533381	533386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017357	GT	4	8	537968	537975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017357	GA	4	8	538192	538199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017357	GA	4	8	540076	540083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017357	TA	3	6	544264	544269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017357	CA	3	6	548936	548941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017357	TA	3	6	557469	557474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017357	AT	3	6	576003	576008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017357	AT	3	6	582527	582532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017357	AT	3	6	582576	582581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017357	CT	3	6	582690	582695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017357	GT	3	6	583124	583129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017357	AT	3	6	583141	583146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017357	TA	3	6	593450	593455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017357	TA	3	6	603624	603629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017357	TC	3	6	603835	603840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017357	AG	3	6	617873	617878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017357	CG	3	6	630525	630530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017357	TC	3	6	644494	644499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017357	TA	3	6	646804	646809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017357	CT	3	6	680120	680125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017357	CT	3	6	680196	680201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017357	TA	3	6	687056	687061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017357	AC	3	6	690143	690148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017357	CA	3	6	693205	693210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017357	AG	3	6	694482	694487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017357	TA	3	6	706339	706344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017357	AG	3	6	706414	706419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017357	TC	3	6	706481	706486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017357	AG	3	6	706732	706737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017357	CT	3	6	706894	706899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017357	CT	3	6	712574	712579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017357	TA	3	6	712660	712665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017357	AT	3	6	728567	728572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017357	GC	3	6	729866	729871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017357	TA	3	6	729927	729932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017357	GA	3	6	733742	733747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017357	GT	3	6	738172	738177	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017357	TA	3	6	739540	739545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017357	AG	3	6	750332	750337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017357	TC	3	6	759356	759361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017357	AT	3	6	760633	760638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017357	GA	3	6	761983	761988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017357	GA	3	6	776249	776254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017357	TC	3	6	781153	781158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017357	TC	3	6	789952	789957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017357	CT	3	6	820429	820434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017357	AC	3	6	862990	862995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017357	TA	3	6	869305	869310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017357	TA	3	6	869861	869866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017357	AT	3	6	882557	882562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017357	CT	3	6	883348	883353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017357	AT	3	6	908199	908204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017357	AG	3	6	933251	933256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017357	AG	3	6	933330	933335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017357	TA	3	6	935139	935144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017357	CT	3	6	943577	943582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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146	NC_017357	TA	3	6	974569	974574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017357	AG	3	6	976229	976234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017357	GA	3	6	976282	976287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017357	TA	3	6	978310	978315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017357	AT	3	6	984667	984672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017357	AG	3	6	985113	985118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.