MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Sat464 plasmid pHPSAT464

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017356	AAC	2	6	63	68	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893582
2	NC_017356	AGA	2	6	175	180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893582
3	NC_017356	AAC	2	6	284	289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893582
4	NC_017356	CAA	2	6	292	297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893582
5	NC_017356	GTG	2	6	452	457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384893582
6	NC_017356	CTT	2	6	660	665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893582
7	NC_017356	AAC	2	6	951	956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893582
8	NC_017356	AAG	2	6	1057	1062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893582
9	NC_017356	CTT	2	6	1088	1093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893582
10	NC_017356	CAA	2	6	1243	1248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893582
11	NC_017356	AGA	2	6	1309	1314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893582
12	NC_017356	TGA	2	6	1821	1826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384893583
13	NC_017356	ATT	2	6	1862	1867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384893583
14	NC_017356	GAA	2	6	1882	1887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893583
15	NC_017356	AAT	2	6	1933	1938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384893583
16	NC_017356	ATT	2	6	1951	1956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384893583
17	NC_017356	GGT	2	6	1987	1992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384893583
18	NC_017356	CAC	2	6	1995	2000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384893583
19	NC_017356	CAA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893583
20	NC_017356	TCT	3	9	2326	2334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893583
21	NC_017356	AAT	2	6	2435	2440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017356	GGT	2	6	2539	2544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017356	CTT	2	6	3153	3158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017356	TGT	2	6	3214	3219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017356	GAT	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384893584
26	NC_017356	GAG	2	6	3656	3661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384893584
27	NC_017356	TCA	2	6	3774	3779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893584
28	NC_017356	GAA	2	6	3801	3806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893584
29	NC_017356	TTA	2	6	3890	3895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384893584
30	NC_017356	GAA	2	6	3899	3904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893584
31	NC_017356	AGA	2	6	3976	3981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893584
32	NC_017356	AAC	2	6	4100	4105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893584
33	NC_017356	GAT	2	6	4175	4180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384893584
34	NC_017356	CTA	2	6	4409	4414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893584
35	NC_017356	CTA	2	6	4463	4468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893584
36	NC_017356	ACA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893584
37	NC_017356	AAT	2	6	4517	4522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384893584
38	NC_017356	ACT	2	6	4756	4761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893584
39	NC_017356	AGA	3	9	4789	4797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893584
40	NC_017356	AAC	2	6	5066	5071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893584
41	NC_017356	GCG	2	6	5460	5465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017356	TTA	2	6	5491	5496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017356	ACA	2	6	5690	5695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017356	ATT	2	6	6166	6171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017356	TAG	2	6	6357	6362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017356	TAG	2	6	6562	6567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017356	TAG	2	6	6767	6772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017356	CAT	2	6	6945	6950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017356	GTT	2	6	6955	6960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017356	ACC	2	6	7041	7046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017356	CTT	2	6	7102	7107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017356	CTT	2	6	7124	7129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017356	CTT	2	6	7146	7151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017356	CTT	2	6	7168	7173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.