MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori v225d chromosome

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017355	AAACAC	2	12	18070	18081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017355	TTTCTT	2	12	22678	22689	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017355	GATGTG	2	12	56384	56395	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017355	CCAACA	2	12	58345	58356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017355	GAAAAA	2	12	60346	60357	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017355	TACAAA	2	12	87458	87469	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017355	GTTTTA	2	12	127827	127838	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017355	TCATGA	2	12	129605	129616	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017355	TAAAAA	2	12	164116	164127	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017355	TATAAT	2	12	207944	207955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017355	ATTTTA	2	12	243343	243354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017355	GAGCGG	2	12	305370	305381	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017355	GCTATG	2	12	305746	305757	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017355	GATTTA	2	12	315639	315650	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017355	AAAAGC	2	12	329797	329808	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017355	TGGCTA	2	12	334883	334894	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017355	AAAAAT	2	12	416624	416635	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017355	TAAAAA	2	12	422835	422846	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017355	TTCTTT	2	12	433765	433776	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017355	TAAAAA	2	12	436843	436854	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017355	TATTTT	2	12	461684	461695	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017355	TTTGGA	2	12	484133	484144	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017355	TTGTAA	2	12	506795	506806	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017355	ATTTTA	2	12	569171	569182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017355	AAAATC	2	12	579326	579337	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017355	ATTGCG	2	12	627024	627035	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017355	CTAAAG	2	12	665213	665224	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017355	CACCGG	2	12	666822	666833	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017355	AAAAAT	2	12	668076	668087	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017355	AAGAAA	2	12	679991	680002	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017355	AATGAG	2	12	680027	680038	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017355	TTTGAA	2	12	734013	734024	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017355	GAATTT	2	12	746143	746154	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017355	CGGCTT	2	12	747602	747613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017355	AAAACT	2	12	845995	846006	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017355	TTTTAA	2	12	854326	854337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017355	ATTTTT	2	12	879140	879151	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017355	AAAAAG	2	12	899523	899534	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017355	ATTATA	2	12	922657	922668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017355	TAAAAT	2	12	922682	922693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017355	ATTGAA	2	12	930054	930065	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017355	TCAAAT	2	12	952501	952512	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017355	TTATTT	2	12	952966	952977	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017355	GCGCGA	2	12	978286	978297	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017355	TAAAAT	2	12	979826	979837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017355	AGTAGA	2	12	1025504	1025515	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017355	TTTCTT	2	12	1027449	1027460	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017355	CATAGC	2	12	1078050	1078061	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017355	GTTTTT	2	12	1078111	1078122	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017355	AGCGTT	2	12	1078213	1078224	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017355	ATTTGA	2	12	1093123	1093134	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017355	AAACAA	2	12	1146338	1146349	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017355	AACGCT	2	12	1149347	1149358	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017355	TTGTAT	2	12	1199870	1199881	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017355	ACTTAA	2	12	1216856	1216867	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017355	TCATTT	2	12	1238987	1238998	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017355	AAACTT	2	12	1239010	1239021	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017355	AAAAAG	2	12	1254349	1254360	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017355	ATTTTT	2	12	1270181	1270192	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017355	TAAAAA	2	12	1298192	1298203	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017355	ATTTTT	2	12	1316307	1316318	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017355	AATTTA	2	12	1357533	1357544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017355	AGTTTT	2	12	1378537	1378548	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017355	CCAACC	2	12	1380448	1380459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017355	AGTAGA	2	12	1385418	1385429	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017355	TTTCTT	2	12	1387363	1387374	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017355	GTTTTA	2	12	1402550	1402561	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017355	TAGCGA	2	12	1410496	1410507	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017355	ATTGAT	2	12	1445834	1445845	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017355	ATGACA	2	12	1461330	1461341	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017355	CCCTAG	2	12	1464650	1464661	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017355	TAAACA	2	12	1528350	1528361	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017355	ATTTGT	2	12	1536043	1536054	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017355	AGAGCA	2	12	1536560	1536571	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017355	TGTCTT	2	12	1538787	1538798	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017355	TAAAAA	2	12	1571582	1571593	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.