MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori v225d chromosome

Total Repeats: 714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017355	AAAGCA	2	12	278	289	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384888658
2	NC_017355	ATTATA	2	12	1785	1796	50 %	50 %	0 %	0 %	384888661
3	NC_017355	GCGATA	2	12	3717	3728	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384888663
4	NC_017355	GCTTGC	2	12	6114	6125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384888665
5	NC_017355	GAAACC	2	12	7489	7500	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384888666
6	NC_017355	CAATAT	2	12	17143	17154	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384888675
7	NC_017355	AGAAAA	2	12	18420	18431	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384888676
8	NC_017355	GATAAA	2	12	21976	21987	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384888679
9	NC_017355	TTTTAG	2	12	28961	28972	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384888687
10	NC_017355	GCGTGG	2	12	30854	30865	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384888691
11	NC_017355	TTGGAT	2	12	30964	30975	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384888691
12	NC_017355	TTGAAT	2	12	32047	32058	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384888691
13	NC_017355	TAAGGA	2	12	32346	32357	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384888691
14	NC_017355	TAGGGG	2	12	33858	33869	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384888694
15	NC_017355	CAGCAC	2	12	34616	34627	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384888695
16	NC_017355	AAAGAA	2	12	35370	35381	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384888695
17	NC_017355	AAAGAA	2	12	36940	36951	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384888698
18	NC_017355	CAAAAT	2	12	39286	39297	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384888700
19	NC_017355	CAAAAT	2	12	39923	39934	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384888700
20	NC_017355	CGCAAA	2	12	43075	43086	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384888703
21	NC_017355	TAAAAA	2	12	49616	49627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384888708
22	NC_017355	AGATAA	2	12	54268	54279	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384888711
23	NC_017355	AGAAAA	2	12	54541	54552	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384888712
24	NC_017355	AAAGAA	2	12	54917	54928	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384888712
25	NC_017355	AATTTT	2	12	55070	55081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888712
26	NC_017355	TTTTGT	2	12	58676	58687	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384888715
27	NC_017355	AAAGAG	2	12	58955	58966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888715
28	NC_017355	GCAAAC	2	12	58983	58994	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384888715
29	NC_017355	GGACAA	2	12	61889	61900	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384888720
30	NC_017355	TAAGGG	2	12	73011	73022	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384888733
31	NC_017355	CGCCCA	2	12	73548	73559	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384888733
32	NC_017355	GGCATG	2	12	75559	75570	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384888736
33	NC_017355	GCAACG	2	12	76607	76618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384888736
34	NC_017355	AATATT	2	12	77208	77219	50 %	50 %	0 %	0 %	384888737
35	NC_017355	AACAGG	2	12	85139	85150	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384888744
36	NC_017355	GATTTT	2	12	90924	90935	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384888749
37	NC_017355	AAACTC	2	12	91041	91052	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384888749
38	NC_017355	TCAAAA	2	12	92527	92538	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384888751
39	NC_017355	GCGGTG	2	12	93227	93238	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384888752
40	NC_017355	AATATT	2	12	96444	96455	50 %	50 %	0 %	0 %	384888753
41	NC_017355	CATATT	2	12	102182	102193	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384888758
42	NC_017355	AGCGTT	2	12	103045	103056	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384888758
43	NC_017355	TTTTCT	2	12	108612	108623	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384888765
44	NC_017355	TGCAAG	2	12	109018	109029	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384888765
45	NC_017355	GGGAAG	2	12	115021	115032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384888771
46	NC_017355	AGGGAG	2	12	115299	115310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384888771
47	NC_017355	TAGGCA	2	12	116164	116175	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384888771
48	NC_017355	CTTCTA	2	12	118487	118498	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384888773
49	NC_017355	GTTCTA	2	12	118694	118705	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384888773
50	NC_017355	CTTCTA	2	12	119806	119817	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384888774
51	NC_017355	GTTCTA	2	12	120067	120078	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384888774
52	NC_017355	CTTCTA	2	12	121179	121190	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384888775
53	NC_017355	GTTCTA	2	12	121419	121430	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384888775
54	NC_017355	CTAAGG	2	12	122777	122788	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384888776
55	NC_017355	TGAATT	2	12	123311	123322	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384888776
56	NC_017355	TTTCAA	2	12	123470	123481	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384888776
57	NC_017355	TTAAAA	2	12	126333	126344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888778
58	NC_017355	CTAAAG	2	12	127080	127091	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384888779
59	NC_017355	AAAAAT	2	12	136156	136167	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384888792
60	NC_017355	TTAAAA	2	12	136358	136369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888793
61	NC_017355	ATTCAA	2	12	137242	137253	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384888795
62	NC_017355	TAGCGA	2	12	138298	138309	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384888796
63	NC_017355	TTAGCG	2	12	141190	141201	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384888798
64	NC_017355	TATCGC	2	12	141402	141413	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384888798
65	NC_017355	ATCGCT	2	12	143110	143121	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384888799
66	NC_017355	TTCTAT	2	12	146493	146504	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384888802
67	NC_017355	TTGTTT	2	12	149481	149492	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384888807
68	NC_017355	CTTGGG	2	12	150142	150153	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384888809
69	NC_017355	GAATCT	2	12	151636	151647	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384888811
70	NC_017355	TTGGGT	2	12	154913	154924	0 %	50 %	50 %	0 %	384888814
71	NC_017355	GATTTT	2	12	155425	155436	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384888815
72	NC_017355	CTTTCT	2	12	159022	159033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888819
73	NC_017355	CCGCTC	2	12	161031	161042	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384888823
74	NC_017355	GCTCTC	2	12	163458	163469	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384888825
75	NC_017355	TTCTAA	2	12	165781	165792	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384888828
76	NC_017355	TCAATA	2	12	167463	167474	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384888830
77	NC_017355	ATCGTT	2	12	167885	167896	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384888830
78	NC_017355	AATTTC	2	12	168236	168247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384888831
79	NC_017355	TAAAAT	2	12	169760	169771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888832
80	NC_017355	TTCTTT	2	12	170170	170181	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384888832
81	NC_017355	ATTTTG	2	12	171347	171358	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384888834
82	NC_017355	CGCTTT	2	12	171825	171836	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384888834
83	NC_017355	GTTTAA	2	12	172607	172618	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384888835
84	NC_017355	CCGCTC	2	12	175252	175263	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384888838
85	NC_017355	GAAAAA	2	12	178894	178905	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384888841
86	NC_017355	AGGCAT	2	12	178983	178994	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384888841
87	NC_017355	GCATTT	2	12	180696	180707	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384888843
88	NC_017355	TCAAAC	2	12	181263	181274	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384888844
89	NC_017355	ATAAAG	2	12	181430	181441	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384888844
90	NC_017355	GGTATT	2	12	185321	185332	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384888847
91	NC_017355	TCTAAA	2	12	185551	185562	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384888847
92	NC_017355	TGGGCA	2	12	186620	186631	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384888848
93	NC_017355	TTCTAA	2	12	187099	187110	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384888849
94	NC_017355	ATTTTC	2	12	189044	189055	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384888849
95	NC_017355	TGGGGC	2	12	196453	196464	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384888859
96	NC_017355	AAATCC	2	12	197880	197891	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384888861
97	NC_017355	AACATC	2	12	197946	197957	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384888861
98	NC_017355	AATTTT	2	12	200659	200670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888863
99	NC_017355	AAAGAT	2	12	205837	205848	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384888868
100	NC_017355	ATTCTA	2	12	208269	208280	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384888871
101	NC_017355	CATAGC	2	12	210034	210045	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384888872
102	NC_017355	GTTTTG	2	12	210539	210550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888872
103	NC_017355	TTATTT	2	12	212171	212182	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384888873
104	NC_017355	GCTAAA	2	12	217631	217642	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384888880
105	NC_017355	AATGCC	2	12	222120	222131	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384888885
106	NC_017355	GGATTG	2	12	224410	224421	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384888886
107	NC_017355	GCTGTA	2	12	224687	224698	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384888886
108	NC_017355	GGACCA	2	12	224760	224771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384888886
109	NC_017355	GGTGAT	2	12	226374	226385	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384888887
110	NC_017355	TCAATA	2	12	226796	226807	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384888888
111	NC_017355	CACGCC	2	12	227276	227287	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384888888
112	NC_017355	GCTTTG	2	12	228518	228529	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384888889
113	NC_017355	GCTAGG	2	12	229899	229910	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384888890
114	NC_017355	TCTTTA	2	12	236247	236258	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384888897
115	NC_017355	GTTTTT	2	12	241883	241894	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384888904
116	NC_017355	TCCCGC	2	12	247226	247237	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384888909
117	NC_017355	TCCCGC	2	12	248039	248050	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384888909
118	NC_017355	CAAAGC	2	12	249508	249519	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384888911
119	NC_017355	TTTAGC	2	12	251242	251253	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384888913
120	NC_017355	TAATAC	2	12	251302	251313	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384888913
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122	NC_017355	GGGGCT	2	12	259709	259720	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384888920
123	NC_017355	GATTTT	2	12	261001	261012	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384888920
124	NC_017355	TGAGCG	2	12	264263	264274	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384888923
125	NC_017355	AGCTTT	2	12	264411	264422	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384888923
126	NC_017355	GATTTT	2	12	268947	268958	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384888930
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225	NC_017355	GCTCGC	2	12	471275	471286	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384889127
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230	NC_017355	GATCAA	2	12	480040	480051	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384889133
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232	NC_017355	TTTAAT	2	12	485655	485666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384889138
233	NC_017355	TTTGGA	2	12	488679	488690	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384889140
234	NC_017355	CATTTT	2	12	489138	489149	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384889141
235	NC_017355	CTATCG	2	12	489433	489444	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384889142
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347	NC_017355	CTTTAT	2	12	721002	721013	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384889351
348	NC_017355	GAGCCA	2	12	725939	725950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384889357
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457	NC_017355	CAAACC	2	12	980828	980839	50 %	0 %	0 %	50 %	384889601
458	NC_017355	TAAAAA	2	12	982679	982690	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384889601
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462	NC_017355	TCCAAA	2	12	992540	992551	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384889608
463	NC_017355	GATAGC	2	12	992821	992832	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384889609
464	NC_017355	GGGACT	2	12	996173	996184	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384889611
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