MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori v225d chromosome

Total Repeats: 580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017355	ATGC	2	8	4272	4279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017355	ATAA	2	8	9413	9420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017355	ATTC	2	8	9616	9623	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017355	TTAA	2	8	13432	13439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017355	AGTT	2	8	16380	16387	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017355	ATCA	2	8	22479	22486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017355	GTAT	2	8	24922	24929	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017355	ATTA	2	8	24989	24996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017355	GGTT	2	8	29845	29852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017355	GATT	2	8	42239	42246	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017355	TTAA	2	8	48168	48175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017355	TTTA	2	8	53296	53303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017355	TAAT	2	8	53396	53403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017355	TTGT	2	8	53475	53482	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017355	CAAG	2	8	56227	56234	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017355	AAAG	2	8	56525	56532	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017355	TGCT	2	8	56711	56718	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017355	AGCG	2	8	57238	57245	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017355	GAAA	2	8	57507	57514	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017355	AGAT	2	8	57800	57807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017355	CATT	2	8	57998	58005	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017355	CAAA	2	8	59388	59395	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017355	TACT	2	8	60679	60686	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017355	TCTG	2	8	66143	66150	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017355	CAAA	2	8	67273	67280	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017355	CGTT	2	8	76941	76948	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017355	ATTT	2	8	87241	87248	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017355	GGTG	2	8	87277	87284	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017355	TCCC	2	8	87347	87354	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_017355	ATTT	2	8	88272	88279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017355	AAAG	2	8	89686	89693	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017355	TTTC	2	8	89952	89959	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017355	TTCA	2	8	92860	92867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017355	TGAT	2	8	94504	94511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017355	CTCC	2	8	99427	99434	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_017355	AATC	2	8	101145	101152	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017355	AAAG	2	8	105940	105947	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017355	CTTT	2	8	108499	108506	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017355	AAAT	2	8	108509	108516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017355	ATTT	2	8	110041	110048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017355	TCAT	2	8	114727	114734	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017355	TTAG	2	8	124539	124546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017355	AAAG	2	8	127443	127450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017355	AAAG	2	8	127938	127945	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017355	GAAG	2	8	127995	128002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017355	AATC	2	8	129181	129188	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017355	AGCA	2	8	129331	129338	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017355	AAAT	2	8	130962	130969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017355	ATTT	2	8	134515	134522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017355	TAAG	2	8	139869	139876	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017355	TTAA	2	8	158434	158441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017355	ATTT	2	8	158459	158466	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017355	ATTA	2	8	159508	159515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017355	TCAA	2	8	159867	159874	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017355	TCAA	2	8	162549	162556	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017355	CATG	2	8	162658	162665	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017355	ATTC	2	8	162691	162698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017355	TGCT	2	8	162762	162769	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017355	GATA	2	8	170872	170879	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017355	CACT	2	8	170910	170917	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017355	ATAA	2	8	170957	170964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017355	AATA	2	8	170969	170976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017355	GAAT	2	8	171019	171026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017355	TTTG	2	8	173655	173662	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017355	GCGT	2	8	173665	173672	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017355	GATT	2	8	176705	176712	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017355	GTGA	2	8	176959	176966	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017355	ATTT	2	8	177035	177042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017355	TTTA	2	8	181921	181928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017355	AATA	2	8	182058	182065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017355	TGCA	2	8	183960	183967	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017355	TAAG	2	8	194319	194326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017355	TTAG	2	8	197481	197488	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017355	CTTT	2	8	197496	197503	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017355	CTAG	2	8	197530	197537	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017355	GTTT	2	8	203590	203597	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017355	TATT	2	8	215674	215681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017355	ATTT	2	8	221633	221640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017355	AAAT	2	8	221913	221920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017355	TTGA	2	8	221955	221962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017355	TGAT	2	8	221979	221986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017355	TCTT	2	8	222913	222920	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017355	TTAT	2	8	226741	226748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017355	TTTA	2	8	228306	228313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017355	TCAA	2	8	234032	234039	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017355	AGCG	2	8	246086	246093	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017355	TAAA	2	8	246596	246603	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017355	TAAT	2	8	249221	249228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017355	AAAG	2	8	249266	249273	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017355	TGAT	2	8	257317	257324	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017355	ACGA	2	8	257616	257623	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017355	AACA	2	8	300800	300807	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017355	TTAA	2	8	301619	301626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017355	GGGA	2	8	305439	305446	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017355	TCAG	2	8	309137	309144	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017355	TGAG	2	8	318636	318643	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017355	TTGG	2	8	321351	321358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017355	AAAT	2	8	329592	329599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017355	GATT	2	8	335659	335666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017355	AATC	2	8	335689	335696	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017355	CAAT	2	8	338141	338148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017355	TGAA	2	8	342444	342451	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017355	CTAA	2	8	342452	342459	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017355	TTGA	2	8	351180	351187	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017355	TAAA	2	8	351223	351230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017355	ACGC	2	8	351595	351602	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017355	TAAA	2	8	352488	352495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017355	TTAA	2	8	363972	363979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017355	TAAA	2	8	363983	363990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017355	AAAT	2	8	368507	368514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017355	TTTA	2	8	371648	371655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017355	AGAA	2	8	371749	371756	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017355	TGAT	2	8	371885	371892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017355	GTTT	2	8	379115	379122	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017355	AAGT	2	8	379215	379222	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017355	TTTC	2	8	383448	383455	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017355	GGGT	2	8	385338	385345	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017355	AACA	2	8	385408	385415	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017355	GTTT	2	8	390774	390781	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017355	CCAA	2	8	397426	397433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017355	CTTT	2	8	398592	398599	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017355	TTTC	2	8	402408	402415	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017355	ATTG	2	8	402450	402457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017355	TCAA	2	8	415255	415262	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017355	AAGA	2	8	417344	417351	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017355	CAAT	2	8	417441	417448	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017355	TTGA	2	8	421342	421349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017355	GTTT	2	8	430353	430360	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017355	CACC	2	8	430455	430462	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_017355	GTGG	2	8	430727	430734	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017355	TCTT	2	8	430939	430946	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017355	TATT	2	8	434009	434016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017355	GTGG	2	8	434023	434030	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017355	GTTG	2	8	434034	434041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017355	GCTT	2	8	434198	434205	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017355	TTGT	2	8	434206	434213	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017355	CTTT	2	8	434228	434235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017355	CTTT	2	8	434252	434259	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017355	TTGA	2	8	434668	434675	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017355	GTTT	2	8	434973	434980	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017355	GCTT	3	12	435053	435064	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017355	TCTT	2	8	436385	436392	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017355	CGCT	2	8	436551	436558	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017355	AGCG	2	8	439838	439845	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017355	ATTA	2	8	444993	445000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017355	TATC	2	8	445024	445031	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017355	GAGC	2	8	459914	459921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017355	AAAT	2	8	465765	465772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017355	CTTA	2	8	470139	470146	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017355	AACT	2	8	473447	473454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_017355	TACC	2	8	473986	473993	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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499	NC_017355	TCTT	2	8	1387893	1387900	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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