MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori v225d chromosome

Total Repeats: 3939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017355	GAGC	2	8	18	25	25 %	0 %	50 %	25 %	384888658
2	NC_017355	CATT	2	8	104	111	25 %	50 %	0 %	25 %	384888658
3	NC_017355	TCTG	2	8	800	807	0 %	50 %	25 %	25 %	384888659
4	NC_017355	AAAT	2	8	902	909	75 %	25 %	0 %	0 %	384888660
5	NC_017355	GCTT	2	8	1445	1452	0 %	50 %	25 %	25 %	384888660
6	NC_017355	CCTG	2	8	1800	1807	0 %	25 %	25 %	50 %	384888661
7	NC_017355	CCAA	2	8	1824	1831	50 %	0 %	0 %	50 %	384888661
8	NC_017355	TGAA	2	8	1864	1871	50 %	25 %	25 %	0 %	384888661
9	NC_017355	TTAA	2	8	2047	2054	50 %	50 %	0 %	0 %	384888661
10	NC_017355	ATTC	2	8	2339	2346	25 %	50 %	0 %	25 %	384888661
11	NC_017355	TCTT	2	8	2548	2555	0 %	75 %	0 %	25 %	384888662
12	NC_017355	GAAA	2	8	3238	3245	75 %	0 %	25 %	0 %	384888663
13	NC_017355	GAAA	2	8	3313	3320	75 %	0 %	25 %	0 %	384888663
14	NC_017355	AGTG	2	8	3334	3341	25 %	25 %	50 %	0 %	384888663
15	NC_017355	CAAG	2	8	3814	3821	50 %	0 %	25 %	25 %	384888663
16	NC_017355	TAAA	2	8	4679	4686	75 %	25 %	0 %	0 %	384888664
17	NC_017355	CTTT	2	8	5227	5234	0 %	75 %	0 %	25 %	384888665
18	NC_017355	CATT	2	8	5293	5300	25 %	50 %	0 %	25 %	384888665
19	NC_017355	GTGC	2	8	5871	5878	0 %	25 %	50 %	25 %	384888665
20	NC_017355	TGGT	2	8	6668	6675	0 %	50 %	50 %	0 %	384888665
21	NC_017355	ATCG	2	8	6842	6849	25 %	25 %	25 %	25 %	384888665
22	NC_017355	CGTT	2	8	6877	6884	0 %	50 %	25 %	25 %	384888665
23	NC_017355	TTCA	2	8	7617	7624	25 %	50 %	0 %	25 %	384888666
24	NC_017355	TCTT	2	8	7911	7918	0 %	75 %	0 %	25 %	384888666
25	NC_017355	AAGC	2	8	8726	8733	50 %	0 %	25 %	25 %	384888666
26	NC_017355	TCAA	2	8	9812	9819	50 %	25 %	0 %	25 %	384888668
27	NC_017355	GCTC	2	8	11255	11262	0 %	25 %	25 %	50 %	384888668
28	NC_017355	ATTG	2	8	11607	11614	25 %	50 %	25 %	0 %	384888669
29	NC_017355	GCAA	2	8	11798	11805	50 %	0 %	25 %	25 %	384888669
30	NC_017355	TGCT	2	8	12003	12010	0 %	50 %	25 %	25 %	384888669
31	NC_017355	GGCC	2	8	12266	12273	0 %	0 %	50 %	50 %	384888669
32	NC_017355	TGCA	2	8	12484	12491	25 %	25 %	25 %	25 %	384888670
33	NC_017355	AGCA	2	8	12539	12546	50 %	0 %	25 %	25 %	384888671
34	NC_017355	TCTT	2	8	13284	13291	0 %	75 %	0 %	25 %	384888671
35	NC_017355	AGCG	2	8	13757	13764	25 %	0 %	50 %	25 %	384888673
36	NC_017355	GATT	2	8	13865	13872	25 %	50 %	25 %	0 %	384888673
37	NC_017355	CAAA	2	8	14034	14041	75 %	0 %	0 %	25 %	384888674
38	NC_017355	ATGC	2	8	14449	14456	25 %	25 %	25 %	25 %	384888674
39	NC_017355	GAGC	2	8	14754	14761	25 %	0 %	50 %	25 %	384888674
40	NC_017355	TTTA	2	8	15036	15043	25 %	75 %	0 %	0 %	384888674
41	NC_017355	GGGT	2	8	15084	15091	0 %	25 %	75 %	0 %	384888674
42	NC_017355	TGAT	2	8	16238	16245	25 %	50 %	25 %	0 %	384888674
43	NC_017355	AACG	2	8	17060	17067	50 %	0 %	25 %	25 %	384888675
44	NC_017355	GCTT	2	8	17232	17239	0 %	50 %	25 %	25 %	384888675
45	NC_017355	ATCT	2	8	17789	17796	25 %	50 %	0 %	25 %	384888675
46	NC_017355	GTTT	2	8	18007	18014	0 %	75 %	25 %	0 %	384888675
47	NC_017355	TTGA	2	8	18349	18356	25 %	50 %	25 %	0 %	384888676
48	NC_017355	TGCT	2	8	18725	18732	0 %	50 %	25 %	25 %	384888676
49	NC_017355	AGCG	2	8	18897	18904	25 %	0 %	50 %	25 %	384888676
50	NC_017355	GAAG	2	8	19331	19338	50 %	0 %	50 %	0 %	384888677
51	NC_017355	ACAA	2	8	19462	19469	75 %	0 %	0 %	25 %	384888677
52	NC_017355	TAAA	2	8	20403	20410	75 %	25 %	0 %	0 %	384888678
53	NC_017355	GCGA	2	8	20412	20419	25 %	0 %	50 %	25 %	384888678
54	NC_017355	AGGC	2	8	20844	20851	25 %	0 %	50 %	25 %	384888678
55	NC_017355	TGAT	2	8	20996	21003	25 %	50 %	25 %	0 %	384888679
56	NC_017355	CTTT	2	8	21263	21270	0 %	75 %	0 %	25 %	384888679
57	NC_017355	AAGT	2	8	21575	21582	50 %	25 %	25 %	0 %	384888679
58	NC_017355	CTTT	2	8	22340	22347	0 %	75 %	0 %	25 %	384888679
59	NC_017355	GTTT	2	8	23274	23281	0 %	75 %	25 %	0 %	384888682
60	NC_017355	TTCC	2	8	24066	24073	0 %	50 %	0 %	50 %	384888682
61	NC_017355	ATTG	2	8	24241	24248	25 %	50 %	25 %	0 %	384888682
62	NC_017355	TCCC	2	8	24417	24424	0 %	25 %	0 %	75 %	384888682
63	NC_017355	ATAA	2	8	26107	26114	75 %	25 %	0 %	0 %	384888684
64	NC_017355	GCTC	2	8	27634	27641	0 %	25 %	25 %	50 %	384888685
65	NC_017355	GATG	2	8	28081	28088	25 %	25 %	50 %	0 %	384888685
66	NC_017355	ATGA	2	8	28346	28353	50 %	25 %	25 %	0 %	384888686
67	NC_017355	CGTT	2	8	28788	28795	0 %	50 %	25 %	25 %	384888687
68	NC_017355	TGGT	2	8	29238	29245	0 %	50 %	50 %	0 %	384888687
69	NC_017355	AGTC	2	8	29519	29526	25 %	25 %	25 %	25 %	384888688
70	NC_017355	TGCT	2	8	29537	29544	0 %	50 %	25 %	25 %	384888688
71	NC_017355	TTTC	2	8	29695	29702	0 %	75 %	0 %	25 %	384888688
72	NC_017355	TTTA	2	8	29979	29986	25 %	75 %	0 %	0 %	384888689
73	NC_017355	CAGA	2	8	30015	30022	50 %	0 %	25 %	25 %	384888689
74	NC_017355	TGAT	2	8	30124	30131	25 %	50 %	25 %	0 %	384888689
75	NC_017355	GCGA	2	8	30177	30184	25 %	0 %	50 %	25 %	384888689
76	NC_017355	ACCC	2	8	30301	30308	25 %	0 %	0 %	75 %	384888690
77	NC_017355	CATC	2	8	30427	30434	25 %	25 %	0 %	50 %	384888690
78	NC_017355	TCAA	2	8	30569	30576	50 %	25 %	0 %	25 %	384888691
79	NC_017355	CATG	2	8	31689	31696	25 %	25 %	25 %	25 %	384888691
80	NC_017355	CGCT	2	8	31805	31812	0 %	25 %	25 %	50 %	384888691
81	NC_017355	TTGC	2	8	32193	32200	0 %	50 %	25 %	25 %	384888691
82	NC_017355	GCTT	2	8	32704	32711	0 %	50 %	25 %	25 %	384888691
83	NC_017355	GAAA	2	8	32763	32770	75 %	0 %	25 %	0 %	384888691
84	NC_017355	GATC	2	8	32841	32848	25 %	25 %	25 %	25 %	384888692
85	NC_017355	ATGA	2	8	33044	33051	50 %	25 %	25 %	0 %	384888692
86	NC_017355	TGGG	2	8	33148	33155	0 %	25 %	75 %	0 %	384888693
87	NC_017355	TTGT	2	8	34644	34651	0 %	75 %	25 %	0 %	384888695
88	NC_017355	CTTT	2	8	34791	34798	0 %	75 %	0 %	25 %	384888695
89	NC_017355	AATA	2	8	35468	35475	75 %	25 %	0 %	0 %	384888695
90	NC_017355	TAAA	2	8	35490	35497	75 %	25 %	0 %	0 %	384888695
91	NC_017355	GAAA	2	8	35620	35627	75 %	0 %	25 %	0 %	384888696
92	NC_017355	ATGA	2	8	36197	36204	50 %	25 %	25 %	0 %	384888697
93	NC_017355	TTTG	2	8	36250	36257	0 %	75 %	25 %	0 %	384888697
94	NC_017355	TGAT	2	8	36740	36747	25 %	50 %	25 %	0 %	384888698
95	NC_017355	TTGT	2	8	37056	37063	0 %	75 %	25 %	0 %	384888698
96	NC_017355	AACC	2	8	37424	37431	50 %	0 %	0 %	50 %	384888699
97	NC_017355	CAAA	2	8	37714	37721	75 %	0 %	0 %	25 %	384888699
98	NC_017355	ATTG	2	8	38128	38135	25 %	50 %	25 %	0 %	384888699
99	NC_017355	ATCA	2	8	38303	38310	50 %	25 %	0 %	25 %	384888699
100	NC_017355	TCAA	2	8	38316	38323	50 %	25 %	0 %	25 %	384888699
101	NC_017355	GATT	2	8	38908	38915	25 %	50 %	25 %	0 %	384888700
102	NC_017355	TGTT	2	8	39090	39097	0 %	75 %	25 %	0 %	384888700
103	NC_017355	CTTT	2	8	39683	39690	0 %	75 %	0 %	25 %	384888700
104	NC_017355	GAAA	2	8	39953	39960	75 %	0 %	25 %	0 %	384888701
105	NC_017355	GATC	2	8	40082	40089	25 %	25 %	25 %	25 %	384888701
106	NC_017355	ATGA	2	8	41089	41096	50 %	25 %	25 %	0 %	384888701
107	NC_017355	AACG	2	8	41481	41488	50 %	0 %	25 %	25 %	384888702
108	NC_017355	CAAA	2	8	41928	41935	75 %	0 %	0 %	25 %	384888702
109	NC_017355	TGAT	2	8	42468	42475	25 %	50 %	25 %	0 %	384888703
110	NC_017355	AAAC	2	8	42481	42488	75 %	0 %	0 %	25 %	384888703
111	NC_017355	CGCT	2	8	42622	42629	0 %	25 %	25 %	50 %	384888703
112	NC_017355	GTTT	2	8	43244	43251	0 %	75 %	25 %	0 %	384888703
113	NC_017355	CAAA	2	8	43740	43747	75 %	0 %	0 %	25 %	384888704
114	NC_017355	AATC	2	8	44538	44545	50 %	25 %	0 %	25 %	384888704
115	NC_017355	TCGC	2	8	44555	44562	0 %	25 %	25 %	50 %	384888704
116	NC_017355	AGGG	2	8	44566	44573	25 %	0 %	75 %	0 %	384888704
117	NC_017355	GCAA	2	8	45219	45226	50 %	0 %	25 %	25 %	384888704
118	NC_017355	CAAC	2	8	45351	45358	50 %	0 %	0 %	50 %	384888704
119	NC_017355	TAAA	2	8	45488	45495	75 %	25 %	0 %	0 %	384888704
120	NC_017355	AGCG	3	12	45911	45922	25 %	0 %	50 %	25 %	384888705
121	NC_017355	TTCA	2	8	46531	46538	25 %	50 %	0 %	25 %	384888705
122	NC_017355	CTTT	2	8	46877	46884	0 %	75 %	0 %	25 %	384888706
123	NC_017355	TGGT	2	8	47637	47644	0 %	50 %	50 %	0 %	384888707
124	NC_017355	TCTT	2	8	47930	47937	0 %	75 %	0 %	25 %	384888707
125	NC_017355	AAAC	2	8	48283	48290	75 %	0 %	0 %	25 %	384888708
126	NC_017355	AGCC	2	8	48483	48490	25 %	0 %	25 %	50 %	384888708
127	NC_017355	CAAG	2	8	48962	48969	50 %	0 %	25 %	25 %	384888708
128	NC_017355	AAGA	2	8	49004	49011	75 %	0 %	25 %	0 %	384888708
129	NC_017355	TCGC	2	8	49529	49536	0 %	25 %	25 %	50 %	384888708
130	NC_017355	ATTT	2	8	49726	49733	25 %	75 %	0 %	0 %	384888709
131	NC_017355	TGCT	2	8	49898	49905	0 %	50 %	25 %	25 %	384888709
132	NC_017355	TCGT	2	8	50061	50068	0 %	50 %	25 %	25 %	384888709
133	NC_017355	TCTG	2	8	51021	51028	0 %	50 %	25 %	25 %	384888709
134	NC_017355	CCAT	2	8	51745	51752	25 %	25 %	0 %	50 %	384888709
135	NC_017355	TTTG	2	8	51890	51897	0 %	75 %	25 %	0 %	384888709
136	NC_017355	AAAG	2	8	52011	52018	75 %	0 %	25 %	0 %	384888709
137	NC_017355	CTTT	2	8	52465	52472	0 %	75 %	0 %	25 %	384888709
138	NC_017355	AAAG	2	8	52968	52975	75 %	0 %	25 %	0 %	384888709
139	NC_017355	GCTC	2	8	53210	53217	0 %	25 %	25 %	50 %	384888709
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