MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori v225d chromosome

Total Repeats: 311

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017355	TC	3	6	4958	4963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017355	GA	6	12	7055	7066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017355	AC	3	6	13364	13369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017355	CA	3	6	16441	16446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017355	AC	3	6	22465	22470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017355	TA	3	6	26812	26817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017355	AG	3	6	38506	38511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017355	TA	3	6	48032	48037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017355	TC	3	6	54123	54128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017355	CT	3	6	56717	56722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017355	AG	4	8	57146	57153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017355	AG	3	6	58133	58138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017355	CG	3	6	59475	59480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017355	TC	3	6	74734	74739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017355	AG	4	8	74809	74816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017355	AG	3	6	79137	79142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017355	AG	3	6	87485	87490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017355	AT	3	6	87531	87536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017355	TA	3	6	90808	90813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017355	TG	4	8	97783	97790	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017355	CT	3	6	106512	106517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017355	TA	4	8	119120	119127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017355	TA	4	8	120493	120500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017355	AG	3	6	130002	130007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017355	TA	3	6	130041	130046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017355	TG	3	6	131352	131357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017355	CT	3	6	159530	159535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017355	TC	3	6	161949	161954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017355	CT	3	6	162824	162829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017355	AC	3	6	171141	171146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017355	AT	4	8	176855	176862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017355	GA	3	6	176863	176868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017355	GT	3	6	182097	182102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017355	CT	3	6	182135	182140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017355	AG	3	6	182161	182166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017355	AG	3	6	182212	182217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017355	GC	3	6	182221	182226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017355	CT	3	6	197344	197349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017355	GA	3	6	203573	203578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017355	GC	3	6	205050	205055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017355	AT	3	6	207913	207918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017355	CT	3	6	221819	221824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017355	CT	3	6	222989	222994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017355	AG	3	6	225312	225317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017355	GT	3	6	226704	226709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017355	TA	3	6	257256	257261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017355	GA	3	6	257392	257397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017355	AG	3	6	257787	257792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017355	AG	3	6	294445	294450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017355	TC	3	6	295417	295422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017355	GC	3	6	295467	295472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017355	CT	3	6	305398	305403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017355	GT	3	6	305758	305763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017355	TC	5	10	335711	335720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017355	AG	3	6	335995	336000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017355	CT	3	6	351464	351469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017355	AT	3	6	368539	368544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017355	AG	3	6	370223	370228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017355	AG	3	6	371673	371678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017355	GA	4	8	379830	379837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017355	AG	3	6	417407	417412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017355	TA	3	6	430379	430384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017355	GC	3	6	430471	430476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017355	CT	3	6	434821	434826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017355	AG	3	6	435145	435150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017355	GT	3	6	435299	435304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017355	TG	3	6	436798	436803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017355	CT	3	6	439599	439604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017355	AT	3	6	445034	445039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017355	TC	4	8	473198	473205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017355	GA	3	6	477669	477674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017355	AG	5	10	478157	478166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017355	CA	3	6	478226	478231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017355	TG	3	6	483991	483996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017355	AT	3	6	499858	499863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017355	AG	4	8	509387	509394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017355	GA	3	6	510964	510969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017355	AG	3	6	510988	510993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017355	GA	3	6	513052	513057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017355	CT	3	6	513607	513612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017355	AC	4	8	514082	514089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017355	AC	4	8	514104	514111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017355	AG	3	6	515191	515196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017355	CA	3	6	517457	517462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017355	CT	3	6	528341	528346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017355	AC	4	8	529741	529748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017355	AC	4	8	529763	529770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017355	AG	3	6	533802	533807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017355	TA	3	6	533820	533825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017355	TA	3	6	544726	544731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017355	AC	3	6	546155	546160	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017355	TA	3	6	550132	550137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017355	AT	3	6	578901	578906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017355	GT	3	6	584562	584567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017355	TC	3	6	584821	584826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017355	AG	3	6	585090	585095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017355	CT	3	6	585583	585588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017355	TG	3	6	585861	585866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017355	CA	3	6	596257	596262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017355	TG	3	6	606516	606521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017355	TA	3	6	627017	627022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017355	CT	3	6	633988	633993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017355	CT	9	18	633996	634013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017355	TA	3	6	648520	648525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017355	TA	3	6	664029	664034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017355	AG	3	6	665229	665234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017355	AC	3	6	665288	665293	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017355	GC	3	6	666609	666614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017355	CT	3	6	668544	668549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017355	CT	3	6	668889	668894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017355	CT	4	8	680569	680576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017355	TA	3	6	687847	687852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017355	TA	3	6	687899	687904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017355	TA	3	6	688772	688777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017355	TA	3	6	696696	696701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017355	AT	3	6	708243	708248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017355	AG	3	6	714061	714066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017355	CT	3	6	718131	718136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017355	AC	3	6	724233	724238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017355	TC	3	6	734461	734466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017355	CT	3	6	734704	734709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017355	TA	3	6	746053	746058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017355	TC	3	6	747678	747683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017355	GT	3	6	782729	782734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017355	TC	3	6	787581	787586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017355	TG	3	6	793459	793464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017355	GA	3	6	794516	794521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017355	TG	3	6	802422	802427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017355	CT	3	6	811733	811738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017355	CA	3	6	811747	811752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017355	AT	3	6	828367	828372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017355	GA	4	8	831303	831310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017355	CT	3	6	839849	839854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017355	GT	3	6	855750	855755	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017355	AG	3	6	855866	855871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017355	TG	3	6	860805	860810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017355	CT	3	6	860909	860914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017355	AC	3	6	877234	877239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017355	CT	3	6	885680	885685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017355	TA	3	6	891486	891491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017355	CT	3	6	898119	898124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017355	AT	3	6	898178	898183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017355	CA	3	6	908520	908525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017355	AT	3	6	922773	922778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017355	AG	3	6	950730	950735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017355	GC	3	6	950799	950804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017355	TA	3	6	951069	951074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017355	AG	3	6	959468	959473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017355	AT	3	6	959632	959637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017355	CT	3	6	959879	959884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017355	CT	3	6	962646	962651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017355	CT	3	6	972925	972930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017355	GA	3	6	978350	978355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_017355	AG	3	6	1536530	1536535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
304	NC_017355	AG	3	6	1536720	1536725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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311	NC_017355	AG	3	6	1571638	1571643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.