MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 52 chromosome

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017354	AAAAAG	2	12	5181	5192	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017354	AAACAC	2	12	18430	18441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017354	TTTCTT	2	12	23126	23137	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017354	TTTGTT	2	12	26053	26064	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017354	GATGTG	2	12	71269	71280	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017354	AAAAGA	2	12	72378	72389	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017354	GGAATG	2	12	72611	72622	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017354	TACAAA	2	12	104031	104042	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017354	AATAAA	2	12	117923	117934	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017354	GTTTTA	2	12	141262	141273	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017354	TTGTTT	2	12	162857	162868	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017354	TTATAA	2	12	171807	171818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017354	TAAAAA	2	12	177369	177380	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017354	AATTTC	2	12	181476	181487	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017354	ATTCTT	2	12	198152	198163	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017354	TTATAA	2	12	224125	224136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017354	CATAGC	2	12	226190	226201	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017354	GTTTTG	2	12	226695	226706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017354	TAATTA	2	12	231206	231217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017354	ATTAAA	2	12	237525	237536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017354	AGTGAG	2	12	238840	238851	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017354	ATTTTA	2	12	260692	260703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017354	CAAAGC	2	12	266854	266865	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017354	AAAAGC	2	12	353855	353866	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017354	AAGAGC	2	12	353867	353878	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017354	CTTTCT	2	12	417538	417549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017354	AAAATA	2	12	444584	444595	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017354	ATCGTT	2	12	454963	454974	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017354	TAAAAA	2	12	458447	458458	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017354	ACTTTA	2	12	477337	477348	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017354	TATTTT	2	12	483443	483454	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017354	AAATAA	2	12	528368	528379	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017354	CTAAAA	2	12	529642	529653	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017354	TGAAGA	2	12	632838	632849	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017354	GAAAAA	2	12	632923	632934	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017354	TTCAAA	2	12	633618	633629	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017354	TGGAAG	2	12	634702	634713	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017354	TTTTTA	2	12	684266	684277	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017354	CTCATT	2	12	690110	690121	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017354	TTTGAT	2	12	787957	787968	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017354	TTAAAA	2	12	795053	795064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017354	CGAAGG	2	12	811595	811606	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017354	GTAATG	2	12	817088	817099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017354	TTTAAA	2	12	828137	828148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017354	TTACAA	2	12	853660	853671	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017354	CAGATA	2	12	883825	883836	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017354	ATTAAA	2	12	891413	891424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017354	CTAAAA	2	12	891518	891529	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017354	AACCCT	2	12	894528	894539	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017354	TTAAGT	2	12	913817	913828	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017354	ATTATA	2	12	937805	937816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017354	ATTGAA	2	12	945219	945230	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017354	TATCCT	2	12	983509	983520	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017354	TTAAAA	2	12	991126	991137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017354	AACTTG	2	12	1013876	1013887	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017354	TTTCTT	2	12	1016420	1016431	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017354	ATAAAA	2	12	1016703	1016714	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017354	AAAGAT	2	12	1016942	1016953	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017354	CTAAAA	2	12	1017719	1017730	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017354	CCTATA	2	12	1031536	1031547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017354	TGCCAT	2	12	1037153	1037164	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017354	TTTTAA	2	12	1057515	1057526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017354	ACAAAA	2	12	1106997	1107008	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017354	AATACC	2	12	1136992	1137003	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017354	AACGCT	2	12	1140413	1140424	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017354	AATGTC	2	12	1140885	1140896	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017354	GCGTAA	2	12	1177032	1177043	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017354	ATCCTT	2	12	1187659	1187670	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017354	AAAATC	2	12	1189686	1189697	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017354	CAAAAC	2	12	1189958	1189969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017354	TTGTAT	2	12	1190079	1190090	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017354	ACTTAA	2	12	1207326	1207337	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017354	AAACTT	2	12	1229619	1229630	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017354	AAAAAG	2	12	1244400	1244411	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017354	ATTTTT	2	12	1260682	1260693	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017354	TAAAAA	2	12	1288756	1288767	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017354	GTAGTG	2	12	1328853	1328864	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017354	TCTAAA	2	12	1351618	1351629	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017354	CTTTAG	2	12	1352121	1352132	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017354	AGTTTT	2	12	1352727	1352738	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017354	AACTTG	2	12	1359422	1359433	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017354	TGTTTA	2	12	1366634	1366645	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017354	AAAGAC	2	12	1367688	1367699	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017354	GTTTTA	2	12	1374470	1374481	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017354	TAAAAA	2	12	1375295	1375306	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017354	AAGCCA	2	12	1375447	1375458	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017354	CTAAGT	2	12	1386612	1386623	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017354	TTTGAG	2	12	1389266	1389277	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017354	TGTTTA	2	12	1395575	1395586	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017354	GCGTGA	2	12	1402841	1402852	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017354	CTTATC	2	12	1407345	1407356	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017354	GTGCAA	2	12	1410859	1410870	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017354	GCTTTT	2	12	1423017	1423028	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017354	AGAGCG	2	12	1444655	1444666	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017354	GCTTAA	2	12	1545722	1545733	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.