MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori 52 chromosome

Total Repeats: 690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017354	ATTATA	2	12	1835	1846	50 %	50 %	0 %	0 %	384887047
2	NC_017354	GCTTGC	2	12	6320	6331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384887050
3	NC_017354	CTATTA	2	12	6731	6742	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384887050
4	NC_017354	CCGTTC	2	12	7049	7060	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384887050
5	NC_017354	GAAACC	2	12	7845	7856	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384887051
6	NC_017354	CAATAT	2	12	17498	17509	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384887059
7	NC_017354	AGAAAA	2	12	18780	18791	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384887060
8	NC_017354	GATAAA	2	12	22342	22353	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384887063
9	NC_017354	ATTGTT	2	12	24679	24690	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384887064
10	NC_017354	ATGCAA	2	12	27394	27405	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384887067
11	NC_017354	CCAAAA	2	12	31520	31531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384887070
12	NC_017354	TAGAGC	2	12	32931	32942	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384887072
13	NC_017354	CATGGA	2	12	36805	36816	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384887076
14	NC_017354	TTTTAT	2	12	40416	40427	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384887078
15	NC_017354	TTCTTT	2	12	41085	41096	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384887079
16	NC_017354	TTAGGG	2	12	42794	42805	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384887080
17	NC_017354	TTGGTG	2	12	43500	43511	0 %	50 %	50 %	0 %	384887082
18	NC_017354	ACAAAA	2	12	44424	44435	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384887083
19	NC_017354	ATTGAA	2	12	46307	46318	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384887085
20	NC_017354	GGCACA	2	12	50992	51003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384887087
21	NC_017354	TGAGCA	2	12	53118	53129	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384887089
22	NC_017354	GAAAAT	2	12	53786	53797	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384887089
23	NC_017354	GTGCCT	2	12	56251	56262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384887092
24	NC_017354	GATTTT	2	12	56587	56598	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384887092
25	NC_017354	CTACGC	2	12	59439	59450	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384887095
26	NC_017354	GTTTTT	2	12	60502	60513	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384887096
27	NC_017354	TTGCAT	2	12	60521	60532	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384887096
28	NC_017354	TGAAAT	2	12	63426	63437	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384887099
29	NC_017354	TAAAAA	2	12	65581	65592	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384887100
30	NC_017354	AGATAA	2	12	70214	70225	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384887103
31	NC_017354	AGAAAA	2	12	70277	70288	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384887103
32	NC_017354	AAAGAT	2	12	70464	70475	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384887103
33	NC_017354	CCAACA	2	12	73228	73239	50 %	0 %	0 %	50 %	384887105
34	NC_017354	TTTTGT	2	12	73565	73576	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384887106
35	NC_017354	AGAAAA	2	12	75584	75595	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384887108
36	NC_017354	ACATGC	2	12	79445	79456	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384887110
37	NC_017354	TGAATG	2	12	81687	81698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887113
38	NC_017354	ACGCCC	2	12	85551	85562	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384887117
39	NC_017354	TAAGGG	2	12	88270	88281	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384887120
40	NC_017354	CGCTAA	2	12	88633	88644	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384887120
41	NC_017354	CGCCCA	2	12	88807	88818	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384887120
42	NC_017354	GTGCAT	2	12	91746	91757	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384887122
43	NC_017354	GGCATG	2	12	92049	92060	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384887122
44	NC_017354	GCAACG	2	12	93097	93108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384887122
45	NC_017354	ATATTG	2	12	93872	93883	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384887123
46	NC_017354	AACAGG	2	12	101679	101690	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384887129
47	NC_017354	AAAAAT	2	12	104234	104245	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384887132
48	NC_017354	ATTAGA	2	12	105738	105749	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384887133
49	NC_017354	GATTTT	2	12	107505	107516	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384887135
50	NC_017354	TCAAAA	2	12	109120	109131	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384887136
51	NC_017354	GCGGTG	2	12	109819	109830	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384887137
52	NC_017354	AATATT	2	12	113027	113038	50 %	50 %	0 %	0 %	384887138
53	NC_017354	TTCCAC	2	12	116146	116157	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384887142
54	NC_017354	TTTTCT	2	12	124651	124662	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384887148
55	NC_017354	GCAAGC	2	12	125058	125069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384887148
56	NC_017354	CGCTCG	2	12	129680	129691	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384887153
57	NC_017354	TAGGCA	2	12	132217	132228	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384887154
58	NC_017354	TTCTAT	2	12	134496	134507	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384887156
59	NC_017354	GTTCTA	2	12	134891	134902	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384887156
60	NC_017354	CTAAGG	2	12	136211	136222	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384887157
61	NC_017354	TGAATT	2	12	136745	136756	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384887157
62	NC_017354	TTTCAA	2	12	136904	136915	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384887157
63	NC_017354	AGCAAA	2	12	140251	140262	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384887160
64	NC_017354	TGGTTT	2	12	141776	141787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887163
65	NC_017354	TCATGA	2	12	143034	143045	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384887164
66	NC_017354	AAAAAT	2	12	149520	149531	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384887169
67	NC_017354	ATTCAA	2	12	150608	150619	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384887171
68	NC_017354	TAGCGA	2	12	151664	151675	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384887172
69	NC_017354	TATCGC	2	12	154778	154789	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384887174
70	NC_017354	ATCGCT	2	12	156486	156497	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384887175
71	NC_017354	CCTAAA	2	12	158709	158720	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384887177
72	NC_017354	TTCTAT	2	12	159869	159880	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384887178
73	NC_017354	CTTGGG	2	12	163518	163529	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384887184
74	NC_017354	GATTTT	2	12	168809	168820	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384887190
75	NC_017354	GATGGC	2	12	172040	172051	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384887194
76	NC_017354	GATGGC	2	12	172148	172159	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384887194
77	NC_017354	CTTTCT	2	12	172292	172303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887194
78	NC_017354	CCGCTC	2	12	174288	174299	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384887196
79	NC_017354	GCTCTC	2	12	176711	176722	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384887198
80	NC_017354	TTCTAA	2	12	179026	179037	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384887201
81	NC_017354	TCAATA	2	12	180708	180719	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384887203
82	NC_017354	ATCGTT	2	12	181130	181141	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384887203
83	NC_017354	TAAAAT	2	12	182846	182857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384887204
84	NC_017354	TTCTTT	2	12	183256	183267	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384887204
85	NC_017354	ATTTTG	2	12	184657	184668	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384887206
86	NC_017354	CGCTTT	2	12	185135	185146	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384887206
87	NC_017354	GTTTAA	2	12	185919	185930	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384887207
88	NC_017354	AATGAA	2	12	189260	189271	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384887211
89	NC_017354	CCGCTC	2	12	191669	191680	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384887213
90	NC_017354	AAAGCA	2	12	192865	192876	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384887214
91	NC_017354	GGTTTG	2	12	193276	193287	0 %	50 %	50 %	0 %	384887215
92	NC_017354	AGGCAT	2	12	195381	195392	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384887216
93	NC_017354	GCATTT	2	12	197094	197105	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384887218
94	NC_017354	TCAAAC	2	12	197661	197672	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384887219
95	NC_017354	ATAAAG	2	12	197828	197839	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384887219
96	NC_017354	GGTATT	2	12	201578	201589	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384887222
97	NC_017354	TCTAAA	2	12	201808	201819	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384887222
98	NC_017354	TGGGCA	2	12	202876	202887	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384887223
99	NC_017354	TTCTAA	2	12	203355	203366	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384887224
100	NC_017354	ATTTTC	2	12	205300	205311	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384887224
101	NC_017354	TGGGGC	2	12	212714	212725	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384887233
102	NC_017354	CTGTAT	2	12	216022	216033	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384887236
103	NC_017354	ATTCTA	2	12	224451	224462	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384887242
104	NC_017354	TTATTT	2	12	228327	228338	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384887243
105	NC_017354	AGGCTA	2	12	234714	234725	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384887249
106	NC_017354	AATGCC	2	12	239199	239210	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384887253
107	NC_017354	AGGGCC	2	12	241787	241798	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384887254
108	NC_017354	GTGCTA	2	12	243342	243353	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384887255
109	NC_017354	GGTGAT	2	12	243401	243412	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384887255
110	NC_017354	TCAATA	2	12	243827	243838	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384887256
111	NC_017354	CACGCC	2	12	244307	244318	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384887256
112	NC_017354	CTTTGA	2	12	245544	245555	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384887257
113	NC_017354	GCTAGG	2	12	246921	246932	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384887258
114	NC_017354	TGGAGG	2	12	247472	247483	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384887259
115	NC_017354	TCTTTA	2	12	253595	253606	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384887265
116	NC_017354	GTTTTT	2	12	259232	259243	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384887272
117	NC_017354	ATTGTC	2	12	262392	262403	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384887275
118	NC_017354	TCCCGC	2	12	265386	265397	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384887277
119	NC_017354	AGTGGG	2	12	268576	268587	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384887280
120	NC_017354	AGCGCT	2	12	270555	270566	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384887281
121	NC_017354	TGAGCG	2	12	273213	273224	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384887285
122	NC_017354	CTTTAG	2	12	273519	273530	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384887285
123	NC_017354	GGGGCT	2	12	278808	278819	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384887290
124	NC_017354	TGGAAA	2	12	279220	279231	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384887290
125	NC_017354	GATTTT	2	12	280100	280111	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384887290
126	NC_017354	AGCTTT	2	12	283507	283518	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384887293
127	NC_017354	GATTTT	2	12	288042	288053	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384887300
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132	NC_017354	AGCGAG	2	12	301928	301939	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384887312
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137	NC_017354	TCAATT	2	12	307510	307521	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384887315
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141	NC_017354	TTATCG	2	12	319233	319244	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384887321
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147	NC_017354	ATTGGA	2	12	326900	326911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887329
148	NC_017354	ATGCGC	2	12	327163	327174	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384887329
149	NC_017354	TTGCGT	2	12	327286	327297	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384887330
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343	NC_017354	CAATGC	2	12	721395	721406	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384887694
344	NC_017354	GTTCAT	2	12	722296	722307	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384887694
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347	NC_017354	CTTTTT	2	12	728158	728169	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384887700
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