MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori 52 chromosome

Total Repeats: 1267

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017354	TAAAA	2	10	1641	1650	80 %	20 %	0 %	0 %	384887046
2	NC_017354	TTTTA	2	10	4954	4963	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017354	CCATG	2	10	5400	5409	20 %	20 %	20 %	40 %	384887050
4	NC_017354	TTTGA	2	10	6289	6298	20 %	60 %	20 %	0 %	384887050
5	NC_017354	TTTCT	2	10	8509	8518	0 %	80 %	0 %	20 %	384887051
6	NC_017354	TGAAC	2	10	12011	12020	40 %	20 %	20 %	20 %	384887054
7	NC_017354	TTTTG	2	10	12026	12035	0 %	80 %	20 %	0 %	384887054
8	NC_017354	TGGTG	2	10	12862	12871	0 %	40 %	60 %	0 %	384887055
9	NC_017354	GCTTT	2	10	13689	13698	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017354	TCGAT	2	10	17824	17833	20 %	40 %	20 %	20 %	384887059
11	NC_017354	CAAAA	2	10	18745	18754	80 %	0 %	0 %	20 %	384887060
12	NC_017354	CATCA	2	10	20121	20130	40 %	20 %	0 %	40 %	384887061
13	NC_017354	TGAAA	2	10	21089	21098	60 %	20 %	20 %	0 %	384887062
14	NC_017354	CCATG	2	10	23385	23394	20 %	20 %	20 %	40 %	384887064
15	NC_017354	CTCTT	2	10	23415	23424	0 %	60 %	0 %	40 %	384887064
16	NC_017354	ATTTT	2	10	27671	27680	20 %	80 %	0 %	0 %	384887067
17	NC_017354	GATTT	2	10	28931	28940	20 %	60 %	20 %	0 %	384887067
18	NC_017354	ATTTG	2	10	29779	29788	20 %	60 %	20 %	0 %	384887068
19	NC_017354	AAATT	2	10	30287	30296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017354	TTTTA	2	10	32460	32469	20 %	80 %	0 %	0 %	384887071
21	NC_017354	GGCGT	2	10	32482	32491	0 %	20 %	60 %	20 %	384887071
22	NC_017354	GATTT	2	10	33659	33668	20 %	60 %	20 %	0 %	384887072
23	NC_017354	AGGGC	2	10	34008	34017	20 %	0 %	60 %	20 %	384887073
24	NC_017354	TGGTG	2	10	34794	34803	0 %	40 %	60 %	0 %	384887073
25	NC_017354	TTTTA	2	10	34978	34987	20 %	80 %	0 %	0 %	384887074
26	NC_017354	GTCTT	2	10	37289	37298	0 %	60 %	20 %	20 %	384887076
27	NC_017354	ATTTC	2	10	37542	37551	20 %	60 %	0 %	20 %	384887076
28	NC_017354	AAGAT	2	10	37668	37677	60 %	20 %	20 %	0 %	384887076
29	NC_017354	TTTAA	2	10	37912	37921	40 %	60 %	0 %	0 %	384887077
30	NC_017354	TGAAA	2	10	38088	38097	60 %	20 %	20 %	0 %	384887077
31	NC_017354	GCGGG	2	10	38588	38597	0 %	0 %	80 %	20 %	384887077
32	NC_017354	TGGCT	2	10	39595	39604	0 %	40 %	40 %	20 %	384887078
33	NC_017354	TTTAG	2	10	39950	39959	20 %	60 %	20 %	0 %	384887078
34	NC_017354	TTTTC	2	10	41301	41310	0 %	80 %	0 %	20 %	384887079
35	NC_017354	TTTGT	2	10	42753	42762	0 %	80 %	20 %	0 %	384887080
36	NC_017354	AATTG	2	10	47028	47037	40 %	40 %	20 %	0 %	384887086
37	NC_017354	CTTAT	2	10	49953	49962	20 %	60 %	0 %	20 %	384887086
38	NC_017354	GCCAA	2	10	49966	49975	40 %	0 %	20 %	40 %	384887086
39	NC_017354	TGCCT	2	10	50076	50085	0 %	40 %	20 %	40 %	384887086
40	NC_017354	AAAAC	2	10	51540	51549	80 %	0 %	0 %	20 %	384887088
41	NC_017354	AAATG	2	10	55113	55122	60 %	20 %	20 %	0 %	384887090
42	NC_017354	TTGGC	2	10	55936	55945	0 %	40 %	40 %	20 %	384887092
43	NC_017354	AAAGA	2	10	56763	56772	80 %	0 %	20 %	0 %	384887093
44	NC_017354	ATTCA	2	10	56992	57001	40 %	40 %	0 %	20 %	384887093
45	NC_017354	AAAAT	2	10	59694	59703	80 %	20 %	0 %	0 %	384887095
46	NC_017354	TCTTT	2	10	60321	60330	0 %	80 %	0 %	20 %	384887096
47	NC_017354	GCTTT	2	10	63794	63803	0 %	60 %	20 %	20 %	384887099
48	NC_017354	TGAAA	2	10	64500	64509	60 %	20 %	20 %	0 %	384887100
49	NC_017354	TCAAA	2	10	64754	64763	60 %	20 %	0 %	20 %	384887100
50	NC_017354	CAGCA	2	10	65701	65710	40 %	0 %	20 %	40 %	384887101
51	NC_017354	TCGCC	2	10	67497	67506	0 %	20 %	20 %	60 %	384887101
52	NC_017354	TAAAA	2	10	67793	67802	80 %	20 %	0 %	0 %	384887101
53	NC_017354	TCAAA	2	10	68509	68518	60 %	20 %	0 %	20 %	384887101
54	NC_017354	TTAAA	2	10	69532	69541	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017354	ACAAA	2	10	69549	69558	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017354	TATCC	2	10	71972	71981	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_017354	GGTGG	2	10	77684	77693	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017354	TCAAT	2	10	80885	80894	40 %	40 %	0 %	20 %	384887112
59	NC_017354	CTTCT	2	10	81734	81743	0 %	60 %	0 %	40 %	384887113
60	NC_017354	TGCCT	2	10	81811	81820	0 %	40 %	20 %	40 %	384887113
61	NC_017354	TCCAA	2	10	82223	82232	40 %	20 %	0 %	40 %	384887114
62	NC_017354	CAAAA	2	10	82540	82549	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017354	ATGTT	2	10	83546	83555	20 %	60 %	20 %	0 %	384887115
64	NC_017354	TTTTA	2	10	85476	85485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017354	TTTTG	2	10	85507	85516	0 %	80 %	20 %	0 %	384887117
66	NC_017354	ACGCC	2	10	85813	85822	20 %	0 %	20 %	60 %	384887117
67	NC_017354	AAAGC	2	10	86579	86588	60 %	0 %	20 %	20 %	384887118
68	NC_017354	CAAAC	2	10	90751	90760	60 %	0 %	0 %	40 %	384887121
69	NC_017354	CCTCA	2	10	93928	93937	20 %	20 %	0 %	60 %	384887123
70	NC_017354	ATCTT	2	10	95027	95036	20 %	60 %	0 %	20 %	384887123
71	NC_017354	TGGCT	2	10	95568	95577	0 %	40 %	40 %	20 %	384887123
72	NC_017354	ATGCC	2	10	95991	96000	20 %	20 %	20 %	40 %	384887124
73	NC_017354	TTGAT	2	10	96909	96918	20 %	60 %	20 %	0 %	384887126
74	NC_017354	GGCGT	2	10	98723	98732	0 %	20 %	60 %	20 %	384887128
75	NC_017354	ATTTT	2	10	100537	100546	20 %	80 %	0 %	0 %	384887129
76	NC_017354	TAAGA	2	10	101937	101946	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017354	TAAAA	2	10	102008	102017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017354	TTTGC	2	10	102998	103007	0 %	60 %	20 %	20 %	384887131
79	NC_017354	TTTGA	2	10	105082	105091	20 %	60 %	20 %	0 %	384887133
80	NC_017354	TCTTT	2	10	105293	105302	0 %	80 %	0 %	20 %	384887133
81	NC_017354	GGCTT	2	10	106410	106419	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017354	CGGCA	2	10	109086	109095	20 %	0 %	40 %	40 %	384887136
83	NC_017354	AATTT	2	10	111119	111128	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017354	ACGAT	2	10	111567	111576	40 %	20 %	20 %	20 %	384887138
85	NC_017354	TTTTC	2	10	111762	111771	0 %	80 %	0 %	20 %	384887138
86	NC_017354	GAATT	2	10	113408	113417	40 %	40 %	20 %	0 %	384887139
87	NC_017354	TCGTT	2	10	115226	115235	0 %	60 %	20 %	20 %	384887140
88	NC_017354	TCTTT	2	10	118535	118544	0 %	80 %	0 %	20 %	384887143
89	NC_017354	AAAGC	2	10	121309	121318	60 %	0 %	20 %	20 %	384887145
90	NC_017354	TTTTG	2	10	122775	122784	0 %	80 %	20 %	0 %	384887147
91	NC_017354	CAAAT	2	10	123171	123180	60 %	20 %	0 %	20 %	384887147
92	NC_017354	ACCCT	2	10	124600	124609	20 %	20 %	0 %	60 %	384887148
93	NC_017354	ATGCC	2	10	124732	124741	20 %	20 %	20 %	40 %	384887148
94	NC_017354	ATTAA	2	10	125352	125361	60 %	40 %	0 %	0 %	384887149
95	NC_017354	TTAAT	2	10	126118	126127	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017354	TGATT	2	10	126736	126745	20 %	60 %	20 %	0 %	384887150
97	NC_017354	CTAAA	2	10	127221	127230	60 %	20 %	0 %	20 %	384887152
98	NC_017354	AAGCC	2	10	133154	133163	40 %	0 %	20 %	40 %	384887155
99	NC_017354	GTTTG	2	10	134455	134464	0 %	60 %	40 %	0 %	384887156
100	NC_017354	TTGAT	2	10	134983	134992	20 %	60 %	20 %	0 %	384887156
101	NC_017354	CGCTG	2	10	136083	136092	0 %	20 %	40 %	40 %	384887157
102	NC_017354	TTTGA	2	10	136230	136239	20 %	60 %	20 %	0 %	384887157
103	NC_017354	GACTT	2	10	136764	136773	20 %	40 %	20 %	20 %	384887157
104	NC_017354	ATCTC	2	10	137515	137524	20 %	40 %	0 %	40 %	384887157
105	NC_017354	CGCTT	2	10	137673	137682	0 %	40 %	20 %	40 %	384887157
106	NC_017354	TTTGT	2	10	138029	138038	0 %	80 %	20 %	0 %	384887158
107	NC_017354	TGCGT	2	10	140062	140071	0 %	40 %	40 %	20 %	384887160
108	NC_017354	GAAAA	2	10	140223	140232	80 %	0 %	20 %	0 %	384887160
109	NC_017354	GAAAA	2	10	140541	140550	80 %	0 %	20 %	0 %	384887160
110	NC_017354	ATTTT	2	10	143498	143507	20 %	80 %	0 %	0 %	384887165
111	NC_017354	ATGTT	2	10	143580	143589	20 %	60 %	20 %	0 %	384887165
112	NC_017354	AAATC	2	10	145991	146000	60 %	20 %	0 %	20 %	384887166
113	NC_017354	AAAAT	2	10	147463	147472	80 %	20 %	0 %	0 %	384887167
114	NC_017354	TTTTC	2	10	150028	150037	0 %	80 %	0 %	20 %	384887170
115	NC_017354	GTAAA	2	10	150580	150589	60 %	20 %	20 %	0 %	384887171
116	NC_017354	TTCTT	2	10	151984	151993	0 %	80 %	0 %	20 %	384887172
117	NC_017354	TCTTT	2	10	152478	152487	0 %	80 %	0 %	20 %	384887173
118	NC_017354	TTTTG	2	10	153651	153660	0 %	80 %	20 %	0 %	384887174
119	NC_017354	GCGAT	2	10	154444	154453	20 %	20 %	40 %	20 %	384887174
120	NC_017354	GCTTG	2	10	154700	154709	0 %	40 %	40 %	20 %	384887174
121	NC_017354	TTTTG	2	10	155352	155361	0 %	80 %	20 %	0 %	384887175
122	NC_017354	CCAAA	2	10	157192	157201	60 %	0 %	0 %	40 %	384887176
123	NC_017354	ACACC	2	10	157717	157726	40 %	0 %	0 %	60 %	384887177
124	NC_017354	ACGCC	2	10	160714	160723	20 %	0 %	20 %	60 %	384887178
125	NC_017354	TTATT	2	10	162610	162619	20 %	80 %	0 %	0 %	384887182
126	NC_017354	GATTT	2	10	163942	163951	20 %	60 %	20 %	0 %	384887184
127	NC_017354	CAAAT	2	10	165843	165852	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017354	AAAAC	2	10	166567	166576	80 %	0 %	0 %	20 %	384887187
129	NC_017354	GGGGA	2	10	166667	166676	20 %	0 %	80 %	0 %	384887187
130	NC_017354	TTTGG	2	10	168297	168306	0 %	60 %	40 %	0 %	384887189
131	NC_017354	AAGCC	2	10	169803	169812	40 %	0 %	20 %	40 %	384887192
132	NC_017354	AATCT	2	10	171689	171698	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017354	ATTTT	2	10	171860	171869	20 %	80 %	0 %	0 %	384887194
134	NC_017354	GGGTG	2	10	172216	172225	0 %	20 %	80 %	0 %	384887194
135	NC_017354	CAAAA	2	10	173111	173120	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017354	ATTCA	2	10	173596	173605	40 %	40 %	0 %	20 %	384887195
137	NC_017354	ATCTT	2	10	176994	177003	20 %	60 %	0 %	20 %	384887198
138	NC_017354	AGGCT	2	10	182515	182524	20 %	20 %	40 %	20 %	384887204
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253	NC_017354	GACTT	2	10	335746	335755	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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