MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori 52 chromosome

Total Repeats: 4397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017354	GAGC	2	8	68	75	25 %	0 %	50 %	25 %	384887044
2	NC_017354	CATT	2	8	154	161	25 %	50 %	0 %	25 %	384887044
3	NC_017354	ATCT	2	8	849	856	25 %	50 %	0 %	25 %	384887045
4	NC_017354	AAAT	2	8	952	959	75 %	25 %	0 %	0 %	384887046
5	NC_017354	GCTT	2	8	1495	1502	0 %	50 %	25 %	25 %	384887046
6	NC_017354	CCTG	2	8	1850	1857	0 %	25 %	25 %	50 %	384887047
7	NC_017354	CCAA	2	8	1874	1881	50 %	0 %	0 %	50 %	384887047
8	NC_017354	TGAA	2	8	1914	1921	50 %	25 %	25 %	0 %	384887047
9	NC_017354	AATG	2	8	2104	2111	50 %	25 %	25 %	0 %	384887047
10	NC_017354	ATTC	2	8	2389	2396	25 %	50 %	0 %	25 %	384887047
11	NC_017354	TCTT	2	8	2597	2604	0 %	75 %	0 %	25 %	384887048
12	NC_017354	CAAA	2	8	3140	3147	75 %	0 %	0 %	25 %	384887048
13	NC_017354	GAAA	2	8	3287	3294	75 %	0 %	25 %	0 %	384887049
14	NC_017354	GAAA	2	8	3362	3369	75 %	0 %	25 %	0 %	384887049
15	NC_017354	AGTG	2	8	3383	3390	25 %	25 %	50 %	0 %	384887049
16	NC_017354	ACGA	2	8	3510	3517	50 %	0 %	25 %	25 %	384887049
17	NC_017354	ATGC	2	8	4319	4326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017354	ACTA	2	8	5084	5091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017354	GCTT	2	8	5425	5432	0 %	50 %	25 %	25 %	384887050
20	NC_017354	CATT	2	8	5496	5503	25 %	50 %	0 %	25 %	384887050
21	NC_017354	CGTG	2	8	6073	6080	0 %	25 %	50 %	25 %	384887050
22	NC_017354	CTTG	2	8	6711	6718	0 %	50 %	25 %	25 %	384887050
23	NC_017354	TGGT	2	8	7006	7013	0 %	50 %	50 %	0 %	384887050
24	NC_017354	ATCG	2	8	7189	7196	25 %	25 %	25 %	25 %	384887050
25	NC_017354	CGTT	2	8	7224	7231	0 %	50 %	25 %	25 %	384887050
26	NC_017354	TTCA	2	8	7973	7980	25 %	50 %	0 %	25 %	384887051
27	NC_017354	TCTT	2	8	8267	8274	0 %	75 %	0 %	25 %	384887051
28	NC_017354	AAGC	2	8	9082	9089	50 %	0 %	25 %	25 %	384887051
29	NC_017354	ATAA	2	8	9769	9776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017354	ATTC	2	8	9972	9979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017354	TCAA	2	8	10168	10175	50 %	25 %	0 %	25 %	384887053
32	NC_017354	GAGC	2	8	10207	10214	25 %	0 %	50 %	25 %	384887053
33	NC_017354	ACAA	2	8	10750	10757	75 %	0 %	0 %	25 %	384887053
34	NC_017354	GCTC	2	8	11612	11619	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017354	AGTG	2	8	11786	11793	25 %	25 %	50 %	0 %	384887054
36	NC_017354	ATTG	2	8	11964	11971	25 %	50 %	25 %	0 %	384887054
37	NC_017354	GCAA	2	8	12155	12162	50 %	0 %	25 %	25 %	384887054
38	NC_017354	GCAG	2	8	12298	12305	25 %	0 %	50 %	25 %	384887054
39	NC_017354	TGCT	2	8	12360	12367	0 %	50 %	25 %	25 %	384887054
40	NC_017354	GGCC	2	8	12623	12630	0 %	0 %	50 %	50 %	384887054
41	NC_017354	TTTG	2	8	12740	12747	0 %	75 %	25 %	0 %	384887054
42	NC_017354	TGCA	2	8	12839	12846	25 %	25 %	25 %	25 %	384887055
43	NC_017354	TCTT	2	8	13639	13646	0 %	75 %	0 %	25 %	384887055
44	NC_017354	TTAA	2	8	13786	13793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017354	AGCG	2	8	14109	14116	25 %	0 %	50 %	25 %	384887057
46	NC_017354	GATT	2	8	14217	14224	25 %	50 %	25 %	0 %	384887057
47	NC_017354	CAAA	2	8	14387	14394	75 %	0 %	0 %	25 %	384887058
48	NC_017354	ATGC	2	8	14802	14809	25 %	25 %	25 %	25 %	384887058
49	NC_017354	GAGC	2	8	15107	15114	25 %	0 %	50 %	25 %	384887058
50	NC_017354	TTTA	2	8	15389	15396	25 %	75 %	0 %	0 %	384887058
51	NC_017354	TGAT	2	8	16591	16598	25 %	50 %	25 %	0 %	384887058
52	NC_017354	AGTT	2	8	16733	16740	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017354	GCTT	2	8	17587	17594	0 %	50 %	25 %	25 %	384887059
54	NC_017354	ATCT	2	8	18144	18151	25 %	50 %	0 %	25 %	384887059
55	NC_017354	GTTT	2	8	18362	18369	0 %	75 %	25 %	0 %	384887059
56	NC_017354	TTGA	2	8	18709	18716	25 %	50 %	25 %	0 %	384887060
57	NC_017354	TGCT	2	8	19085	19092	0 %	50 %	25 %	25 %	384887060
58	NC_017354	TATT	2	8	19189	19196	25 %	75 %	0 %	0 %	384887060
59	NC_017354	AGCG	2	8	19257	19264	25 %	0 %	50 %	25 %	384887060
60	NC_017354	AGAA	2	8	19690	19697	75 %	0 %	25 %	0 %	384887061
61	NC_017354	TAAA	2	8	20763	20770	75 %	25 %	0 %	0 %	384887062
62	NC_017354	GCGA	2	8	20772	20779	25 %	0 %	50 %	25 %	384887062
63	NC_017354	AGGC	2	8	21204	21211	25 %	0 %	50 %	25 %	384887062
64	NC_017354	CTTT	2	8	21629	21636	0 %	75 %	0 %	25 %	384887063
65	NC_017354	AAGT	2	8	21941	21948	50 %	25 %	25 %	0 %	384887063
66	NC_017354	GCTT	2	8	22074	22081	0 %	50 %	25 %	25 %	384887063
67	NC_017354	TTTA	2	8	22528	22535	25 %	75 %	0 %	0 %	384887063
68	NC_017354	AAAT	2	8	22613	22620	75 %	25 %	0 %	0 %	384887063
69	NC_017354	AACT	2	8	22692	22699	50 %	25 %	0 %	25 %	384887063
70	NC_017354	CTTT	2	8	22706	22713	0 %	75 %	0 %	25 %	384887063
71	NC_017354	ATCA	2	8	22845	22852	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017354	GTTT	2	8	23742	23749	0 %	75 %	25 %	0 %	384887064
73	NC_017354	TTCC	2	8	24537	24544	0 %	50 %	0 %	50 %	384887064
74	NC_017354	TCCC	2	8	24879	24886	0 %	25 %	0 %	75 %	384887064
75	NC_017354	AGTT	2	8	25038	25045	25 %	50 %	25 %	0 %	384887064
76	NC_017354	GATT	2	8	25362	25369	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017354	ATTA	2	8	25458	25465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017354	TGAA	2	8	25930	25937	50 %	25 %	25 %	0 %	384887065
79	NC_017354	AATC	2	8	26120	26127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017354	CAAT	2	8	26153	26160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017354	CCAT	2	8	26253	26260	25 %	25 %	0 %	50 %	384887066
82	NC_017354	TTTG	2	8	26358	26365	0 %	75 %	25 %	0 %	384887066
83	NC_017354	CGCT	2	8	26670	26677	0 %	25 %	25 %	50 %	384887066
84	NC_017354	TTTC	2	8	27231	27238	0 %	75 %	0 %	25 %	384887067
85	NC_017354	ATTC	2	8	28365	28372	25 %	50 %	0 %	25 %	384887067
86	NC_017354	ATCA	2	8	28981	28988	50 %	25 %	0 %	25 %	384887067
87	NC_017354	TTCT	2	8	29686	29693	0 %	75 %	0 %	25 %	384887068
88	NC_017354	CTTT	2	8	30007	30014	0 %	75 %	0 %	25 %	384887068
89	NC_017354	ATGA	2	8	31060	31067	50 %	25 %	25 %	0 %	384887069
90	NC_017354	AGCG	2	8	31140	31147	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017354	GTGG	2	8	31642	31649	0 %	25 %	75 %	0 %	384887070
92	NC_017354	AGCG	2	8	33133	33140	25 %	0 %	50 %	25 %	384887072
93	NC_017354	TTCA	2	8	33335	33342	25 %	50 %	0 %	25 %	384887072
94	NC_017354	TTTG	2	8	33756	33763	0 %	75 %	25 %	0 %	384887072
95	NC_017354	GTTT	2	8	33947	33954	0 %	75 %	25 %	0 %	384887073
96	NC_017354	GTGC	2	8	34263	34270	0 %	25 %	50 %	25 %	384887073
97	NC_017354	TTGA	2	8	34345	34352	25 %	50 %	25 %	0 %	384887073
98	NC_017354	AGGG	2	8	34638	34645	25 %	0 %	75 %	0 %	384887073
99	NC_017354	TTCA	2	8	35274	35281	25 %	50 %	0 %	25 %	384887074
100	NC_017354	CAAG	2	8	35493	35500	50 %	0 %	25 %	25 %	384887074
101	NC_017354	TTTG	2	8	35796	35803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017354	TTAC	2	8	35868	35875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017354	GAGC	2	8	36335	36342	25 %	0 %	50 %	25 %	384887075
104	NC_017354	GTTT	2	8	37194	37201	0 %	75 %	25 %	0 %	384887076
105	NC_017354	CGCT	2	8	37370	37377	0 %	25 %	25 %	50 %	384887076
106	NC_017354	CATG	2	8	37594	37601	25 %	25 %	25 %	25 %	384887076
107	NC_017354	CGTT	2	8	37690	37697	0 %	50 %	25 %	25 %	384887076
108	NC_017354	AAAG	2	8	38128	38135	75 %	0 %	25 %	0 %	384887077
109	NC_017354	GCAG	2	8	39079	39086	25 %	0 %	50 %	25 %	384887077
110	NC_017354	GCTT	2	8	39116	39123	0 %	50 %	25 %	25 %	384887077
111	NC_017354	CATG	2	8	40015	40022	25 %	25 %	25 %	25 %	384887078
112	NC_017354	TTCT	2	8	40365	40372	0 %	75 %	0 %	25 %	384887078
113	NC_017354	TATC	2	8	40438	40445	25 %	50 %	0 %	25 %	384887078
114	NC_017354	TTTA	2	8	40826	40833	25 %	75 %	0 %	0 %	384887079
115	NC_017354	TATT	2	8	41404	41411	25 %	75 %	0 %	0 %	384887079
116	NC_017354	ATTT	2	8	41912	41919	25 %	75 %	0 %	0 %	384887079
117	NC_017354	AAAG	2	8	42656	42663	75 %	0 %	25 %	0 %	384887080
118	NC_017354	GCAT	2	8	42943	42950	25 %	25 %	25 %	25 %	384887080
119	NC_017354	TTGG	2	8	43076	43083	0 %	50 %	50 %	0 %	384887081
120	NC_017354	GAAA	2	8	43416	43423	75 %	0 %	25 %	0 %	384887081
121	NC_017354	CTTT	2	8	43653	43660	0 %	75 %	0 %	25 %	384887082
122	NC_017354	ATGC	2	8	44163	44170	25 %	25 %	25 %	25 %	384887083
123	NC_017354	GAAA	2	8	44701	44708	75 %	0 %	25 %	0 %	384887083
124	NC_017354	TCCA	2	8	45412	45419	25 %	25 %	0 %	50 %	384887084
125	NC_017354	TTCT	2	8	45583	45590	0 %	75 %	0 %	25 %	384887084
126	NC_017354	CGCT	2	8	45595	45602	0 %	25 %	25 %	50 %	384887084
127	NC_017354	ATGA	2	8	45615	45622	50 %	25 %	25 %	0 %	384887084
128	NC_017354	TTTG	2	8	45638	45645	0 %	75 %	25 %	0 %	384887084
129	NC_017354	TTTG	2	8	45811	45818	0 %	75 %	25 %	0 %	384887085
130	NC_017354	GAGC	2	8	46182	46189	25 %	0 %	50 %	25 %	384887085
131	NC_017354	AGCG	2	8	46453	46460	25 %	0 %	50 %	25 %	384887085
132	NC_017354	AGCC	2	8	46753	46760	25 %	0 %	25 %	50 %	384887086
133	NC_017354	GCTC	2	8	47232	47239	0 %	25 %	25 %	50 %	384887086
134	NC_017354	AAAG	2	8	48196	48203	75 %	0 %	25 %	0 %	384887086
135	NC_017354	AAAG	2	8	48838	48845	75 %	0 %	25 %	0 %	384887086
136	NC_017354	GGAG	2	8	49254	49261	25 %	0 %	75 %	0 %	384887086
137	NC_017354	AAGC	2	8	50020	50027	50 %	0 %	25 %	25 %	384887086
138	NC_017354	TTTG	2	8	50549	50556	0 %	75 %	25 %	0 %	384887087
139	NC_017354	GGTT	2	8	50557	50564	0 %	50 %	50 %	0 %	384887087
140	NC_017354	ACAA	2	8	50825	50832	75 %	0 %	0 %	25 %	384887087
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