MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 52 chromosome

Total Repeats: 612

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017354	ATGC	2	8	4319	4326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017354	ACTA	2	8	5084	5091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017354	ATAA	2	8	9769	9776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017354	ATTC	2	8	9972	9979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017354	GCTC	2	8	11612	11619	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017354	TTAA	2	8	13786	13793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017354	AGTT	2	8	16733	16740	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017354	ATCA	2	8	22845	22852	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017354	GATT	2	8	25362	25369	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017354	ATTA	2	8	25458	25465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017354	AATC	2	8	26120	26127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017354	CAAT	2	8	26153	26160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017354	AGCG	2	8	31140	31147	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017354	TTTG	2	8	35796	35803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017354	TTAC	2	8	35868	35875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017354	TGAA	2	8	52562	52569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017354	TAGA	2	8	52590	52597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017354	TTCT	2	8	52633	52640	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017354	TTTA	2	8	56644	56651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017354	TAAA	2	8	56680	56687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017354	TTGT	2	8	60657	60664	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017354	TTCA	2	8	60892	60899	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017354	AAAT	2	8	64096	64103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017354	TTTA	2	8	69261	69268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017354	AGCG	2	8	70573	70580	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017354	AAAG	2	8	71408	71415	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017354	TGCT	2	8	71579	71586	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017354	AGCG	2	8	72108	72115	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017354	AGAT	2	8	72683	72690	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017354	CATT	2	8	72881	72888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017354	CTAT	2	8	73891	73898	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017354	TACT	2	8	75920	75927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017354	TTAT	2	8	76157	76164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017354	TAAA	2	8	77130	77137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017354	TTTA	2	8	77147	77154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017354	AAAG	2	8	77597	77604	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017354	CAAA	2	8	78941	78948	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017354	AAAC	2	8	79070	79077	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017354	TAGA	2	8	87340	87347	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017354	TTTA	2	8	89025	89032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017354	AAAG	2	8	89689	89696	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017354	ACTC	2	8	90039	90046	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017354	TTTA	2	8	91138	91145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017354	CCAA	2	8	91146	91153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017354	AAAG	2	8	91160	91167	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017354	TCTA	2	8	91211	91218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017354	TTTG	2	8	91333	91340	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017354	TTAG	2	8	93449	93456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017354	CTTT	2	8	93464	93471	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017354	AACT	2	8	93558	93565	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017354	TTTC	2	8	96746	96753	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017354	TCAA	2	8	101917	101924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017354	GGTG	2	8	103850	103857	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017354	TCCC	2	8	103920	103927	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_017354	AAAG	2	8	106260	106267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017354	TTTC	2	8	106533	106540	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017354	GTAA	2	8	106803	106810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017354	CTAA	2	8	108460	108467	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017354	TTCA	2	8	109453	109460	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017354	TTTA	2	8	109480	109487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017354	TGAT	2	8	111097	111104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017354	GAAT	2	8	117915	117922	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017354	AAGC	2	8	122611	122618	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017354	CCGC	2	8	122635	122642	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_017354	CTTT	2	8	124538	124545	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017354	AAAT	2	8	124548	124555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017354	ATTT	2	8	126080	126087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017354	GCAT	2	8	127145	127152	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017354	TCAT	2	8	130780	130787	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017354	CATT	2	8	135372	135379	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017354	GTTA	2	8	137972	137979	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017354	AAAG	2	8	140878	140885	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017354	AAAG	2	8	141373	141380	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017354	GAAG	2	8	141430	141437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017354	ACAA	2	8	142436	142443	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017354	AATT	2	8	142495	142502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017354	AATC	2	8	142607	142614	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017354	ATTA	2	8	143471	143478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017354	TAAA	2	8	144805	144812	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017354	ATTT	2	8	147674	147681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017354	CAAA	2	8	149672	149679	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017354	TAAG	2	8	153245	153252	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017354	GAGC	2	8	171793	171800	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017354	TCAA	2	8	173129	173136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017354	CTTG	2	8	173465	173472	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017354	AAGG	2	8	181580	181587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017354	TTTA	2	8	181689	181696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017354	TTGA	2	8	181785	181792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017354	TAAA	2	8	182098	182105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017354	GCAT	2	8	182299	182306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017354	CATT	2	8	182367	182374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017354	CACT	2	8	183996	184003	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017354	TAAC	2	8	184258	184265	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017354	AATA	2	8	184269	184276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017354	AATA	2	8	184278	184285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017354	GAAT	2	8	184329	184336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017354	TTTA	2	8	186973	186980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017354	TTGA	2	8	187112	187119	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017354	GATT	2	8	193122	193129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017354	CATT	2	8	198313	198320	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017354	GTTT	2	8	198331	198338	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017354	TCGT	2	8	199982	199989	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017354	TTCA	2	8	200206	200213	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017354	TGAT	2	8	211629	211636	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017354	GTTT	2	8	212124	212131	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017354	TTAG	2	8	213748	213755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017354	CTTT	2	8	213763	213770	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017354	CTAG	2	8	213797	213804	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017354	TGCA	2	8	219643	219650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017354	GTTT	2	8	219754	219761	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017354	AATG	2	8	223197	223204	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017354	ATTC	2	8	225724	225731	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017354	TTGT	2	8	225803	225810	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017354	AGGG	2	8	226535	226542	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017354	TGCC	2	8	226589	226596	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017354	CTTT	2	8	227191	227198	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017354	TGAT	2	8	228960	228967	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017354	ATCA	2	8	231039	231046	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017354	ATCC	2	8	231248	231255	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017354	AAAG	2	8	231305	231312	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017354	GTTT	2	8	231387	231394	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017354	CTTT	2	8	231581	231588	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017354	ATTG	2	8	231617	231624	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017354	TATT	2	8	232760	232767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017354	TGGT	2	8	233270	233277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017354	CGCT	2	8	238704	238711	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017354	ATTT	2	8	238713	238720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017354	AAAT	2	8	238993	239000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017354	TTGA	2	8	239035	239042	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017354	TGAT	2	8	239059	239066	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017354	TCTT	2	8	239992	239999	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017354	TTTA	2	8	245337	245344	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017354	AGCG	2	8	249602	249609	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017354	AACA	2	8	250087	250094	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017354	GGGT	2	8	250182	250189	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017354	TCAA	2	8	251377	251384	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017354	TAAT	2	8	266568	266575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017354	AAAG	2	8	266613	266620	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017354	TTGA	2	8	276274	276281	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017354	TGAT	2	8	276419	276426	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017354	TCAA	2	8	316323	316330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017354	TTAA	2	8	320806	320813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017354	GTTT	2	8	332924	332931	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017354	TGAG	2	8	335803	335810	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017354	TTGG	2	8	338518	338525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017354	TTGG	2	8	340588	340595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017354	GATT	2	8	344362	344369	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017354	TTTA	2	8	344541	344548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017354	AAAT	2	8	346729	346736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017354	AATC	2	8	352563	352570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017354	TCTT	2	8	352967	352974	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017354	AGCA	2	8	353828	353835	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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483	NC_017354	TTCA	2	8	1189530	1189537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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