MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori 52 chromosome

Total Repeats: 15713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017354	GAT	3	9	162	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887044
2	NC_017354	GTT	2	6	345	350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887044
3	NC_017354	TTC	2	6	396	401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887044
4	NC_017354	ACA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384887044
5	NC_017354	ACC	2	6	433	438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384887044
6	NC_017354	AAT	2	6	497	502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384887045
7	NC_017354	AAC	2	6	737	742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384887045
8	NC_017354	CTT	2	6	840	845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887045
9	NC_017354	TGA	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887045
10	NC_017354	TCA	2	6	998	1003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384887046
11	NC_017354	CCG	3	9	1083	1091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384887046
12	NC_017354	CCA	2	6	1227	1232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384887046
13	NC_017354	GCT	2	6	1252	1257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384887046
14	NC_017354	ATA	2	6	1400	1405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384887046
15	NC_017354	GGC	2	6	1443	1448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384887046
16	NC_017354	GTT	2	6	1663	1668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887046
17	NC_017354	TAG	2	6	1686	1691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887046
18	NC_017354	CTT	2	6	1697	1702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887046
19	NC_017354	TTC	2	6	1802	1807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887047
20	NC_017354	ATG	2	6	1863	1868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887047
21	NC_017354	TCA	2	6	1900	1905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384887047
22	NC_017354	TTG	2	6	1938	1943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887047
23	NC_017354	TTC	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887047
24	NC_017354	CAT	2	6	2092	2097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384887047
25	NC_017354	AAT	2	6	2144	2149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384887047
26	NC_017354	TAG	2	6	2197	2202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887047
27	NC_017354	AGC	2	6	2817	2822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384887048
28	NC_017354	GTG	2	6	3006	3011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384887048
29	NC_017354	AGA	2	6	3104	3109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384887048
30	NC_017354	GTG	2	6	3165	3170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384887048
31	NC_017354	GCC	2	6	3172	3177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384887048
32	NC_017354	TGC	2	6	3257	3262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384887049
33	NC_017354	GGT	2	6	3617	3622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384887049
34	NC_017354	ATC	2	6	3702	3707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384887049
35	NC_017354	ATT	2	6	3946	3951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384887049
36	NC_017354	GGC	2	6	4019	4024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384887049
37	NC_017354	GGT	2	6	4123	4128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017354	TAT	2	6	4171	4176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017354	TGG	2	6	4215	4220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017354	TGG	2	6	4335	4340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017354	GTG	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017354	ACC	2	6	4483	4488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017354	GGT	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017354	AAT	2	6	4658	4663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017354	ATT	2	6	4852	4857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017354	TGT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017354	AGT	2	6	5165	5170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017354	ATT	2	6	5518	5523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384887050
49	NC_017354	TGG	2	6	5616	5621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384887050
50	NC_017354	GTT	2	6	5818	5823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887050
51	NC_017354	TAA	2	6	5887	5892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384887050
52	NC_017354	TTA	2	6	5945	5950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384887050
53	NC_017354	GTG	2	6	6014	6019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384887050
54	NC_017354	GTT	2	6	6034	6039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887050
55	NC_017354	TCT	2	6	6158	6163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887050
56	NC_017354	AGT	2	6	6246	6251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887050
57	NC_017354	AGA	2	6	6367	6372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384887050
58	NC_017354	TTG	2	6	6490	6495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887050
59	NC_017354	TGC	2	6	6616	6621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384887050
60	NC_017354	TGG	2	6	6648	6653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384887050
61	NC_017354	ACC	2	6	6679	6684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384887050
62	NC_017354	AGT	2	6	6688	6693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887050
63	NC_017354	ACT	3	9	6748	6756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384887050
64	NC_017354	CCG	2	6	6788	6793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384887050
65	NC_017354	TTG	2	6	6808	6813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887050
66	NC_017354	CTT	2	6	6879	6884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887050
67	NC_017354	TTG	2	6	6892	6897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887050
68	NC_017354	GAT	2	6	6898	6903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887050
69	NC_017354	TCA	2	6	6932	6937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384887050
70	NC_017354	CCG	2	6	7101	7106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384887050
71	NC_017354	GCT	2	6	7216	7221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384887050
72	NC_017354	TGT	2	6	7552	7557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017354	TTG	2	6	7640	7645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017354	CAT	2	6	7730	7735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384887051
75	NC_017354	GCC	2	6	7736	7741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384887051
76	NC_017354	TCT	2	6	7797	7802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887051
77	NC_017354	AAT	2	6	7895	7900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384887051
78	NC_017354	CTT	2	6	7903	7908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887051
79	NC_017354	CAT	2	6	7993	7998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384887051
80	NC_017354	ATG	2	6	8046	8051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887051
81	NC_017354	TCA	2	6	8070	8075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384887051
82	NC_017354	CCG	2	6	8124	8129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384887051
83	NC_017354	CTT	2	6	8143	8148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887051
84	NC_017354	TCA	2	6	8178	8183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384887051
85	NC_017354	TTG	2	6	8299	8304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887051
86	NC_017354	CAT	2	6	8347	8352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384887051
87	NC_017354	GTG	2	6	8379	8384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384887051
88	NC_017354	TTC	2	6	8459	8464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887051
89	NC_017354	CCG	2	6	8478	8483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384887051
90	NC_017354	CAC	2	6	8579	8584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384887051
91	NC_017354	GAT	2	6	8621	8626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887051
92	NC_017354	TAG	2	6	8660	8665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887051
93	NC_017354	CTT	2	6	8833	8838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887051
94	NC_017354	TCT	2	6	8943	8948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887051
95	NC_017354	TAA	2	6	8986	8991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384887051
96	NC_017354	GCA	2	6	9117	9122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384887051
97	NC_017354	CTT	2	6	9142	9147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887051
98	NC_017354	TAA	3	9	9378	9386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017354	ACA	2	6	9464	9469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384887052
100	NC_017354	TCT	2	6	9498	9503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887052
101	NC_017354	CTT	2	6	9580	9585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887052
102	NC_017354	GAT	3	9	9668	9676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887052
103	NC_017354	TCT	2	6	9696	9701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887052
104	NC_017354	CTA	2	6	9712	9717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384887052
105	NC_017354	ATT	2	6	9878	9883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017354	GAA	2	6	10007	10012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017354	TTG	2	6	10127	10132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887053
108	NC_017354	GAA	2	6	10143	10148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384887053
109	NC_017354	TTA	2	6	10322	10327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384887053
110	NC_017354	AGA	2	6	10337	10342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384887053
111	NC_017354	ACC	2	6	10345	10350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384887053
112	NC_017354	AAG	2	6	10378	10383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384887053
113	NC_017354	ATT	2	6	10411	10416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384887053
114	NC_017354	GTG	2	6	10626	10631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384887053
115	NC_017354	ATG	2	6	10906	10911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887053
116	NC_017354	AGG	2	6	10971	10976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384887053
117	NC_017354	AAC	2	6	10998	11003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384887053
118	NC_017354	AGA	2	6	11384	11389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384887053
119	NC_017354	TTG	2	6	11397	11402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887053
120	NC_017354	GAC	2	6	11484	11489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384887053
121	NC_017354	TTA	3	9	11505	11513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384887053
122	NC_017354	TTG	2	6	11563	11568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017354	TGT	2	6	11749	11754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887054
124	NC_017354	ACG	2	6	11911	11916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384887054
125	NC_017354	TGT	2	6	11917	11922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887054
126	NC_017354	AAG	2	6	12076	12081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384887054
127	NC_017354	TAA	2	6	12386	12391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384887054
128	NC_017354	TGG	3	9	12487	12495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384887054
129	NC_017354	GAA	3	9	12504	12512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384887054
130	NC_017354	AGA	2	6	12608	12613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384887054
131	NC_017354	AGG	2	6	12831	12836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017354	TTA	2	6	12918	12923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384887055
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134	NC_017354	GTT	2	6	13002	13007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887055
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140	NC_017354	AGA	3	9	13603	13611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384887055
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142	NC_017354	GTG	2	6	14027	14032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384887056
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247	NC_017354	GTT	2	6	25558	25563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_017354	ATT	2	6	26215	26220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_017354	ATC	2	6	26444	26449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384887066
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255	NC_017354	GCG	2	6	26714	26719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384887066
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