MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus lugdunensis N920143

Total Repeats: 1149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017353	TTCAGA	2	12	2313	2324	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385782958
2	NC_017353	ATTAAA	2	12	12609	12620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017353	ATTATC	2	12	16528	16539	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385782969
4	NC_017353	GGTGGC	2	12	17961	17972	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385782969
5	NC_017353	TAAAGG	2	12	18103	18114	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385782970
6	NC_017353	ATGATT	2	12	19541	19552	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385782971
7	NC_017353	AAGGTA	2	12	20316	20327	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385782972
8	NC_017353	ATTAGC	2	12	23949	23960	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385782974
9	NC_017353	TGGTAT	2	12	24828	24839	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385782974
10	NC_017353	AAAGCA	2	12	26873	26884	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385782976
11	NC_017353	ATTGTC	2	12	31852	31863	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385782981
12	NC_017353	AATTAT	2	12	37989	38000	50 %	50 %	0 %	0 %	385782988
13	NC_017353	GATGTA	2	12	40593	40604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782991
14	NC_017353	TGCAAC	2	12	40750	40761	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017353	CAAAGG	2	12	41273	41284	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385782992
16	NC_017353	AGAATC	2	12	45947	45958	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017353	AAATGA	2	12	46882	46893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385782997
18	NC_017353	TGAAAT	2	12	47065	47076	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385782997
19	NC_017353	CTAAAG	2	12	48451	48462	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385782998
20	NC_017353	ATTTTT	2	12	51172	51183	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385783001
21	NC_017353	TGAAAA	2	12	54710	54721	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385783005
22	NC_017353	TAAATC	2	12	55092	55103	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385783005
23	NC_017353	TAAAAC	2	12	56909	56920	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385783007
24	NC_017353	CAAAAA	2	12	58226	58237	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017353	ATTATG	2	12	61823	61834	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017353	GGCGAT	2	12	74580	74591	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385783020
27	NC_017353	CTTTTT	2	12	80283	80294	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385783028
28	NC_017353	TAAAAA	2	12	88952	88963	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385783038
29	NC_017353	TAAAAA	2	12	90237	90248	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385783038
30	NC_017353	TATTTT	2	12	91627	91638	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017353	ACGAAT	2	12	92161	92172	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385783039
32	NC_017353	TCATCT	2	12	93214	93225	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385783039
33	NC_017353	GTTGTA	2	12	98237	98248	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385783042
34	NC_017353	TGTTGC	2	12	101971	101982	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385783046
35	NC_017353	CAACAC	2	12	106041	106052	50 %	0 %	0 %	50 %	385783048
36	NC_017353	AATTTT	2	12	106267	106278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385783048
37	NC_017353	AGAGGA	2	12	107238	107249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017353	CATTTA	2	12	109054	109065	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385783052
39	NC_017353	ATAAAA	2	12	110225	110236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385783054
40	NC_017353	TAAACC	2	12	112275	112286	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385783055
41	NC_017353	ATAAGT	2	12	113343	113354	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385783056
42	NC_017353	TGTAGG	2	12	117180	117191	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385783061
43	NC_017353	CACCTT	2	12	117623	117634	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385783061
44	NC_017353	CAACGT	2	12	118938	118949	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385783062
45	NC_017353	AGATGA	2	12	120726	120737	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385783064
46	NC_017353	TCATGA	2	12	123959	123970	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385783066
47	NC_017353	TAGCTG	2	12	124676	124687	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385783067
48	NC_017353	TTCAAA	2	12	128841	128852	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385783071
49	NC_017353	TGTCAT	2	12	129337	129348	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385783072
50	NC_017353	CAGAAG	2	12	132698	132709	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385783077
51	NC_017353	ATTTCT	2	12	133516	133527	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385783078
52	NC_017353	ATAAAA	2	12	135615	135626	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385783080
53	NC_017353	TAAAGC	2	12	135832	135843	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385783080
54	NC_017353	TCATGG	2	12	137878	137889	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385783082
55	NC_017353	AGAAGC	2	12	146214	146225	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385783090
56	NC_017353	TAATCC	2	12	151027	151038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385783093
57	NC_017353	TAATCA	2	12	155580	155591	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385783096
58	NC_017353	AATGTT	2	12	155691	155702	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017353	CCTTTA	2	12	156170	156181	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385783097
60	NC_017353	TTTATT	2	12	156852	156863	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385783097
61	NC_017353	TTAGGC	2	12	161215	161226	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385783101
62	NC_017353	TCGACA	2	12	162297	162308	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385783103
63	NC_017353	AGTGGC	2	12	162376	162387	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385783103
64	NC_017353	TTTATA	2	12	168440	168451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385783108
65	NC_017353	ATGTTT	2	12	171752	171763	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017353	TGTTGG	2	12	177873	177884	0 %	50 %	50 %	0 %	385783117
67	NC_017353	CAGTAT	2	12	180569	180580	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385783119
68	NC_017353	ATGAAC	2	12	183012	183023	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385783120
69	NC_017353	TTTCAC	2	12	183712	183723	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017353	GGACGT	2	12	185360	185371	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385783122
71	NC_017353	TGATAA	2	12	187525	187536	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385783123
72	NC_017353	TTAGCA	2	12	189088	189099	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385783125
73	NC_017353	TATGGG	2	12	189273	189284	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385783125
74	NC_017353	TTTATT	2	12	190662	190673	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385783126
75	NC_017353	AAAATA	2	12	192483	192494	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017353	GCAATG	2	12	194134	194145	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385783131
77	NC_017353	AGCCAT	2	12	195725	195736	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385783132
78	NC_017353	ATCCAT	2	12	195970	195981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385783132
79	NC_017353	GAATAA	2	12	196076	196087	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385783132
80	NC_017353	AAATGA	2	12	196618	196629	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385783132
81	NC_017353	ATAAAA	2	12	196775	196786	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017353	CATTCG	2	12	197567	197578	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385783134
83	NC_017353	TTCATA	2	12	198649	198660	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385783135
84	NC_017353	GGTGTA	2	12	198663	198674	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385783135
85	NC_017353	TGATAA	2	12	201973	201984	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385783138
86	NC_017353	CAGGTG	2	12	202872	202883	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385783138
87	NC_017353	TAAAAT	2	12	205358	205369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385783141
88	NC_017353	CTTTAG	2	12	205748	205759	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385783142
89	NC_017353	TTTTTG	2	12	209578	209589	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385783146
90	NC_017353	TTATCT	2	12	209900	209911	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385783146
91	NC_017353	TTCTTT	2	12	209980	209991	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385783146
92	NC_017353	CTGATT	2	12	211350	211361	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385783147
93	NC_017353	AGTGGT	2	12	215931	215942	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385783152
94	NC_017353	GTTTAG	2	12	216169	216180	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385783152
95	NC_017353	CACCAA	2	12	218772	218783	50 %	0 %	0 %	50 %	385783154
96	NC_017353	GTTTTT	2	12	222041	222052	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385783158
97	NC_017353	ATTTTC	2	12	228445	228456	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385783166
98	NC_017353	TAAAAA	2	12	229007	229018	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017353	CGTTGT	2	12	238100	238111	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385783174
100	NC_017353	TTAAAT	2	12	243699	243710	50 %	50 %	0 %	0 %	385783177
101	NC_017353	TTACAG	2	12	247083	247094	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385783180
102	NC_017353	AAGTGA	2	12	247794	247805	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385783180
103	NC_017353	GGTGCA	2	12	249537	249548	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385783182
104	NC_017353	ATGACA	2	12	250220	250231	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385783183
105	NC_017353	TAACTG	2	12	250959	250970	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385783183
106	NC_017353	ATTTTT	2	12	257809	257820	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385783189
107	NC_017353	TATGAT	2	12	259522	259533	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385783190
108	NC_017353	TTTTTG	2	12	261757	261768	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017353	TCTGAT	2	12	262883	262894	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385783195
110	NC_017353	TAATGT	2	12	263088	263099	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385783195
111	NC_017353	ACAGTT	2	12	263104	263115	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385783195
112	NC_017353	TGATAT	2	12	263359	263370	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385783195
113	NC_017353	ATTAAT	2	12	263744	263755	50 %	50 %	0 %	0 %	385783196
114	NC_017353	ATGAAA	2	12	263799	263810	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385783196
115	NC_017353	TGGTTC	2	12	267808	267819	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385783198
116	NC_017353	TCAATT	2	12	267886	267897	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385783198
117	NC_017353	CAATTT	2	12	272716	272727	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385783205
118	NC_017353	TATCTG	2	12	275323	275334	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385783209
119	NC_017353	TAATTC	2	12	277699	277710	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385783211
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236	NC_017353	TCCTAT	2	12	527655	527666	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385783427
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349	NC_017353	TTATTT	2	12	802709	802720	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385783687
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