MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus lugdunensis N920143

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017353	ATTAAA	2	12	12609	12620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017353	TGCAAC	2	12	40750	40761	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017353	AGAATC	2	12	45947	45958	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017353	CAAAAA	2	12	58226	58237	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017353	ATTATG	2	12	61823	61834	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017353	TATTTT	2	12	91627	91638	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017353	AGAGGA	2	12	107238	107249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017353	AATGTT	2	12	155691	155702	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017353	ATGTTT	2	12	171752	171763	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017353	TTTCAC	2	12	183712	183723	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017353	AAAATA	2	12	192483	192494	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017353	ATAAAA	2	12	196775	196786	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017353	TAAAAA	2	12	229007	229018	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017353	TTTTTG	2	12	261757	261768	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017353	AATTTA	2	12	283609	283620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017353	TGTTAA	2	12	288756	288767	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017353	TGTATT	2	12	292393	292404	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017353	AATAAA	2	12	293919	293930	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017353	CTTGTG	2	12	294996	295007	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017353	TATGGA	2	12	313402	313413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017353	TTTGTT	2	12	321990	322001	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017353	ATTTGA	2	12	330739	330750	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017353	TTGTTC	2	12	331662	331673	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017353	GTTTAA	2	12	332341	332352	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017353	ATATTA	2	12	367700	367711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017353	CCCCAA	2	12	395680	395691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017353	TTTTAA	2	12	395903	395914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017353	TATAAT	2	12	413275	413286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017353	AGTGTA	2	12	424200	424211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017353	GGATAT	2	12	437722	437733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017353	ATTAAA	2	12	451381	451392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017353	AAATAT	2	12	462603	462614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017353	AATTAA	2	12	492590	492601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017353	TAAAGA	2	12	495535	495546	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017353	CTATTA	2	12	514613	514624	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017353	CAATTA	2	12	514994	515005	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017353	CAATCA	2	12	516893	516904	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017353	CAATCA	2	12	517262	517273	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017353	CAATCA	2	12	517400	517411	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017353	CAATTA	2	12	518129	518140	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017353	CAATTA	2	12	518738	518749	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017353	CAGTAA	2	12	520151	520162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017353	CAGTAA	2	12	520271	520282	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017353	CAGTAA	2	12	520964	520975	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017353	TACAAT	2	12	521613	521624	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017353	TACAAT	2	12	521835	521846	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017353	CATCAA	2	12	522455	522466	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017353	TCATTA	2	12	522797	522808	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017353	TCGAAA	2	12	534654	534665	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017353	TCGAAA	2	12	535156	535167	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017353	AAGAGG	2	12	560764	560775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017353	TTTAAT	2	12	575681	575692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017353	AAGCTG	2	12	579507	579518	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017353	TTTTAA	2	12	579601	579612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017353	TTATAA	2	12	664252	664263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017353	ATAGTA	2	12	670271	670282	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017353	TAAGTA	2	12	670719	670730	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017353	TAAATT	2	12	689265	689276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017353	TAGATA	2	12	703523	703534	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017353	TAATTT	2	12	716553	716564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017353	ATAATG	2	12	720214	720225	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017353	TCATTA	2	12	723663	723674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017353	TAAAAA	2	12	738517	738528	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017353	GATTAT	2	12	744221	744232	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017353	TTTAAT	2	12	757606	757617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017353	ATGATA	2	12	770702	770713	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017353	TTAAAG	2	12	802620	802631	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017353	AAAAGA	2	12	818551	818562	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017353	ATGTTA	2	12	824410	824421	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017353	AATCAG	2	12	831410	831421	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017353	ATTGTT	2	12	843922	843933	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017353	CATTAT	2	12	851024	851035	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017353	AATGTA	2	12	855220	855231	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017353	TCTTTA	2	12	855292	855303	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017353	TATTTT	2	12	886806	886817	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017353	TGCATT	2	12	887373	887384	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017353	AAAATT	2	12	890981	890992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017353	ATAAGA	2	12	907541	907552	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017353	AATTAA	2	12	928717	928728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017353	TTTATG	2	12	929744	929755	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017353	TGATAA	2	12	937290	937301	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017353	TAATGA	2	12	980429	980440	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017353	AGTATA	2	12	980521	980532	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017353	TAAAAA	2	12	997058	997069	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017353	TTATTT	2	12	1016879	1016890	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017353	TTTAAA	2	12	1068367	1068378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017353	ATATTA	2	12	1080213	1080224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017353	GATAAA	2	12	1086926	1086937	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017353	TCATTG	2	12	1098866	1098877	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017353	AATATG	2	12	1123787	1123798	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017353	ATGAAG	2	12	1132489	1132500	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017353	GTATTT	2	12	1133226	1133237	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017353	ATTTGA	2	12	1133313	1133324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017353	TAATTA	2	12	1141380	1141391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017353	ATAAGT	2	12	1146949	1146960	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017353	TATTAA	2	12	1160720	1160731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017353	TCAATT	2	12	1172324	1172335	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017353	TTAAAA	2	12	1178082	1178093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017353	TTATTT	2	12	1215936	1215947	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017353	CTTGCA	2	12	1227155	1227166	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017353	TTTGCA	2	12	1267188	1267199	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017353	GTCTGG	2	12	1299299	1299310	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017353	ACAATA	2	12	1304913	1304924	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017353	GTAGAG	2	12	1316889	1316900	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017353	AGTCAA	2	12	1406906	1406917	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017353	ATTATA	2	12	1448264	1448275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017353	TTCAAA	2	12	1457759	1457770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017353	TTAAAA	2	12	1487717	1487728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017353	TTATCA	2	12	1501893	1501904	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017353	TTAATT	2	12	1607851	1607862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017353	ATTAAA	2	12	1608534	1608545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017353	TAAAAA	2	12	1640223	1640234	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017353	CAGCTT	2	12	1650690	1650701	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017353	TTAATC	2	12	1662476	1662487	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017353	TCAAAA	2	12	1685939	1685950	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017353	TATTTT	2	12	1685970	1685981	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017353	TTTTGT	2	12	1734924	1734935	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017353	TATTTA	2	12	1770272	1770283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017353	TATTTT	2	12	1824618	1824629	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017353	AAAAAT	2	12	1828352	1828363	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017353	TTAAAT	2	12	1830807	1830818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017353	ATTAAA	2	12	1837126	1837137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017353	TTTTTA	2	12	1840996	1841007	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017353	ATTCTA	2	12	1847417	1847428	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017353	TTAAAT	2	12	1889924	1889935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017353	TAATTT	2	12	1907934	1907945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017353	CTTTAA	2	12	1933865	1933876	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017353	CTATAT	2	12	1934052	1934063	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017353	AATTTA	2	12	1934408	1934419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017353	GTTATA	2	12	1942831	1942842	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.